Application of metabolomic analysis

Application of metabolomic analysis to the
understanding of oxidative stresses
Experimental conditions such as various nutrient sources
and stresses have been commonly used in well-characterized
microorganisms like E. coli [38]. Similarly, E.
histolytica trophozoites were also tested for such environmental
conditions to understand the response [39]. E.
histolytica trophozoites are exposed to various reactive
oxygen or nitrogen species (ROS and RNS) during tissue
invasion, colonization in the intestine, and extra intestinal
propagation [39]. E. histolytica lacks most of the components
involved in the usual antioxidant defense mechanisms
in aerobic organisms, such as catalase, glutathione,
and the glutathione-recycling enzymes. E. histolytica also
lacks glucose 6-phosphate dehydrogenase (G6PD), and
thus functional pentose phosphate pathway is absent to
yield NADPH [4]. However, the genome of E. histolytica
encodes several proteins for detoxification of reactive
oxygen and nitrogen species (ROS, RNS), such as peroxiredoxin,
superoxide dismutase, rubrerythrin, hybridcluster
protein, and flavo-di-iron proteins [40,41]. In
addition, E. histolytica also possesses pyridine nucleotide
transhydrogenase, and NADH kinase for NADPH synthesis
from NAD(H) [42,43
]. NAPDH is in turn utilized
in the detoxification of ROS and RNS. Recently Pearson
et al. utilized DNA affinity chromatography and mass
spectrometry to identify a new E. histolytica transcription
factor that plays a role in coordinately regulating gene
expression in response to hydrogen peroxide exposure
[44].
R

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

แอพลิเคชันของการวิ metabolomic การความเข้าใจของ oxidative เครียดเงื่อนไขทดลองเช่นแหล่งธาตุอาหารต่าง ๆและความเครียดโดยทั่วไปใช้ในห้องพัก characterizedจุลินทรีย์เช่น E. coli [38] ในทำนองเดียวกัน อีนอกจากนี้ยังทดสอบ histolytica trophozoites สำหรับเช่นสิ่งแวดล้อมเงื่อนไขเข้าใจตอบสนอง [39] อีhistolytica trophozoites กำลังเผชิญกับปฏิกิริยาต่าง ๆออกซิเจนหรือไนโตรเจนชนิด (ROS และ RNS) ระหว่างเนื้อเยื่อบุกรุก สนามในลำไส้ และลำไส้เพิ่มเผยแพร่ [39] E. histolytica ขาดส่วนประกอบส่วนใหญ่เกี่ยวข้องกับกลไกการป้องกันสารต้านอนุมูลอิสระปกติในสิ่งมีชีวิตเต้นแอโรบิก เช่น catalase กลูตาไธโอนและเอนไซม์กลูตาไธโอนรีไซเคิล E. histolytica ยังขาดกลูโคส 6-ฟอสเฟต dehydrogenase (G6PD), และจึงขาดงานสฟอสเฟตไปผลผลิต NADPH [4] อย่างไรก็ตาม จีโนมของ E. histolyticaจแมปโปรตีนหลายสำหรับการล้างพิษของปฏิกิริยาออกซิเจนและไนโตรเจนชนิด (ROS, RNS), เช่น peroxiredoxinซูเปอร์ออกไซด์ dismutase, rubrerythrin, hybridclusterโปรตีน และโปรตีนเหล็ก flavo ดี [40,41] ในนอกจากนี้ E. histolytica ยังมีนิวคลีโอไทด์ pyridinetranshydrogenase และ NADH kinase สำหรับสังเคราะห์ NADPHจาก NAD(H) [42,43]. NAPDH ในการใช้ประโยชน์ในการล้างพิษ RNS และ ROS เพียร์สันเมื่อเร็ว ๆ นี้ร้อยเอ็ด al. ใช้ดีเอ็นเอความสัมพันธ์ chromatography และมวลspectrometry เพื่อระบุการ transcription E. histolytica ใหม่ปัจจัยที่มีบทบาทในการควบคุมยีน coordinatelyนิพจน์ในการตอบสนองต่อแสงของไฮโดรเจนเพอร์ออกไซด์[44]R

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การประยุกต์ใช้การวิเคราะห์ metabolomic กับความเข้าใจในการออกซิเดชั่เน้นเงื่อนไขการทดลองเช่นแหล่งที่มาของสารอาหารต่างๆและความเครียดได้รับการใช้กันทั่วไปในลักษณะที่ดีจุลินทรีย์เช่นเชื้อE. coli [38] ในทำนองเดียวกัน E. histolytica trophozoites ได้มีการทดสอบยังสิ่งแวดล้อมเช่นเงื่อนไขที่จะเข้าใจการตอบสนอง[39] อีtrophozoites histolytica กำลังเผชิญกับปฏิกิริยาต่างๆออกซิเจนหรือไนโตรเจนชนิด(ROS และอาร์เอ็นเอ) ในระหว่างเนื้อเยื่อบุกรุกการล่าอาณานิคมในลำไส้และลำไส้พิเศษขยายพันธุ์ [39] E. histolytica ขาดมากที่สุดขององค์ประกอบที่มีส่วนร่วมในการป้องกันสารต้านอนุมูลอิสระกลไกปกติในสิ่งมีชีวิตแอโรบิกเช่นcatalase, กลูตาไธโอนและเอนไซม์กลูตาไธโอน-รีไซเคิล E. histolytica ยังขาดกลูโคสdehydrogenase 6 ฟอสเฟต (G6PD) และทำให้การทำงานวิถีเพนโตสฟอสเฟตขาดการให้ผลผลิตNADPH [4] อย่างไรก็ตามจีโนมของเชื้อ E. histolytica เข้ารหัสโปรตีนหลายล้างพิษของปฏิกิริยาออกซิเจนและไนโตรเจนชนิด (ROS, RNS) เช่น peroxiredoxin, superoxide dismutase, rubrerythrin, hybridcluster โปรตีนและ flavo-di-เหล็กโปรตีน [40,41] ในนอกจากนี้อี histolytica ยังมี pyridine เบื่อหน่าย transhydrogenase และไคเนส NADH สำหรับการสังเคราะห์ NADPH จาก NAD (H) [42,43] NAPDH เป็นที่ในการเปิดใช้ในการล้างพิษของROS และ RNS เมื่อเร็ว ๆ นี้เพียร์สันและอัล ความสัมพันธ์โคดีเอ็นเอใช้และมวลspectrometry การระบุอี histolytica ถอดความใหม่อีกปัจจัยหนึ่งที่มีบทบาทในการควบคุมcoordinately ยีนแสดงออกในการตอบสนองต่อการสัมผัสไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์[44]. R

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การประยุกต์การวิเคราะห์ metabolomic กับความเครียดออกซิเด

เข้าใจสภาวะการทดลอง เช่น สารอาหารต่าง ๆแหล่ง
และความเครียดที่ถูกใช้บ่อยในดีลักษณะ
จุลินทรีย์เช่น E . coli [ 38 ] ในทำนองเดียวกัน , E .
ทั้งหมด 12 ตัวอย่าง trophozoites ยังทดสอบสภาพแวดล้อม
เช่นเข้าใจคำตอบ [ 39 ]
Eทั้งหมด 12 ตัวอย่าง trophozoites จะสัมผัสกับออกซิเจนหรือไนโตรเจนชนิดต่าง ๆปฏิกิริยา
( รอสและ RNs ) ในระหว่างการรุกรานเนื้อเยื่อ
, การล่าอาณานิคมในลำไส้และลำไส้
พิเศษขยายพันธุ์ [ 39 ] ทั้งหมด 12 ตัวอย่าง เช่น ขาดส่วนขององค์ประกอบที่เกี่ยวข้องในปกติ

ในกลไกการป้องกันสารต้านอนุมูลอิสระที่มีสิ่งมีชีวิตเช่น Catalase , กลูตาไธโอน , กลูต้าไธโอน รีไซเคิล
และเอนไซม์ E .ทั้งหมด 12 ตัวอย่างยังขาดเอนไซม์กลูโคส
6-phosphate ( G6PD ) และ
ดังนั้นการทำงานวิถีเพนโตสฟอสเฟตไม่อยู่

ผลผลิต nadph [ 4 ] อย่างไรก็ตาม จีโนมของ E .
เข้ารหัสโปรตีนทั้งหมด 12 ตัวอย่างหลายสำหรับการล้างพิษของปฏิกิริยา ( ROS
ออกซิเจนและไนโตรเจนชนิด , เช่น peroxiredoxin RNs ) , Superoxide Dismutase rubrerythrin
, ,
hybridcluster โปรตีน และโปรตีน flavo di เหล็ก [ 40,41 ] ใน
นอกจากนี้ยังมีคุณสมบัติเช่นไพริดีนนิวคลีโอไทด์ทั้งหมด 12 ตัวอย่าง
transhydrogenase และ NADH สำหรับการสังเคราะห์ไคเนส
nadph จาก NAD ( H ) [ 42,43
] napdh จะใช้
ในการล้างพิษของผลตอบแทนและ RNs . เมื่อเร็ว ๆนี้เพียร์สัน
et al . ใช้ดีเอ็นเอขี้รังแค และมวล
วิธีที่จะระบุใหม่ ทั้งหมด 12 ตัวอย่างการถอดความ
ปัจจัยที่มีบทบาทใน coordinately
ควบคุมยีน