Cross-reaction experiments with clo

Cross-reaction experiments with closely related bacterial species
were performed to rule out relevant cross-reactions. Briefly,
the Agrobacterium sp. TMS1 specific MGB probe was tested with
samples from closely related bacterial species as far as available
to ensure specificity. No relevant (Ct > 40) overlap in the fluorescence
signal was detected using the TMS1 MGB probe. Defined
amounts of DNA from a known species were quantified by realtime
PCR and additionally spiked in a mixture of DNA from other
bacterial strains or DNA extracted from samples. The fluorescence
signal given by the DNA alone was then compared to the signal
obtained from the spiked DNA. No significant differences were
observed, indicating high specificity of the probe used and no relevant
cross-reaction. Moreover, with the primers from the TMS1
region, a fragment is amplified outside the T-DNA which is known
as the part to be inserted in the plant genome during infection
(Citovsky et al., 2007). For this reason, amplification products can
be provided only from the bacteria containing the plasmid, and
not from transformed plant cells. However this has been investigated
in our study and the uses of TMS1 region products from
the Ti plasmid are amplified from the bacterial cells exclusively

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Cross-reaction ทดลองกับแบคทีเรียชนิดที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดได้ดำเนินการออก cross-reactions ที่เกี่ยวข้อง สั้น ๆทดสอบอโกรแบคทีเรียม sp. TMS1 เฉพาะ MGB โพรบด้วยตัวอย่างจากที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดจากแบคทีเรียสายพันธุ์ไกลเป็นพร้อมใช้งานเพื่อให้แน่ใจ specificity ไม่เกี่ยวข้อง (Ct > 40) การทับซ้อนในการ fluorescenceสัญญาณตรวจพบการใช้โพรบ TMS1 MGB กำหนดจำนวนดีเอ็นเอจากสายพันธุ์ที่รู้จักถูก quantified โดยเรียลไทม์PCR และถูกแทงนอกจากนี้ในส่วนผสมของดีเอ็นเอจากอื่น ๆสายพันธุ์แบคทีเรียหรือดีเอ็นเอที่สกัดจากตัวอย่าง Fluorescence ที่สัญญาณที่กำหนด โดยดีเอ็นเอเพียงอย่างเดียวถูกแล้วเมื่อเปรียบเทียบกับสัญญาณได้รับจากดีเอ็นเอที่ถูกแทง ไม่แตกต่างกันได้สังเกต ระบุ specificity สูงของโพรบที่ใช้ และไม่เกี่ยวข้องcross-reaction นอกจากนี้ กับไพรเมอร์จาก TMS1ภูมิภาค ส่วนจะขยายนอก T-DNA ซึ่งเป็นที่รู้จักเป็นส่วนหนึ่งที่จะแทรกในกลุ่มโรงงานในระหว่างการติดเชื้อ(Citovsky et al., 2007) ด้วยเหตุนี้ สามารถขยายผลิตภัณฑ์ได้จากแบคทีเรียที่ประกอบด้วย plasmid และไม่ได้มาจากแปลงพืชเซลล์ อย่างไรก็ตาม นี้ได้ถูกสอบสวนในการศึกษาของเราและการใช้งานของผลิตภัณฑ์ TMS1 ภูมิภาคplasmid ตี้จะขยายจากเซลล์แบคทีเรียโดยเฉพาะ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การทดลองข้ามปฏิกิริยากับสายพันธุ์แบคทีเรียที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดได้ดำเนินการในการออกกฎปฏิกิริยาข้ามที่เกี่ยวข้อง สั้น ๆ ,
เอสพี Agrobacterium สอบสวน MGB TMS1 เฉพาะได้รับการทดสอบกับกลุ่มตัวอย่างจากสายพันธุ์แบคทีเรียที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดเท่าที่มีอยู่เพื่อให้แน่ใจว่าเฉพาะเจาะจง ไม่เกี่ยวข้อง (Ct> 40) ทับซ้อนในการเรืองแสงสัญญาณที่ตรวจพบโดยใช้หัววัดTMS1 MGB กำหนดปริมาณของดีเอ็นเอจากสายพันธุ์ที่รู้จักกันถูกวัดโดยเรียลไทม์พีซีอาร์และถูกแทงนอกจากนี้ในส่วนผสมของดีเอ็นเอจากอื่นๆสายพันธุ์แบคทีเรียหรือดีเอ็นเอที่สกัดจากตัวอย่าง เรืองแสงสัญญาณที่ได้รับจากดีเอ็นเอเพียงอย่างเดียวแล้วเมื่อเทียบกับสัญญาณที่ได้รับจากดีเอ็นเอถูกแทง ไม่มีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญที่สังเกตได้แสดงให้เห็นความจำเพาะสูงของการสอบสวนที่ใช้และไม่มีการเกี่ยวข้องข้ามปฏิกิริยา นอกจากนี้ยังมีไพรเมอร์จาก TMS1 ภาคส่วนจะขยายนอก T-ดีเอ็นเอซึ่งเป็นที่รู้จักเป็นส่วนหนึ่งที่จะแทรกอยู่ในจีโนมพืชระหว่างการติดเชื้อ(Citovsky et al., 2007) ด้วยเหตุนี้การขยายผลิตภัณฑ์สามารถได้รับจากเชื้อแบคทีเรียที่มีพลาสมิดและไม่ได้มาจากเซลล์พืชเปลี่ยน อย่างไรก็ตามเรื่องนี้ได้รับการตรวจสอบในการศึกษาและการใช้งานของผลิตภัณฑ์ TMS1 ภูมิภาคจากพลาสมิดTi จะขยายจากเซลล์แบคทีเรียโดยเฉพาะ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ปฏิกิริยาข้ามกับการทดลองที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดชนิดแบคทีเรีย
ได้ออกกฎปฏิกิริยาข้ามที่เกี่ยวข้อง สั้น ๆ ,
Agrobacterium sp . tms1 เฉพาะ mgb probe ทดสอบกับตัวอย่างจากแบคทีเรียชนิดที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด

เท่าที่สามารถใช้ได้เพื่อให้แน่ใจว่า specificity ไม่ที่เกี่ยวข้อง ( CT > 40 ) ทับซ้อนกันของสัญญาณในการ
ถูกตรวจพบใช้ tms1 mgb probe . กําหนด
ปริมาณของดีเอ็นเอจากชนิดที่รู้จักเป็น quantified โดยเรียลไทม์
PCR และนอกจากนี้ spiked ในส่วนผสมของดีเอ็นเอจากแบคทีเรียสายพันธุ์อื่น
หรือสกัดออกมาจากตัวอย่าง เรืองแสง
สัญญาณให้โดยดีเอ็นเอไว้แล้วเมื่อเทียบกับสัญญาณที่ได้จาก DNA
ถูกแทง ไม่แตกต่างกัน
สังเกตแสดงความจำเพาะสูงในการสอบสวนการใช้และไม่มีความเกี่ยวข้อง
ปฏิกิริยาข้าม ยิ่งไปกว่านั้น ด้วยไพรเมอร์จาก tms1
ภาค ส่วนจะขยายนอก t-dna ซึ่งเป็นที่รู้จัก
เป็นส่วนหนึ่งจะแทรกอยู่ในจีโนมพืชในระหว่างการติดเชื้อ
( citovsky et al . , 2007 ) ด้วยเหตุนี้ผลิตภัณฑ์ขยายสามารถ
ได้มาจากแบคทีเรียที่มีพลาสมิดเท่านั้นและ
ไม่ได้เปลี่ยนเซลล์พืช แต่อย่างไรก็ตาม จะสอบสวน
การศึกษาและการใช้ประโยชน์ของผลิตภัณฑ์จากภูมิภาค tms1
Ti พลาสมิดจะขยายจากเซลล์แบคทีเรียโดยเฉพาะ