There have been more than 350 mutat

There have been more than 350 mutations recorded to date, including
16 splice site mutations that cause Gaucher disease (http://www.
hgmd.org). Many of these mutations, including IVS9 + 1(G N A) and
G355R/R359X, are present in only one or a small number of individuals.
A splice site mutation can have a range of consequences including exon
skipping, activation of cryptic splice sites, creation of a pseudo-exon
within a gene or intron retention (Nakai and Sakamoto, 1994). In the
case of the highly prevalent splice site mutation IVS2+1 (GNA), exon
2 is entirely removed from the spliced mRNA (He and Grabowski,
1992). In order to assess the possible impact of the IVS9+1 (GNA) mutation
found in patient 1 on GBA mRNA splicing, we used the RegRNA
2.0 program (http://regrna2.mbc.nctu.edu.tw/), the Neural Network
program (http://www.fruitfly.org/seq_tools/splice.html), and the Maximum
Entropy program (http://genes.mit.edu/burgelab/maxent/
Xmaxentscan_scoreseq.html) to predict how this mutation would affect
RNA processing. All three programs indicate that the IVS9 + 1 mutated
sequence would no longer be recognized as donor splice site (please
refer to Supplementary Information for details of the in silico analyses).
Additionally, the Neural Network and Maximum Entropy programs predicted
that the mutation would result in a much lower splice site signal
below recognition threshold. Thus, the IVS9 + 1 mutation will be very
disruptive for GBA mRNA processing and enzyme function. An alternative
possibility is the activation of cryptic donor splice sites. In a study
describing another exon 9 splice site mutation (c.1389-1 GNA), the
Neural Network and Maximum Entropy programs predicted the mutated
sequence would no longer be recognized as an acceptor splice site.
However, when RT-PCR analysis was performed on mRNAs from
cultured fibroblasts, it was found that the mutation led to exon slippage
of 4 nucleotides and activation of a cryptic acceptor splice site (Malini
et al., 2014). We are unable to perform similar RT-PCR analysis of fibroblast
GBA mRNAs from patient 1 because dried dot blood on filter paper
cards is the only available cell source for our study

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

มีการกลายพันธุ์มากกว่า 350 บันทึกวันที่ รวมทั้ง16 ตัดต่อพันธุ์ไซต์ที่ทำให้เกิดโรค Gaucher (http://wwwhgmd.org) หลายพันธุ์เหล่านี้ รวมทั้ง IVS9 + 1 (G N A) และG355R/R359X อยู่ในหนึ่งเดียวหรือจำนวนของบุคคลการกลายพันธุ์ไซต์ประกบได้ช่วงของผลรวมทั้ง exonข้าม การเปิดใช้งานไซต์ประกบลับ สร้าง exon หลอกภายในมียีนหรือ intron เก็บข้อมูล (มาซาฮิโระและกาฮะเกสท์เฮาส์ 1994) ในกรณีของกลายพันธุ์ไซต์ประกบเรียงสูง IVS2 + 1 (สบันงา), exon2 ทั้งหมดออกจาก mRNA spliced และราบาวสกี1992) . เพื่อประเมินผลกระทบเป็นไปได้ของ IVS9 + 1 (สบันงา) ผ่าพบในผู้ป่วยที่ 1 บน GBA mRNA ประกบ เราใช้ RegRNAโปรแกรม 2.0 (http://regrna2.mbc.nctu.edu.tw/), เครือข่ายระบบประสาทโปรแกรม (http://www.fruitfly.org/seq_tools/splice.html), และสูงสุดโปรแกรมเอนโทรปี (http://genes.mit.edu/burgelab/maxent/Xmaxentscan_scoreseq.html) เพื่อทำนายการกลายพันธุ์นี้จะมีผลต่อการประมวลผลของ RNA โปรแกรมทั้งหมดสามระบุว่า IVS9 การ + 1 กลายลำดับจะไม่ถูกรู้จักว่าเป็นไซต์ประกบผู้บริจาค (โปรดดูข้อมูลเพิ่มเติมสำหรับรายละเอียดของ silico ในวิเคราะห์)นอกจากนี้ โครงข่ายประสาทและเอนโทรปีสูงสุดโปรแกรมทำนายที่จะทำการกลายพันธุ์มากล่างประกบไซต์สัญญาณต่ำกว่าขีดจำกัดการรับรู้ ดังนั้น การ IVS9 + 1 กลายพันธุ์มีมากอย่างสิ้นเชิงสำหรับฟังก์ชันการประมวลผลและเอนไซม์ GBA mRNA ทางเลือกการเปิดใช้งานไซต์ประกบลับบริจาคเป็นไปได้ ในการศึกษาอธิบายอีก exon 9 ประกบไซต์ผ่า (สบันงา c.1389-1), การโปรแกรมเครือข่ายและเอนโทรปีสูงประสาททำนายการกลายพันธุ์ลำดับจะไม่ถูกรู้จักว่าเป็นไซต์ประกบให้เป็นผู้รับอย่างไรก็ตาม เมื่อวิเคราะห์ RT-PCR ทำบน mRNAs จากfibroblasts อ่าง พบว่า การกลายพันธุ์นำ exon slippageนิวคลีโอไทด์และการเปิดใช้งานให้เป็นผู้รับความลับ 4 ตัดต่อไซต์ (สมเด็จพระet al. 2014) เราไม่สามารถทำการวิเคราะห์การ RT-PCR คล้ายของ fibroblastGBA mRNAs จากผู้ป่วย 1 เนื่องจากแห้งจุดเลือดบนกระดาษกรองบัตรเป็นแหล่งมีเฉพาะเซลล์สำหรับการศึกษาของเรา

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

มีการมากกว่า 350 การกลายพันธุ์ที่บันทึกไว้ถึงวันที่รวมทั้ง
การกลายพันธุ์เว็บไซต์ 16 ประกบที่ก่อให้เกิดโรค Gaucher (http:. // www
hgmd.org) หลายของการกลายพันธุ์เหล่านี้รวมทั้ง IVS9 + 1 (GNA) และ
G355R / R359X, ที่มีอยู่ในเพียงหนึ่งหรือจำนวนเล็ก ๆ ของบุคคล.
การกลายพันธุ์เว็บไซต์ประกบกันสามารถมีช่วงของผลกระทบรวมทั้งเอกซ์ซอน
กระโดดเปิดใช้งานของเว็บไซต์ประกบลับการสร้าง ของหลอกเอกซ์ซอน
ภายในยีนหรือการเก็บรักษา intron (Nakai และ Sakamoto, 1994) ใน
กรณีของการที่แพร่หลายอย่างมากในเว็บไซต์ประกบกลายพันธุ์ IVS2 + 1 (GNA), เอกซ์ซอน
2 จะถูกลบออกทั้งหมดจาก mRNA แต่งงาน (เขาและ Grabowski,
1992) เพื่อประเมินผลกระทบที่เป็นไปได้ของ IVS9 + 1 (GNA) การกลายพันธุ์
ที่พบในผู้ป่วย 1 ใน GBA mRNA ประกบเราใช้ RegRNA
โปรแกรม 2.0 (http://regrna2.mbc.nctu.edu.tw/) ประสาท เครือข่าย
โปรแกรม (http://www.fruitfly.org/seq_tools/splice.html) และสูงสุด
โปรแกรมเอนโทรปี (http://genes.mit.edu/burgelab/maxent/
Xmaxentscan_scoreseq.html) จะคาดการณ์ว่าการกลายพันธุ์นี้จะ ส่งผลกระทบต่อ
การประมวลผลอาร์เอ็นเอ ทั้งสามโปรแกรมระบุว่า IVS9 + 1 กลายพันธุ์
ลำดับจะไม่ได้รับการยอมรับเป็นเว็บไซต์บริจาคประกบกัน (โปรด
ดูข้อมูลเพิ่มเติมสำหรับรายละเอียดของใน silico วิเคราะห์).
นอกจากนี้โครงข่ายประสาทเทียมและสูงสุดเอนโทรปีโปรแกรมที่คาดการณ์
ว่าการกลายพันธุ์จะส่งผลให้ ในสัญญาณเว็บไซต์ประกบต่ำกว่ามาก
ต่ำกว่าเกณฑ์การรับรู้ ดังนั้น IVS9 + 1 กลายพันธุ์จะมาก
ก่อกวนสำหรับการประมวลผล GBA mRNA และการทำงานของเอนไซม์ เป็นทางเลือกที่
เป็นไปได้คือการเปิดใช้งานเว็บไซต์ประกบคลุมเครือผู้บริจาค ในการศึกษา
อธิบายเอกซ์ซอน 9 ประกบกลายพันธุ์เว็บไซต์อื่น (c.1389-1 GNA) ซึ่งเป็น
โปรแกรมโครงข่ายประสาทเทียมและสูงสุดเอนโทรปีคาดการณ์กลายพันธุ์
ลำดับจะไม่ได้รับการยอมรับในฐานะที่เป็นเว็บไซต์ใบเสร็จประกบ.
อย่างไรก็ตามเมื่อวิเคราะห์ RT-PCR ที่ได้ดำเนินการ ใน mRNAs จาก
เซลล์เพาะเลี้ยงพบว่าการกลายพันธุ์ที่นำไปสู่การเลื่อนหลุดของเอกซ์ซอน
4 นิวคลีโอและการทำงานของเว็บไซต์ประกบคลุมเครือใบเสร็จ (Malini
et al., 2014) เราไม่สามารถที่จะดำเนินการวิเคราะห์ RT-PCR ที่คล้ายกันของ fibroblast
GBA mRNAs จากผู้ป่วย 1 เพราะเลือดแห้งจุดบนกระดาษกรอง
บัตรเป็นแหล่งเซลล์เดียวที่มีอยู่สำหรับการศึกษาของเรา

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

มีมากกว่า 350 การกลายพันธุ์ บันทึกวัน ได้แก่การกลายพันธุ์ที่ทำให้เกิด gaucher ไซต์ 16 ต่อโรค ( http : / / www .hgmd . org ) หลายของการกลายพันธุ์เหล่านี้ รวมทั้ง ivs9 + 1 ( g N ) และg355r / r359x มีอยู่ในเพียงหนึ่งหรือจำนวนเล็ก ๆของแต่ละบุคคลมีต่อเว็บไซต์ของสามารถมีช่วงของผลกระทบรวมถึงเอ็กซกระโดดข้าม , การเปิดใช้งานเว็บไซต์ที่ต่อกันสร้างเป็นชนิดเทียมภายในยีนหรือ iNtRON ความคงทน ( นากากับซากาโมโตะ , 1994 ) ในกรณีอย่างแพร่หลายต่อเว็บไซต์ของ ivs2 + 1 ( GNA ) , exon2 เอาทั้งหมดจากไมเกรอบอว์สกี้ ( และของเขา ,1992 ) เพื่อประเมินผลกระทบที่เป็นไปได้ของ ivs9 + 1 ( GNA ) การกลายพันธุ์ที่พบในผู้ป่วย 1 ใน GBA ยีน Splicing เราใช้ regrna2.0 โปรแกรม ( http : / / regrna2 . MBC nctu . edu TWN / ) , โครงข่ายประสาทเทียมโปรแกรม ( http : / / www.fruitfly . org / seq_tools / เกลียว . html ) และสูงสุดเอนโทรปี ( http://genes.mit.edu/burgelab/maxent/ โปรแกรมxmaxentscan_scoreseq . html ) พยากรณ์ว่า การกลายพันธุ์นี้จะมีผลต่อการประมวลผล RNA ทั้งสามโปรแกรม พบว่า ivs9 + 1 กลายพันธุ์ลำดับจะไม่ได้รับการยอมรับในฐานะผู้บริจาคต่อเว็บไซต์ ( กรุณาดูข้อมูลรายละเอียดเพิ่มเติมของ ในการวิเคราะห์สำหรับ )นอกจากนี้ เครือข่ายประสาทและโปรแกรมเอนโทรปีสูงสุดทำนายที่การเปลี่ยนแปลงจะส่งผลมากต่อเว็บไซต์สัญญาณลดลงด้านล่าง รู้เกณฑ์ ดังนั้น การ ivs9 + 1 จะถูกมากรบกวนของ GBA และการทำงานของเอนไซม์ ทางเลือกที่เป็นไปได้คือการกระตุ้นที่ผู้บริจาคต่อเว็บไซต์ ในการศึกษาอธิบายอีก 8 9 ต่อเว็บไซต์ของ c.1389-1 GNA )โครงข่ายประสาทเทียมและโปรแกรมเอนโทรปีสูงสุดทำนายกลายพันธุ์ลำดับจะไม่สามารถรับรู้เป็นพระนาสิกต่อเว็บไซต์อย่างไรก็ตาม เมื่อวิเคราะห์วิธีคือใช้รหัสจากจากการเพาะเลี้ยงพบว่า การกลายพันธุ์ทำให้ล้อหน้าลื่นไถล4 นิวคลีโอไทด์ และการกระตุ้นที่พระนาสิกประกบกัน ( malini เว็บไซต์et al . , 2010 ) เราไม่สามารถที่จะดำเนินการวิเคราะห์วิธีที่คล้ายกันของไฟโบรบลาสต์GBA รหัสจากผู้ป่วย 1 เพราะจุดเลือดบนกระดาษกรองแห้งบัตรใช้ได้เฉพาะเซลล์เป็นแหล่งศึกษาของเรา