Due to its highly conserved nature, the 16S rRNA gene
sequence is inadequate for finer differentiation of phytoplasma
strains. Therefore, we next conducted homology
analyses of the secY, groEL, and amp genes (Table 1). The
secY and groEL genes are well conserved in ‘Ca. P. asteris’
and are proposed to be appropriate for finer differentiation
of strains of the species (Lee et al. 2006; Mitrovic´ et al.
2011). The antigenic membrane protein (amp) gene is under
positive selection and harbors high genetic diversity, which
can be used to resolve classifications at the strain level
(Kakizawa et al. 2006). The secY, groEL, and amp genes of
HP were amplified and sequenced as described previously
(Kakizawa et al. 2006; Lee et al. 2006). Like the 16S rRNA
gene, these three genes were also perfectly conserved
among the three HP isolates. The secY (AB738738), groEL
(AB738737), and amp (AB738737) gene sequences of HP
were deposited in the GenBank database. The secY gene of
HP had 100 % nucleotide sequence identity with strain
RhY. Furthermore, it had 99.9 % identity with CWB from
chinaberry in China, 99.2 % identity with HYPh, 98.9 %
identity with OY-M, 98.8 % identity with MD, 94.1 %
identity with HYDP and 70.9 % identity with JHP. The
homology of the secY gene sequences indicates that HP is
most closely related to strain RhY among ‘Ca. P. asteris’.
Due to its highly conserved nature, the 16S rRNA genesequence is inadequate for finer differentiation of phytoplasmastrains. Therefore, we next conducted homologyanalyses of the secY, groEL, and amp genes (Table 1). ThesecY and groEL genes are well conserved in ‘Ca. P. asteris’and are proposed to be appropriate for finer differentiationof strains of the species (Lee et al. 2006; Mitrovic´ et al.2011). The antigenic membrane protein (amp) gene is underpositive selection and harbors high genetic diversity, whichcan be used to resolve classifications at the strain level(Kakizawa et al. 2006). The secY, groEL, and amp genes ofHP were amplified and sequenced as described previously(Kakizawa et al. 2006; Lee et al. 2006). Like the 16S rRNAgene, these three genes were also perfectly conservedamong the three HP isolates. The secY (AB738738), groEL(AB738737), and amp (AB738737) gene sequences of HPwere deposited in the GenBank database. The secY gene ofHP had 100 % nucleotide sequence identity with strainRhY. Furthermore, it had 99.9 % identity with CWB fromchinaberry in China, 99.2 % identity with HYPh, 98.9 %identity with OY-M, 98.8 % identity with MD, 94.1 %identity with HYDP and 70.9 % identity with JHP. Thehomology of the secY gene sequences indicates that HP ismost closely related to strain RhY among ‘Ca. P. asteris’.
การแปล กรุณารอสักครู่..

Due to its highly conserved nature, the 16S rRNA gene
sequence is inadequate for finer differentiation of phytoplasma
strains. Therefore, we next conducted homology
analyses of the secY, groEL, and amp genes (Table 1). The
secY and groEL genes are well conserved in ‘Ca. P. asteris’
and are proposed to be appropriate for finer differentiation
of strains of the species (Lee et al. 2006; Mitrovic´ et al.
2011). The antigenic membrane protein (amp) gene is under
positive selection and harbors high genetic diversity, which
can be used to resolve classifications at the strain level
(Kakizawa et al. 2006). The secY, groEL, and amp genes of
HP were amplified and sequenced as described previously
(Kakizawa et al. 2006; Lee et al. 2006). Like the 16S rRNA
gene, these three genes were also perfectly conserved
among the three HP isolates. The secY (AB738738), groEL
(AB738737), and amp (AB738737) gene sequences of HP
were deposited in the GenBank database. The secY gene of
HP had 100 % nucleotide sequence identity with strain
RhY. Furthermore, it had 99.9 % identity with CWB from
chinaberry in China, 99.2 % identity with HYPh, 98.9 %
identity with OY-M, 98.8 % identity with MD, 94.1 %
identity with HYDP and 70.9 % identity with JHP. The
homology of the secY gene sequences indicates that HP is
most closely related to strain RhY among ‘Ca. P. asteris’.
การแปล กรุณารอสักครู่..

เนื่องจากที่มีการอนุรักษ์ธรรมชาติ ลำดับเบส 16S rRNA ยีน
นั้นไม่เพียงพอสำหรับความแตกต่างปลีกย่อยของเชื้อไฟโตพลาสมา
สายพันธุ์ ดังนั้นเราจึงทำการทดลองต่อไป
การวิเคราะห์ของคำย่อของ secretary โกรล , แอมป์ , ยีน ( ตารางที่ 1 )
และคำย่อของ secretary โกรลยีนดีป่าสงวนในแคลิฟอร์เนียหน้า Asteris '
และเสนอให้เหมาะสมกับความแตกต่างของสายพันธุ์
ละเอียดชนิด ( ลี et al . 2006 ;mitrovic ใหม่ et al .
2011 ) โปรตีนเมมเบรนแอนติเจน ( แอมป์ ) ยีนภายใต้
เลือกบวกและท่าเรือความหลากหลายทางพันธุกรรมสูง ซึ่งสามารถใช้แก้ไขหมวดหมู่
( ที่เครียดระดับ kakizawa et al . 2006 ) ส่วนคำย่อของ secretary โกรล , และแอมป์ของยีนและ HP เป็นลำดับเบส
( ตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ kakizawa et al . 2006 ; ลี et al . 2006 ) ชอบ 16S rRNA
ยีนเหล่านี้สามยีนยังสมบูรณ์อนุรักษ์
ระหว่างสาม HP ของเชื้อ ส่วนคำย่อของ secretary ( ab738738 ) โกรล
( ab738737 ) และแอมป์ ( ab738737 ) ลำดับยีนของ HP
ฝากเงินในขนาดของฐานข้อมูล ส่วนคำย่อของ secretary ยีน
HP มี 100% ลำดับนิวคลีโอไทด์ตัวตนมากเกินไปเมื่อย
และมีเอกลักษณ์ของ cwb 99.9% จาก
chinaberry ในประเทศจีน 99.2% ตัวตน hyph 98.9 %
oy-m , ตัวตน ,98.8 ซึ่งมีความเหมือนกับ MD , ร้อยละ %
ตัวตนและเอกลักษณ์ของ hydp 70.9 JHP .
เป็นลำดับยีนของคำย่อของ secretary พบว่า HP
อย่างใกล้ชิดมากที่สุดที่เกี่ยวข้องกับความเครียดมากเกินไปใน ' มาก่อนหน้า Asteris '
การแปล กรุณารอสักครู่..
