KMI is a distributed, in-memory has

KMI is a distributed, in-memory hashing library for matching k-mers and short snippets of DNA sequences. The original KMI code was originally implemented using asynchronous MPI communica-tion. In Figure 12 we show how the performance of the original implementation compares to that of the re-implementation of KMI on top of our communication library. We used two systems in the performance evaluation: 32 BG/Q nodes and 32 P7-IH nodes. The results show that the KMI implementation using our model is 9X and 10X faster than the MPI implementation on P7-IH and BG/Q, respectively.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

KMI กระจาย หน่วยแปลงแป้นพิมพ์ไลบรารีสำหรับประชาคมโลก k และข้อมูลโค้ดสั้นของลำดับดีเอ็นเอได้ รหัส KMI เดิมคือแต่เดิมดำเนินการโดยใช้แบบอะซิงโครนัส MPI communica-ทางการค้า เราแสดงในรูปที่ 12 วิธีการเปรียบเทียบประสิทธิภาพของการดำเนินการเดิมที่ใช้งานใหม่ของ KMI บนไลบรารีการสื่อสารของเรา เราใช้สองระบบในการประเมินประสิทธิภาพการทำงาน: 32 BG/Q โหนดและโหน P7 IH 32 ผลลัพธ์แสดงการใช้รูปแบบของเราใช้งาน KMI ว่า 9 เท่าและ 10 เท่าเร็วกว่าการใช้งาน MPI P7 IH และ BG/Q ตามลำดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

KMI เป็นกระจายในหน่วยความจำ hashing ห้องสมุดสำหรับการจับคู่ K-mers และตัวอย่างสั้น ๆ ของลำดับดีเอ็นเอ รหัส KMI ต้นฉบับเดิมดำเนินการโดยใช้ตรงกัน MPI COMMUNICA-การ ในรูปที่ 12 ที่เราแสดงให้เห็นว่าประสิทธิภาพของการดำเนินงานเดิมเปรียบเทียบกับที่ของงานอีกครั้งของ KMI ด้านบนของห้องสมุดการสื่อสารของเรา เราใช้ทั้งสองระบบในการประเมินผลการปฏิบัติงาน: 32 โหนด BG / q และ 32 โหนด P7-IH ผลการศึกษาพบว่าการดำเนินการ KMI โดยใช้รูปแบบของเราคือ 9X 10x และเร็วกว่าการดำเนินงาน MPI ใน P7-IH และ BG / q ตามลำดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

kmi เป็นแบบกระจาย ในความทรงจำ hashing ห้องสมุดสำหรับการจับคู่ k-mers และตัวอย่างสั้นๆ ของดีเอ็นเอลำดับดีเอ็นเอ รหัส kmi ต้นฉบับเดิมใช้ใช้สำหรับการสื่อสารแบบอะซิงโครนัส tion . ในรูปที่ 12 เราแสดงให้เห็นว่าประสิทธิภาพของการปฏิบัติเดิมเปรียบเทียบกับที่ของกำลังการ kmi บนห้องสมุดการสื่อสารของเรา เราใช้สองระบบในการประเมินผลการปฏิบัติงาน : 32 / 32 p7-ih BG Q โหนดและโหนด ผลที่ได้แสดงให้เห็นว่าการใช้แบบจำลองและ kmi เป็น 9x 10x เร็วกว่าดัชนีผลผลิตอุตสาหกรรมและการ p7-ih BG / Q ตามลำดับ