1. IntroductionTyphoid fever, cause

1. Introduction

Typhoid fever, caused by Salmonella enterica serovar Typhi (S.Typhi), remains a global public health problem centred in devel-oping countries [1]. The emergence of multi-drug resistant (MDR)S. Typhi, with resistance to all first line drugs: (chloramphenicol,co-trimoxazole and ampicillin) led to the fluoroquinolones becom-ing the treatment of choice for enteric fever [2]. There is a clearrelationship between increasing fluoroquinolone MIC and outcomeduring fluoroquinolone treatment of typhoid fever. Therefore for clinical management, any increase in fluoroquinolone MIC needsto be detected [3]. No zone around a nalidixic acid 30 g disc hasbeen used as a screening test for isolates with a clinically rele-vant ciprofloxacin resistance; MIC of ≥0.125 mg/L with a sensitivityof 92.9% (248/267); and a specificity of 98.4% (540/549) [4]. Themost common mutation associated with reduced susceptibility tofluoroquinolones in S. Typhi is in the quinolone resistance deter-mining region of the GyrA sub-unit of DNA gyrase. This mutation,at amino acid 83, also confers resistance to nalidixic acid (NALR)and so nalidixic acid can be a marker for fluoroquinolone resis-tance where this mutation is the sole cause of resistance. Strainsof S. Typhi with decreased susceptibility to fluoroquinolones (e.g.ciprofloxacin (CIPI) MIC > 0.064 mg/L are now very common in India[3]. The reports of alternative mechanisms of fluoroquinolone resis-tance are increasing [5,6]. In response to this the CLSI has redefinedthe breakpoints for ciprofloxacin as ≤0.064 mg/L and ≥1 mg/L and ≥31 mm and ≤20 mm for susceptibility and resistance using MICand disc diffusion [7], and strains that are >0.064 mg/L and

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

1. บทนำไข้รากสาดน้อย เกิดจากซัล enterica serovar Typhi (S.Typhi), ยังคง ปัญหาสาธารณสุขทั่วโลกเป็นศูนย์กลางในประเทศ devel oping [1] การเกิดขึ้นของยาหลายทน (MDR) s ได้ Typhi มีความต้านทานต่อยารายการแรกทั้งหมด: (chloramphenicol บริษัท trimoxazole และแอมพิซิลลิน) นำไปสู่ fluoroquinolones becom-ing ทางเลือกสำหรับไข้ enteric [2] Clearrelationship ระหว่าง fluoroquinolone เพิ่ม MIC และ outcomeduring fluoroquinolone รักษาไข้ไทฟอยด์ได้ ดังนั้น สำหรับการจัดการทางคลินิก needsto fluoroquinolone ไมค์เพิ่มใด ๆ สามารถตรวจพบ [3] โซนทั่วดิสก์ 30 กรัมกรดนาลิดิซิกไม่ใช้แบบทดสอบคัดกรองแยกกับทางคลินิก rele vant ciprofloxacin ต้านทาน ไมค์ ≥0.125 mg/L เป็น sensitivityof 92.9% (248/267); และ specificity 98.4% (540/549) [4] Themost กลายพันธุ์ทั่วไปที่เกี่ยวข้องกับภูมิไวรับลด tofluoroquinolones ใน S. Typhi ที่อยู่ในพื้นที่เหมืองแร่ขัดขวางต้านทานควิโนโลน GyrA หน่วยย่อยของ DNA gyrase กลายพันธุ์นี้ ที่กรดอะมิโน 83, confers นอกจากนี้ยังทนต่อกรดนาลิดิซิก (NALR) และดังนั้น กรดนาลิดิซิกสามารถทำเครื่องหมายสำหรับ fluoroquinolone resis tance ที่กลายพันธุ์นี้เป็นสาเหตุแต่เพียงผู้เดียวของความต้านทาน Strainsof S. Typhi กับ fluoroquinolones ง่ายลดลง (e.g.ciprofloxacin (CIPI) ไมค์ > 0.064 mg / L ได้ขณะนี้กันมากในอินเดีย [3] รายงานของกลไกอื่นของ fluoroquinolone resis tance กำลังเพิ่ม [5,6] ในการตอบสนองนี้ CLSI มี redefinedthe จุดสั่งหยุดสำหรับ ciprofloxacin ≤0.064 mg/L และ ≥1 mg/L และ ≥31 mm และ ≤20 mm ภูมิไวรับและใช้แพร่ดิสก์ MICand [7], และสายพันธุ์ที่ต้านทาน > 0.064 mg/L และ < 1 มิลลิกรัม/ลาสำหรับ enterica ระดับกลาง ห้องปฏิบัติการจำนวนมากใน Indiahowever ยังทดสอบกรดนาลิดิซิกเป็นเครื่องหมายสำหรับ decreasedsusceptibility กับ fluoroquinolones (CIPI) และให้ รายงานเป็นทางการของกรดนาลิดิซิกตรวจทดสอบในอินเดียเป็น greatimportance เพื่อเป็น แนวทางการจัดการทางคลินิก นอกจากนี้ยัง มีหลักฐาน isconflicting บทบาทของการกลายพันธุ์ fluoroquinolones inclinical แยก กลายพันธุ์สองใน gyrA หรือ gyrB สามารถ associ เส้น มีความต้านทานต่อ fluoroquinolones เต็ม (ไมค์≥ 4 mg/L) [8] การ butgenetic สายพันธุ์ isogenic แสดงว่า นี่ไม่ใช่เรื่อง thefull – กลายพันธุ์อื่น ๆ ยังต้องแสดง [9] Thereforeimportant ลักษณะต้องใช้หมุนเวียนได้ทวีปย่อยอินเดียรายงานไข้ไทฟอยด์เพิ่มมากขึ้นกว่า anyother ภูมิภาคของโลก และสามารถใช้เพื่อ ตรวจสอบความต้านทานยาปฏิชีวนะใน S.Typhi ในอินเดียเพื่อตรวจหาแนวโน้มใด ๆ ต่อต้านทาน ciprofloxacin increas-ไอเอ็นจี ศูนย์ของเราเป็น inIndia อันดับหนึ่ง และเฝ้าระวังต้าน ciprofloxacin ได้รับรถ-ried ออกตั้งแต่ปี 2001 ในการศึกษาก่อนหน้านี้จาก 2003 majority(282/285) ของแยกกับ CIPIexhibited quinoloneresistance คลาสสิก phenotype, NALR-CIPIand สามแยกกับ NALS CIPI(CIP-MIC 0.125 mg/L) ถูกสังเกต [10] ที่นี่เราแสดงข้อมูลบนการพันธุกรรม และไทป์คุณสมบัติของ CIPIisolates S.Typhi จาก 2004 ถึง 25542. MethodsAll ที่แยกได้จากผู้ป่วยยอมรับการที่ซัฟดาร์จังเอ็น Hos-pital ระหว่างปี 2004-2011 และได้จากเลือดหรืออุจจาระวัฒนธรรม มากถูกดำเนินการเท่าที่ทำได้โดยใช้ clinicaldata ใช้ย้อนหลังได้ ต่ำสุดลิปกลอสไข Concentra-สเตรชัน (MIC) กรดนาลิดิซิกและ ciprofloxacin ต่อ 891 Typhiwas s ได้ตาม E-ทดสอบ (AB Biodisk, Solna สวีเดน) Wereinterpreted ผล microbiologists สอง และ discrepant ผล wererepeated Susceptibilities กรดนาลิดิซิก (30 กรัม), chloramphenicol ciprofloxacin(5 g) (30 กรัม), co-trimoxazole (25 กรัม) และ ampi-cillin (10 g) ถูกกำหนด โดยดิสก์แพร่ (DD) ทดสอบตามแนวทางของ CLSI [7] จุดเปลี่ยนที่ใช้สำหรับการ CIPI ถูก 0.064 – 1.0 mg/L และ 21 – 30 มม.สำหรับไมค์และ DD ตามลำดับ MDRwas ที่กำหนดเป็นความต้านทานต่อ chloramphenicol โค trimoxazole, andampicillin ข้อมูลถูกวิเคราะห์โดยใช้ WHONET 5.6 ซอฟต์แวร์จาก NALSS แสดงถึง selectedto ทุกปีแยกและ antibiograms ทั้งหมดเพื่อ charac-terize กลไกต้าน FQ Typhi (ไมค์ < 32 mg / L) 52 สายพันธุ์ได้ PCR ใช้ amplifythe QRDRs gyrA, gyrB ปาร์ค และ parE ยีน [3] Denaturinghigh-ความดันของเหลว chromatography (DHPLC: คลื่น Nucleic AcidFragment วิเคราะห์ระบบ Transgenomic Inc.) ใช้กับ studymutations [11] การกลายพันธุ์ในยีนที่ศึกษาได้เปรียบเทียบ identifiedby กับลำดับดีเอ็นเอจากสายพันธุ์ S. Typhi Ty2 (GenBank ทะเบียนไม่ AE014613) ตรวจคัดกรองสำหรับการ plasmiddeterminants (qnrA, B, S; aac (6) - Ib - cr และ qepA) ถูกทำ byPCR (ไพรเมอร์ในตารางที่ 1)โลกัสโพลแบบหลายตัวแปรเลขตัวตามกันไปซ้ำ (VNTR) analysis(MLVA) ได้รับการดำเนินการประเมินพันธุกรรม relatedness ใช้ fiveVNTR loci (TR1, TR2, TR4699, Sal02 และ Sal16) [12] Weretagged ไพรเมอร์ ด้วยย้อมฟลูออเรส FAM (สีฟ้า) 6 แยกส่วน analysiswas ยาวโดยเส้นเลือดฝอย electrophoresis (วิเคราะห์พันธุกรรม ABI3130, Biosystems ใช้) ส่วนขนาดได้ binned เป็น alleles Copynumber ได้รับการยืนยัน โดยลำดับ เป็นคลัสเตอร์ dendogram wasconstructed ใช้ซอฟต์แวร์ R

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

1. บทนำไข้ไทฟอยด์เกิดจากเชื้อSalmonella enterica serovar typhi (ทำการหาลำดับเบส) ยังคงเป็นปัญหาระดับโลกเป็นศูนย์กลางสุขภาพของประชาชนในประเทศที่-devel oping [1] การเกิดขึ้นของยาเสพติดหลายทน (MDR) S typhi มีความต้านทานต่อยาเสพติดบรรทัดแรกทั้งหมด: (chloramphenicol, co-trimoxazole และ ampicillin) นำไปสู่การ fluoroquinolones becom ไอเอ็นจีการรักษาทางเลือกสำหรับไข้ลำไส้ [2] มี clearrelationship ระหว่างการเพิ่ม MIC fluoroquinolone และ outcomeduring รักษา fluoroquinolone ไข้รากสาด ดังนั้นการบริหารจัดการทางคลินิกที่เพิ่มขึ้นใน MIC fluoroquinolone needsto ถูกตรวจพบ [3] ? โซนรอบกรด nalidixic 30 กรัมไม่มีแผ่น hasbeen ใช้เป็นแบบคัดกรองไอโซเลทที่มีคลินิก rele-Vant ต้านทาน ciprofloxacin; MIC ของ≥0.125มิลลิกรัม / ลิตรมี sensitivityof 92.9% (248/267); และความจำเพาะของ 98.4% (ที่ 540/549) [4] การกลายพันธุ์ที่พบบ่อย Themost เกี่ยวข้องกับ tofluoroquinolones ความไวต่อการลดลงในเอส typhi อยู่ในควิโนโลนต้านทานภูมิภาคยับยั้งการทำเหมืองแร่ของ Gyra ยูนิตย่อยของดีเอ็นเอ gyrase การกลายพันธุ์นี้ที่กรดอะมิโน 83 ยังฟาโรห์ต้านทานต่อกรด nalidixic (NALR) และกรด nalidixic เพื่อให้สามารถเป็นเครื่องหมาย fluoroquinolone resis-ในระยะที่กลายพันธุ์นี้เป็นสาเหตุของความต้านทาน แต่เพียงผู้เดียว Strainsof S. typhi ที่มีความไวต่อการลดลง fluoroquinolones (egciprofloxacin (CIPI) MIC> 0.064 มิลลิกรัม / ลิตรอยู่ในขณะนี้พบบ่อยมากในประเทศอินเดีย [3]. รายงานของกลไกทางเลือกของการ fluoroquinolone resis-ในระยะที่มีการเพิ่มขึ้น [5,6]. ในการตอบสนอง ในการนี้มีจุดพัก CLSI redefinedthe สำหรับ ciprofloxacin เป็น≤0.064มิลลิกรัม / ลิตรและ≥1มิลลิกรัม / ลิตรและ≥31มมมม≤20สำหรับความอ่อนแอและความต้านทานต่อการแพร่กระจายโดยใช้แผ่นดิสก์ MICand [7] และสายพันธุ์ที่มี> 0.064 มิลลิกรัม / ลิตร และ <1 มิลลิกรัม / ลากลางสำหรับ Salmonella enterica. ห้องปฏิบัติการหลายแห่งใน Indiahowever ยังคงทดสอบกรด nalidixic เป็นเครื่องหมายสำหรับ decreasedsusceptibility เพื่อ fluoroquinolones (CIPI) และเพื่อให้รายงานอย่างเป็นทางการ onthe ยูทิลิตี้ของการทดสอบการตรวจคัดกรองกรด nalidixic ในอินเดียของ greatimportance เพื่อให้คำแนะนำ . การจัดการทางคลินิกนอกจากนี้ยังมีหลักฐาน isconflicting เกี่ยวกับบทบาทของ fluoroquinolones กลายพันธุ์สายพันธุ์ inclinical ที่สองกลายพันธุ์ใน Gyra และ / หรือ gyrB สามารถ Associ-ated ที่มีความต้านทานแบบเต็มไป fluoroquinolones (MIC ≥ 4 มิลลิกรัม / ลิตร) [8] butgenetic การจัดการของการกลายพันธุ์พันธุ์ แสดงให้เห็นว่านี้ไม่ได้เป็นเรื่อง thefull - กลายพันธุ์อื่น ๆ ยังจะต้องนำเสนอ [9] มันเป็น thereforeimportant ลักษณะการไหลเวียนของสายพันธุ์. รายงานอนุทวีปอินเดียไข้รากสาดมากกว่าภูมิภาค anyother โลกและเพื่อตรวจสอบความต้านทานยาปฏิชีวนะในการทำการหาลำดับเบสในอินเดียสามารถนำมาใช้ในการตรวจสอบแนวโน้มต้านทาน ciprofloxacin increas ไอเอ็นจีใด ๆ ศูนย์ของเราเป็นหนึ่งในคึกคักที่สุดในอินเดียและการเฝ้าระวังของความต้านทาน ciprofloxacin ได้รับรถ Ried ออกมาตั้งแต่ปี 2001 ในการศึกษาก่อนหน้านี้จาก 2,003 ส่วนใหญ่ (282/285) ของเชื้อกับ CIPIexhibited ฟีโนไทป์ quinoloneresistance คลาสสิก NALR-CIPIand สามสายพันธุ์ที่มี NALS-CIPI (CIP-MIC 0.125 มิลลิกรัม / ลิตร) ถูกตั้งข้อสังเกต [10] ที่นี่เรานำเสนอข้อมูล onthe ลักษณะทางพันธุกรรมและฟีโนไทป์ของ CIPIisolates ทำการหาลำดับเบสของจากปี 2004 ถึงปี 2011 2 MethodsAll แยกได้จากผู้ป่วยที่เข้ารับการรักษา Safdarjung เหลวแหลก-Pital ในช่วง 2004-2011 และจากวัฒนธรรมเลือดหรืออุจจาระการขจัดข้อมูลซ้ำซ้อนได้ดำเนินการเท่าที่จะทำได้โดยใช้ clinicaldata ใช้ได้ย้อนหลัง ขั้นต่ำยับยั้ง Concentra-การ (MIC) กรด nalidixic และ ciprofloxacin กับเอส 891 Typhiwas กำหนดโดย E-ทดสอบ (AB Biodisk, โซล, สวีเดน) ผล wereinterpreted สองจุลชีววิทยาและผลไม่ตรงกัน wererepeated ไวต่อกรด nalidixic (30 กรัม) ciprofloxacin (5? g) chloramphenicol (30 กรัม) co-trimoxazole (25? g) และ AMPI ล์ (10 กรัม) ได้รับการพิจารณาโดยการแพร่แผ่น (DD) การทดสอบ accordingto แนวทาง CLSI [7] จุดพักที่ใช้สำหรับ CIPI เป็น 0.064-1.0 มิลลิกรัม / ลิตรและ 21-30 มม MIC และ DD ตามลำดับ MDRwas กำหนดให้เป็นความต้านทานต่อการ chloramphenicol, co-trimoxazole, andampicillin วิเคราะห์ข้อมูลโดยใช้ WHONET 5.6 ซอฟแวร์. จาก NALSS typhi (MIC <32 mg / L) 52 สายพันธุ์ที่มี selectedto เป็นตัวแทนของทุกปีของการแยกและ antibiograms ทั้งหมดเพื่ออักขระ-terize กลไกของความต้านทาน FQ PCR ถูกใช้ในการ amplifythe QRDRs ของ Gyra, gyrB, Parc และยีนตัด [3] Denaturinghigh แรงดันของเหลว chromatography (DHPLC: คลื่นนิวคลีอิก AcidFragment การวิเคราะห์ระบบ; Transgenomic Inc) ถูกใช้ในการ studymutations [11] การกลายพันธุ์ในยีนที่มีการศึกษาบ่งชี้ได้เปรียบเทียบกับดีเอ็นเอจาก S. typhi สายพันธุ์ Ty2 (ภาคยานุวัติ GenBank ไม่มี. AE014613) การตรวจคัดกรองสำหรับ plasmiddeterminants (qnrA, B, S? AAC (6) - Ib-CR และ qepA) ได้ดำเนินการ byPCR (ไพรเมอร์ในตารางที่ 1). หลายสถานที่จำนวนตัวแปรซ้ำควบคู่ (VNTR) การวิเคราะห์ (MLVA) ได้ดำเนินการ ออกมาเพื่อประเมินความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมโดยใช้ตำแหน่ง fiveVNTR (TR1, TR2, TR4699, Sal02 และ Sal16) [12] ไพรเมอร์ weretagged 6? FAM (สีฟ้า) สีย้อมเรืองแสง ส่วนระยะเวลาใน analysiswas ทำโดยอิเล็กฝอย (ABI3130 วิเคราะห์ทางพันธุกรรม, Applied Biosystems) ขนาดส่วนถูก binned ลงในอัลลีล Copynumber รับการยืนยันโดยลำดับ dendogram กลุ่ม wasconstructed ใช้ R-ซอฟแวร์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

1 . บทนำ

ไข้ไทฟอยด์ เกิดจากเชื้อไทฟอยด์ enterica ซีโรวาร์ ( s.typhi ) ยังคงเป็นปัญหาสาธารณสุขระดับโลก เป็นศูนย์กลางใน oping devel ประเทศ [ 1 ] การเกิดขึ้นของหลายดื้อยา ( 2547 ) . ประเทศที่มีความต้านทานต่อยาทุกบรรทัดแรก ( อล trimoxazole Co และเมอรีล สตรีป ) นำไปสู่ฟลอโรควิโนโลน becom ไอเอ็นจีทางเลือกการรักษาไข้ไทฟอยด์ [ 2 ]มีการ clearrelationship ระหว่างไมโครโฟนและ outcomeduring ฟลูออโรควิโนโลนฟลูออโรควิโนโลนรักษา ไข้ไทรอยด์ ดังนั้น การจัดการทางคลินิกเพิ่มไมค์ needsto ฟลูออโรควิโนโลนใดตรวจพบ [ 3 ] ไม่มีโซนรอบๆสะพานกรุงธน 30  G แผ่นดิสก์ได้ใช้เป็นการตรวจคัดกรองหาเชื้อด้วยยาซิโปรฟลอกซาซิน rele vant ต้านทาน ; MIC ≥ 0125 มิลลิกรัมต่อลิตรด้วย sensitivityof 92.9 % ( 248 / 267 ) ; และความจำเพาะของ 98.4 % ( 540 / 549 ) [ 4 ] โดยทั่วไปที่เกี่ยวข้องกับการลดความไวในการ tofluoroquinolones . ไทฟอยด์ในเขตเหมืองแร่ของความต้านทานควิโนโลนห้ามปราม Gyra ย่อยหน่วย gyrase ดีเอ็นเอ การกลายพันธุ์ที่กรดอะมิโน 83 ,นอกจากนี้ยังพระราชทานต้านทานสะพานกรุงธน ( nalr ) และสะพานกรุงธนสามารถเป็นเครื่องหมายไปที่ฟลูออโรควิโนโลนรีซิซการกลายพันธุ์นี้เป็นสาเหตุเดียวของการต้านทาน strainsof . ไทฟอยด์กับลดลงเกิดฟลอโรควิโนโลน ( e.g.ciprofloxacin ( cipi ) ไมค์ > 0.064 มิลลิกรัมต่อลิตร ขณะนี้พบมากในอินเดีย [ 3 ]รายงานของกลไกทางเลือกฟลูออโรควิโนโลนรีซิซไปเพิ่ม [ 5 , 6 ] ในการตอบสนองนี้มีจุดต่าง redefinedthe สำหรับไซโปรฟลอกซาซินเป็น≤ 0.064 มิลลิกรัม / ลิตร และ≥ 1 มก. / ล. และ≥ 31 มม. และ 20 มม. ≤ความต้านทานต่อการใช้แผ่นกระจาย micand [ 7 ] , และสายพันธุ์ที่ > 0.064 มิลลิกรัมต่อลิตรและ < 1 มก. / Las สื่อกลางสำหรับ Salmonella enterica .ห้องปฏิบัติการจำนวนมากใน indiahowever ยังคงทดสอบสะพานกรุงธนเป็นเครื่องหมาย decreasedsusceptibility กับฟลอโรควิโนโลน ( cipi ) และรายงานอย่างเป็นทางการต่อประโยชน์ของกรดนาลิดิซิกคัดกรองในอินเดียเป็น greatimportance คู่มือการจัดการทางคลินิก นอกจากนี้ยังมี isconflicting หลักฐานในบทบาทของกลุ่ม Fluoroquinolones ภาคแยก ;สองการกลายพันธุ์ใน Gyra และ / หรือ gyrb สามารถ ( พ่อพันธุ์ ated กับเต็มความต้านทานฟลอโรควิโนโลน ( MIC ≥ 4 มก. / ล. ) [ 8 ] จัดการ butgenetic ของ isogenic สายพันธุ์ พบว่า นี่ไม่ใช่เรื่อง thefull –การกลายพันธุ์อื่นๆยังต้องปัจจุบัน [ 9 ] มันเป็น thereforeimportant ลักษณะหมุนเวียนเมื่อย

ไทฟอยด์ไข้รายงานเพิ่มเติมมากกว่าภูมิภาคอื่นทั่วโลก อนุทวีปอินเดียและการตรวจสอบของความต้านทานยาปฏิชีวนะในประเทศสหรัฐ ในอินเดียสามารถใช้ตรวจพบแนวโน้มต่อความต้านทานไอเอ็นจีไซโปรฟลอกซาซินสินค้า . ศูนย์บริการของเราเป็นหนึ่งในดีที่สุดและการเฝ้าระวังไซโปรฟลอกซาซิน inIndia ต่อต้านได้รับรถรีด ออกมาตั้งแต่ปี 2001ในการศึกษาก่อนหน้านี้จาก 2003 ส่วนใหญ่ ( 282 / 0 ) cipiexhibited ไอโซเลทที่การ quinoloneresistance คลาสสิก nalr cipiand 3 ไอโซเลท nals-cipi ( cip-mic 0.125 มิลลิกรัมต่อลิตร ) พบ [ 10 ] ที่นี่เรานำเสนอข้อมูลทางพันธุกรรมและคุณสมบัติต่อคุณสมบัติของ cipiisolates ของสหรัฐอเมริกาที่ได้รับจากปี 2011


2