Electropherograms were edited in Ch

Electropherograms were edited in Chromas v1.45 (Techne-
lysium Pty., Tewantin, Australia). Alignment was done by eye in
Bioedit v7.0.1 (Hall, 1999). Indels were coded with the “simple
indel coding” method of Simmons and Ochoterena (2000).
There is no reason to suspect incongruence from a uniparentally
inherited, non-recombining genome, therefore the different gene
regions were immediately combined for phylogenetic analysis.
Parsimony analyses were conducted using PAUP⁎4.0b10
(Swofford, 2003). Heuristic searches were done on a combined
dataset. One thousand replicates of random stepwise taxon
addition were performed, holding one tree at each step with TBR
branch swapping saving no more than 100 trees per replicate.
This was followed by a second round of TBR branch swapping
using all trees retained in memory. Support for each node was
inferred using the bootstrap procedure (Felsenstein, 1985).
Bootstrapping was performed using NoNa (Goloboff, 1993),
spawned as a daughter process from WinClada (Nixon, 2002).
One thousand bootstrap replicates were run with 100 TBR
searches per replicate, holding 10 trees per replicate, followed by
“max⁎” to swap to completion.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Electropherograms ถูกแก้ไขใน Chromas v1.45 (Techne-
lysium เนชั่ลแนล เทวันติน ออสเตรเลีย) จัดทำ โดยตาใน
Bioedit v7.0.1 (ฮอลล์ 1999) Indels ถูกเข้ารหัสด้วย "ง่าย
indel รหัส" วิธีของซิมมอนส์และ Ochoterena (2000) .
มีเหตุผลที่ต้องสงสัยว่า incongruence จาก uniparentally
กลุ่มสืบทอด ไม่ recombining ยีนแตกต่างกัน
ภูมิภาคได้รวมสำหรับ phylogenetic วิเคราะห์ทันที
Parsimony วิเคราะห์ได้ดำเนินการโดยใช้ PAUP⁎4.0b10
(Swofford, 2003) ทำการค้นหาแล้วในการรวม
ชุดข้อมูล หนึ่งพันเหมือนกับของ stepwise taxon สุ่ม
นี้ดำเนิน ถือทรีหนึ่งในแต่ละขั้นตอนกับ TBR
สาขาเปลี่ยนบันทึกต้นไม้ไม่เกิน 100 ต่อจำลอง
นี้ถูกตาม ด้วยรอบที่สองเปลี่ยนสาขา TBR
ใช้ต้นไม้ทั้งหมดที่เก็บไว้ในหน่วยความจำ สนับสนุนสำหรับแต่ละโหนถูก
สรุปโดยใช้กระบวนการเริ่มต้นระบบ (Felsenstein, 1985) .
Bootstrapping ทำใช้ NoNa (Goloboff, 1993),
เกิดเป็นกระบวนการลูกจาก WinClada (Nixon, 2002) .
พันเหมือนกับเริ่มต้นระบบที่รัน ด้วย 100 TBR
ค้นหาต่อจำลอง จับต้นไม้ 10 ต่อจำลอง ตามด้วย
"max⁎" เพื่อสลับให้เสร็จสมบูรณ์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

electropherograms ก็แก้ไขได้ใน chromas V 1.45 ( pty. tewantin ออสเตรเลีย techne -
lysium ) การจัดเรียงเป็นการกระทำด้วยตาเปล่าใน
bioedit v7. 0.1 ( Hall 1999 ) indels ก็มีรหัสสีพร้อม"แบบเรียบง่าย
indel รหัส"วิธีการของ Simmons และ ochoterena ( 2000 )..
ไม่มีเหตุผลที่จะสงสัยว่า incongruence จาก uniparentally
สืบทอด,ไม่ recombining ยีน,ยีนที่แตกต่างกันดังนั้น
เขตพื้นที่รวมสำหรับการวิเคราะห์ phylogenetic ทันที.
วิเคราะห์รวดเร็วประหนึ่งเป็นผู้ดำเนินการโดยใช้ paup ⁎ 4.0 B 10
( swofford 2003 ) การค้นหา Heuristic ก็ทำได้บนรวม
dataset ที่ หนึ่งพันหาดจอมเทียนในแบบสุ่ม stepwise taxon
นอกจากนี้ยังได้ดำเนินการอยู่ต้นหนึ่งในแต่ละขั้นตอนมีสาขา TBR
ซึ่งจะช่วยประหยัดการสลับอุปกรณ์ขณะยังมีไฟเลี้ยงไม่มีมากกว่า 100 ต้นต่อลอกเลียน.
โรงแรมแห่งนี้ได้รับการตามมาด้วยรอบที่สองของสาขา TBR การสลับอุปกรณ์ขณะยังมีไฟเลี้ยง
การใช้ต้นทั้งหมดถูกเก็บไว้ในหน่วยความจำ การสนับสนุนสำหรับโหนดแต่ละ
จริงแต่อย่างใดโดยใช้วิธีการ Bootstrap Processor ( felsenstein ; Spark , 1985 )..
bootstrapping ได้ดำเนินการโดยใช้ Nona Medical City เขต( goloboff 1993 )
อยู่เป็นกระบวนการบุตรสาวจาก winclada ( Nixon , 2002 )..
หนึ่งพันหาดจอมเทียน Bootstrap Processor เป็นการวิ่งพร้อมด้วย 100 TBR
ซึ่งจะช่วยการค้นหาต่อลอกเลียนแบบได้จับ 10 ต้นต่อลอกเลียนแบบได้ตามด้วย
" MAX ⁎ "เพื่อสลับไปยังการจบหลักสูตร