BLAST (Basic Local Alignment Search

BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) analysis was performed for HM102505, which shows 100% identity with the C. gloeosporioides affecting other subtropical fruits. The sequence HM102505 is highly identical to other C. gloeosporioides which were reported from USA, China and Thailand to cause anthracnose disease on different fruits as hosts. During sequence similarity of HM102505 for C. gloeosporioides isolates from mango in India through Genomatix dialing programme with the selected identical isolate from the GenBank, 100% similarity was recorded with AY266390 isolate of C. gloeosporioides reported from Thailand on Herbaceous plants. Lower similarities of selected sequence were found with HM146134, DQ062671, HM53032, HM575231, HM575260, AY266379, AY266373, EF423519 and AY266389 i.e. 89%. Phylogenetic analysis of nucleotide sequence of HM102505 for C. gloeosporioides isolate with selected isolates from Genbank which were all at least 90% identical, was performed using the molecular evolutionary genetics analysis (MEGA) version 4.0 software ( Tamura et al., 2007). The analysis revealed 100% homology to the C. gloeosporioides mango isolate (AY266390) from Thailand and high homology with the other reported isolates of C. gloeosporioides ( Fig. 3). Thus, on the basis of the sequence similarity and phylogenetic analysis it was confirmed that mango anthracnose disease in India is caused by C. gloeosporioides. From India, the existence of anthracnose disease of mango has been confirmed by serological and RAPD analyses ( Gupta et al., 2010) but to the best of our knowledge no prior information is available at sequence level phylogenetic analysis of C. gloeosporioides from India.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

วิเคราะห์ระเบิด (พื้นฐานเฉพาะตำแหน่งค้นหาเครื่องมือ) ที่ดำเนินการสำหรับ HM102505 ซึ่งแสดงตัวตน 100% กับ gloeosporioides C. ผลผลไม้อื่น ๆ แบบ ลำดับที่ HM102505 จะสูงเหมือนกับอื่น ๆ C. gloeosporioides ซึ่งมีรายงานจากสหรัฐอเมริกา จีน และไทยทำให้เกิดโรค anthracnose บนผลไม้ต่าง ๆ เป็นเจ้าภาพ ระหว่างลำดับคล้ายของ HM102505 สำหรับ C. gloeosporioides ที่แยกได้จากมะม่วงในอินเดียผ่าน Genomatix เรียกโปรแกรม ด้วยการเลือกเหมือนแยกจาก GenBank, 100% คล้ายถูกบันทึกไว้ ด้วย AY266390 แยกของ C. gloeosporioides รายงานจากไทยใน Herbaceous พืช ต่ำความเหมือนของลำดับเลือกพบกับ HM146134, DQ062671, HM53032, HM575231, HM575260, AY266379, AY266373, EF423519 และ AY266389 เช่น 89% แยกวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์ของ HM102505 สำหรับ C. gloeosporioides phylogenetic กับเลือกแยกจาก Genbank ที่ได้ทั้งหมดอย่างน้อย 90% เหมือนกัน ทำโดยใช้การวิเคราะห์โมเลกุลพันธุศาสตร์เชิงวิวัฒนาการ (ร็อค) เวอร์ชัน 4.0 ซอฟต์แวร์ (Tamura et al., 2007) วิเคราะห์เปิดเผย 100% homology กับมะม่วง C. gloeosporioides แยก (AY266390) จากประเทศไทย และสูง homology กับอื่น ๆ รายงานแยกของ C. gloeosporioides (Fig. 3) ดัง ตามลำดับคล้ายการวิเคราะห์ phylogenetic ก็ได้รับการยืนยันว่า โรค anthracnose มะม่วงในอินเดียเกิดจาก C. gloeosporioides จากอินเดีย ได้รับการยืนยันการมีอยู่ของโรค anthracnose ของมะม่วง โดยสภาวะอาร์เอพีดีวิเคราะห์ (กุปตา et al., 2010) แต่ให้ดีสุดของความรู้ของเรา ไม่มีข้อมูลก่อนได้ที่ลำดับ phylogenetic วิเคราะห์ระดับของ C. gloeosporioides จากอินเดีย

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ระเบิด (Alignment ท้องถิ่นพื้นฐานเครื่องมือค้นหา) การวิเคราะห์ได้ดำเนินการสำหรับ HM102505 ซึ่งแสดงให้เห็นตัวตน 100% กับ gloeosporioides ซีมีผลกระทบต่อผลไม้เขตร้อนอื่น ๆ HM102505 ลำดับเป็นอย่างมากเหมือนกันกับ gloeosporioides ซีอื่น ๆ ที่ได้รับรายงานจากประเทศสหรัฐอเมริกา, จีนและไทยที่จะทำให้เกิดโรคแอนแทรกโนผลไม้ที่แตกต่างกันในฐานะเจ้าภาพ ในช่วงคล้ายคลึงกันลำดับของ HM102505 สำหรับ C. gloeosporioides แยกจากมะม่วงในประเทศอินเดียโดยผ่านโปรแกรมโทร Genomatix กับแยกเหมือนกันเลือกจาก GenBank ที่คล้ายคลึงกัน 100% ได้รับการบันทึกไว้ด้วย AY266390 แยกซี gloeosporioides รายงานจากประเทศไทยในพืชล้มลุก คล้ายคลึงล่างของลำดับการคัดเลือกที่พบกับ HM146134, DQ062671, HM53032, HM575231, HM575260, AY266379, AY266373, EF423519 และ AY266389 คือ 89% การวิเคราะห์วิวัฒนาการของลำดับเบสของ HM102505 สำหรับ gloeosporioides ซีแยกกับที่เลือกแยกจาก Genbank ซึ่งทุกคนอย่างน้อย 90% เหมือนกันได้รับการดำเนินการโดยใช้การวิเคราะห์วิวัฒนาการพันธุศาสตร์ระดับโมเลกุล (MEGA) ซอฟต์แวร์รุ่น 4.0 (ทามูระ et al., 2007) การวิเคราะห์พบคล้ายคลึงกัน 100% กับ C. gloeosporioides แยกมะม่วง (AY266390) จากประเทศไทยและคล้ายคลึงกันสูงที่มีสายพันธุ์อื่น ๆ รายงานของซี gloeosporioides (รูปที่. 3) ดังนั้นบนพื้นฐานของความคล้ายคลึงกันตามลำดับและการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการที่ได้รับการยืนยันว่าโรคแอนแทรกโนมะม่วงในอินเดียเกิดจาก C. gloeosporioides จากประเทศอินเดีย, การดำรงอยู่ของโรคแอนแทรกโนมะม่วงได้รับการยืนยันจากทางภูมิคุ้มกันและ RAPD วิเคราะห์ (Gupta et al., 2010) แต่ที่ดีที่สุดของความรู้ของเราไม่มีข้อมูลก่อนที่มีอยู่ในระดับลำดับการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการของ gloeosporioides ซีจากประเทศอินเดีย

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ระเบิด ( เครื่องมือค้นหาการปรับพื้นฐานท้องถิ่น ) วิเคราะห์ข้อมูลเพื่อ hm102505 ซึ่งแสดงให้เห็นเอกลักษณ์กับ C . gloeosporioides 100% ต่อผลไม้เขตร้อนอื่น ๆ ลำดับ hm102505 สูงอื่น ๆ C . gloeosporioides เหมือนกันซึ่งมีรายงานจากสหรัฐอเมริกา จีน และไทย เพื่อทำให้เกิดโรคแอนแทรคโนสของผลไม้ที่แตกต่างกันเป็นเจ้าภาพ ในความเหมือนของลำดับ hm102505 สำหรับ Cเชื้อราที่แยกได้จากมะม่วงในอินเดียผ่าน genomatix กดเลือกโปรแกรมด้วยเหมือนกันแยกจากขนาด 100 % ความเหมือนที่ถูกบันทึกไว้กับ ay266390 ของ C . gloeosporioides isolate รายงานจากไทยพืชต้นไม้ . ความคล้ายคลึงกันของลำดับล่างที่พบด้วย hm146134 dq062671 hm53032 hm575231 , , , hm575260 ay266379 ay266373 , , , ,และ ef423519 ay266389 เช่น 89 % วิวัฒนาการของการวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์ของ C . gloeosporioides isolate ที่ hm102505 แยกจาก 5% ซึ่งทั้งหมดอย่างน้อย 90% เหมือนกัน มีการใช้ระดับโมเลกุลการวิเคราะห์พันธุศาสตร์วิวัฒนาการ ( ใหญ่ ) รุ่น 4.0 ซอฟต์แวร์ ( ทามูระ et al . , 2007 ) จากการวิเคราะห์พบ 100% ตัว c .มะม่วงแยกเชื้อรา ( ay266390 ) จากประเทศไทยและลำดับสูงกับอื่น ๆรายงานเชื้อ C . gloeosporioides ( รูปที่ 3 ) ดังนั้นบนพื้นฐานของความคล้ายคลึงของลําดับและการวิเคราะห์ ซึ่งได้รับการยืนยันว่า โรคแอนแทรคโนสมะม่วงในอินเดีย เกิดจาก C . gloeosporioides . จากอินเดียการดำรงอยู่ของโรคแอนแทรคโนสของมะม่วงและได้รับการยืนยันจากการศึกษาโดยการวิเคราะห์ ( Gupta et al . , 2010 ) แต่เพื่อที่ดีที่สุดของความรู้ของเราไม่ก่อนที่ข้อมูลจะพร้อมใช้งานในระดับต่างๆของ C . gloeosporioides ลำดับการวิเคราะห์จากอินเดีย