Sediment, a special realm in aquati

Sediment, a special realm in aquatic environments, has high microbial diversity. While there are numerous reports about the microbial community in marine sediment, freshwater and intertidal sediment communities have been overlooked. The present study determined millions of Illumina reads for a comparison of bacterial communities in freshwater, intertidal wetland, and marine sediments along Pearl River, China, using a technically consistent approach. Our results show that both taxon richness and evenness were the highest in freshwater sediment, medium in intertidal sediment, and lowest in marine sediment. The high number of sequences allowed the determination of a wide variety of bacterial lineages in all sediments for reliable statistical analyses. Principal component analysis showed that the three types of communities could be well separated from phylum to operational taxonomy unit (OTU) levels, and the OTUs from abundant to rare showed satisfactory resolutions. Statistical analysis (LEfSe) demonstrated that the freshwater sediment was enriched with Acidobacteria, Nitrospira, Verrucomicrobia, Alphaproteobacteria, and Betaproteobacteria. The intertidal sediment had a unique community with diverse primary producers (such as Chloroflexi, Bacillariophyta, Gammaproteobacteria, and Epsilonproteobacteria) as well as saprophytic microbes (such as Actinomycetales, Bacteroidetes, and Firmicutes). The marine sediment had a higher abundance of Gammaproteobacteria and Deltaproteobacteria, which were mainly involved in sulfate reduction in anaerobic conditions. These results are helpful for a systematic understanding of bacterial communities in natural sediment environments.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ตะกอน ขอบเขตพิเศษในสภาพแวดล้อมน้ำ มีความหลากหลายทางชีวภาพของจุลินทรีย์สูง ในขณะที่มีรายงานมากมายเกี่ยวกับชุมชนจุลินทรีย์ในทะเลตะกอน ตะกอนน้ำจืด และ intertidal ชุมชนได้ถูกมองข้าม การศึกษาปัจจุบันกำหนดล้าน Illumina อ่านสำหรับการเปรียบเทียบชุมชนแบคทีเรียในพื้นที่ชุ่มน้ำน้ำจืด intertidal และตะกอนทะเลริมแม่น้ำเพิร์ล ประเทศจีน ใช้วิธีการทางเทคนิคที่สอดคล้องกัน ผลของเราแสดงว่า taxon ร่ำรวยและ evenness ได้สูงสุดในตะกอนน้ำจืด ปานกลางในตะกอน intertidal และต่ำสุดในตะกอนทะเล จำนวนลำดับสูงได้กำหนดความหลากหลายของเชื้อชาติเชื้อแบคทีเรียในตะกอนทั้งหมดสำหรับวิเคราะห์ทางสถิติที่เชื่อถือได้ ส่วนประกอบหลักการวิเคราะห์พบว่า ชุมชนสามชนิดสามารถดีแยกออกจากไฟลัมระดับหน่วย (OTU) ระบบปฏิบัติงาน และ OTUs จากอุดมสมบูรณ์เพื่อแก้ปัญหาพอแสดงหายาก วิเคราะห์ทางสถิติ (LEfSe) แสดงว่า ตะกอนน้ำจืดอุดมไป ด้วย Acidobacteria, Nitrospira, Verrucomicrobia, Alphaproteobacteria และ Betaproteobacteria ตะกอน intertidal มีชุมชนเฉพาะ มีหลากหลายผู้ผลิตหลัก (เช่น Chloroflexi, Bacillariophyta, Gammaproteobacteria และ Epsilonproteobacteria) และจุลินทรีย์ saprophytic (เช่น Actinomycetales, Bacteroidetes และ Firmicutes) ตะกอนในทะเลมีความอุดมสมบูรณ์สูง Gammaproteobacteria และ Deltaproteobacteria ที่ได้ส่วนใหญ่เกี่ยวข้องกับลดซัลเฟตในเงื่อนไขที่ไม่ใช้ออกซิเจน ผลลัพธ์เหล่านี้จะเป็นประโยชน์สำหรับความเข้าใจระบบของชุมชนแบคทีเรียในสภาพแวดล้อมธรรมชาติตะกอน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ตะกอนดินแดนพิเศษในสภาพแวดล้อมที่น้ำมีความหลากหลายของจุลินทรีย์สูง ขณะที่มีรายงานจำนวนมากเกี่ยวกับชุมชนของจุลินทรีย์ในดินตะกอนทะเลน้ำจืดและตะกอนชุมชน intertidal ได้รับการมองข้าม การศึกษาครั้งนี้กำหนดนับล้าน Illumina อ่านสำหรับการเปรียบเทียบของชุมชนแบคทีเรียในน้ำจืดบึง intertidal และตะกอนทะเลพร้อมแม่น้ำเพิร์ล, จีน, โดยใช้วิธีการทางเทคนิคที่สอดคล้องกัน ผลของเราแสดงให้เห็นว่าความร่ำรวยทั้งแท็กซอนและสมดุลเป็นที่สูงที่สุดในตะกอนน้ำจืดขนาดกลางในตะกอน intertidal และต่ำสุดในดินตะกอนทะเล จำนวนที่สูงได้รับอนุญาตของลำดับความมุ่งมั่นของความหลากหลายของ lineages แบคทีเรียในตะกอนทั้งหมดการวิเคราะห์ทางสถิติที่เชื่อถือได้ การวิเคราะห์องค์ประกอบหลักพบว่าสามประเภทของชุมชนที่จะได้รับการแยกออกจากกันอย่างดีจากประเภทหน่วยอนุกรมวิธานการดำเนินงาน (OTU) ระดับและ Otus จากความอุดมสมบูรณ์ที่หายากที่จะแสดงให้เห็นความละเอียดที่น่าพอใจ การวิเคราะห์ทางสถิติ (lefse) แสดงให้เห็นว่าตะกอนน้ำจืดเป็นที่อุดมไปด้วย Acidobacteria, Nitrospira, Verrucomicrobia, Alphaproteobacteria และ Betaproteobacteria ตะกอน intertidal มีชุมชนที่ไม่ซ้ำกันกับผู้ผลิตหลักที่มีความหลากหลาย (เช่น Chloroflexi, Bacillariophyta, Gammaproteobacteria และ Epsilonproteobacteria) เช่นเดียวกับจุลินทรีย์ saprophytic (เช่น Actinomycetales, Bacteroidetes และ Firmicutes) ตะกอนทะเลมีความอุดมสมบูรณ์สูงขึ้นของ Gammaproteobacteria และ Deltaproteobacteria ซึ่งส่วนใหญ่มีส่วนร่วมในการลดซัลเฟตในสภาวะไร้อากาศ ผลลัพธ์เหล่านี้มีประโยชน์สำหรับการทำความเข้าใจระบบของชุมชนแบคทีเรียในสภาพแวดล้อมที่ตะกอนธรรมชาติ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ดินแดนพิเศษในสภาพแวดล้อมทางน้ำ มีความหลากหลายของจุลินทรีย์สูง ในขณะที่มีรายงานมากมายเกี่ยวกับชุมชนจุลินทรีย์ในดินตะกอนทะเลน้ำจืดและตะกอน ป่าโกงกาง ชุมชนได้ มองข้าม การศึกษาพิจารณาล้านของ Illumina อ่านการเปรียบเทียบแบคทีเรียในชุมชนบึงน้ำจืด , ป่าโกงกาง ,ทางทะเลและตะกอนตามแม่น้ำไข่มุกจีนโดยใช้วิธีการที่สอดคล้องกันในทางเทคนิค ผลของเราแสดงให้เห็นว่าทั้งสองชนิดมีความมั่งคั่งและความราบสูงสุดในตะกอนน้ำจืด กลางในตะกอน ป่าโกงกาง และถูกที่สุดในตะกอนทะเล จำนวนของลำดับให้กำหนดความหลากหลายของเชื้อชาติในตะกอนแบคทีเรียทั้งหมดสำหรับการวิเคราะห์ทางสถิติที่เชื่อถือได้การวิเคราะห์องค์ประกอบหลัก พบว่า สามประเภทของชุมชนอาจจะแยกกันจากไฟลัมหน่วยอนุกรมวิธานปฏิบัติการ ( otu ) ระดับ และจากที่หายาก พบชุกชุมในมติที่น่าพอใจ การวิเคราะห์ทางสถิติ ( lefse ) พบว่าตะกอนน้ำจืด คือ อุดมไปด้วย acidobacteria ไนโตรสไปรา verrucomicrobia alphaproteobacteria , , , , และ betaproteobacteria .ตะกอนป่าโกงกางมีชุมชนที่เป็นเอกลักษณ์กับผู้ผลิตหลักที่หลากหลาย ( เช่น chloroflexi , Bacillariophyta , gammaproteobacteria และ epsilonproteobacteria ) รวมทั้งโดยกินสิ่งที่เน่าเปื่อยจุลินทรีย์ ( เช่น actinomycetales bacteroidetes , และ Firmicutes ) ตะกอนทะเลมีความอุดมสมบูรณ์สูง และ deltaproteobacteria gammaproteobacteria ,ซึ่งส่วนใหญ่มีส่วนร่วมในการลดซัลเฟตในเงื่อนไขแบบไม่ใช้ออกซิเจน ผลลัพธ์เหล่านี้จะเป็นประโยชน์สำหรับความเข้าใจในระบบของชุมชนที่มีสภาพแวดล้อม
ตะกอนธรรมชาติ