There is an urgent need to increase

There is an urgent need to increase the genetic yield potential of rice since past
yield increases have been negated by unabated population growth and reduction in rice
hcctarage in many countries including the Philippines. Molecular marker technology
promises to speed up and improve the overall efficiency of plant breeding and, hence,
the attainment of higher yield potential. This paper describes effoi1s at Phil Rice to use
molecular marker-aided approaches for breeding direct-seeded and hybrid rice varieties,
considered 'new frontier' varietal types for the next millennium.
For hybrid rice breeding, the nuclear genome diversity of 22 cytoplasmic malesterile
(CMS) lines used as female parents for breeding hybrids in the Philippines were
assayed at loci amplified by 20 microsatellite or simple-sequence repeat (SSR), 25
RAPD, and !O amplified fragment length polymorphism (AFLP) primers or primer
combinations. A high degree of polymorphism was detected in the CMS lines.
Microsatellites and AFLPs appeared to be the most suited for DNA fingerprinting.
Cluster analysis based on 222 molecular markers classified the CMS lines into nine
groups. The groupings could guide hybrid rice breeders in developing genetically
diverse and heterotic rice hybrids.
To detemline the utility of markers for predicting heterosis or hybrid vigor, the
relationship of SSR heterozygosity and heterotic potential was studied for eight traits in
48 rice hybrids derived from 5 CMS and 10 male parents. Based on 43 microsatellite
loci, the CMS and male parents clustered into 2 and 8 groups. respectively, at 75%
level of genetic similarity. Microsatellite heterozygosity (based on all the mark~rs
used) and heterotic performance were signincantly correlated for the number of tillers
per plant and LA! when all 1'1 's were used in the analysis. Signilicant corrdation were observed for maturity and number of tillers per plant between SSR polymorphism and
heterosis relative to the male parent when only hybrids with positive heterosis for each
trait were analyzed. Significant negative correlations were observed betwet'n
heterozygosity and heterosis for maturity, harvest index, and grain yield, relative to the
check varieties. Correlations for other traits were insignificant The relationship of
molecular marker heterozygosity and heterosis. therefore, appears to be complex and
could vary with the traits and germplasm studied.
For breeding direct-seeded rice, 25 quantitat ive trait loci (QTL) underlying
seedling vigor (SV), one most important traits in direct-seeded rice culture, have bllen
mapped through interval and single-point analyses to different rice chromosomes using
restriction fragment length polymorphism (RFLP) and random amplified polymolvhic
DNA (RAPD) markers. To identify high-SV donors in local gemlplasm, 37 RAPDs
flanking SV QTL were used as diagnostic probes to genotype 49 cultivars at II SV
QTL. High-SV genotypes were identified in addition to known SV genetic donors and
cluster analysis discriminated the 49 cultivars into eight major clusters. Newly identified
high-SV genotypes such as Aus 257. Vandana, Dular WH, CG-14, CG-l7, en-20 and
UG-20, that could possess alternative SV QTL alleles, have been lIsed to develop
crosses designed to concentrate favorable SV alleles in new populations thaI could be
subjected to marker-aided selection.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

มีความจำเป็นเร่งด่วนเพื่อเพิ่มศักยภาพผลผลิตทางพันธุกรรมของข้าวตั้งแต่อดีตเพิ่มผลผลิตได้ถูก negated โดยคงอัตราการเติบโตและลดข้าวhcctarage ในหลายประเทศเช่นฟิลิปปินส์ เทคโนโลยีเครื่องหมายโมเลกุลสัญญาเร็วขึ้น และช่วยเพิ่มประสิทธิภาพโดยรวมของพืชที่เพาะพันธุ์ และ จึงโดยศักยภาพผลผลิตสูง เอกสารนี้อธิบาย effoi1s ที่ Phil ข้าวใช้โมเลกุลเครื่องหมายช่วยวิธี seeded ตรงปรับปรุงพันธุ์และผสมพันธุ์ข้าวถือว่า 'ชายแดนใหม่"มิลเลนเนียมต่อชนิดพันธุ์สำหรับข้าวผสมพันธุ์ พรมหลากหลายนิวเคลียร์จีโนม 22 cytoplasmic malesterileบรรทัด (CMS) ที่ใช้เป็นพ่อแม่หญิงสำหรับพันธุ์ลูกผสมในฟิลิปปินส์ได้assayed ที่ loci ขยาย 20 ชนิด microsatellite หรือง่ายลำดับซ้ำ (SSR), 25อาร์เอพีดี และ O ขยายส่วนความยาวโพลีมอร์ฟิซึม (AFLP) ไพรเมอร์หรือรองพื้นชุด ระดับสูงของโพลิมอร์ฟิซึมพบในบรรทัดซ.ม.Microsatellites และ AFLPs ดูเหมือนจะ เป็นการเหมาะสมที่สุดสำหรับลายพิมพ์ดีเอ็นเอแบ่งตามเครื่องหมายโมเลกุล 222 แบ่งบรรทัดซ.ม.เก้ากลุ่ม การจัดกลุ่มสามารถแนะนำบรีดเดอร์สข้าวแบบผสมผสานในการพัฒนาแปลงพันธุกรรมหลากหลาย และ heterotic ข้าวลูกผสมการ detemline ของเครื่องหมายสำหรับการคาดการณ์ heterosis หรือไฮบริแข็ง การได้ศึกษาความสัมพันธ์ของ SSR heterozygosity และศักยภาพ heterotic ลักษณะแปดในข้าวลูกผสมที่ 48 มาจาก 5 CMS และผู้ปกครองชาย 10 ตามชนิด microsatellite 43loci, CMS และผู้ปกครองชายจับกลุ่มเป็นกลุ่ม 2 และ 8 ตามลำดับ ที่ 75%ระดับของความคล้ายคลึงกันทางพันธุกรรม ชนิด Microsatellite heterozygosity (ตามเครื่องหมาย ~ อาร์เอสใช้) และประสิทธิภาพ heterotic signincantly correlated สำหรับหมายเลขของรถไถเดินตามต่อพืชและ LA เมื่อทั้งหมด 1'1 ของใช้ในการวิเคราะห์ Signilicant corrdation สุภัคครบกำหนดและจำนวนของรถไถเดินตามต่อพืชระหว่าง SSR โพลิมอร์ฟิซึม และheterosis สัมพันธ์หลักชายเมื่อเฉพาะลูกผสมกับ heterosis บวกสำหรับแต่ละติดได้วิเคราะห์ ความสัมพันธ์เชิงลบอย่างมีนัยสำคัญสุภัค betwet'nheterozygosity และ heterosis ในวันครบกำหนด เกี่ยวดัชนี และผลผลิตข้าว สัมพันธ์กับการตรวจสอบสายพันธุ์ ความสัมพันธ์ในลักษณะอื่น ๆ สำคัญความสัมพันธ์ของเครื่องหมายโมเลกุล heterozygosity และ heterosis ดังนั้น เหมือน จะซับซ้อน และสามารถเปลี่ยนแปลงลักษณะและ germplasm ศึกษาได้สำหรับพันธุ์ข้าว seeded ตรง 25 quantitat ive ติด loci (QTL) ต้นแหล่งแข็ง (ญา), ลักษณะสำคัญหนึ่งในวัฒนธรรมข้าว seeded ตรง มี bllenแมปผ่านช่วงเวลาและการวิเคราะห์จุดเดียวกับ chromosomes ข้าวแตกต่างกันโดยใช้ข้อจำกัดส่วนความยาวโพลีมอร์ฟิซึม (RFLP) และ polymolvhic สุ่มเอาต์เครื่องหมายดีเอ็นเอ (อาร์เอพีดี) ระบุผู้บริจาคญาสูงในท้องถิ่น gemlplasm, 37 RAPDsflanking QTL ญาใช้เป็นคลิปปากตะเข้วินิจฉัยให้ลักษณะทางพันธุกรรมพันธุ์ 49 ที่ญา IIQTL ระบุนอกจากพันธุกรรมผู้บริจาครู้จักญาญาสูงศึกษาจีโนไทป์ และคลัสเตอร์การวิ discriminated พันธุ์ 49 ในคลัสเตอร์หลักแปด ระบุใหม่การศึกษาจีโนไทป์ญาสูงเช่นต. 257 Vandana, Dular WH, CG-14, CG-หมายเลข l7 น้ำ 20 และยูจี-20 ที่ไม่มีสำรอง QTL ญา alleles ได้ lIsed พัฒนาตัดที่ออกแบบมาให้มีสมาธิดีญา alleles ในประชากรใหม่ไทยอาจภายใต้เครื่องหมายช่วยเลือก

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

มีความจำเป็นเร่งด่วนที่จะเพิ่มผลผลิตที่มีศักยภาพทางพันธุกรรมของข้าวตั้งแต่อดีตที่ผ่านมาคือการเพิ่มขึ้นของอัตราผลตอบแทนที่ได้รับเมื่อตะกี้การเติบโตของประชากรคงที่และลดลงในข้าวhcctarage ในหลายประเทศรวมทั้งฟิลิปปินส์ เทคโนโลยีโมเลกุลเครื่องหมายสัญญาว่าจะเพิ่มความเร็วและเพิ่มประสิทธิภาพโดยรวมของการปรับปรุงพันธุ์พืชและดังนั้นความสำเร็จของผลผลิตที่มีศักยภาพสูงขึ้น กระดาษนี้จะอธิบาย effoi1s ที่ฟิลข้าวที่จะใช้วิธีการเครื่องหมายช่วยโมเลกุลสำหรับการเพาะพันธุ์โดยตรงเมล็ดและพันธุ์ข้าวลูกผสมถือว่า'ชายแดนใหม่' ชนิดพันธุ์สำหรับสหัสวรรษใหม่. สำหรับการปรับปรุงพันธุ์ข้าวลูกผสมที่มีความหลากหลายของจีโนมนิวเคลียร์ malesterile นิวเคลียส 22 ( CMS) สายที่ใช้เป็นพ่อแม่ของหญิงพันธุ์ลูกผสมในฟิลิปปินส์ถูกassayed ตำแหน่งที่ขยายโดย 20 ไมโครหรือซ้ำง่ายลำดับ (SSR) 25 RAPD และ! O ขยายระยะเวลาในส่วนความแตกต่าง (AFLP) ไพรเมอร์หรือไพรเมอร์รวมกัน ระดับสูงของความแตกต่างถูกตรวจพบในสาย CMS. ไมโคร AFLPs และดูเหมือนจะเหมาะที่สุดสำหรับการพิมพ์ลายนิ้วมือดีเอ็นเอ. การวิเคราะห์กลุ่มขึ้นอยู่กับ 222 โมเลกุลจัดสาย CMS เป็นเก้ากลุ่ม กรุ๊ปสามารถให้คำแนะนำพ่อพันธุ์แม่พันธุ์ข้าวไฮบริดในการพัฒนาพันธุกรรมที่หลากหลายและ heterotic ลูกผสมข้าว. เพื่อ detemline ประโยชน์ของเครื่องหมายการทำนาย heterosis หรือความแข็งแรงของไฮบริดที่ความสัมพันธ์ของheterozygosity SSR และศักยภาพ heterotic ศึกษาแปดลักษณะใน48 ลูกผสมข้าวที่ได้มาจาก 5 CMS และพ่อแม่ของชาย 10 ขึ้นอยู่กับ 43 ไมโครตำแหน่งที่CMS และผู้ปกครองชายคลัสเตอร์เป็น 2 และ 8 กลุ่ม ตามลำดับที่ 75% ระดับของความคล้ายคลึงกันทางพันธุกรรม ไมโคร heterozygosity (ขึ้นอยู่กับทุกเครื่องหมาย ~ อาร์เอสใช้) และประสิทธิภาพการทำงานมีความสัมพันธ์ heterotic signincantly สำหรับจำนวนหน่อต่อต้นและLA! เมื่อทุก 1'1 's ถูกนำมาใช้ในการวิเคราะห์ corrdation Signilicant ถูกตั้งข้อสังเกตสำหรับการกำหนดและจำนวนหน่อต่อต้นแตกต่างระหว่าง SSR และญาติheterosis กับผู้ปกครองชายเมื่อลูกผสมเฉพาะกับ heterosis ในเชิงบวกสำหรับแต่ละลักษณะวิเคราะห์ ความสัมพันธ์เชิงลบอย่างมีนัยสำคัญ betwet'n heterozygosity และครบกำหนด heterosis สำหรับดัชนีการเก็บเกี่ยวและผลผลิตเทียบกับสายพันธุ์ที่ตรวจสอบ ความสัมพันธ์ลักษณะอื่น ๆ ที่ไม่มีนัยสำคัญความสัมพันธ์ของheterozygosity เครื่องหมายโมเลกุลและ heterosis จึงดูเหมือนจะซับซ้อนและอาจแตกต่างกันกับลักษณะและพันธุ์ศึกษา. สำหรับการปรับปรุงพันธุ์ข้าวโดยตรงเมล็ด 25 quantitat ive ตำแหน่งลักษณะ (QTL) พื้นฐานความแข็งแรงของต้นกล้า(SV) หนึ่งในลักษณะที่สำคัญที่สุดในวัฒนธรรมข้าวโดยตรงเมล็ดมี bllen แมปผ่านช่วงเวลาและจุดเดียวที่จะวิเคราะห์โครโมโซมข้าวที่แตกต่างกันโดยใช้ความแตกต่างส่วนระยะเวลาในการ จำกัด (RFLP) และ polymolvhic ขยายสุ่มดีเอ็นเอ(RAPD) เครื่องหมาย เพื่อระบุผู้บริจาคสูง SV gemlplasm ในท้องถิ่น 37 RAPDs ขนาบข้าง SV QTL ถูกนำมาใช้เป็นยานสำรวจวินิจฉัยเพื่อตรวจหาสายพันธุ์ 49 พันธุ์ที่สอง SV QTL ยีนสูง SV ถูกระบุว่านอกเหนือจากการบริจาคทางพันธุกรรมที่รู้จักกัน SV และการวิเคราะห์กลุ่มเลือกปฏิบัติ49 สายพันธุ์เป็นแปดกลุ่มที่สำคัญ ใหม่ระบุยีนสูง SV เช่นออสเตรเลีย 257. Vandana, Dular WH, CG-14, CG-l7, en-20 และ UG-20 ที่จะมีทางเลือกที่อัลลีลเอ QTL ได้รับการพัฒนา lised ข้ามได้รับการออกแบบให้มีสมาธิดี อัลลีลเอในประชากรใหม่ของไทยอาจจะอยู่ภายใต้เครื่องหมายช่วยเลือก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

มีความจําเป็นเร่งด่วน เพื่อเพิ่มผลผลิตทางพันธุกรรมที่มีศักยภาพของข้าวตั้งแต่อดีต
เพิ่มผลผลิตได้ถูกยกเลิกโดยการเติบโตของประชากรคงที่และลด hcctarage ข้าว
ในหลายประเทศ ได้แก่ ฟิลิปปินส์
เทคโนโลยีโมเลกุลเครื่องหมายสัญญาเพื่อเพิ่มความเร็วและปรับปรุงประสิทธิภาพโดยรวมของพันธุ์พืชและดังนั้น
ความสำเร็จของศักยภาพในการให้ผลผลิตสูงกระดาษนี้จะอธิบาย effoi1s ฟิล ข้าวที่ใช้โมเลกุลเครื่องหมายช่วยในการปรับปรุงพันธุ์
แนวทางโดยเมล็ดและพันธุ์ข้าวลูกผสมพันธุ์ใหม่ชายแดน
ถือว่า ' ' ชนิดสำหรับสหัสวรรษ .
สำหรับการปรับปรุงพันธุ์ข้าวลูกผสม , นิวเคลียร์ จีโนม ความหลากหลายของ 22 นี้ malesterile
( CMS ) สายที่ใช้เป็นพ่อแม่พันธุ์ลูกผสมในหญิง ฟิลิปปินส์
ของเอนไซม์ที่ถูกขยายโดย 20 ชนิดหรือทำซ้ำลำดับง่าย ( SSR ) , 25
RAPD และ ! o amplified fragment length polymorphism ( AFLP ) ไพรเมอร์รองพื้น
หรือชุด ระดับสูงของ polymorphism ที่ตรวจพบใน CMS สาย ไมโครแซเทลไลต์ aflps
และปรากฏจะเหมาะที่สุดสำหรับลายพิมพ์ดีเอ็นเอ
การวิเคราะห์กลุ่มขึ้นอยู่กับ 222 โมเลกุลเครื่องหมายแบ่งสายออกเป็นเก้า
CMSกลุ่ม คือสามารถนำพันธุ์ข้าวลูกผสมในการพัฒนาทางพันธุกรรมที่หลากหลายและลูกผสม heterotic
.
เพื่อ detemline อรรถประโยชน์ของการใช้เครื่องหมายเพื่อทำนายหรือไฮบริดพลัง
ความสัมพันธ์ของ SSR และศักยภาพ heterotic เฉพาะที่ศึกษา 8 )
48 ข้าวลูกผสมที่ได้จาก 5 เซนติเมตรและ 10 ผู้ปกครองชาย ขึ้นอยู่กับชนิดของ 43
,CMS และผู้ปกครองชาย จับกลุ่มเป็น 2 และ 8 กลุ่ม ตามลำดับที่ 75 %
ระดับพันธุกรรมคล้ายคลึงกัน ใช้เฉพาะที่ ( ขึ้นอยู่กับอาร์เอสทั้งหมดเครื่องหมาย ~
ใช้ ) และประสิทธิภาพ heterotic เป็น signincantly มีความสัมพันธ์กับจำนวนหน่อต่อต้น
la ! ตอนที่ 1 ' 1 ' s มาใช้ในการวิเคราะห์signilicant corrdation เป็นสังเกตสำหรับผู้ใหญ่และจำนวนหน่อต่อต้นระหว่าง polymorphism SSR และ
2 เมื่อเทียบกับผู้ปกครองชายเมื่อไฮบริดเท่านั้นที่มีลักษณะในเชิงบวกสำหรับแต่ละ
ลักษณะข้อมูล ความสัมพันธ์เชิงลบอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติพบ betwet'n
เฉพาะที่ใช้วุฒิภาวะ , ดัชนีเก็บเกี่ยว และผลผลิต เทียบกับ
ตรวจสอบพันธุ์ความสัมพันธ์ของลักษณะอื่น ๆไม่มีความแตกต่างระหว่าง
เฉพาะที่เครื่องหมายโมเลกุล 2 . ดังนั้นดูเหมือนจะซับซ้อนและอาจแตกต่างกันกับคุณลักษณะและ

เพาะเชื้อโดยตรงข้าวนาหว่าน , 25 quantitat ไอฟ์ลักษณะโลไซ ( QTL ) เป็นต้น
ความแข็งแรงของต้นกล้า ( SV ) , หนึ่งที่สำคัญที่สุดของลักษณะตรงเมล็ดข้าว วัฒนธรรม มี bllen
แมปผ่านช่วงเวลาและจุดเดียวเพื่อใช้วิเคราะห์โครโมโซมข้าวแตกต่างกัน
จำกัด fragment length polymorphism ( RFLP ) และสุ่ม polymolvhic
DNA ( RAPD ) ของเครื่องหมาย ระบุ ผู้บริจาค SV สูงใน gemlplasm ท้องถิ่น , 37 rapds
flanking SV QTL ที่ใช้วินิจฉัย probes เพื่อพันธุกรรมพันธุ์ที่ 49 2 SV
ความ .พันธุ์ SV สูงระบุนอกจากรู้จัก SV พันธุกรรมและการวิเคราะห์จำแนกกลุ่มผู้บริจาค
49 พันธุ์เป็นแปดกลุ่มหลัก ระบุ
ใหม่สูง SV พันธุ์เช่น AUS 257 . vandana dular อะ cg-14 cg-l7 , , , , และ en-20
ug-20 ที่ได้ครอบครองความอัลลีล SV ทางเลือก , ได้รับ lised พัฒนา
ข้ามออกแบบให้มีสมาธิที่ดี SV อัลลีลใหม่ในประชากรไทยอาจ
ภายใต้เครื่องหมายช่วยในการคัดเลือก