Figure 2 | Gene discovery strategy. (a,b) Complete-linkage hierarchical clustering of early MIA pathway gene expression in C. roseus based on our data (a) or the Medicinal Plant Genomics Resource consortium (http://medicinalplantgenomics.msu.edu) (b). Colours indicate transcriptional activation (blue) or repression (yellow) relative to untreated samples. Tissues: Fl, flower; mL, mature leaves; iL, immature leaves; St, stem; Ro, root; Sdlg, seedling. Suspension cells (CellSus): Wt, wild-type; O2, ORCA2; O3, ORCA3. Hairy roots (HairRt): Wt, wild-type; Td, TDCi; RebH, RebH_F. Treatments: Not, no treatment; MeJA, methyl jasmonate (6, 12 or 24 h); Con, mock; YE, yeast extract. (c) Candidate P450 protein hits in the epidermis and mesophyll samples from proteomics analysis±s.d. (n¼3). GES, geraniol synthase; G8O, geraniol 8-oxidase; 8-HGO, 8-hydroxygeraniol oxidoreductase; IS, iridoid
synthase; IO, iridoid oxidase; 7-DLGT, 7-deoxyloganetic acid glucosyl transferase; 7-DLH, 7-deoxyloganic acid hydroxylase; LAMT, loganic acid
O-methyltransferase; SGD, strictosidine b-D-glucosidase; SLS, secologanin synthase; STR, strictosidine synthase (1–3: three related genes); TDC,
tryptophan decarboxylase.
รูปที่ 2 | กลยุทธ์การค้นพบยีน (a, b) เชื่อมโยงสมบูรณ์ลำดับคลัสเตอร์ของต้น MIA ทางเดินยีนใน C. ฝรั่งตามข้อมูล (ก) หรือยาพืช Genomics ทรัพยากรองค์กร (http://medicinalplantgenomics.msu.edu) (b) สีระบุเรียกใช้ transcriptional (สีน้ำเงิน) หรือปราบปราม (สีเหลือง) เทียบกับตัวอย่างที่ไม่ถูกรักษา เนื้อเยื่อ: Fl ดอกไม้ มล. ใบไม้ผู้ใหญ่ iL ใบไม้ immature เซนต์ ก้าน Ro ราก Sdlg แหล่ง ระงับเซลล์ (CellSus): Wt ป่าชนิด O2, ORCA2 O3, ORCA3 ขนราก (HairRt): Wt ป่าชนิด Td, TDCi RebH, RebH_F การรักษา: ไม่ ไม่รักษา MeJA, methyl jasmonate (6, 12 หรือ 24 h); บังกะโล ล้อ เย สารสกัดจากยีสต์ (ค) ผู้สมัคร P450 โปรตีนปริมาณในตัวอย่างหนังกำพร้าและ mesophyll จากโปรตีโอมิกส์ analysis±s.d. (n¼3) GES, geraniol synthase G8O, geraniol 8-oxidase 8-HGO, 8 hydroxygeraniol oxidoreductase IS, iridoidsynthase IO, iridoid oxidase 7-DLGT, 7 deoxyloganetic กรด glucosyl transferase 7-DLH, 7 deoxyloganic กรด hydroxylase LAMT กรด loganicO-methyltransferase SGD, strictosidine b-D-glucosidase SLS, secologanin synthase STR, strictosidine synthase (1-3: สามที่เกี่ยวข้องกับยีน); ทีดีซีทริปโตเฟน decarboxylase
การแปล กรุณารอสักครู่..

รูปที่ 2 | กลยุทธ์การค้นพบยีน (ข) ที่สมบูรณ์-เชื่อมโยงการจัดกลุ่มตามลำดับชั้นของทางเดิน MIA ต้นการแสดงออกของยีนใน C. roseus อยู่บนพื้นฐานของข้อมูลของเรา (ก) หรือสมาคมสมุนไพรฟังก์ชั่นทรัพยากร (http://medicinalplantgenomics.msu.edu) (ข) สีบ่งบอกถึงการเปิดใช้งานการถอดรหัส (สีฟ้า) หรือปราบปราม (สีเหลือง) เมื่อเทียบกับกลุ่มตัวอย่างที่ได้รับการรักษา เนื้อเยื่อ: ชั้นดอกไม้; มิลลิลิตรใบผู้ใหญ่; iL ใบอ่อน; เซนต์, ก้าน; Ro ราก; SDLG, ต้นกล้า เซลล์ (Suspension CellSus): น้ำหนักป่าชนิด; O2, ORCA2; O3, ORCA3 รากขน (HairRt): น้ำหนักป่าชนิด; td, TDCi; RebH, RebH_F การรักษา: ไม่, ไม่มีการรักษา; เชื้อร, เมธิล jasmonate (6, 12 หรือ 24 ชั่วโมง); นักโทษเยาะเย้ย; YE, สารสกัดจากยีสต์ (ค) โปรตีน P450 สมัครฮิตในผิวหนังชั้นนอกและตัวอย่าง mesophyll จากการวิเคราะห์โปรตีน± SD (n¼3) GES, เทส geraniol; G8O, geraniol 8 oxidase; 8 HGO, oxidoreductase 8 hydroxygeraniol; IS, iridoid
เทส; IO, oxidase iridoid; 7 DLGT 7 deoxyloganetic transferase glucosyl กรด; 7 DLH 7 deoxyloganic hydroxylase กรด; LAMT กรด loganic
O-methyltransferase; SGD, strictosidine BD-glucosidase; SLS, secologanin เทส; STR, เทส strictosidine (1-3: สามยีนที่เกี่ยวข้อง); TDC,
decarboxylase โพรไบโอ
การแปล กรุณารอสักครู่..

รูปที่ 2 | ยีนค้นพบกลยุทธ์ ( A , B ) โดยการจัดกลุ่มลำดับชั้นสมบูรณ์ก่อนมีอาทางเดินยีน C roseus บนพื้นฐานของข้อมูล ( ) หรือยาในกลุ่มพืชทรัพยากร ( http://medicinalplantgenomics.msu.edu ) ( B ) สีแสดงการกระตุ้นหรือการลอง ( สีฟ้า ) ( สีเหลือง ) เมื่อเทียบกับตัวอย่างดิบ เนื้อเยื่อ : FL , ดอกไม้ ; ML , ผู้ใหญ่ใบ ;อิล ใบอ่อน ; St , ต้น ; ราก ; โร sdlg ต้นกล้า . เซลล์แขวนลอย ( cellsus ) โดยน้ำหนัก ของ ; O2 orca2 ; O3 orca3 . รากขน ( hairrt ) : WT ของ ; TD , ไอ ; rebh rebh_f , บําบัด : ไม่ ไม่ รักษา ตารางเมทิลจั มเนต ( , 6 , 12 หรือ 24 ชั่วโมง ) ; คอน เยาะเย้ย เจ้า , สารสกัดจากยีสต์ ( C ) ของโปรตีนพีฮิตในผิวหนังชั้นนอกและตัวอย่างมีโซฟีลล์จากการวิเคราะห์ Proteomics ± S.D . ( N ¼ 3 ) ซานฟรานซิสโก ,เจอรานิออลเทส ; g8o เจอรานิออล , 8-oxidase ; 8-hgo 8-hydroxygeraniol อ ซิโดรีดักเทส , ; , ริ ดอยด
synthase ; ไอโอ , ริ ดอยด oxidase ; 7-dlgt 7-deoxyloganetic , กรด glucosyl ทรานสเฟอเรส ; 7-dlh 7-deoxyloganic hydroxylase lamt , กรด , กรด loganic ;
o-methyltransferase ; SGD strictosidine b-d-glucosidase ; แอลเอส และเซคโคโลกานิน ; STR strictosidine , synthase ( 1 – 3 : สาม ยีนที่เกี่ยวข้องกับเพลา
)ทริปใช้ .
การแปล กรุณารอสักครู่..
