We report here the first comprehens

We report here the first comprehensive dataset derived by using high-throughput sequencing technology (Illumina) for Sacha inchi. Transcriptome analyses from two developmental stages (the initial stage of seed development and the fast oil accumulation stage) of Sacha Inchi seeds revealed 70,392 unigenes. Expression of 22,179 unigenes differed at least 2-fold between the two libraries. Transcriptome sequences were annotated with Gene Ontology and KEGG Orthology identifiers. Functional categorization of differentially expressed genes reflected a number of important pathways, including the de novo FA biosynthesis, TAG assembly and the formation of PUFAs. Focusing on lipid genes, we identified 397 unigenes associated with the de novo FA biosynthesis, TAG assembly and the formation of PUFAs from Sacha Inchi seeds. These unigenes provide the foundation for further studies on molecular mechanisms underlying oil accumulation and PUFA biosynthesis in Sacha Inchi seeds. In particular, those candidate genes (such as SAD, FAD2, FAD3) associated with PUFA biosynthesis would provide critical clues to reveal the molecular mechanisms underlying the high levels of α-linolenic acid biosynthesis in Sacha Inchi seeds.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ที่นี่เรารายงานชุดข้อมูลอย่างแรกมา โดยลำดับอัตราความเร็วสูงเทคโนโลยี (Illumina) สำหรับ inchi ซาชา Transcriptome วิเคราะห์จากสองพัฒนาระยะ (ระยะเริ่มต้นของการพัฒนาเมล็ด) และขั้นตอนการสะสมน้ำมันอย่างรวดเร็วของเมล็ดซาชา Inchi เปิดเผย 70,392 unigenes ของ 22,179 unigenes แตกต่างน้อย 2-fold ระหว่างรีสอง Transcriptome ลำดับได้ใส่คำอธิบายประกอบ ด้วยตัวระบุยีนภววิทยาและ KEGG Orthology ประเภทหน้าที่ของยีน differentially แสดงผลจำนวนหลักสำคัญ การสังเคราะห์ de novo FA แท็กแอสเซมบลี และการก่อตัวของ PUFAs เราเน้นยีนไขมัน ระบุ 397 unigenes ที่เกี่ยวข้องกับชีวสังเคราะห์ de novo FA แท็กแอสเซมบลี และการก่อตัวของ PUFAs จากเมล็ด Inchi ซาชา Unigenes เหล่านี้ให้เป็นพื้นฐานสำหรับศึกษาเพิ่มเติมในกลไกระดับโมเลกุลที่ต้นสะสมน้ำมันและสังเคราะห์ PUFA ในเมล็ด Inchi ซาชา โดยเฉพาะอย่างยิ่ง ยีนผู้สมัครเหล่านั้น (เช่นซาด FAD2, FAD3) ที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์ PUFA จะให้เบาะแสสำคัญจะเปิดเผยกลไกระดับโมเลกุลที่ต้นระดับสูงของการสังเคราะห์ด้วยกองทัพ-linolenic กรดในเมล็ด Inchi ซาชา

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เรารายงานที่นี่ชุดข้อมูลที่ครบวงจรครั้งแรกที่ได้มาโดยการใช้เทคโนโลยีการจัดลำดับสูง throughput (Illumina) สำหรับ Sacha inchi ยีนวิเคราะห์จากสองขั้นตอนการพัฒนา (ระยะเริ่มแรกของการพัฒนาเมล็ดพันธุ์และการสะสมอย่างรวดเร็วน้ำมันเวที) ของเมล็ด Sacha Inchi เปิดเผย 70,392 unigenes การแสดงออกของ 22179 unigenes แตกต่างกันอย่างน้อย 2 เท่าระหว่างสองห้องสมุด ลำดับยีนถูกข้อเขียนที่มียีนอภิปรัชญาและ KEGG ระบุ Orthology การแบ่งประเภทการทำงานของยีนที่แสดงออกแตกต่างกันสะท้อนให้เห็นถึงจำนวนของทางเดินที่สำคัญรวมทั้งโนโวสังเคราะห์เอฟเอประกอบ TAG และการก่อตัวของ PUFAs มุ่งเน้นไปที่ยีนไขมันเราระบุ unigenes 397 ที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์โนโวเดเอฟเอประกอบ TAG และการก่อตัวของ PUFAs จากเมล็ด Sacha Inchi unigenes เหล่านี้ให้มูลนิธิเพื่อการศึกษาเพิ่มเติมเกี่ยวกับกลไกระดับโมเลกุลสะสมน้ำมันพื้นฐานและการสังเคราะห์ PUFA ในเมล็ด Sacha Inchi โดยเฉพาะอย่างยิ่งผู้ที่ยีน (เช่นเศร้า fad2, FAD3) ที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์ PUFA จะให้เบาะแสสำคัญที่จะเผยให้เห็นกลไกระดับโมเลกุลพื้นฐานระดับสูงของการสังเคราะห์กรดลิโนลิαในเมล็ดซาชา Inchi

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เรารายงานที่นี่ครั้งแรกที่ครอบคลุมข้อมูลที่ได้มาโดยการใช้เทคโนโลยีช่วยการจัดลำดับ ( Illumina ) ซาชา inchi . ทราน ริปโตมวิเคราะห์พัฒนาการจากสองขั้นตอน ( ขั้นตอนแรกของการพัฒนาของเมล็ดและการสะสมน้ำมันอย่างรวดเร็วเวที ) ของซาช่า inchi เมล็ด พบ 70392 unigenes . การแสดงออกของ 22179 อย่างน้อยถึง unigenes แตกต่างระหว่างสองห้องสมุดทราน ริปโตมลำดับถูกบันทึกย่อที่มียีนอภิปรัชญาและ KEGG เป็นต้น orthology ระบุ . ประเภทการทำงานของยีนที่แสดงออกแตกต่างกันสะท้อนให้เห็นถึงจำนวนของเส้นทางที่สำคัญ ได้แก่ อีกครั้ง เอฟเอ ในการประกอบแท็กและการก่อตัวของกรดไขมัน เน้นลิปิดยีน เราระบุว่า unigenes เกี่ยวข้องกับอีกครั้งในเอฟเอ ,ประกอบแท็กและการก่อตัวของกรดไขมันจากเมล็ด Sacha inchi . unigenes เหล่านี้ให้มูลนิธิเพื่อการศึกษาต่อในกลไกพื้นฐานและน้ำมันสะสมในเมล็ด Sacha inchi PUFA ในโมเลกุล โดยเฉพาะบรรดาผู้สมัครยีน ( เช่น fad2 , เศร้า ,fad3 ) ที่เกี่ยวข้องกับภูฟ้าในจะให้วิจารณ์ปมที่จะเปิดเผยกลไกระดับโมเลกุลในระดับสูงของกรดไลโนเลนิกในวิถีการสังเคราะห์แอลฟา สัจจะ inchi เมล็ด .