ResultsAssemblages of endophytic ba

Results
Assemblages of endophytic bacteria in chili pepper A total of 283 endophytic bacteria were isolated from leaf, stem and root samples of 45 chili pepper plants. Total 900 tissue segments were plated where 300 tissue segments were plated in every tissue samples. The general isolation frequency was 0.31.
However, the IR and IF in leaf, stem and root samples were 4.9%, 44.9% & 50.2% and 0.05, 0.42 & 0.47, respectively (Table 1).
Maximum number of isolates was recovered from root samples, whereas leaf samples showed lower endophytic bacterial assemblages.
According to the macromorphological characteristics, endophytic bacteria were grouped into 44 morpho-groups and representative isolates were assigned to the genus or species level based on 16S rDNA gene sequence analysis.
Fourteen distinctive bacterial genotypes were detected at a >97% sequence similarity threshold (Table 2).
A comparison of these sequences with the databases of valid species by using the EzTaxon server showed a very high sequence similarity to the type strains of the corresponding species.
The isolate CNU082012 showed 100% sequence similarity with the sequences of bacteria Bacillus methylotrophicus CBMB205T.
This GenBank strain is type strain.
Many isolates showed 99-100% sequence similariy with the type strain Pseudomonas aeruginosa LMG 1242T and the isolates were CNU082120, CNU082123, CNU082135, CNU082137, CNU082140, CNU082141 and CNU082142 (Fig.2).
Isolates CNU082015, CNU082021, CNU082022, CNU082025 and CNU082026 were 99% identical to the type strain Bacillus aryabhattai B8W22T.
The isolate CNU082036 showed 96.1% sequence similarity with its reference strains. In
some cases, the sequence similarity below 97% is not acceptable for the identification of bacteria.
But the phylogenetic tree showed high bootstrap value (92%) which supported that the isolate would be Pantoea anthophila (Fig. 3).
Results showed that the most abundant genus was Pseudomonas followed by Bacillus and Burkholderia.
A diverse range of other bacterial taxa were isolated and identified, including isolates of the genera Actinobacter, Arthrobacter, Enterobacter, Escherichia, Kitasatospora, Pandoraea, Pantoea, Rhizobium, Ralstonia, Paenibacillus and
Serratia.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ผลลัพธ์Assemblages ของแบคทีเรีย endophytic ในพริก A จำนวน 283 endophytic แบคทีเรียที่แยกจากตัวอย่างก้าน ใบ และรากของพืชพริก 45 ส่วนเนื้อเยื่อ 900 รวมถูกชุบ 300 เนื้อเยื่อส่วนที่ถูกชุบในทุกตัวอย่างเนื้อเยื่อ ความถี่ทั่วไปแยกเป็น$ 0.31อย่างไรก็ตาม IR และถ้าในใบไม้ เกิด และรากตัวอย่าง 4.9%, 44.9% และ 50.2 สา% และ 0.05, 0.42 และ 0.47 ตามลำดับ (ตารางที่ 1) จำนวนแยกถูกกู้คืนจากตัวอย่างราก ในขณะที่ตัวอย่างใบแสดงให้เห็นว่า assemblages แบคทีเรีย endophytic ล่าง ตามลักษณะ macromorphological แบคทีเรีย endophytic ถูกจัดกลุ่มเป็นกลุ่ม morpho 44 และแยกพนักงานถูกกำหนดไว้ในระดับสกุลหรือชนิดที่ขึ้นอยู่กับยีน 16S rDNA วิเคราะห์ พบศึกษาจีแบคทีเรียเด่นสิบสี่โนไทป์ที่เป็น > 97% ลำดับคล้ายจำกัด (ตารางที่ 2) การเปรียบเทียบลำดับเหล่านี้กับฐานข้อมูลชนิดที่ถูกต้องโดยใช้เซิร์ฟเวอร์ EzTaxon แสดงให้เห็นลำดับสูงมากคล้ายคลึงกับสายพันธุ์ชนิดพันธุ์ที่สอดคล้องกัน CNU082012 แยกพบ 100% ลำดับคล้ายกับลำดับของแบคทีเรียคัด methylotrophicus CBMB205T ต้องใช้ GenBank นี้จะต้องใช้ชนิด แยกหลายพบ similariy ลำดับ 99-100% กับชนิดสายพันธุ์ Pseudomonas aeruginosa LMG 1242T และการแยกได้ CNU082120, CNU082123, CNU082135, CNU082137, CNU082140, CNU082141 และ CNU082142 (Fig.2) แยก CNU082015, CNU082021, CNU082022, CNU082025 และ CNU082026 ได้ 99% เหมือนกับชนิดสายพันธุ์คัด aryabhattai B8W22T CNU082036 แยกพบ 96.1% ลำดับคล้ายกับสายพันธุ์ของอ้างอิง ในบางกรณี เฉพาะลำดับต่ำกว่า 97% ไม่ยอมรับได้สำหรับรหัสของแบคทีเรีย แต่ต้น phylogenetic แสดงให้เห็นว่าการเริ่มต้นระบบค่าสูง (92%) ที่สนับสนุนว่าการแยกจะเป็น Pantoea anthophila (Fig. 3)ผลลัพธ์แสดงให้เห็นว่า ตระกูลนี้อุดมสมบูรณ์มากที่สุดคือ ลีตามคัดและ Burkholderia แยกต่างหาก และ ระบุ รวมถึงแยกของสกุล Actinobacter, Arthrobacter, Enterobacter, Escherichia, Kitasatospora, Pandoraea, Pantoea ไรโซเบียม Ralstonia, Paenibacillus taxa แบคทีเรียอื่น ๆ หลากหลาย และSerratia

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ผลResults
assemblages รวม ความถี่แยกทั่วไป Assemblages of endophytic bacteria in chili pepper A total of 283 endophytic bacteria were isolated from leaf, stem and root samples of 45 chili pepper plants. Total 900 tissue segments were plated where 300 tissue segments were plated in every tissue samples. The general isolation frequency was 0.31.
อย่างไรก็ตาม However, the IR and IF in leaf, stem and root samples were 4.9%, 44.9% & 50.2% and 0.05, 0.42 & 0.47, respectively (Table 1).
จำนวนสูงสุดของเชื้อหายจากราก ตัวอย่างในขณะที่กลุ่มตัวอย่างใบแสดงให้เห็น Maximum number of isolates was recovered from root samples, whereas leaf samples showed lower endophytic bacterial assemblages.
ตามลักษณะ According to the macromorphological characteristics, endophytic bacteria were grouped into 44 morpho-groups and representative isolates were assigned to the genus or species level based on 16S rDNA gene sequence analysis.
สิบสี่สายพันธุ์แบคทีเรียที่โดดเด่นเป็น ตรวจพบที่Fourteen distinctive bacterial genotypes were detected at a >97% sequence similarity threshold (Table 2).
การเปรียบเทียบลำดับเหล่านี้กับฐานข้อมูลของสปีชีส์ที่ถูกต้องโดยใช้เซิร์ฟเวอร์ A comparison of these sequences with the databases of valid species by using the EzTaxon server showed a very high sequence similarity to the type strains of the corresponding species.
แยก The isolate CNU082012 showed 100% sequence similarity with the sequences of bacteria Bacillus methylotrophicus CBMB205T.
นี้เป็นสายพันธุ์ This GenBank strain is type strain.
ไอโซเลทจำนวนมากแสดงให้เห็นถึงลำดับที่ Many isolates showed 99-100% sequence similariy with the type strain Pseudomonas aeruginosa LMG 1242T and the isolates were CNU082120, CNU082123, CNU082135, CNU082137, CNU082140, CNU082141 and CNU082142 (Fig.2).
แยก Isolates CNU082015, CNU082021, CNU082022, CNU082025 and CNU082026 were 99% identical to the type strain Bacillus aryabhattai B8W22T.
แยก The isolate CNU082036 showed 96.1% sequence similarity with its reference strains. In
some cases, the sequence similarity below 97% is not acceptable for the identification of bacteria.
But the phylogenetic tree showed high bootstrap value (92%) which supported that the isolate would be Pantoea anthophila (Fig. 3).
Results showed that the most abundant genus was Pseudomonas followed by Bacillus and Burkholderia.
A diverse range of other bacterial taxa were isolated and identified, including isolates of the genera Actinobacter, Arthrobacter, Enterobacter, Escherichia, Kitasatospora, Pandoraea, Pantoea, Rhizobium, Ralstonia, Paenibacillus and
Serratia.

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ผลลัพธ์
ทะเลของทะเลของแบคทีเรียเอนโดไฟท์ในพริกทั้งหมด 283 แบคทีเรียเอนโดไฟท์ที่แยกได้จากใบ ลำต้น และราก จำนวน 45 พริกพืช รวม 900 เนื้อเยื่อส่วนที่เป็นเนื้อเยื่อส่วนที่ถูกชุบ ชุบ 300 ทุกตัวอย่างเนื้อเยื่อ . แยกทั่วไปความถี่ 0.31 .
แต่ IR และถ้าในใบ ลำต้นและราก จำนวน 4.9 ร้อยละ 44.9 % & 50.2 % 005 , 0.42 & 0.47 ตามลำดับ ( ตารางที่ 1 )
จำนวนสูงสุดของสายพันธุ์คือหายจากตัวอย่างราก ในขณะที่ตัวอย่างใบแสดงลดราแบคทีเรียทะเลของทะเล .
ตามลักษณะ macromorphological แบคทีเรียเอนโดไฟท์ , แบ่งตามกลุ่มและเป็นตัวแทนจาก 44 Morpho ได้รับสกุลชนิด หรือระดับบนพื้นฐานของ 16S rDNA การวิเคราะห์ลำดับเบสของยีน
14 ตรวจพบแบคทีเรียพันธุ์ที่โดดเด่น > 97% ความเหมือนของลำดับ ( ตารางที่ 2 ) .
เปรียบเทียบลำดับเหล่านี้มีฐานข้อมูลของสายพันธุ์ที่ถูกต้อง โดยใช้ eztaxon เซิร์ฟเวอร์แสดงความเหมือนลำดับสูงมากกับชนิดสายพันธุ์ของชนิดที่สอดคล้องกัน
แยก cnu082012 พบ 100% ลำดับความเหมือนกับลำดับของแบคทีเรีย Bacillus methylotrophicus cbmb205t .
นี้พบสายพันธุ์คือชนิดสายพันธุ์ หลายสายพันธุ์ พบ 99-100
% ตามลำดับ similariy กับชนิดสายพันธุ์ Pseudomonas aeruginosa lmg 1242t และไอโซเลท cnu082120 cnu082123 , cnu082135 cnu082137 cnu082140 , , , , และ cnu082141 cnu082142 ( fig.2 ) cnu082015
ไอโซเลท ,cnu082021 cnu082022 cnu082025 , และ , cnu082026 เป็น 99% เหมือนประเภทสายพันธุ์ Bacillus aryabhattai b8w22t .
แยก cnu082036 96.1 % มีความเหมือนกับลำดับของสายพันธุ์อ้างอิง . ใน
บางกรณี ลำดับความเหมือนข้างล่าง 97% ไม่เป็นที่ยอมรับสำหรับการพิสูจน์เอกลักษณ์ของแบคทีเรีย
แต่ต้นไม้ phylogenetic พบค่าบูทสูง ( ร้อยละ 92 ) ซึ่งสนับสนุนว่าเชื้อจะ pantoea anthophila ( รูปที่ 3 ) .
พบว่าสกุลที่มีมากที่สุดคือส่วนของเชื้อ Burkholderia และตามด้วย .
หลากหลายและแบคทีเรียอื่น ๆถูกแยกและระบุ รวมทั้งเชื้อสกุล actinobacter ยา , Enterobacter , Escherichia , ,kitasatospora pandoraea pantoea ไรโซเบียม , , , ,
ralstonia paenibacillus , และเซอร์ราเทีย .