PLP-dependent enzymes catalyze many

PLP-dependent enzymes catalyze many important reactions
that act upon amino acids, including transamination, decarboxylation,
b,g-replacement/elimination, and racemization (6, 7).
In all of these reactions (except in the case of the glycogen
phosphorylase family), the two basic chemical properties of the
PLP are conserved; it forms an external aldimine between its
aldehyde group and the a-amino group of the substrates and
withdraws electrons from the substrate by serving as an electron
sink (7). As a PLP-dependent enzyme, the ACCD’s ringopening
reaction starts with a transformation reaction from an
internal aldimine between the PLP and the enzyme to an
external aldimine. In most of the PLP-dependent enzymes, the
next step is the nucleophilic abstraction of the a-substituent,
either an a-proton or a carboxylate group, to form an a-carbanionic
intermediate. This reaction mechanism cannot be applied
to ACCD because the substrate (ACC) does not contain a-hydrogen
and the carboxyl group is retained in the product.
Therefore, the ring-opening reaction of ACC must be initiated
without obvious accessibility to an a-carbanionic intermediate,
which is, for PLP-dependent enzymes, the common entry for
catalysis. One proposed reaction mechanism is the nucleophilic
addition to Cg followed by the cleavage of the Ca-Cg bond and
b-proton abstraction. Because PLP acts as an electron sink,
external aldimine is fairly electrophilic, and the nucleophilic
addition to Cg to rupture the cyclopropane ring of ACC is
mechanistically feasible (8, 9).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ขึ้นอยู่กับ PLP เอนไซม์สถาบันปฏิกิริยาสำคัญมากที่ทำงานกับกรดอะมิโน รวม transamination, decarboxylationb, g-เปลี่ยน/ตัดออก และ racemization (6, 7)ในปฏิกิริยาเหล่านี้ทั้งหมด (ยกเว้นในกรณียังphosphorylase ครอบครัว), สองคุณสมบัติเคมีพื้นฐานของการPLP จะอาศัย แบบ aldimine การภายนอกระหว่างนั้นกลุ่มแอลดีไฮด์และพื้นผิวในกลุ่ม a-อะมิโน และถอนตัวอิเล็กตรอนจากพื้นผิว โดยการให้บริการเป็นอิเล็กตรอนจม (7) เป็นเอนไซม์ขึ้นอยู่กับ PLP, ringopening ของ ACCDปฏิกิริยาเริ่มต้น ด้วยปฏิกิริยาการเปลี่ยนแปลงจากการaldimine ภายในระหว่าง PLP และเอนไซม์เพื่อการaldimine ภายนอก ส่วนใหญ่ขึ้นอยู่กับ PLP เอนไซม์ การขั้นตอนถัดไปคือ abstraction nucleophilic ของที่มี-substituentเป็นต่อโปรตอนหรือกลุ่ม carboxylate เพื่อการเป็น-carbanionicระดับกลาง ไม่สามารถใช้กลไกปฏิกิริยานี้การ ACCD เนื่องจากพื้นผิว (บัญชี) ไม่มีไฮโดรเจนและกลุ่ม carboxyl ถูกเก็บไว้ในผลิตภัณฑ์ดังนั้น จึง ต้องเริ่มต้นปฏิกิริยาการเปิดวงแหวนของบัญชีไม่ชัดเจนถึงกลางได้-carbanionicซึ่งคือ เอนไซม์ขึ้นอยู่กับ PLP รายการทั่วไปสำหรับเร่งปฏิกิริยา หนึ่งนำเสนอกลไกปฏิกิริยาเป็นการ nucleophilicนี้ Cg ตามปริของพันธบัตร Ca Cg และขโปรตอน abstraction เพราะ PLP ทำหน้าที่เป็นตัวรับอิเล็กตรอนaldimine ภายนอกเป็น electrophilic ค่อนข้าง และที่ nucleophilicเป็น Cg rupture แหวน cyclopropane ของบัญชีนี้mechanistically เป็นไปได้ (8, 9)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เอนไซม์ PLP ขึ้นอยู่กับการกระตุ้นปฏิกิริยาที่สำคัญมาก
ที่ทำหน้าที่อยู่กับกรดอะมิโนรวมทั้ง transamination, decarboxylation,
B, G-เปลี่ยน / กำจัดและ racemization (6, 7).
ในทุกปฏิกิริยาเหล่านี้ (ยกเว้นในกรณีของไกลโคเจน
ครอบครัว phosphorylase ) ทั้งสองคุณสมบัติทางเคมีพื้นฐานของ
PLP ป่าสงวน; มันเป็น aldimine ภายนอกระหว่างที่
กลุ่มลดีไฮด์และกลุ่มอะมิโนของพื้นผิวและ
ถอนอิเล็กตรอนจากพื้นผิวโดยทำหน้าที่เป็นอิเล็กตรอน
อ่างล้างจาน (7) ในฐานะที่เป็นเอนไซม์ PLP ขึ้นอยู่กับ ringopening ACCD ของ
ปฏิกิริยาเริ่มต้นด้วยการเกิดปฏิกิริยาการเปลี่ยนแปลงจาก
ภายในระหว่าง aldimine PLP และเอนไซม์ที่จะ
aldimine ภายนอก ในส่วนของเอนไซม์ PLP ขึ้นอยู่กับ
ขั้นตอนต่อไปคือการเอา nucleophilic ของ-แทน,
ทั้ง-โปรตอนหรือกลุ่ม carboxylate ในรูปแบบ-carbanionic
กลาง กลไกการเกิดปฏิกิริยานี้ไม่สามารถนำมาใช้
เพื่อ ACCD เพราะสารตั้งต้น (ACC) ไม่ได้มีไฮโดรเจน
และกลุ่ม carboxyl จะถูกเก็บไว้ในผลิตภัณฑ์.
ดังนั้นปฏิกิริยาแหวนเปิดแม็กจะต้องเริ่มต้น
โดยไม่ต้องเข้าถึงที่ชัดเจนที่จะ-carbanionic กลาง
ซึ่งเป็นเอนไซม์ PLP ขึ้นอยู่กับรายการที่พบบ่อยสำหรับ
การเร่งปฏิกิริยา หนึ่งในกลไกการเกิดปฏิกิริยาที่นำเสนอเป็น nucleophilic
นอกจาก Cg ตามความแตกแยกของพันธบัตร Ca-Cg และ
นามธรรมขโปรตอน เพราะ PLP ทำหน้าที่เป็นอ่างล้างจานอิเล็กตรอน
aldimine ภายนอก electrophilic เป็นธรรมและ nucleophilic
นอกจาก Cg จะแตกร้าวแหวน cyclopropane ของแม็กเป็น
ไปได้ mechanistically (8, 9)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ขึ้นอยู่กับเอนไซม์เร่งปฏิกิริยา PLP สําคัญมาก
พระราชบัญญัติเมื่อกรดอะมิโน รวมทั้งทรานแอมิเนชันเงือก
b , , , g-replacement / ตัดออกและราเซไมด์เซชัน ( 6 , 7 ) .
ในทั้งหมดของปฏิกิริยาเหล่านี้ ( ยกเว้นในกรณีของไกลโคเจน
ครอบครัวฟอ ฟรีเลส ) , สองพื้นฐานทางเคมีของ
PLP อนุรักษ์ ; มันรูปแบบ aldimine ภายนอกระหว่าง
กลุ่มอัลดีไฮด์ และ a-amino กลุ่มของพื้นผิวและ
ถอนอิเล็กตรอนจากพื้นผิว โดยให้บริการเป็นอิเล็กตรอน
จม ( 7 ) โดย PLP ขึ้นอยู่กับเอนไซม์ ของ accd ringopening
ปฏิกิริยาเริ่มต้นด้วยปฏิกิริยาการเปลี่ยนแปลงจาก
aldimine ภายในระหว่าง PLP และเอนไซม์ไป
aldimine ภายนอก ในส่วนของ PLP
ขึ้นอยู่กับเอนไซม์ขั้นตอนต่อไป คือ นามธรรม nucleophilic ของ a-substituent
, ทั้ง a-proton หรือกลุ่มคาร์บอกซิเลตในรูปแบบ a-carbanionic
กลาง นี้กลไกปฏิกิริยาไม่สามารถประยุกต์
เพื่อ accd เพราะพื้นผิว ( ACC ) ไม่ได้มี a-hydrogen
และกลุ่มคาร์บอกซิลถูกเก็บไว้ในผลิตภัณฑ์ .
ดังนั้น ปฏิกิริยาการเปิดวงแหวนของบัญชีจะต้องริเริ่ม
โดยไม่ต้องชัดเจน การเป็นสื่อกลาง a-carbanionic
, ซึ่งใน PLP ขึ้นอยู่กับเอนไซม์ รายการทั่วไป
ปฏิกิริยา หนึ่งเสนอกลไกปฏิกิริยาคือการเพิ่ม nucleophilic
กับ CG ตามรอยปริแยกของแคลิฟอร์เนียพันธบัตร CG และ
b-proton นามธรรม เพราะ PLP ทำหน้าที่เป็นอิเล็กตรอนจม
aldimine ภายนอกค่อนข้างรับ และ nucleophilic
นอกจาก CG จะทำให้ไซโคลโพรเพนแหวนบัญชี
mechanistically ไปได้ ( 8 , 9 )