We have determined the KcsA K1chann

We have determined the KcsA K1
channel structure from residue position 23
to 119 by x-ray crystallography (Table 1).
The cytoplasmic carboxyl terminus (residues
126 to 158) was removed in the preparation
and the remaining residues were
disordered. The KcsA K1 channel crystals
are radiation-sensitive and the diffraction
pattern is anisotropic, with reflections observed
along the best and worst directions
at 2.5 Å and 3.5 Å Bragg spacings, respectively.
By data selection, anisotropy correction,
introduction of heavy atom sites by
site-directed mutagenesis, averaging, and
solvent flattening, an interpretable electron
density map was calculated (Fig. 2, A
through C). This map was without main
chain breaks and showed strong side chain
density (Fig. 2C). The model was refined
with data to 3.2 Å (the data set was 93 %
complete to 3.2 Å with 67% completeness
between 3.3 Å and 3.2 Å), maintaining
highly restrained stereochemistry and keeping
tight noncrystallographic symmetry restraints.
The refinement procedure wasmonitored by minimizing the value R-free
(29.0%) and its separation from R-crystallographic
(28.0%). The presence of four
molecules (subunits) in the asymmetric unit
of the crystal provides a very significant
enhancement of the accuracy of the crystallographic
analysis; first, by enabling averaging
of the electron density over four
crystallographically independent regions of
the multiple isomorphous replacement
(MIR) map, and second, by providing a
powerful set of constraints on the atomic
model during refinement (9).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เราได้พบ KcsA K1โครงสร้างสถานีจากสารตกค้างตำแหน่ง 23ถึง 119 โดยเอกซเรย์ผลิกศาสตร์ (ตาราง 1)นัส cytoplasmic carboxyl (ตก126 การ 158) ถูกเอาออกในการจัดทำและตกค้างเหลืออยู่disordered ผลึกช่อง KcsA K1ลับของรังสีและการเลี้ยวเบนที่รูปแบบเป็น anisotropic มีสะท้อนที่สังเกตตามคำแนะนำที่ดี และเลวร้ายที่สุด2.5 Åและ 3.5 Å Bragg spacings ตามลำดับโดยเลือกข้อมูล การแก้ไข anisotropyแนะนำเว็บไซต์อะตอมหนักโดยตรงไซต์ mutagenesis หาค่าเฉลี่ย และแบน อิเล็กตรอน interpretable เป็นตัวทำละลายคำนวณแผนที่ความหนาแน่น (Fig. 2, Aผ่าน C) แผนที่นี้ได้ โดยไม่มีหลักแบ่ง และพบห่วงโซ่ด้านแข็งแรงความหนาแน่น (Fig. 2C) รูปแบบได้รับมีข้อมูล 3.2 Å (ชุดข้อมูลคือ 93%3.2 Åเสร็จกับสมบูรณ์ 67%ระหว่าง 3.3 Å 3.2 Å), รักษาstereochemistry สูงทรงและเก็บรักษาnoncrystallographic สมมาตรแน่น restraintsWasmonitored กระบวนการรีไฟน์เมนท์ โดยลดค่า R ฟรี(29.0%) และการแยกจาก R crystallographic(28.0%) ของสี่โมเลกุล (subunits) ในหน่วย asymmetricของคริสตัลให้ความสำคัญมากเพิ่มประสิทธิภาพของความแม่นยำของการ crystallographicวิเคราะห์ ครั้งแรก การเปิดใช้งานการหาค่าเฉลี่ยของความหนาแน่นของอิเล็กตรอนมากกว่า 4แคว้นอิสระ crystallographicallyเปลี่ยน isomorphous หลายแผนที่ (มีร์) และสอง โดยให้มีชุดมีประสิทธิภาพของข้อจำกัดที่อะตอมแบบจำลองในระหว่างการรีไฟน์เมนท์ (9)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เราได้กำหนด KCSA K1
โครงสร้างช่องจากตำแหน่งที่เหลือ 23
119 โดยผลึก x-ray (ตารางที่ 1).
สถานี carboxyl นิวเคลียส (ตกค้าง
126-158) จะถูกลบออกในการจัดทำ
และสารตกค้างที่เหลือเป็น
ระเบียบ ผลึกช่อง KCSA K1
เป็นรังสีที่มีความสำคัญและการเลี้ยวเบน
รูปแบบเป็น anisotropic มีการสะท้อนความเห็นข้อสังเกต
ไปตามทิศทางที่ดีที่สุดและเลวร้ายที่สุด
ที่ 2.5 และ 3.5 ความยาวแบร็กตามลำดับ.
โดยการเลือกข้อมูล, การแก้ไข anisotropy,
การเปิดตัวของเว็บไซต์อะตอมหนักโดย
เว็บไซต์ ฉับตรงจุด, ค่าเฉลี่ยและ
แฟบตัวทำละลายอิเล็กตรอน interpretable
แผนที่ความหนาแน่นที่คำนวณได้ (รูปที่. 2,
ผ่าน C) แผนที่นี้ได้โดยไม่ต้องหลัก
แบ่งห่วงโซ่ห่วงโซ่และแสดงให้เห็นด้านที่แข็งแกร่ง
ความหนาแน่น (รูป. 2C) รูปแบบที่ถูกขัดเกลา
กับข้อมูลการ 3.2 (ข้อมูลชุดเป็น 93%
ที่สมบูรณ์เป็น 3.2 ที่มีความสมบูรณ์ 67%
ระหว่าง 3.3 และ 3.2) การรักษาความ
ยับยั้งชั่งใจสูงสเตอริโอและการรักษา
หมอนรองสมมาตร noncrystallographic แน่น.
ขั้นตอนการปรับแต่ง wasmonitored โดยการลด ค่า R-ฟรี
(29.0%) และการแยกจาก R-crystallographic
(28.0%) การปรากฏตัวของสี่
โมเลกุล (หน่วยย่อย) ในหน่วยไม่สมมาตร
ของผลึกมีความสำคัญมาก
การเพิ่มประสิทธิภาพของความถูกต้องของผลึก
วิเคราะห์ ครั้งแรกด้วยการทำให้ค่าเฉลี่ย
ของความหนาแน่นของอิเล็กตรอนกว่าสี่
ภูมิภาคอิสระ crystallographically ของ
หลาย isomorphous ทดแทน
(MIR) แผนที่และที่สองโดยการให้
ชุดที่มีประสิทธิภาพของข้อ จำกัด ในอะตอม
รุ่นในระหว่างการปรับแต่ง (9)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

We have determined the KcsA K1
channel structure from residue position 23
to 119 by x-ray crystallography (Table 1).
The cytoplasmic carboxyl terminus (residues
126 to 158) was removed in the preparation
and the remaining residues were
disordered. The KcsA K1 channel crystals
are radiation-sensitive and the diffraction
pattern is anisotropic, with reflections observed
ที่ดีที่สุดและเลวร้ายที่สุดตามเส้นทาง
2.5 และ 3.5 Åกริพเพนแบร็ก ) ตามลำดับ โดยเลือก

แนะนำแก้ไขข้อมูล anisotropy ของเว็บไซต์ , เว็บไซต์ของอะตอมหนักด้วย

โดยเฉลี่ย และตัวทำละลาย flattening , interpretable คำนวณความหนาแน่นอิเล็กตรอน
แผนที่ ( รูปที่ 2 ,
ผ่าน C ) แผนที่นี้ได้โดยไม่ต้องหยุดพัก และมีความหนาแน่นของโซ่โซ่หลัก

ด้านที่แข็งแกร่ง ( รูปที่ 2 )แบบจำลองการกลั่น
กับข้อมูล 3.2 กริพเพน ( ชุดข้อมูล คือ ร้อยละ 93

ครบถ้วนสมบูรณ์ 3.2 •กับ• 67 % ระหว่าง 3.3 และ 3.2 Å ) , การรักษาและการรักษา

สูงสเตอริโอเคมิสตรีไว้แน่น noncrystallographic สมมาตรเสพ .
การปรับแต่งขั้นตอนการวัดโดยการลดมูลค่า r-free
( 29.0 ตามลำดับ ) และ การแยกจาก r-crystallographic
( 28 % ) การปรากฏตัวของ 4
molecules (subunits) in the asymmetric unit
of the crystal provides a very significant
enhancement of the accuracy of the crystallographic
analysis; first, by enabling averaging
of the electron density over four
crystallographically independent regions of
the multiple isomorphous replacement
(MIR) map, and second, by providing a
powerful set of constraints on the atomic
รูปแบบในการปรับแต่ง ( 9 )