Sequences belonging to the genera Gluconacetobacter or Asaia
were also rare in our analysis (Table 2). Several species previously
classified within Gluconacetobacter have been reclassified as
members of the new genus Komagataeibacter (Yamada et al., 2012),
and some of these have been observed in some alcoholic fermentations,
albeit in low proportions (Gonzalez et al., 2004 ). Other
Acetobacteraceae were also present at very low percentages,
although they could not be unambiguously assigned to specific
genera (Table 2).
At the end of fermentation, we observed a decrease in AAB sequences
(Table 2; Fig. 2A) at the same time that an increase of LAB
of the order Lactobacillales (Fig. 2A). Andorra, Landi, Mas,
Guillamon, and Esteve-Zarzoso (2008) described an increase of
LAB population close to 104 cells/mL at the end of Carignan wine
fermentation using qPCR technique and Bokulich, Swadener, et al.
(2014) reported more than 60% of sequences obtained by HTS
related to Lactobacillaceae at the 10th day of Chardonnay wine
fermentation, both results for non-inoculated and SO2 free fermentations.
The observed increase of LAB at the end of alcoholic
fermentation on our Grenache wine could be expected to generate
the appropriate conditions for the subsequent malolactic fermentation
(although, as in most spontaneous fermentations, it did not
proceed).
We could detect other minor bacterial taxonomic groups during
the fermentations (Fig. 2A), some of them, like genera Orbus and
Wolbachia, were detected until the end of the alcoholic fermentation
although their role remains unknown and they have not been
detected in previous studies.
The most abundant eukaryotic genera were Hanseniaspora,
Candida and Saccharomyces, with a clear succession during
fermentation (Fig. 2B). Issatchenkia was relevant in the must too.
These genera have been frequently isolated on spontaneous fermentations
(Clemente-Jimenez, Mingorance-Cazorla, MartınezRodrıguez,
Las Heras-V
azquez, & Rodrıguez-Vico, 2004). At the
initial fermentation, Hanseniaspora and Issatchenkia were dominant,
though their abundance decreased sharply across fermentation
and Candida represented the most abundant genus from the
24 h to mid fermentation (52e87%). At the end of the fermentation,
Saccharomyces was the dominant genus together with Candida (48
and 40% respectively). These results were in agreement with previous
studies from our group using PCR-DGGE and qPCR on spontaneous
fermentations and describing the abundance of
Hanseniaspora at the beginning of the fermentation and Candida
and Saccharomyces at the end of alcoholic fermentation (Andorra
et al., 2010, 2008). However, Bokulich, Swadener, et al. (2014)
described by HTS techniques Kluyveromyces as the dominant
yeast at early stage of Chardonnay grapes fermentation before being
displaced by Hanseniaspora and then Saccharomyces cerevisiae,
which clearly differed from our results for Grenache variety.
Although Kluyveromyces is often isolated in fermenting musts, in
our previous studies on the ecology of Grenache and other grape
varieties from Priorat wine region, its presence was very marginal
(Constantí, Poblet, Arola, Mas, & Guillamon, 1997; Torija, Roz es,
ลำดับของสกุล Gluconacetobacter หรือ Asaiaก็ยังหายากในการวิเคราะห์ของเรา (ตาราง 2) หลายชนิดก่อนหน้านี้จัดภายใน Gluconacetobacter ถูกจัดประเภทใหม่เป็นKomagataeibacter (ยามาดะ et al. 2012), ในสกุลใหม่และบางส่วนของเหล่านี้ได้รับการปฏิบัติในบางหมักแหนมแอลกอฮอล์ในสัดส่วนที่ต่ำ (กี et al. 2004) อื่น ๆAcetobacteraceae ก็ยังอยู่ในเปอร์เซ็นต์ต่ำมากแม้ว่าพวกเขาไม่สามารถไม่กำกวมกำหนดเฉพาะสกุล (ตาราง 2)เมื่อสิ้นสุดการหมัก เราสังเกตเห็นการลดลงของ AAB ลำดับ(ตารางที่ 2 รูปที่ 2A) ขณะเดียวกันที่เพิ่มขึ้นของห้องปฏิบัติการสั่ง Lactobacillales (รูป 2A) อันดอร์รา Landi, MasGuillamon และ Esteve-Zarzoso (2008) อธิบายการเพิ่มขึ้นของประชากรแล็บใกล้กับ 104 เซลล์/มล.ที่ทุนไวน์หมักโดยใช้เทคนิค qPCR และ Bokulich, Swadener, et al(2014) รายงานมากกว่า 60% ของลำดับได้ โดย HTSเกี่ยวข้องกับ Lactobacillaceae ที่วัน 10 ของไวน์ชาดอนเนย์หมัก ทั้งผลไม่ใช่-inoculated และ SO2 ฟรีหมักแหนมการสังเกตเพิ่มห้องปฏิบัติการที่มีแอลกอฮอล์หมักไวน์ดื่มเราอาจต้องสร้างเงื่อนไขที่เหมาะสมสำหรับการหมัก malolactic ตามมา(ถึงแม้ว่า ในขณะที่การหมักแหนมที่ธรรมชาติมากที่สุด มันไม่ได้ดำเนินต่อ)เราสามารถตรวจพบอื่น ๆ เล็กน้อยระหว่างอนุกรมวิธานแบคทีเรียกลุ่มหมักแหนม (รูป 2A), บางส่วนของพวกเขา เช่นสกุล Orbus และWolbachia ตรวจพบจนถึงตอนท้ายของการหมักแอลกอฮอล์แม้ว่าบทบาทของพวกเขายังคงไม่รู้จัก และพวกเขาไม่ได้ตรวจพบในการศึกษาก่อนหน้านี้สกุลของ eukaryotic สุดถูก HanseniasporaCandida และ Saccharomyces มีการสืบทอดชัดเจนระหว่างการหมัก (รูปที่ 2B) Issatchenkia ถูกต้องเกี่ยวข้องสกุลนี้มีถูกบ่อยหน้าธรรมชาติหมักแหนม(นจิเมเนซ Mingorance Cazorla, MartınezRodrıguezลา Heras Vazquez, & Rodrıguez-วิโก 2004) ที่เริ่มต้นหมัก Hanseniaspora และ Issatchenkia โดดเด่นแม้ว่า ความอุดมสมบูรณ์ของพวกเขาลดลงอย่างรวดเร็วผ่านการหมักและ Candida แสดงสกุลอุดมสมบูรณ์มากที่สุดจากการ24 ชั่วโมงการหมักกลาง (52e87%) เมื่อสิ้นสุดการหมักSaccharomyces เป็นสกุลหลักร่วมกับ Candida (48และ 40% ตามลำดับ) ผลลัพธ์เหล่านี้เป็นข้อตกลงก่อนหน้าการศึกษาจากกลุ่มของเราใช้ PCR DGGE และ qPCR บนเกิดขึ้นเองหมักแหนมและอธิบายความอุดมสมบูรณ์ของHanseniaspora ที่จุดเริ่มต้นของการหมักและ Candidaและเมื่อสิ้นสุดการหมักแอลกอฮอล์ (อันดอร์รา Saccharomyceset al. 2010, 2008) อย่างไรก็ตาม Bokulich, Swadener, et al. (2014)อธิบาย โดย HTS เทคนิค Kluyveromyces เป็นการที่โดดเด่นยีสต์ที่ระยะแรก ๆ ของการหมักองุ่นชาดอนเนย์ก่อนที่จะพลัดถิ่นจาก Hanseniaspora และ Saccharomyces cerevisiaeอย่างชัดเจนซึ่งแตกต่างจากผลของเราสำหรับความหลากหลายของอาหารและแม้ว่ามักจะมีแยก Kluyveromyces ในหมัก musts ในศึกษาของเราก่อนหน้านี้ในระบบนิเวศของดื่มและองุ่นอื่น ๆพันธุ์จากภูมิภาค Priorat ไวน์ ตนก็ร่อแร่มาก(Constantí, Poblet, Arola, Mas, & Guillamon, 1997 Torija, Roz es
การแปล กรุณารอสักครู่..

วนเวียนอยู่ในจำพวก Gluconacetobacter หรือ Asaia
ก็มีความยากในการวิเคราะห์ของเรา (ตารางที่ 2) หลายชนิดก่อนหน้านี้
จัดภายใน Gluconacetobacter ได้รับการปรับฐานะเป็น
สมาชิกประเภทใหม่ Komagataeibacter (ยามาดะ et al., 2012)
และบางส่วนของเหล่านี้ได้รับการปฏิบัติในกระบวนการหมักแอลกอฮอล์บาง
แม้ว่าในสัดส่วนที่ต่ำ (อนซาเลซ, et al., 2004) . อื่น ๆ
Acetobacteraceae ยังเป็นปัจจุบันที่ร้อยละต่ำมาก
แม้ว่าพวกเขาจะไม่สามารถกำหนดได้อย่างไม่น่าสงสัยเฉพาะ
. จำพวก (ตารางที่ 2)
ในตอนท้ายของการหมักที่เราสังเกตเห็นลดลงในลำดับ AAB
(ตารางที่ 2. รูปที่ 2A) ในเวลาเดียวกัน ว่าการเพิ่มขึ้นของแล็บ
ของ Lactobacillales สั่งซื้อ (รูป. 2A) อันดอร์รา Landi, Mas,
Guillamon และ Esteve-Zarzoso (2008)? อธิบายการเพิ่มขึ้นของ
ประชากร LAB ใกล้กับ 104 เซลล์ / มิลลิลิตรในตอนท้ายของไวน์ Carignan
การหมักโดยใช้เทคนิค qPCR และ Bokulich, Swadener, et al.
(2014) รายงานมากกว่า 60% ของลำดับที่ได้รับโดย HTS
ที่เกี่ยวข้องกับ Lactobacillaceae ในวันที่ 10 ไวน์ Chardonnay
หมักผลทั้งกระบวนการหมักที่ไม่ใช่เชื้อและ SO2 ฟรี.
เพิ่มขึ้นสังเกตของแล็บในตอนท้ายของแอลกอฮอล์
หมักไวน์ Grenache ของเราอาจจะคาดว่าจะสร้าง
สภาวะที่เหมาะสมสำหรับการหมัก malolactic ที่ตามมา
(แม้ว่าในขณะที่ส่วนใหญ่ กระบวนการหมักที่เกิดขึ้นเองก็ไม่ได้
ดำเนินการ).
เราสามารถตรวจสอบรายย่อยกลุ่มการจัดหมวดหมู่อื่น ๆ แบคทีเรียในช่วง
หมักแหนม (รูป. 2A) บางส่วนของพวกเขาเช่นจำพวก Orbus และ
Wolbachia ถูกตรวจพบจนกว่าจะสิ้นสุดของการหมักแอลกอฮอล์
แม้ว่าบทบาทของพวกเขายังไม่ทราบ และพวกเขายังไม่ได้รับ
การตรวจพบในการศึกษาก่อนหน้า.
จำพวกยูคาริโอที่อุดมสมบูรณ์มากที่สุดคือ Hanseniaspora,
Candida และ Saccharomyces ที่มีการสืบทอดชัดเจนในระหว่างการ
หมัก (รูปที่ 2B) Issatchenkia เกี่ยวข้องจะต้องมากเกินไป.
จำพวกเหล่านี้ได้รับการแยกบ่อยในกระบวนการหมักที่เกิดขึ้นเอง
(เคล-เมเนซ Mingorance-กาซอร์ล่า, MartınezRodrıguez,
Las Heras-V?
azquez และ Rodriguez-Vico, 2004) ที่
หมักเริ่มต้น Hanseniaspora และ Issatchenkia เป็นที่โดดเด่น
แต่ความอุดมสมบูรณ์ของพวกเขาลดลงอย่างรวดเร็วทั่วหมัก
และ Candida เป็นตัวแทนของพืชและสัตว์ที่มีมากที่สุดจาก
24 ชั่วโมงถึงกลางเดือนหมัก (52e87%) ในตอนท้ายของการหมักที่
Saccharomyces เป็นสกุลที่โดดเด่นพร้อมกับ Candida (48
และ 40% ตามลำดับ) ผลลัพธ์เหล่านี้อยู่ในข้อตกลงกับก่อนหน้านี้
การศึกษาจากกลุ่มของเราโดยใช้วิธี PCR-DGGE และ qPCR ในธรรมชาติ
หมักแหนมและอธิบายความอุดมสมบูรณ์ของ
Hanseniaspora ที่จุดเริ่มต้นของการหมักและการ Candida
และ Saccharomyces ในตอนท้ายของการหมักแอลกอฮอล์ (อันดอร์รา
et al., 2010 2008) อย่างไรก็ตาม Bokulich, Swadener, et al (2014)
อธิบายโดย HTS เทคนิค Kluyveromyces เป็นที่โดดเด่น
ยีสต์ในขั้นตอนแรกของการ Chardonnay หมักองุ่นก่อนที่จะถูก
แทนที่ด้วย Hanseniaspora แล้ว Saccharomyces cerevisiae,
ที่แตกต่างอย่างชัดเจนจากผลของเราสำหรับ Grenache หลากหลาย.
แม้ว่า Kluyveromyces มักจะถูกโดดเดี่ยวในน้ำลิ้นจี่หมักใน
ของเรา การศึกษาก่อนหน้าในระบบนิเวศของ Grenache องุ่นและอื่น ๆ
สายพันธุ์จากไวน์ Priorat แสดงตนเป็นร่อแร่มาก
(Constanti, โป, Arola, Mas & Guillamon, 1997;? Torija รอซ ES,
การแปล กรุณารอสักครู่..

ลำดับของ gluconacetobacter หรือ asaia สกุลยังหายากในการวิเคราะห์ของเรา ( ตารางที่ 2 ) ก่อนหน้านี้หลายๆ ชนิดลับภายใน gluconacetobacter ได้รับการจัดประเภทใหม่เป็นสมาชิกของ komagataeibacter สกุลใหม่ ( ยามาดะ et al . , 2012 )และบางส่วนของเหล่านี้ได้รับการปฏิบัติในบาง fermentations แอลกอฮอล์ ,แม้ว่าในสัดส่วนที่น้อย ( กอนซาเลซ et al . , 2004 ) อื่น ๆacetobacteraceae ก็อยู่ในเปอร์เซ็นต์ที่น้อยมากถึงแม้ว่าพวกเขาไม่อาจจะกันเป็นกลุ่มเฉพาะสกุล ( ตารางที่ 2 )เมื่อสิ้นสุดการหมัก พบการลดลงของ AAB ลำดับ( ตารางที่ 2 ; รูปที่ 2A ) ในเวลาเดียวกันกับที่เพิ่มขึ้นของแล็บของคำสั่ง lactobacillales ( รูปที่ 2A ) อันดอร์รา , Landi , Mas ,guillamon และ esteve zarzoso ( 2008 ) ที่อธิบายเพิ่มประชากร Lab ใกล้กับ 104 เซลล์ / มล. ในตอนท้ายของ Carignan ไวน์การหมักโดยใช้เทคนิค qpcr และ bokulich swadener , et al .( 2014 ) รายงานว่า กว่า 60% ของลำดับได้โดย htsที่เกี่ยวข้องกับ lactobacillaceae ในวันที่ 10 ของไวน์ชาร์ดอนเน่ย์หมัก ทั้งผลและปลอดเชื้อ SO2 fermentations ฟรีจากการเพิ่มขึ้นของ Lab ที่ส่วนท้ายของแอลกอฮอล์หมักในไวน์ grenache ของเราอาจจะคาดว่าจะสร้างสภาวะที่เหมาะสมสำหรับการหมัก malolactic ตามมา( แม้ว่าในธรรมชาติมากที่สุด fermentations มันไม่ได้ดำเนินการ )เราสามารถตรวจพบแบคทีเรียกลุ่มในทางอื่นเล็กน้อยการ fermentations ( รูปที่ 2A ) , บางส่วนของพวกเขาเช่นสกุล orbus และwolbachia ถูกตรวจพบ จนกว่าจะสิ้นสุดของการหมักแอลกอฮอล์แม้ว่าบทบาทของพวกเขายังคงไม่ทราบและพวกเขาไม่ได้ที่ตรวจพบในการศึกษาก่อนหน้านี้ .ที่มีมากที่สุดคือ hanseniaspora eukaryotic สกุล ,Candida และ Saccharomyces , กับการสืบทอดชัดเจนระหว่างหมัก ( รูปที่ 2B ) issatchenkia ถูกเกี่ยวข้องในต้องเหมือนกันสกุลนี้มีบ่อยที่แยกได้ในธรรมชาติ fermentations( เคลเมนเต้ mingorance Jimenez , คาซอร์ลา , มาร์ทı nezrodr โรดรีเกซı ,heras-v ลาสazquez & ลุยส์โรดรีเกซı Vico , 2004 ) ที่เริ่มต้นการหมัก และ hanseniaspora issatchenkia เป็นเด่นแม้ว่าความอุดมสมบูรณ์ของพวกเขาลดลงอย่างแหลมคมในการหมักและ Candida แทนสกุลชุกชุมมากที่สุดจาก24 ชั่วโมงกับกลางหมัก ( 52e87 % ) ในตอนท้ายของการหมักและเป็นเด่นสกุลร่วมกับ Candida ( 48และ 40 ตามลำดับ ) ผลลัพธ์เหล่านี้สอดคล้องกับก่อนหน้านี้การศึกษาจากกลุ่มของเราดีเอ็นเอ 9 แถบบ่งชี้ qpcr ในธรรมชาติและใช้fermentations อธิบายมากมายhanseniaspora จุดเริ่มต้นของการหมักและแคนดิดาและ และในตอนท้ายของกระบวนการหมักแอลกอฮอล์ ( อันดอร์ราet al . , 2010 , 2008 ) อย่างไรก็ตาม bokulich swadener , et al . ( 2014 )บรรยายโดยเทคนิค kluyveromyces HTS เป็นเด่นยีสต์ที่หมัก Chardonnay องุ่นในระยะแรก ก่อนที่จะถูกพลัดถิ่นโดย Saccharomyces cerevisiae hanseniaspora แล้ว ,ซึ่งเห็นได้ชัดว่าแตกต่างจากผลลัพธ์ของเรา grenache หลากหลายแม้ว่า kluyveromyces มักจะแยกในการหมักต้องในการศึกษาก่อนหน้านี้ของเราเกี่ยวกับนิเวศวิทยาของ grenache และองุ่นอื่น ๆพันธุ์จาก catalonia comarques . kgm ไวน์ภูมิภาคของตนมาก( เมือง Poblet , คงที่ , Arola , Mas & guillamon , 1997 ; torija รอซ es ,
การแปล กรุณารอสักครู่..
