2.7. Microbial community as determi

2.7. Microbial community as determined by denaturing gradient gel electrophoresis

The samples for microbial community analysis were collected before and after 5 days of the experiment. Root and soil samples were initially homogenized using a tissue grinder and sonicator. Water samples were filtrated through a 0.2 μm filter membrane (Nuclepore, Whatman, UK).

Total genomic DNA was extracted from the samples using the SDS-based method as described previously by Zhou et al. (Zhou et al., 1996) and purified by using the Gel/PCR DNA fragments extraction kit (Geneaid, Taiwan). The purified DNA was used as a template for amplification of the partial 16S rDNA fragment of the domain Bacteria using Taq DNA polymerase (Invitrogen, USA) according to the manufacturer's protocol with

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.7. จุลินทรีย์ชุมชนตามที่กำหนดโดย denaturing อิเจไล่ระดับตัวอย่างสำหรับการวิเคราะห์จุลินทรีย์ชุมชนถูกจัดเก็บก่อน และ หลังการทดลอง 5 วัน ตัวอย่างรากและดินถูกตอนแรก homogenized ใช้เครื่องบดเนื้อเยื่อและ sonicator ตัวอย่างน้ำมี filtrated ผ่านการ 0.2 ไมครอนกรองเมมเบรน (Nuclepore, Whatman สหราชอาณาจักร)ดีเอ็นเอออกรวมสกัดจากตัวอย่างที่ใช้ SDS ตามวิธีตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้โดยโจว et al. (โจว et al. 1996) และบริสุทธิ์ โดยใช้ชุดแยกชิ้นส่วนของดีเอ็นเอ เจล/PCR (Geneaid ไต้หวัน) ดีเอ็นเอบริสุทธิ์ใช้เป็นแม่แบบสำหรับการขยายของส่วนของ rDNA 16S บางส่วนของโดเมนแบคทีเรียใช้ Taq DNA พอลิเมอเรส (Invitrogen, USA) ตามโพรโทคอลผู้ผลิตด้วย

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.7 กลุ่มจุลินทรีย์ที่กำหนดโดย denaturing เจลไล่ระดับสี electrophoresis

ตัวอย่างสำหรับการวิเคราะห์กลุ่มจุลินทรีย์ที่ถูกเก็บรวบรวมก่อนและหลังวันที่ 5 ของการทดลอง รากและดินตัวอย่างที่ถูกปั่นในขั้นต้นโดยใช้เครื่องบดเนื้อเยื่อและคลื่นเสียง ตัวอย่างน้ำที่กรองผ่านตัวกรองเมมเบรน 0.2 ไมครอนกรอง (Nuclepore, Whatman สหราชอาณาจักร).

ดีเอ็นเอทั้งหมดถูกสกัดจากตัวอย่างโดยใช้วิธี SDS-ตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้โดยโจว, et al (Zhou et al., 1996) และบริสุทธิ์โดยใช้เจล / PCR ดีเอ็นเอเศษชุดสกัด (Geneaid ไต้หวัน) ดีเอ็นเอบริสุทธิ์ถูกใช้เป็นแม่แบบสำหรับการขยายของชิ้นส่วนบางส่วน 16S rDNA ของแบคทีเรียโดเมนโดยใช้ Taq DNA Polymerase (Invitrogen, สหรัฐอเมริกา) ตามโปรโตคอลของผู้ผลิตด้วย

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.7 . จุลินทรีย์ชุมชนตามที่กำหนดโดยี่ลาดเจลตัวอย่างการวิเคราะห์ชุมชนจุลินทรีย์ เก็บข้อมูลก่อนและหลัง 5 วันของการทดลอง รากและดินก็เริ่มบดโดยใช้เครื่องบดเนื้อเครื่องเขย่าแบบเสียง . ตัวอย่างน้ำถูกผลิตผ่านμ 0.2 M ไส้กรองเมมเบรน ( nuclepore whatman , UK )รวมจีโนมดีเอ็นเอจากตัวอย่างการใช้ SDS ใช้วิธีตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ โดย โจว et al . ( โจว et al . , 1996 ) และทำให้บริสุทธิ์โดยใช้เทคนิคการสกัดดีเอ็นเอเจล / ชุด ( geneaid , ไต้หวัน ) ดีเอ็นเอสามารถใช้เป็นแม่แบบสำหรับการเพิ่มชิ้นส่วน 16S rDNA บางส่วนของโดเมนแบคทีเรียโดยใช้ดีเอ็นเอพอลิเมอเรส ทัค ( Invitrogen , USA ) ตามขั้นตอนของผู้ผลิตด้วย