Biochemical and molecular aspects o

Biochemical and molecular aspects of ACC deaminase
ACC deaminase is a pyridoxal 5-phosphate (PLP)-dependent enzyme that degrades a cyclopropanoid amino acid, ACC, to α-ketobutyrate and ammonia [12]. Molecular mapping of ACC deaminase revealed that there might be similar, in addition to several different, types of deaminase genes in different microbes. Alignment of the amino acid sequences from some of the genes indicates that there is conservation of key amino acid residues, for example Lys51 and Cys162, both thought to be important for enzymatic activity [16]. Like other polymeric enzymes, ACC deaminase demonstrates a vast array of biochemical and physical characteristics depending on the microbial species. The molecular mass of ACC deaminase is up to 105 000 Da and its subunit molecular mass ranges from 35 000 to 41 800 Da. Moreover, the estimated numbers of subunits are 2 or 3 [8].

Generally, ACC deaminase exhibits optimum activity at a pH close to 8; however, this might vary depending on the microbial species. The Km values of this enzyme in any chemical reaction range from 1.5 to 4.6 mM, and the kcat values range from 146 to 290 min−1 17, 18, 19 and 20. The details of the reaction mechanisms followed by ACC deaminase to convert ACC to α-ketobutyrate and ammonia can be found elsewhere 21 and 22.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ด้านชีวเคมีและโมเลกุลของแม็ก deaminase
deaminase แม็กเป็น 5 pyridoxal ฟอสเฟต (PLP) เอนไซม์ -dependent ที่ลดกรดอะมิโน cyclopropanoid, ACC เพื่อα-ketobutyrate และแอมโมเนีย [12] การทำแผนที่ของโมเลกุล deaminase แม็กเปิดเผยว่าอาจจะมีคล้ายกันนอกเหนือจากการแตกต่างกันหลายชนิดของยีน deaminase ในจุลินทรีย์ที่แตกต่างกัน การจัดตำแหน่งของลำดับกรดอะมิโนจากบางส่วนของยีนที่แสดงให้เห็นว่ามีการอนุรักษ์กรดอะมิโนที่สำคัญเช่น Lys51 และ Cys162 ทั้งความคิดที่มีความสำคัญสำหรับเอนไซม์ [16] เช่นเดียวกับเอนไซม์พอลิเมออื่น ๆ deaminase แม็กแสดงให้เห็นมากมายของลักษณะทางชีวเคมีและทางกายภาพขึ้นอยู่กับชนิดของจุลินทรีย์ มวลโมเลกุลของ deaminase แม็กขึ้นอยู่กับ 105 000 ดาและหน่วยย่อยของช่วงมวลโมเลกุลจาก 35 000-41 800 ดา นอกจากนี้การประเมินตัวเลขของหน่วยย่อยเป็น 2 หรือ 3 [8]. โดยทั่วไป deaminase แม็กกิจกรรมการจัดแสดงนิทรรศการที่ดีที่สุดที่ pH ใกล้กับ 8; แต่นี้อาจแตกต่างกันขึ้นอยู่กับชนิดของจุลินทรีย์ ค่ากมเอนไซม์นี้อยู่ในช่วงการเกิดปฏิกิริยาเคมีใด ๆ 1.5-4.6 มิลลิและช่วงค่า kcat 146-290 1 นาที 17, 18, ​​19 และ 20 โดยมีรายละเอียดของกลไกการเกิดปฏิกิริยาตามมาด้วย deaminase แม็กแม็กการแปลง เพื่อα-ketobutyrate และแอมโมเนียสามารถพบได้ที่อื่น ๆ ที่ 21 และ 22

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ด้านชีวเคมีและโมเลกุลของอะมิเนส
บัญชีบัญชีเป็น 5-phosphate pyridoxal อะมิเนส ( PLP ) ชนิดนี้เป็นเอนไซม์ที่ cyclopropanoid กรดอะมิโน , ACC , แอลฟา ketobutyrate และแอมโมเนีย [ 12 ] แผนที่ของโมเลกุลของอะมิเนส เปิดเผยว่า อาจจะมีคล้ายกัน นอกจากนี้หลายๆ ประเภท ทำแผนที่ยีนในเชื้อจุลินทรีย์ที่แตกต่างกันการเรียงตัวของกรดอะมิโนจากบางส่วนของยีน พบว่า มีการอนุรักษ์ที่สำคัญกรดอะมิโนตกค้าง เพื่อ lys51 ตัวอย่างและ cys162 ทั้งสองคิดว่าเป็นสิ่งสำคัญสำหรับกิจกรรมเอนไซม์ [ 16 ] เช่นเอนไซม์สารอื่น ๆบัญชี ทำแผนที่แสดงให้เห็นถึง array กว้างใหญ่ของชีวภาพและกายภาพ ขึ้นอยู่กับชนิดของจุลินทรีย์มวลของโมเลกุลของอะมิเนสถึง 105 , 000 ดาและช่วงมวลโมเลกุลลดลงจาก 35 , 000 ถึง 41 800 ดา . นอกจากนี้ ตัวเลขประมาณการของหน่วยย่อยที่ 2 หรือ 3 [ 8 ] .

โดยทั่วไป , บัญชีการทำแผนกิจกรรมสูงสุดที่ pH ใกล้เคียงกับ 8 ; อย่างไรก็ตาม , นี้อาจแตกต่างกันไปขึ้นอยู่กับชนิดของจุลินทรีย์ กม. ค่าเอนไซม์ในปฏิกิริยาทางเคมีใด ๆจากช่วงประมาณ 4.6 มม.และ kcat ค่าช่วงจาก 146 290 นาที− 1 17 , 18 , 19 และ 20 รายละเอียดของกลไกปฏิกิริยาตามบัญชีเป็นบัญชีเพื่อทำแผนที่ ketobutyrate แอลฟาและแอมโมเนียสามารถพบในที่อื่น
21 และ 22