Fig. 2. Phylogenetic trees of the polymerase ORF1b (RdRp) and HSP70 homologue genes of viruses in the family Closteroviridae showing the positioning of the two proposed new species in the genus Closterovirus. The trees were generated from codon-aligned nucleotide sequences using MEGA4 (Neighbor-Joining, Maximum Composite Likelihood method with 10,000 bootstrap replicates. Bootstrap values shown when >60%). The RdRp trees uses Cucumber mosaic virus (CMV) as outgroup and the HSP70 tree is rooted with the Arabidopsis thaliana putative heat shock protein 70, AAN71949. The trees are based on those presented by Tzanetakis et al. (2007). Abbreviations are: BPYV, Beet pseudoyellows virus; BYSV, Beet yellow stunt virus; BYV, Beet yellows virus; BYVaV, Blackberry yellow veinassociated virus; CTV, Citrus tristeza virus; CYSDV, Cucurbit yellow stunting disorder virus; GLRaV-1, Grapevine leafroll-associated virus 1; GLRaV-2, Grapevine leafroll-associated virus 2; GLRaV-3, Grapevine leafroll-associated virus 3; LChV-1, Little cherry virus 1; LChV-2, Little cherry virus 2; LIYV, Lettuce infectious yellows virus; MV-1, Mint virus 1; MVBaV, Mint vein banding-associated virus; PMWaV-1, Pineapple mealybug wilt-associated virus 1; PMWaV-2, Pineapple mealybug wilt-associated virus 2; PYVV, Potato yellow vein virus; RLMV, Raspberry mottle virus; SCFaV, Strawberry chlorotic
fleck associated virus; SPaV, Strawberry pallidosis-associated virus; SPCSV, Sweet potato chlorotic stunt virus; ToCV, Tomato chlorosis virus.
Fig. 2 ต้นไม้ phylogenetic ของพอลิเมอเรส ORF1b (RdRp) และยีน homologue HSP70 ไวรัสในตระกูล Closteroviridae ที่แสดงตำแหน่งของสปีชีส์ใหม่นำเสนอสองในสกุล Closterovirus ต้นไม้ถูกสร้างจากลำดับของนิวคลีโอไทด์ที่ตำแหน่งรหัสพันธุกรรมที่ใช้ MEGA4 (เพื่อนบ้านรวม วิธีการโอกาสสูงสุดประกอบ ด้วยเหมือนกับเริ่มต้นระบบ 10000 Bootstrap แสดงเมื่อค่า > 60%) RdRp ต้นไม้ใช้แตงกวาไวรัส (CMV) เป็น outgroup และต้น HSP70 รากกับ Arabidopsis thaliana ร้อน putative ช็อกโปรตีน 70, AAN71949 ต้นไม้ขึ้นอยู่กับผู้นำเสนอโดย Tzanetakis et al. (2007) มีคำย่อ: BPYV ผักชนิดหนึ่ง pseudoyellows ไวรัส BYSV ผักชนิดหนึ่งสีเหลืองจักรยานไวรัส BYV ผักชนิดหนึ่งออกไวรัส BYVaV, Blackberry veinassociated เหลืองไวรัส CTV ไวรัส tristeza ส้ม สีเหลือง stunting โรคไวรัส CYSDV, Cucurbit GLRaV-1, Grapevine สัมพันธ์ leafroll ไวรัส 1 GLRaV-2, Grapevine สัมพันธ์ leafroll ไวรัส 2 GLRaV-3, Grapevine สัมพันธ์ leafroll ไวรัส 3 LChV-1 เชอร์รี่น้อยไวรัส 1 LChV-2 เชอร์รี่น้อยไวรัส 2 ออก LIYV ผักกาดหอมที่ติดเชื้อไวรัส MV-1 มิ้นท์ไวรัส 1 MVBaV มิ้นท์เส้นเลือดไวรัสแถบเชื่อมโยง PMWaV-1 ไวรัสการเหี่ยวเกี่ยวข้องเพลี้ยแป้งสับปะรด 1 PMWaV-2 ไวรัสการเหี่ยวเกี่ยวข้องเพลี้ยแป้งสับปะรด 2 PYVV มันฝรั่งเส้นเหลืองไวรัส RLMV ราสเบอร์รี่ mottle ไวรัส SCFaV สตรอเบอร์รี่ปาก fleck ไวรัสเชื่อมโยง SPaV ไวรัสในการเชื่อมโยง pallidosis สตรอเบอร์รี่ SPCSV มันฝรั่งหวานปากจักรยานไวรัส ToCV ไวรัส chlorosis มะเขือเทศ
การแปล กรุณารอสักครู่..

มะเดื่อ 2. ต้นไม้ของโพลิเมอร์ ORF1b (RdRp) และยีน HSP70 คล้ายคลึงกันของไวรัสในตระกูล Closteroviridae แสดงตำแหน่งของทั้งสองสายพันธุ์ใหม่ที่นำเสนอในสกุล Closterovirus ต้นไม้ที่ถูกสร้างขึ้นจากลำดับเบส codon ชิดโดยใช้ MEGA4 (เพื่อนบ้านเข้าสูงสุดวิธีการน่าจะเป็นคอมโพสิตที่มี 10,000 บูตซ้ำ. ค่า Bootstrap แสดงเมื่อ> 60%) ต้นไม้ RdRp ใช้ไวรัสที่เข้าทำลายแตงกวา (CMV) เป็น outgroup และต้นไม้ HSP70 มีรากที่มีโปรตีน Arabidopsis thaliana ช็อกความร้อนสมมุติ 70, AAN71949 ต้นไม้จะขึ้นอยู่กับผู้ที่นำเสนอโดย Tzanetakis และคณะ (2007) ตัวย่อคือ BPYV, บีท pseudoyellows ไวรัส BYSV ไวรัสบีทแคระสีเหลือง BYV, สีเหลืองบีทไวรัส BYVaV, BlackBerry เหลืองไวรัส veinassociated; CTV ส้มไวรัส tristeza; CYSDV, แตงไวรัสโรคแคระแกร็นเหลือง; GLRaV-1, เกรปไวน์ไวรัส leafroll ที่เกี่ยวข้อง 1; GLRaV-2, เกรปไวน์ไวรัส leafroll ที่เกี่ยวข้อง 2; GLRaV-3, เกรปไวน์ไวรัส leafroll ที่เกี่ยวข้อง 3; LChV-1, ไวรัสเชอร์รี่น้อย 1; LChV-2, ไวรัสเชอร์รี่เล็ก ๆ น้อย ๆ 2; LIYV, ผักกาดหอมสีเหลืองติดเชื้อไวรัส MV-1, ไวรัสมิ้นท์ 1; MVBaV หลอดเลือดดำมิ้นท์แถบเกี่ยวข้องไวรัส PMWaV-1, สับปะรดเพลี้ยแป้งไวรัสโรคเหี่ยวที่เกี่ยวข้อง 1; PMWaV-2, สับปะรดเพลี้ยแป้งไวรัสโรคเหี่ยวที่เกี่ยวข้อง 2; PYVV ไวรัสหลอดเลือดดำมันฝรั่งสีเหลือง RLMV, ราสเบอร์รี่ไวรัส mottle; SCFaV, สตรอเบอร์รี่ซีด
ขี้แมลงวันเกี่ยวข้องไวรัส SPaV, สตรอเบอร์รี่ไวรัส pallidosis ที่เกี่ยวข้อง; SPCSV, มันเทศไวรัสแสดงความสามารถจาง; ToCV มะเขือเทศไวรัส chlorosis
การแปล กรุณารอสักครู่..

รูปที่ 2 ต้นไม้วิวัฒนาการของการ orf1b ( rdrp ) และยีนยีนของไวรัสในครอบครัวผิว closteroviridae แสดงตำแหน่งของทั้งสองเสนอสปีชีส์ใหม่ในสกุล closterovirus . ต้นไม้ถูกสร้างขึ้นจากลำดับนิวคลีโอไทด์ของ codon ชิดใช้ mega4 ( เพื่อนบ้านเข้าร่วม ประกอบด้วย 10 วิธีบูตสแตรปความเป็นไปได้สูงสุด ได้แก่ค่าบูทแสดงเมื่อ > 60% ) การ rdrp ต้นไม้ใช้แตงกวาฝังไวรัส ( ซีเ มวี ) และยีนกลุ่มต้นไม้มีรากกับ Arabidopsis thaliana กรดอะมิโนโปรตีนช็อกความร้อน 70 , aan71949 . ต้นไม้จะขึ้นอยู่กับผู้ที่นำเสนอโดย tzanetakis et al . ( 2007 ) อักษรย่อ : bpyv บีท pseudoyellows ไวรัส bysv , beet ไวรัสแกนสีเหลือง byv บีท byvav สีเหลือง , ไวรัสveinassociated BlackBerry สีเหลืองไวรัส ทีวีสี ส้มทริสเทซ่าไวรัส cysdv แตงโมสีเหลือง , stunting โรคไวรัส glrav-1 ต้นองุ่นที่ leafroll , ไวรัส 1 ; glrav-2 ต้นองุ่นที่ leafroll , ไวรัส 2 glrav-3 ต้นองุ่นที่ leafroll , ไวรัส 3 lchv-1 ไวรัสเชอร์รี่เล็กน้อย 1 ; lchv-2 ไวรัสเชอร์รี่น้อย 2 liyv ผักกาดหอม ติดเชื้อสีเหลืองไวรัส mv-1 มิ้น mvbav ไวรัส 1 ; ,มิ้นท์หลอดเลือดดำแถบเชื่อมโยงไวรัส pmwav-1 เพลี้ยแป้งสับปะรดจะเกี่ยวข้อง , ไวรัส 1 ; pmwav-2 เพลี้ยแป้งสับปะรดจะเกี่ยวข้อง , ไวรัส 2 pyvv มันฝรั่งไวรัสเส้นใบเหลือง ; rlmv , ราสเบอร์รี่ mottle virus ; scfav , สตรอเบอร์รี่ chlorotic
จุดที่ไวรัส spav , สตรอเบอร์รี่ pallidosis เกี่ยวข้องไวรัส spcsv มันเทศ chlorotic แกน tocv ไวรัส , ไวรัส คลอโรซิมะเขือเทศ
การแปล กรุณารอสักครู่..
