2.4. Data analysisIn preliminary st

2.4. Data analysis
In preliminary statistical analyses, the day 0 (initial) samples re-
vealed strong between site differences in sediment properties and mac-
rofaunal community structure. These initial, site-specific differences in
community structure persisted throughout the experiment and resulted
in significant site × treatment and site × time interactions in subse-
quent uni- and multi-variate analyses (described below). Recognising
these initial differences, we chose to present separate analyses for
each site to better focus on the effects of treatment and time, and to bet-
ter illustrate differences in the response between sites.
Non-metric multi-dimensional scaling (nMDS) analysis, using
Bray–Curtis similarity matrices, was used on raw macrofaunal abun-
dance data to plot and compare benthic community structure among
treatments, as well as through time. We analysed these changes sta-
tistically using a repeated measures permutational multivariate
analysis of variance (PERMANOVA, Bray–Curtis similarity). Time
and treatment were treated as fixed factors (with 5 and 3 levels, re-
spectively), with plot (6 levels) treated as a random factor nested
within treatment (Anderson et al., 2008). PERMANOVA pair-wise
tests were used to determine where significant treatment and time
effects occurred, and SIMPER analysis determined the taxa that con-
tributed to the dissimilarity/similarity in community structure be-
tween treatments. The percent dissimilarity to standard deviation
ratio (Diss/SD) was also used to determine whether the taxa
identified in SIMPER analyses were good discriminating taxa (Diss/
SD N 1.3) (Clarke and Warwick 1994). Raw data were used for multi-
variate analyses as transformations did not alter the results. All mul-
tivariate analyses were performed using the PRIMER (with the
PERMANOVA A+ addition) statistical software program (Plymouth
Routines In Multivariate Ecological Research; Anderson et al., 2008;
Clarke and Gorley, 2006).
A repeated measures analysis (two-way, fixed factor, repeated mea-
sures analyses of variance (ANOVA)) was also used to test treatment ef-
fects on univariate variables (sediment properties, and macrofauna
taxonomic richness and abundance) through time. Newman–Keuls
post-hoc tests were used to determine differences between treatments
for each sample date. Raw data (including the initial day 0 samples,
which we analysed via t-tests) conformed to assumptions of homoge-
neity of variances and normality, therefore no transformations were
necessary. Univariate analyses were conducted using the STATISTICA
software package (Statsoft Inc.)

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.4 วิเคราะห์ข้อมูลวิเคราะห์ทางสถิติเบื้องต้น ในวัน 0 (เริ่มต้น) ตัวอย่าง re-vealed แข็งแรงระหว่างความแตกต่างของไซต์ในตะกอนคุณสมบัติและ mac -โครงสร้างชุมชน rofaunal ความแตกต่างเหล่านี้เริ่มต้น เฉพาะในโครงสร้างชุมชนทดลองที่ยังคงอยู่ และส่งผลให้รักษาฟิลด์สำคัญไซต์และไซต์โต้ตอบเวลาซื้อใน subse-quent variate uni และ multi วิเคราะห์ (อธิบายด้านล่าง) ตระหนักถึงความแตกต่างเหล่านี้เริ่มต้น เราเลือกที่จะวิเคราะห์แยกต่างหากสำหรับการนำเสนอแต่ละไซต์ เพื่อเน้นผลของการรักษาและเวลาที่ดี และใกล้เคียง-เธอแสดงให้เห็นถึงความแตกต่างในการตอบสนองระหว่างอเมริกาไม่ใช่วัดหลายมิติมาตราส่วนวิเคราะห์ (nMDS) ใช้เมทริกซ์คล้าย bray – เคอร์ทิส ใช้ใน abun macrofaunal ดิบ -ข้อมูลเพื่อพล็อต และการเปรียบเทียบโครงสร้างชุมชนธรรมชาติระหว่างการเต้นรำรักษา เช่นเป็นผ่านเวลา เรา analysed สตาเปลี่ยนแปลงเหล่านี้-tistically ที่ใช้การวัดซ้ำ permutational multivariateวิเคราะห์ความต่าง (PERMANOVA คล้าย Bray – เคอร์ทิส) เวลาและการรักษาได้รับการรักษาเป็นปัจจัยคงที่ (มี 5 ระดับ และ 3 ระดับ re-spectively), กับพล็อต (ระดับ 6) เป็นตัวสุ่มซ้อนในการรักษา (แอนเดอร์สันและ al., 2008) PERMANOVA pair-wiseใช้ทดสอบเพื่อตรวจสอบสำคัญรักษาและเวลาผลที่เกิดขึ้น และวิเคราะห์ SIMPER กำหนด taxa คอนที่-tributed เพื่อ dissimilarity/ความ คล้ายกันในชุมชน เป็นโครงสร้าง-tween รักษา Dissimilarity ร้อยละส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐานเพื่ออัตราส่วน (Diss/SD) ถูกใช้เพื่อกำหนดว่า taxaระบุใน SIMPER วิเคราะห์ได้ดีรับการจำแนก taxa (Diss /SD N 1.3) (คลาร์กและวอร์วิค 1994) ใช้ข้อมูลดิบสำหรับ multi-วิเคราะห์ variate เป็นแปลงได้เปลี่ยนผลลัพธ์ ทั้งหมดมูล-tivariate วิเคราะห์ได้ดำเนินการโดยใช้พื้นที่ (ด้วยการโปรแกรมซอฟต์แวร์สถิติ PERMANOVA A + เพิ่ม) (พลีมัธคำสั่งตัวแปรพหุวิจัยระบบนิเวศ แอนเดอร์สันและ al., 2008คลาร์กและ Gorley, 2006)การวิเคราะห์การวัดซ้ำ (คูณสอง ถาวร mea ซ้ำ-sures วิเคราะห์ของผลต่าง (การวิเคราะห์ความแปรปรวน)) ถูกใช้เพื่อทดสอบการรักษา ef -fects บนตัวแปรอย่างไร univariate (ตะกอนคุณสมบัติ และ macrofaunaอนุกรมวิธานร่ำรวยและความอุดมสมบูรณ์) ผ่านเวลา นิวแมน-Keulsทดสอบโพสต์แบบเฉพาะกิจถูกใช้เพื่อกำหนดความแตกต่างระหว่างการรักษาตัวอย่างการ ข้อมูลดิบ (รวมถึงตัวอย่างการเริ่มต้นวันที่ 0ซึ่งเรา analysed ผ่านการทดสอบ t) ตามสมมติฐานของ homoge-neity ต่างและ normality ดังนั้นการแปลงไม่ได้จำเป็น วิเคราะห์อย่างไร Univariate ได้ดำเนินการใช้ STATISTICAแพคเกจซอฟต์แวร์ (Statsoft Inc.)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.4 การวิเคราะห์ข้อมูลในการวิเคราะห์ทางสถิติเบื้องต้นวันที่ 0 (เริ่มต้น) ตัวอย่างใหม่ vealed ที่แข็งแกร่งระหว่างความแตกต่างของเว็บไซต์ในคุณสมบัติของดินตะกอนและ mac- โครงสร้างชุมชน rofaunal เหล่านี้เริ่มต้นที่แตกต่างกันเว็บไซต์ที่เฉพาะเจาะจงในโครงสร้างชุมชนยืนกรานตลอดการทดลองและส่งผลให้ในเว็บไซต์อย่างมีนัยสำคัญ×รักษาและการเว็บไซต์×ปฏิสัมพันธ์เวลาในsubse- Quent หนึ่ง - และการวิเคราะห์หลายตัวแปร (อธิบายด้านล่าง) ตระหนักถึงความแตกต่างเหล่านี้เริ่มต้นที่เราเลือกที่จะนำเสนอการวิเคราะห์แยกต่างหากสำหรับแต่ละเว็บไซต์จะโฟกัสที่ดีขึ้นเกี่ยวกับผลกระทบของการรักษาและเวลาและการเดิมพันเธอแสดงให้เห็นถึงความแตกต่างในการตอบสนองระหว่างเว็บไซต์. ไม่ปรับตัวชี้วัดหลายมิติ (nMDS) การวิเคราะห์ โดยใช้การฝึกอบรมความคล้ายคลึงกันBray-เคอร์ติถูกนำมาใช้ในดิบ macrofaunal abun- ข้อมูลเต้นรำไปกับพล็อตและเปรียบเทียบโครงสร้างชุมชนของสัตว์หน้าดินในหมู่การรักษาเช่นเดียวกับการผ่านช่วงเวลาที่ เราวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงเหล่านี้สถานีซึ่งtistically ใช้มาตรการซ้ำ permutational หลายตัวแปรการวิเคราะห์ความแปรปรวน(PERMANOVA คล้ายคลึงกัน Bray-Curtis) เวลาและการรักษาที่ได้รับการรักษาเป็นปัจจัยคงที่ (5 และ 3 ระดับอีกครั้ง spectively) กับพล็อต (6 ระดับ) ถือว่าเป็นปัจจัยสุ่มซ้อนกันภายในการรักษา(แอนเดอ et al., 2008) PERMANOVA คู่ฉลาดทดสอบถูกนำมาใช้ในการตรวจสอบการรักษาที่สำคัญและเวลาที่ผลกระทบที่เกิดขึ้นและการวิเคราะห์simper กำหนดแท็กซ่าที่จะประกอบด้วยtributed กับความแตกต่างกัน / ความคล้ายคลึงกันในโครงสร้างชุมชนโดยสลับการรักษาทวี ความแตกต่างในการร้อยละส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐานอัตราส่วน (Diss / SD) ก็ยังใช้เพื่อตรวจสอบว่าแท็กซ่าที่ระบุไว้ในการวิเคราะห์simper มีแท็กซ่าแบ่งแยกดี (Diss / SD ไม่มี 1.3) (คลาร์กและวอร์วิค 1994) ข้อมูลดิบที่ถูกนำมาใช้สำหรับหลายตัวแปรการวิเคราะห์เป็นแปลงไม่ได้เปลี่ยนแปลงผล ทุก ๆ ได้วิเคราะห์tivariate ถูกดำเนินการโดยใช้รองพื้น (ที่มีPERMANOVA A + เพิ่มเติม) โปรแกรมซอฟต์แวร์ทางสถิติ (พลีมัปฏิบัติในหลายตัวแปรเชิงนิเวศน์วิจัยเดอร์สัน, et al, 2008;. คลาร์กและ Gorley 2006). การวิเคราะห์วัดซ้ำ (สองทาง ปัจจัยคงซ้ำเด็ดขาดยังคงใช้มาตรการวิเคราะห์ความแปรปรวน(ANOVA)) นอกจากนี้ยังใช้ในการทดสอบประสิทธิผลการรักษาfects กับตัวแปร univariate (คุณสมบัติของดินตะกอนและสัตว์ทะเลความร่ำรวยและความอุดมสมบูรณ์อนุกรมวิธาน) ผ่านช่วงเวลาที่ นิวแมน Keuls ทดสอบ post-hoc ถูกใช้ในการกำหนดความแตกต่างระหว่างการรักษาในแต่ละวันตัวอย่าง ข้อมูลดิบ (รวมทั้งวันเริ่มต้น 0 ตัวอย่างที่เราวิเคราะห์ผ่านการทดสอบเสื้อ) สอดคล้องกับสมมติฐานของลักษณะเหมือนกันneity ความแปรปรวนและภาวะปกติจึงไม่มีการเปลี่ยนแปลงเป็นสิ่งที่จำเป็น การวิเคราะห์ univariate ได้ดำเนินการโดยใช้ STATISTICA แพคเกจซอฟต์แวร์ (Statsoft อิงค์)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.4 . การวิเคราะห์ข้อมูลในการวิเคราะห์ทางสถิติเบื้องต้น
, วัน 0 ( เริ่มต้น ) ตัวอย่าง Re -
vealed ที่แข็งแกร่งระหว่างเว็บไซต์แตกต่างในตะกอนดินและคุณสมบัติ Mac --
rofaunal ชุมชนโครงสร้าง เหล่านี้เริ่มต้นความแตกต่างเฉพาะใน
โครงสร้างชุมชนยืนกรานตลอดการทดลองและผลในการรักษาเว็บไซต์
ที่สำคัญและเว็บไซต์××เวลาปฏิกิริยาใน subse -
เคว็น Uni - และหลายวิเคราะห์ variate ( อธิบายด้านล่าง ) ตระหนักถึงความแตกต่าง
เริ่มต้นนี้เราเลือกที่จะนำเสนอการวิเคราะห์แยกต่างหากสำหรับแต่ละเว็บไซต์
ดีขึ้น ผลของการรักษาและเวลาและการเดิมพัน -
เธอแสดงให้เห็นถึงความแตกต่างในการตอบสนองระหว่างเว็บไซต์ ไม่ใช่มิติมาตราส่วนระบบเมตริก
( nmds ) การวิเคราะห์โดยใช้
เบรย์ ( เคอร์ติสความเหมือนเมทริกซ์ใช้กับวัตถุดิบ macrofaunal Abun -
เต้นข้อมูลพล็อตและเปรียบเทียบโครงสร้างชุมชนของ
รักษาสัตว์ ตลอดจนถึงเวลา เราได้วิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงเหล่านี้ STA -
tistically โดยใช้การวัดซ้ำ permutational เมื่อวิเคราะห์ความแปรปรวนทางเดียว ( permanova
, เคอร์ติส เบรย์ ( ความเหมือน ) และได้รับการรักษาเป็นเวลา
รักษาปัจจัยคงที่ ( มี 5 ระดับ 3
spectively Re - )กับแผน ( ระดับ 6 ) ถือว่าเป็นปัจจัยสุ่มซ้อน
ภายในการรักษา ( Anderson et al . , 2008 ) permanova คู่ปัญญา
แบบที่ใช้ในการตรวจสอบการรักษาที่สำคัญและเวลา ผลที่เกิดขึ้น และ วิเคราะห์ กำหนดและยิ้มแห้งๆที่ต่อต้าน -
tributed เพื่อความเหมือนในความแตกต่าง / โครงสร้างชุมชนเป็น -
ก่อนการรักษา เปอร์เซ็นต์ความแตกต่าง

ส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐานอัตราส่วน ( เย้ย / SD ) ถูกใช้เพื่อตรวจสอบว่าซ่า
ระบุในการวิเคราะห์จำแนกและยิ้มแห้งๆดี ( เย้ย /
SD ( 1.3 ) ( คลาร์กและ Warwick 1994 ) ข้อมูลดิบถูกใช้สำหรับหลาย --
variate วิเคราะห์เป็นแบบไม่ได้เปลี่ยนผล ทั้งหมดมุล -
tivariate วิเคราะห์ข้อมูลโดยใช้ไพรเมอร์ ( ด้วย
permanova นอกจาก ) โปรแกรมซอฟต์แวร์ ( พลีมัธ
สถิติกิจวัตรในการวิจัยนิเวศวิทยาหลายตัวแปร ; Anderson et al . , 2008 ;
คลาร์กและ gorley , 2006 ) .
วัดซ้ำ ( สองทาง การวิเคราะห์ปัจจัยคงที่ และทำซ้ำ กฟน. -
อีกครั้งการวิเคราะห์ความแปรปรวน ( ANOVA ) ถูกใช้เพื่อทดสอบการรักษา EF -
fects บน 2 ตัวแปร ( คุณสมบัติ ดินตะกอน และละเว้น
และความมั่งคั่งและความอุดมสมบูรณ์ ) ผ่านเวลา นิวแมน คลูส์
จำกัดPost Hoc Tests ถูกใช้เพื่อกำหนดความแตกต่างระหว่างการรักษา
สำหรับแต่ละตัวอย่างวันที่ ข้อมูลดิบ ( รวมทั้งวันเริ่มต้น 0 ตัวอย่าง
ซึ่งเราวิเคราะห์ผ่านแบบ ) สอดคล้องกับสมมติฐานของ homoge -
neity ความแปรปรวนของการแจกแจงแบบปกติและดังนั้นไม่มีการแปลงเป็น
ที่จําเป็น 2 วิเคราะห์การใช้ statistica
แพคเกจซอฟต์แวร์ ( StatSoft Inc . )