bands of BSFGE. The automatic band

bands of BSFGE. The automatic band detection was performed
with a minimum slope of 100 and a noise reduction
of 13. Bands were manually approved and matched to construct
an absent/present binary matrix. A dendrogram was
constructed by Unweighted Pair Group Method with Arithmetic
Mean (UPGMA). Interpretation of BSFGE patterns was
based on the criteria of Tenover et al. [27] Briefly, strains presenting
one- to three-band differences and a similarity of
>85% upon dendrogram analysis were considered to represent
PFGE pattern subtypes, while more than three DNA
band variations and a similarity of

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

วงของ BSFGE ทำการตรวจหาอัตโนมัติวงมีความชันต่ำสุด 100 และลดเสียงรบกวนของ 13 วงได้อนุมัติ และจับคู่กับสร้างด้วยตนเองเมทริกซ์การไบนารีขาด/ปัจจุบัน Dendrogram ถูกสร้าง โดยวิธี Unweighted คู่กลุ่มกับเลขคณิตหมายถึง (UPGMA) มีการตีความของรูปแบบ BSFGEตามเงื่อนไขของ Tenover et al. [27] โดยย่อ สายพันธุ์ที่นำเสนอหนึ่ง - การสามวงความแตกต่างและความคล้ายคลึงกันของ> 85% เมื่อวิเคราะห์ dendrogram ได้ถือเป็นตัวแทนPFGE ลาย subtypes ในขณะที่ DNA มากกว่าสามวงความแตกต่างและความคล้ายของ < 85% dendrogramวิเคราะห์ได้ถือเป็นตัวแทนของ BSFGE แตกต่างกันหมายเลขทะเบียนลำดับนิวคลีโอไทด์ลำดับนิวคลีโอไทด์ที่กำหนดตลอดการศึกษานี้ส่งมาให้ DNA ข้อมูลธนาคารของญี่ปุ่น (DDBJ)ฐานข้อมูลลำดับของนิวคลีโอไทด์ หมายเลขทะเบียนที่กำหนดจะแสดงในตารางที่ 1ผลลัพธ์ลำดับบางส่วนของยีน tufทั้งหมดที่แยกได้ปฏิกิริยาที่เกิดขึ้นบวกกับไพรเมอร์ของยีน tuf ที่ออกแบบจาก S. dysgalactiae ถั่ว dysgalactiae ATCC43078ผลิตภัณฑ์เดียวขยายขนาดคาด 795-bpได้รับจากทั้งหมดกล่าวถึงแยก (Fig. 1) Tufรวบรวมลำดับยีนของสิบสามลักษณะที่แยกได้จากปลาต่าง ๆพันธุ์และประเทศส่งมาที่ลำดับ GenBankฐานข้อมูล (ตาราง 1) แยก 10 รวบรวมจากไต้หวัน ญี่ปุ่นมาเลเซีย และถูกเหมือนกัน (100% ลำดับรหัสประจำตัว) อย่างไรก็ตามthree isolates (Kdy0719, TS041207 and KNH07903 collectedfrom Japan), have a single nucleotide differed fromthat of the other isolates. On the other hand, the determinedsequence of the reference strain ATCC43078 differed from

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

วง BSFGE วงดนตรีที่ได้ดำเนินการโดยอัตโนมัติ
ที่มีความลาดชันขั้นต่ำ 100 และลดเสียงรบกวน
13 วงได้รับการอนุมัติด้วยตนเองและการจับคู่เพื่อสร้าง
ขาด / ปัจจุบันเมทริกซ์ไบนารี dendrogram ถูก
สร้างขึ้นโดยกลุ่มชั่งคู่กับวิธี Arithmetic
Mean (UPGMA) การแปลความหมายของรูปแบบ BSFGE ถูก
ตามเกณฑ์ของ Tenover และคณะ [27] สั้น ๆ สายพันธุ์ที่นำเสนอ
ความแตกต่างหนึ่งสามวงและความคล้ายคลึงกันของ
> 85% การวิเคราะห์ dendrogram ได้รับการพิจารณาให้เป็นตัวแทนของ
เชื้อ PFGE รูปแบบในขณะที่มากกว่าสามดีเอ็นเอ
รูปแบบวงดนตรีและความคล้ายคลึงกันของ <85% ที่ dendrogram
วิเคราะห์เป็น ถือว่าเป็นตัวแทนของประเภทที่แตกต่างกัน BSFGE.
หมายเลขภาคยานุวัติลำดับเบส
ลำดับเบสที่กำหนดตลอดการศึกษาครั้งนี้
ได้รับการส่งไปยังธนาคารข้อมูลดีเอ็นเอของญี่ปุ่น (DDBJ)
ฐานข้อมูลลำดับนิวคลีโอ หมายเลขภาคยานุวัติให้
แสดงในตารางที่ 1.
ผลการค้นหา
ลำดับบางส่วนของยีน TUF
เชื้อทั้งหมดมีปฏิกิริยาตอบสนองในทางบวกกับไพรเมอร์ยีน TUF ที่ได้รับการ
ออกแบบมาจากเอส subsp dysgalactiae dysgalactiae ATCC43078.
ขยายผลิตภัณฑ์เดียวที่มีขนาดที่คาดหวังของ 795-bp
ที่ได้รับจากการตรวจสอบไอโซเลท (รูปที่ 1). TUF
ลำดับยีนสิบสามแยกเก็บจากปลาที่แตกต่างกัน
ชนิดและประเทศที่ถูกส่งไปลำดับ GenBank
ฐานข้อมูล (ตารางที่ 1) สิบสายพันธุ์ที่เก็บรวบรวมจากไต้หวัน, ญี่ปุ่น
และมาเลเซียเป็นเหมือนกัน (ลำดับบัตร 100%) แต่
สามไอโซเลท (Kdy0719, TS041207 และ KNH07903 เก็บรวบรวม
จากประเทศญี่ปุ่น) ได้เบื่อหน่ายเดียวแตกต่างจาก
ที่อื่น ๆ ของเชื้อ ในทางตรงกันข้าม, กำหนด
ลำดับของสายพันธุ์ ATCC43078 อ้างอิงแตกต่างไปจาก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

วงดนตรีของ bsfge . การตรวจหาอัตโนมัติแสดงวงดนตรี
กับความลาดชันขั้นต่ำ 100 และการลดเสียงรบกวน
13 . รัดด้วยตนเองได้รับการอนุมัติและการจับคู่เพื่อสร้าง
เป็นขาด / ปัจจุบันแบบเมทริกซ์ เป็นพันธุกรรม คือ
สร้างโดยวิธีถ่วงน้ำหนักด้วยค่า
หมายถึงกลุ่มคู่ ( UPGMA ) การตีความของรูปแบบ bsfge คือ
ตามเกณฑ์ tenover et al . [ 27 ] สั้น ๆสายพันธุ์ที่เสนอ
- สามวงความแตกต่างและความคล้ายคลึงกันของ
> 85% ตามพันธุกรรมการวิเคราะห์ถือว่าเป็นตัวแทน
PFGE รูปแบบชนิดย่อย , ในขณะที่มากกว่าดีเอ็นเอ 3
วงดนตรีรูปแบบและความคล้ายคลึงของ < 85% ในการวิเคราะห์พันธุกรรม
ถือว่าเป็นตัวแทนของประเภท bsfge แตกต่าง

เปลี่ยนหมายเลขลำดับนิวคลีโอไทด์เบสลำดับการศึกษา
กำหนดตลอดที่ถูกส่งไปยังดีเอ็นเอข้อมูลธนาคารของญี่ปุ่น ( ddbj )
ฐานข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ . การกำหนดตัวเลข
จะแสดงในตารางที่ 1

ลำดับผลลัพธ์บางส่วนของยีนโดย
ทุกไอโซเลทปฏิกิริยาทางบวกกับไฮยีนโดยใช้ไพรเมอร์ที่ออกแบบจาก S .
dysgalactiae subsp . dysgalactiae atcc43078 .
ผลิตภัณฑ์แบบเดียวกับที่คาดว่าขนาดของ 795 BP
ได้จากการแยกทั้งหมด ( รูปที่ 1 ) อย่างไรก็ตาม
ยีน ลำดับ 13 ไอโซจากปลาต่างสายพันธุ์ และประเทศที่ถูกส่งไปยัง

ขนาดลำดับฐานข้อมูล ( ตารางที่ 1 ) 10 ไอโซเลท ที่รวบรวมจากไต้หวัน ญี่ปุ่น และมาเลเซีย
อยู่เหมือนกัน ( 100% ตัวตนดับ ) อย่างไรก็ตาม ,
3 สายพันธุ์ ( kdy0719 ts041207 knh07903 , และรวบรวม
จากญี่ปุ่น )มีซิงเกิลนิวคลีโอไทด์แตกต่างกันจาก
ที่ของอื่น ๆของเชื้อ บนมืออื่น ๆ , กำหนด
ลำดับอ้างอิง atcc43078 แตกต่างจากความเครียด