In a recent study, a limited search

In a recent study, a limited search for novel flu CTL epitopes
was performed; only one epitope was found with a
search restricted to only a part of the genome, one flu isolate
and one HLA-I molecule [9]. Here, we have performed a
genome-, pathogen- and HLA-wide search for new CTL epitopes
directed against influenza A virus. The genome-wide
aspect assures that all influenza virus proteins are considered,
the pathogen-wide assures that maximum conservation
is achieved, whereas the HLA-wide aspect assures maximum
coverage of human populations. Others and we have
developed immuno-bioinformatics methods to identify CTL
epitopes. Here, we have used recently improved methods
based upon combined HLA binding, TAP binding, and proteasome
processing predictions [10–13]. Note, that these
tools have been developed using large databases such as
SYFPEITHI and Los Alamos database as biological benchmarks,
i.e. they have been designed with optimal immune
epitope identification in mind. The predicted peptides were
synthesized and tested by biochemical methods for binding
to the appropriate recombinant HLA-I protein, and by
IFN- ELISPOT analysis for CTL immune responses using
PBMCs from healthy, elderly and HLA-typed Danish subjects,
which are assumed to have been exposed to multiple
influenza infections in their past. Here – even at the limited
scale of this study – we suggest several HLA-I-restricted,
influenza-specific 9mer epitopes, many of which are conserved
among several different influenza virus isolates even
including the H5N1 bird flu virus. Combining their HLArestriction
specificity, they cover virtually the entire human
population.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ในการศึกษาล่าสุด ค้นหาไข้หวัดนวนิยาย CTL epitopes จำกัดดำเนินการ พบ epitope เดียวกับค้นหาที่จำกัดเฉพาะส่วนของจีโน isolate หวัดหนึ่งและ HLA หนึ่ง-ฉันโมเลกุล [9] ที่นี่ เราได้ทำการกลุ่ม- เชื้อโรค - และ HLA ทั้งค้นหาใหม่ CTL epitopesนำไวรัสไข้หวัดใหญ่ กลุ่มกว้างด้านมั่นใจว่า จะพิจารณาโปรตีนไวรัสไข้หวัดใหญ่ทั้งหมดเชื้อโรคกว้างมั่นใจอนุรักษ์ที่สูงสุดจะประสบความสำเร็จ ในขณะที่ด้านกว้าง HLA มั่นใจสูงสุดความครอบคลุมของประชากรมนุษย์ เราและผู้อื่นได้วิธีการพัฒนาบุคคล immuno-bioinformatics ระบุ CTLepitopes ที่นี่ เราได้ใช้วิธีการปรับปรุงเมื่อเร็ว ๆ นี้ตามรวมผูก HLA แตะผูก และ proteasomeการประมวลผลการคาดคะเน [10-13] หมายเหตุ ที่เครื่องมือได้รับการพัฒนาโดยใช้ฐานข้อมูลขนาดใหญ่เช่นฐานข้อมูล SYFPEITHI และ Los Alamos เป็นเกณฑ์มาตรฐานทางชีวภาพเช่นพวกเขาออกกับภูมิคุ้มกันที่ดีที่สุดรหัส epitope ในใจ เปปไทด์คาดการณ์ได้สังเคราะห์ และทดสอบ โดยวิธีทางชีวเคมีสำหรับผูกไป HLA recombinant เหมาะสม-ผมโปรตีน และโดยIFN - ELISPOT วิเคราะห์สำหรับ CTL การตอบสนองภูมิคุ้มกันโดยใช้PBMCs จากสุขภาพ ผู้สูงอายุ และ HLA พิมพ์วิชาเดนมาร์กซึ่งจะถือว่าได้สัมผัสหลายติดเชื้อไข้หวัดใหญ่ในอดีตของพวกเขา ที่นี่แม้ในการจำกัดขนาดของการศึกษานี้ – เราขอแนะนำหลาย HLA-ฉันจำกัดไข้หวัดใหญ่เฉพาะ 9mer epitopes ที่จะอนุรักษ์ระหว่างไข้หวัดใหญ่แตกต่างกันหลาย ไวรัสที่แยกได้รวมทั้งไวรัสไข้หวัดนก H5N1 รวม HLArestriction ของพวกเขาความจำเพาะ พวกเขาครอบคลุมแทบทั้งมนุษย์ประชากร

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ในการศึกษาล่าสุดการค้นหาที่ จำกัด สำหรับไข้หวัดนวนิยาย epitopes CTL
ได้ดำเนินการ; เพียงหนึ่ง epitope ก็พบว่ามี
การค้นหา จำกัด ให้เพียงส่วนหนึ่งของจีโนมที่เป็นไข้หวัดหนึ่งแยก
และ HLA-I โมเลกุล [9] ที่นี่เราได้ดำเนินการ
ค้นหา genome-, pathogen- และ HLA-กว้างสำหรับ epitopes CTL ใหม่
ผู้กำกับกับไวรัสไข้หวัดใหญ่ จีโนมกว้าง
ด้านมั่นใจว่าทุกโปรตีนไวรัสไข้หวัดใหญ่มีการพิจารณา,
มั่นใจเชื้อโรคทั้งที่อนุรักษ์สูงสุด
จะประสบความสำเร็จในขณะที่ด้าน HLA-กว้างมั่นใจสูงสุด
คุ้มครองของประชากรมนุษย์ อื่น ๆ และเราได้
พัฒนาวิธีการอิมมูโนชีวสารสนเทศเพื่อแจ้ง CTL
epitopes ที่นี่เราได้ใช้วิธีการที่ดีขึ้นเมื่อเร็ว ๆ นี้
ขึ้นอยู่กับการรวม HLA ผูกพันแตะผูกพันและ proteasome
การคาดการณ์การประมวลผล [10-13] โปรดทราบว่าสิ่งเหล่านี้
เครื่องมือที่ได้รับการพัฒนาโดยใช้ฐานข้อมูลขนาดใหญ่เช่น
ฐานข้อมูล SYFPEITHI และ Los Alamos เป็นมาตรฐานทางชีวภาพ
คือพวกเขาได้รับการออกแบบที่ดีที่สุดที่มีภูมิคุ้มกัน
บัตรประจำตัว epitope ในใจ เปปไทด์ที่คาดการณ์ถูก
สังเคราะห์และทดสอบโดยวิธีทางชีวเคมีสำหรับการผูก
กับ recombinant HLA-I โปรตีนที่เหมาะสมและ
IFN-? วิเคราะห์ ELISPOT สำหรับการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกัน CTL ใช้
PBMCs จากที่ดีต่อสุขภาพผู้สูงอายุและ HLA-พิมพ์วิชาเดนมาร์ก
ซึ่งจะถือว่าได้รับการสัมผัสกับหลาย
การติดเชื้อไข้หวัดใหญ่ในอดีตของพวกเขา นี่ - แม้ที่ จำกัด
ขนาดของการศึกษาครั้งนี้ - เราขอแนะนำ HLA-I- จำกัด หลาย
ไข้หวัดใหญ่เฉพาะ epitopes 9mer หลายแห่งที่ได้รับการอนุรักษ์
ในหมู่เชื้อไวรัสไข้หวัดใหญ่ที่แตกต่างกันแยกแม้
รวมทั้งเชื้อไวรัสไข้หวัดนกสายพันธุ์ H5N1 รวม HLArestriction ของพวกเขา
จำเพาะพวกเขาครอบคลุมแทบมนุษย์ทั้งหมด
ประชากร

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ในการศึกษาล่าสุด ค้นหาผู้ป่วยไข้หวัดใหญ่ ctl จำกัดสำหรับนวนิยายแสดง ; เพียงหนึ่งพบว่ามีไวรัสค้นหาจำกัดเพียงส่วนหนึ่งของโครโมโซมหนึ่งจากไข้หวัดใหญ่และหนึ่ง hla-i โมเลกุล [ 9 ] ที่นี่เราได้ทำการจีโนม - เชื้อโรค - hla ค้นหากว้างจากซีทีแอลใหม่มุ่งป้องกันไข้หวัดใหญ่ไวรัส การ genome-wideด้านมั่นใจว่าโปรตีนไวรัสไข้หวัดใหญ่จะพิจารณาเชื้อโรคที่กว้างเพื่อให้มั่นใจได้ว่าสูงสุด อนุรักษ์ได้ ส่วนด้านกว้างมั่นใจสูงสุดค่าสัมประสิทธิ์ความคุ้มครองของประชากรมนุษย์ คนอื่น ๆและเราได้การพัฒนาวิธีการเพื่อระบุ ctl รสนมมูโนจาก . ที่นี่ เราใช้วิธีปรับปรุงเมื่อเร็ว ๆ นี้ขึ้นอยู่กับการรวมการตแตะผูกพันและโปรทีโซมการประมวลผลคาดคะเน [ 10 – 13 ] หมายเหตุ ที่ เหล่านี้เครื่องมือถูกพัฒนาขึ้นโดยใช้ฐานข้อมูลขนาดใหญ่เช่นsyfpeithi และฐานข้อมูล ลอส อลามอส เป็นมาตรฐานทางชีวภาพเช่นที่พวกเขาได้รับการออกแบบ ที่เหมาะสม ภูมิคุ้มกันไวรัสตัวในใจ พบว่าเปปไทด์ คือการสังเคราะห์และทดสอบโดยวิธีทางชีวภาพเพื่อผูกพันให้เหมาะสม hla-i รีคอมบิแนนท์โปรตีน และอินเตอร์เฟียรอน - การวิเคราะห์การตอบสนองทางภูมิคุ้มกันสำหรับ ctl อีไลสปอทนำไปตรวจสุขภาพจากผู้สูงอายุและ DQB1 พิมพ์คนเดนมาร์กซึ่งสันนิษฐานว่าได้รับสัมผัสหลายไข้หวัดใหญ่การติดเชื้อในอดีตของพวกเขา ที่นี่และที่ จำกัดระดับการศึกษา–เราแนะนำ hla-i-restricted หลาย ,ไข้หวัดใหญ่จาก 9mer เฉพาะมากมายที่อนุรักษ์ของไวรัสไข้หวัดใหญ่ สายพันธุ์ที่แตกต่างกันหลายแม้รวมถึงไข้หวัดนกไวรัสไข้หวัดนก รวม hlarestriction ของพวกเขาวิธีที่พวกเขาครอบคลุมเกือบทั้งหมดของมนุษย์ประชากร