Bacteria differ widely with respect

Bacteria differ widely with respect to the composition of the cell envelope, and this is reflected in different susceptibilities to protocols for lysis and DNA extraction. For all analyses that rely on DNA-based procedures, efficient and unbiased DNA isolation is critical. Available methods include enzymatic lysis with proteases, lysozyme, and mutanolysin or lysostaphin; chemical lysis with detergents or solvents; and mechanical disruption of cells. Most protocols combine several of these principles. Comparative analyses have shown that workflows including mechanical disruption by repeated beat-beating yield higher proportions of DNA from robust bacteria such as Clostridium, Veillonella, or Streptococcus than more gentle methods (Ó Cuív et al., 2011) and increase the measured diversity (Salonen et al., 2010; Maukonen et al., 2012). During the isolation and subsequent handling of DNA for stomach microbiota analysis, extra care should be taken to avoid the introduction of contaminations at these steps: as the extracted DNA will contain significantly lower fractions of bacterial DNA than many other materials, low levels of contamination might have a significant effect.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

แบคทีเรียที่แตกต่างกันอย่างกว้างขวางเกี่ยวกับองค์ประกอบของเซลล์ซอง และนี้จะแสดงใน susceptibilities ที่แตกต่างโพรโทคอการ lysis และสกัดดีเอ็นเอ สำหรับการวิเคราะห์ทั้งหมดที่ใช้ในกระบวนการดีเอ็นเอตาม แยกดีเอ็นเอที่มีประสิทธิภาพ และเป็นกลางเป็นสำคัญ ใช้วิธีรวม lysis เอนไซม์โปรตีเอส lysozyme และ mutanolysin หรือ lysostaphin lysis เคมีผงซักฟอกหรือสารทำละลาย และจักรกลทรัพยเซลล์ ส่วนใหญ่โปรโตคอลที่รวมหลายหลักการเหล่านี้ วิเคราะห์เปรียบเทียบได้แสดงว่า เวิร์กโฟลว์รวมถึงกลทรัพย โดยซ้ำจังหวะว่าให้ผลผลิตสูงกว่าสัดส่วนของดีเอ็นเอจากแบคทีเรียที่ทนทานเช่น Clostridium, Veillonella หรืออุณหภูมิกว่าวิธีอ่อนโยนเพิ่มเติม (Ó Cuív et al. 2011) และเพิ่มความหลากหลายวัด (บรรเลง et al. 2010 Maukonen et al. 2012) ระหว่างแยกและจัดการตามมาของดีเอ็นเอสำหรับการวิเคราะห์จุลินทรีย์ในกระเพาะอาหาร บริการดูแลควรควรหลีกเลี่ยงการแนะนำของปนเปื้อนในขั้นตอนเหล่านี้: สกัดดีเอ็นเอจะประกอบด้วยดีเอ็นเอของแบคทีเรียเศษต่ำกว่าวัสดุอื่น ๆ มากมาย การปนเปื้อนในระดับต่ำอาจมีผลกระทบ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เชื้อแบคทีเรียที่แตกต่างกันเกี่ยวกับองค์ประกอบของซองมือถือและนี่คือภาพสะท้อนในความไวที่แตกต่างเพื่อโปรโตคอลสำหรับการสลายและการสกัดดีเอ็นเอ สำหรับการวิเคราะห์ทั้งหมดที่พึ่งพาขั้นตอนการตรวจดีเอ็นเอตามที่มีประสิทธิภาพและเป็นกลางดีเอ็นเอแยกเป็นสิ่งสำคัญ วิธีการที่มีจำหน่าย ได้แก่ เอนไซม์สลายกับโปรตีเอส, ไลโซไซม์และ mutanolysin หรือ lysostaphin; สลายทางเคมีที่มีผงซักฟอกหรือตัวทำละลาย; และการหยุดชะงักทางกลของเซลล์ โปรโตคอลส่วนใหญ่รวมหลายหลักการเหล่านี้ การวิเคราะห์เปรียบเทียบได้แสดงให้เห็นว่าขั้นตอนการทำงานรวมทั้งการหยุดชะงักกลซ้ำจังหวะเต้นผลผลิตในสัดส่วนที่สูงดีเอ็นเอจากเชื้อแบคทีเรียที่แข็งแกร่งเช่น Clostridium, Veillonella หรือ Streptococcus กว่าวิธีที่อ่อนโยนมากขึ้น (O Cuív et al., 2011) และเพิ่มความหลากหลายของวัด (Salonen et al, 2010;.. Maukonen et al, 2012) ในช่วงการแยกและการจัดการที่ตามมาของดีเอ็นเอสำหรับการวิเคราะห์ท้อง microbiota, การดูแลเป็นพิเศษจะต้องดำเนินการเพื่อหลีกเลี่ยงการแนะนำของการปนเปื้อนในขั้นตอนเหล่านี้เป็น DNA ที่สกัดจะมีเศษส่วนอย่างมีนัยสำคัญที่ต่ำกว่าของดีเอ็นเอของแบคทีเรียกว่าวัสดุอื่น ๆ อีกมากมายระดับต่ำของการปนเปื้อนอาจ มีผลกระทบอย่างมีนัยสำคัญ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

แบคทีเรียที่แตกต่างกันอย่างกว้างขวางเกี่ยวกับองค์ประกอบของเซลล์ซองจดหมายและนี่คือภาพสะท้อนในโปรโตคอลที่แตกต่างกันสำหรับการสลายและการสกัดดีเอ็นเอ ตลอดการวิเคราะห์ดีเอ็นเอที่อาศัยตามขั้นตอน มีประสิทธิภาพ และปราศจากอคติ การแยกดีเอ็นเอเป็นสําคัญ วิธีการที่ใช้ได้รวมถึงการสลายด้วยเอนไซม์ไลโซไซม์โปรติเนส และ mutanolysin , หรือไลโซ ตฟิน ; สารเคมีเสื่อมด้วยผงซักฟอกหรือตัวทำละลาย และหยุดชะงักเชิงกลของเซลล์ โปรโตคอลส่วนใหญ่รวมหลายหลักการเหล่านี้ การวิเคราะห์เปรียบเทียบแสดงให้เห็นว่าเวิร์กโฟลว์รวมทั้งเครื่องกลหยุดชะงักโดยซ้ำจังหวะเต้นตอบแทนสูงกว่าสัดส่วนของดีเอ็นเอจากแบคทีเรียที่แข็งแกร่งเช่น Clostridium veillonella , หรือ Streptococcus กว่าวิธีการที่นุ่มนวลมากขึ้น ( Ó CU í v et al . , 2011 ) และเพิ่มความหลากหลาย ( วัด salonen et al . , 2010 ; maukonen et al . , 2012 ) . ในการแยกและการจัดการที่ตามมาของดีเอ็นเอเพื่อการวิเคราะห์ไมโครไบโ ้าท้อง , ดูแลพิเศษ ควรหลีกเลี่ยงการปนเปื้อนในขั้นตอนเหล่านี้ เป็นสารสกัด ดีเอ็นเอ จะประกอบด้วยส่วนของดีเอ็นเอแบคทีเรียลดกว่าวัสดุอื่น ๆอีกมากมายระดับต่ำของการปนเปื้อนที่อาจมีผลกระทบอย่างมีนัยสำคัญ