2.2. Scoring of microsatellite
Six microsatellite loci, Cga01, Cga02, Cga03, Cga06, Cga09 and Cga10 were amplified from the individual DNA samples using the primers developed by Galbusera et al. (1996). Each 10 μl total reaction contained 5–10 ng of DNA templates, 0.25 pmol each of the forward
and reverse primers, 1X PCR buffer, 1.5 mM MgCl2, 100 μM dNTP, and 0.2 unit of Taq DNA Polymerase (Fermentas). The PCR reactions were performed in a PTC-100TM Programmable Thermal Controller (MJ Research, Inc.) employing PCR profiles as follows: predenaturation at
95 °C for 5 min; followed by 35 cycles of: 30 s denaturation at 95 °C,
30 s of annealing at 52–56 °C and 1 min extension at 72 °C; followed
by 72 °C final extension for 5 min prior to storage at 4 °C.
2.2. การให้คะแนนของชนิด microsatelliteหกชนิด microsatellite ตำแหน่งอ่อนแอ Cga01, Cga02, Cga03, Cga06, Cga09 และ Cga10 ถูกขยายจากตัวอย่างดีเอ็นเอแต่ละโดยใช้ไพรเมอร์ที่พัฒนาโดย Galbusera et al. (1996) แต่ละปฏิกิริยาทั้งหมดของ 10 μl อยู่ 5-10 ฉบับของดีเอ็นเอแม่แบบ ราคาชิ้นละ 0.25 pmol ของไปข้างหน้าและย้อนกลับไพรเมอร์ บัฟเฟอร์ X PCR 1, 1.5 มม. MgCl2, 100 μ m dNTP และ 0.2 หน่วยของ Taq DNA พอลิเมอเรส (Fermentas) ดำเนินการในตัว PTC 100TM โปรแกรมความร้อนควบคุม (MJ วิจัย Inc.) ใช้โพรไฟล์ PCR ดังปฏิกิริยา PCR: predenaturation เวลา95 ° C เป็นเวลา 5 นาที ตาม ด้วยรอบ 35 ของ: 30 s แปรสภาพที่ 95 ° C30 ของหลอมที่ 52 – 56 ° C และนามสกุล 1 นาทีที่อุณหภูมิ 72 ° C ตามด้วยนามสกุลสุดท้าย 72 ° C 5 นาทีก่อนเก็บที่ 4 องศาเซลเซียส
การแปล กรุณารอสักครู่..
2.2 เกณฑ์การให้คะแนนของไมโคร
หกตำแหน่งไมโคร Cga01, Cga02, Cga03, Cga06, Cga09 และ Cga10 ถูกขยายจากตัวอย่างดีเอ็นเอของแต่ละบุคคลโดยใช้ไพรเมอร์ที่พัฒนาโดย Galbusera et al, (1996) ละ 10 ไมโครลิตรปฏิกิริยาทั้งหมดที่มีอยู่ประมาณ 5-10 NG ของแม่ดีเอ็นเอ 0.25 pmol แต่ละข้างหน้า
และย้อนกลับไพรเมอร์, 1X PCR บัฟเฟอร์ 1.5 มิลลิ MgCl2 100 ไมครอน dNTP และ 0.2 หน่วย Taq DNA Polymerase (Fermentas) ปฏิกิริยา PCR ได้ดำเนินการใน PTC-100TM โปรแกรมได้ความร้อน Controller (MJ Research, Inc. ) จ้างโปรไฟล์ PCR ดังนี้ predenaturation ที่
95 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 5 นาที; ตามด้วย 35 รอบ: 30 S denaturation ที่ 95 องศาเซลเซียส
เป็นเวลา 30 วินาทีของการหลอมที่ 52-56 องศาเซลเซียสและต่ำสุด 1 ส่วนขยายที่ 72 ° C; ตาม
72 ° C ขยายสุดท้ายเป็นเวลา 5 นาทีก่อนที่จะมีการเก็บรักษาที่ 4 องศาเซลเซียส
การแปล กรุณารอสักครู่..