Previously, SSR have been used to d

Previously, SSR have been used to determine genetic variation in rice. The reported number of allele per locus, genetic diversity, and Polymorphism information content (PIC) were ranged from 4.8-14.0, 6.2-6.8 and 0.63-0.70, respectively (Ni et al. 2002; Garris et al. 2005; Pessoa-Filho et al. 2007; Ram et al. 2007). Very recenly,Ali et al. (2011) genotyped 409 Asian rice accessions originated from 79 countries representing all the major rice growing regions of the world using 36 SSR markers.They reported an average of 9.17 alleles per marker(range from 2 to 24), a mean genetic diversity of 0.68,and an average PIC of 0.63. In addition, Chen et al.(2011) studies genetic diversity of 300 rice accessions representing major geographic areas of rice growing
countries in the world using 372 SNP markers. They detected 744 alleles at 372 markers, an average gene diversity of 0.358, and an average PIC of 0.285. Using 19 SSCP InDel markers to determine genetic variation in 101 rice accessions, we found that the 19 markers produced the average number of allele of 6.68, and the average PIC of 0.44. Our results on average allele per locus, genetic diversity, and PIC were higher than that reported by the study using SNP marekers (Chen et al., 2011). Comparing to other studies using SSR, our result on the average number of allele per locus was comparable to several studies (Ni et al. 2002; Yu et al. 2003). However, the average PIC produced by our method was lower than that reported by the other studies using SSR, concordant
with the earlier study in pearl millet, which reported the average PIC value of 0.49 by SSCP relative to the SSR value of 0.72 tested on the same genotype panel (Bertin et al. 2005).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ก่อนหน้านี้ SSR ได้ถูกใช้เพื่อกำหนดความผันแปรทางพันธุกรรมในข้าว รายงานจำนวน allele ต่อโลกัสโพล พันธุ และเนื้อหาข้อมูลโพลิมอร์ฟิซึม (PIC) กำลังอยู่ในช่วง 4.8-14.0, 6.2-6.8 และ 0.63 0.70 ตามลำดับ (Ni et al. 2002 Garris et al. 2005 Al. ร้อยเอ็ด Pessoa Filho 2007 Ram ร้อยเอ็ด al. 2007) มาก recenly, Ali et al. (2011) genotyped 409 ข้าวเอเชีย accessions มาจาก 79 ประเทศที่แสดงถึงการเติบโตภูมิภาคของโลกที่ใช้เครื่องหมาย SSR 36 หลักทั้งหมดของข้าว พวกเขารายงานค่าเฉลี่ยของ alleles 9.17 ต่อเครื่อง (ช่วงตั้งแต่ 2 ถึง 24) พันธุหมายถึง 0.68 และเฉลี่ย PIC 0.63 นอกจากนี้ Chen et al.(2011) ศึกษาพันธุกรรม accessions ข้าว 300 ตัวแทนพื้นที่สำคัญทางภูมิศาสตร์ของนาประเทศในโลกที่ใช้เครื่องหมายของ SNP 372 พวกเขาพบ 744 alleles ที่เครื่องหมาย 372 มียีนเฉลี่ยหลากหลาย 0.358 และภาพการเฉลี่ยของ 0.285 ใช้เครื่องหมาย SSCP InDel 19 การตรวจสอบความผันแปรทางพันธุกรรมในข้าว 101 accessions เราพบว่า เครื่องหมาย 19 ผลิตเฉลี่ยจำนวน allele ของ 6.68 ภาพเฉลี่ยของ 0.44 ผลของเราเฉลี่ย allele ต่อโลกัสโพล พันธุ และรูปภาพได้สูงกว่าที่รายงาน โดยการศึกษาใช้ SNP marekers (Chen et al., 2011) เปรียบเทียบการศึกษาอื่น ๆ ใช้ SSR ผลลัพธ์ของเรากับจำนวนเฉลี่ยของ allele ต่อโลกัสโพลได้เปรียบการศึกษาหลาย (Ni et al. 2002 Yu et al. 2003) อย่างไรก็ตาม เฉลี่ย PIC ที่ผลิต โดยวิธีการของเราได้ต่ำกว่าที่รายงาน โดยศึกษาอื่น ๆ ใช้ SSR, concordantกับก่อนหน้านี้ศึกษาในประเทศ เพิร์ลซึ่งรายงาน PIC ค่าเฉลี่ย 0.49 โดย SSCP เทียบค่า SSR ของ 0.72 ทดสอบบนแผงลักษณะทางพันธุกรรมเดียวกัน (Bertin et al. 2005)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ก่อนหน้านี้ SSR ได้ใช้ในการตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมข้าว จำนวนรายงานของอัลลีลต่อสถานที่, ความหลากหลายทางพันธุกรรมและเนื้อหาข้อมูล Polymorphism (PIC) กำลังอยู่ในช่วง 4.8-14.0, 6.2-6.8 และ 0.63-0.70 ตามลำดับ (Ni et al, 2002;. Garris et al, 2005;. Pessoa-Filho . et al, 2007; ราม et al, 2007). recenly มาก, อาลีอัลเอต (2011) genotyped 409 สายเอเชียข้าวมาจาก 79 ประเทศที่เป็นตัวแทนของทุกพื้นที่ที่ปลูกข้าวที่สำคัญของโลกโดยใช้ 36 SSR markers.They รายงานค่าเฉลี่ยของอัลลีล 9.17 ต่อเครื่องหมาย (ช่วง 2-24) ความหลากหลายทางพันธุกรรมเฉลี่ย 0.68 และ PIC เฉลี่ย 0.63 นอกจากนี้เฉิน et al. (2011) การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของข้าวสาย 300 เป็นตัวแทนของพื้นที่ทางภูมิศาสตร์ที่สำคัญของการปลูกข้าว
ประเทศในโลกโดยใช้เครื่องหมาย SNP 372 พวกเขาตรวจพบอัลลีลที่ 744 372 เครื่องหมายความหลากหลายของยีนเฉลี่ย 0.358 และ PIC เฉลี่ย 0.285 ใช้ 19 SSCP เครื่องหมาย Indel เพื่อตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมใน 101 สายข้าวเราพบว่า 19 ตัวบ่งชี้การผลิตจำนวนเฉลี่ยของอัลลีลของ 6.68 และค่าเฉลี่ยของ PIC 0.44 ผลของเราในอัลลีลเฉลี่ยต่อสถานที่, ความหลากหลายทางพันธุกรรมและ PIC สูงกว่าที่รายงานโดยใช้การศึกษา SNP marekers (Chen et al., 2011) เมื่อเปรียบเทียบกับการศึกษาอื่น ๆ โดยใช้ SSR ผลของเราเกี่ยวกับค่าเฉลี่ยของจำนวนอัลลีลต่อสถานที่ก็เปรียบได้กับการศึกษาหลาย (Ni et al, 2002;. Yu et al, 2003). แต่ PIC เฉลี่ยที่ผลิตโดยวิธีการของเราคือต่ำกว่าที่รายงานโดยการศึกษาอื่น ๆ โดยใช้ SSR, สอดคล้อง
กับการศึกษาก่อนหน้านี้ในข้าวฟ่างมุกซึ่งรายงานค่าเฉลี่ยของ PIC 0.49 โดยญาติ SSCP ค่า SSR 0.72 การทดสอบบน แผงพันธุ์เดียวกัน (Bertin et al. 2005)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ก่อนหน้านี้ ติดได้ถูกใช้เพื่อตรวจสอบความแปรปรวนทางพันธุกรรมในข้าว รายงานจำนวนอัลลีลต่อความเชื่อ ความหลากหลายทางพันธุกรรม และเนื้อหาข้อมูล polymorphism ( PIC ) มีค่าจาก 4.8-14.0 6.2-6.8 0.63-0.70 , และตามลำดับ ( ฉัน et al . 2002 ; แกร์ริส et al . 2005 ; เปสโซฟิลโฮ et al . 2007 ; RAM et al . 2007 ) มาก recenly , Ali et al .( 2011 ) genotyped 409 เอเชียข้าวสายพันธุ์ที่มาจาก 79 ประเทศ เป็นตัวแทนของพื้นที่ปลูกข้าวทั้งหมดที่สำคัญของโลกใช้ 36 ได้รับเครื่องหมาย พวกเขารายงานเฉลี่ย 9.17 อัลลีลต่อเครื่องหมาย ( ตั้งแต่ 2 ถึง 24 ) หมายถึงความหลากหลายทางพันธุกรรมเท่ากับ 0.68 และเฉลี่ย 0.63 , รูปภาพ . นอกจากนี้ Chen et al .( 2011 ) การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของข้าวสายพันธุ์ 300 แสดงพื้นที่ทางภูมิศาสตร์ที่สำคัญของข้าวเติบโต
ประเทศทั่วโลกใช้ 372 SNP เครื่องหมาย พวกเขาตรวจพบ 744 อัลลีลที่ 372 เครื่องหมาย , ความหลากหลายของยีนโดย ทดลอง และเฉลี่ยรูป 0.285 . การใช้ยีนเครื่องหมาย INDEL 19 ตรวจสอบความหลากหลายทางพันธุกรรมใน 101 สายพันธุ์ข้าว ,เราพบว่าเครื่องหมายที่ 19 จำนวนอัลลีลเฉลี่ย 6.68 และรูปภาพ 2 . ผลของเราในอัลลีลเฉลี่ยต่อความเชื่อความหลากหลายทางพันธุกรรม และรูปภาพ , สูงกว่ารายงานโดยการใช้ marekers SNP ( Chen et al . , 2011 ) เมื่อเปรียบเทียบกับการศึกษาอื่น ๆที่ใช้ SSR , ผลของเรามีจำนวนอัลลีลต่อตนได้ศึกษาหลาย ๆ ( ฉัน et al . 2002 ;ยู et al . 2003 ) แต่รูปที่ผลิตโดยวิธีเฉลี่ยของเราต่ำกว่าที่ได้รับการรายงานจากการศึกษาอื่น ๆและใช้ SSR ,
กับก่อนหน้านี้การศึกษาหญ้าไข่มุก ซึ่งรายงานค่ารูปเฉลี่ย 0.49 โดยยีนที่สัมพันธ์กับค่า SSR ) ทดสอบบนแผงพันธุกรรมเดียวกัน ( Bertin et al . 2005 )