We have determined the KcsA K1
channel structure from residue position 23
to 119 by x-ray crystallography (Table 1).
The cytoplasmic carboxyl terminus (residues
126 to 158) was removed in the preparation
and the remaining residues were
disordered. The KcsA K1 channel crystals
are radiation-sensitive and the diffraction
pattern is anisotropic, with reflections observed
along the best and worst directions
at 2.5 Å and 3.5 Å Bragg spacings, respectively.
By data selection, anisotropy correction,
introduction of heavy atom sites by
site-directed mutagenesis, averaging, and
solvent flattening, an interpretable electron
density map was calculated (Fig. 2, A
through C). This map was without main
chain breaks and showed strong side chain
density (Fig. 2C). The model was refined
with data to 3.2 Å (the data set was 93 %
complete to 3.2 Å with 67% completeness
between 3.3 Å and 3.2 Å), maintaining
highly restrained stereochemistry and keeping
tight noncrystallographic symmetry restraints.
The refinement procedure wasmonitored by minimizing the value R-free
(29.0%) and its separation from R-crystallographic
(28.0%). The presence of four
molecules (subunits) in the asymmetric unit
of the crystal provides a very significant
enhancement of the accuracy of the crystallographic
analysis; first, by enabling averaging
of the electron density over four
crystallographically independent regions of
the multiple isomorphous replacement
(MIR) map, and second, by providing a
powerful set of constraints on the atomic
model during refinement (9).
We have determined the KcsA K1
channel structure from residue position 23
to 119 by x-ray crystallography (Table 1).
The cytoplasmic carboxyl terminus (residues
126 to 158) was removed in the preparation
and the remaining residues were
disordered. The KcsA K1 channel crystals
are radiation-sensitive and the diffraction
pattern is anisotropic, with reflections observed
ที่ดีที่สุดและเลวร้ายที่สุดตามเส้นทาง
2.5 และ 3.5 Åกริพเพนแบร็ก ) ตามลำดับ โดยเลือก
แนะนำแก้ไขข้อมูล anisotropy ของเว็บไซต์ , เว็บไซต์ของอะตอมหนักด้วย
โดยเฉลี่ย และตัวทำละลาย flattening , interpretable คำนวณความหนาแน่นอิเล็กตรอน
แผนที่ ( รูปที่ 2 ,
ผ่าน C ) แผนที่นี้ได้โดยไม่ต้องหยุดพัก และมีความหนาแน่นของโซ่โซ่หลัก
ด้านที่แข็งแกร่ง ( รูปที่ 2 )แบบจำลองการกลั่น
กับข้อมูล 3.2 กริพเพน ( ชุดข้อมูล คือ ร้อยละ 93
ครบถ้วนสมบูรณ์ 3.2 •กับ• 67 % ระหว่าง 3.3 และ 3.2 Å ) , การรักษาและการรักษา
สูงสเตอริโอเคมิสตรีไว้แน่น noncrystallographic สมมาตรเสพ .
การปรับแต่งขั้นตอนการวัดโดยการลดมูลค่า r-free
( 29.0 ตามลำดับ ) และ การแยกจาก r-crystallographic
( 28 % ) การปรากฏตัวของ 4
molecules (subunits) in the asymmetric unit
of the crystal provides a very significant
enhancement of the accuracy of the crystallographic
analysis; first, by enabling averaging
of the electron density over four
crystallographically independent regions of
the multiple isomorphous replacement
(MIR) map, and second, by providing a
powerful set of constraints on the atomic
รูปแบบในการปรับแต่ง ( 9 )
การแปล กรุณารอสักครู่..