In total eight (A,B,..,H) different

In total eight (A,B,..,H) different configurations of repressor binding sites were tested (Figure 4). Two: F and H, were found to be produce Kill-switch systems robust towards variations in binding strengths and production rates. The result of the best scoring configuration H has been magnified (figure 5). The repressor binding site configuration corresponding to this map has the highest chance of working in an experimental set-up. The x-axis shows the fold change in protein production, the y-axis has increased binding strengths for individual repressors by an order of magnitude each row. The color map indicates that increases in repressor binding strengths can be compensated for by increased production rates of either the target gene or decreased production of the repressor itself. The practical implications for constructing the an optimized version of the Kill-switch were as follows: two TetR repressor binding sites on the LacI promoter, two LacI and one CIλ repressor binding site on the TetR promoter, two TetR and one CIλ repressor binding site on the toxin promoter.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ในรวมแปด (A, B, ..., H) กำหนดค่าแบบต่าง ๆ ของ repressor รวมเว็บไซต์ที่ทดสอบ (รูป 4) สอง: F และ H พบเพื่อจะผลิตสวิทช์ฆ่าระบบทนทานต่อการเปลี่ยนแปลงในจุดแข็งและอัตราการผลิตที่มีผลผูกพัน ผลการให้คะแนน H ได้รับการกำหนดค่าที่ดีสุดขยาย (รูป 5) กำหนดค่าไซต์ผูก repressor ที่สอดคล้องกับแผนที่นี้มีสูงที่จะทำงานในการตั้งค่าการทดลอง การพับการเปลี่ยนแปลงในการผลิตโปรตีนแสดงแกน x แกน y ได้เพิ่มความแข็งแกร่งสำหรับ repressors แต่ละผูก โดยความแต่ละแถว แผนที่สีบ่งชี้ว่า การเพิ่มจุดแข็งผูก repressor สามารถถูกชดเชย ด้วยอัตราการผลิตเพิ่มขึ้นทั้งเป้าหมายยีนหรือการผลิตที่ลดลงของ repressor เอง ผลปฏิบัติการสร้างสวิทช์ฆ่ารุ่นเหมาะสมมีดังนี้: สองไซต์ผูก repressor TetR โปรโมเตอร์ LacI, LacI สอง และหนึ่งไซต์ผูก repressor CIλ โปรโมเตอร์ TetR, TetR สอง และหนึ่งผูก repressor CIλ ไซต์บนโปรโมเตอร์พิษ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

รวมแปด (A, B, .. , H) การกำหนดค่าที่แตกต่างกันของเว็บไซต์ที่มีผลผูกพันอดกลั้นได้มีการทดสอบ (รูปที่ 4) สอง: F และ H ถูกพบว่ามีการผลิตระบบฆ่าสวิทช์ที่มีประสิทธิภาพต่อการเปลี่ยนแปลงในผลผูกพันจุดแข็งและอัตราการผลิต ผลมาจากการกำหนดค่า H คะแนนที่ดีที่สุดที่ได้รับการขยาย (รูปที่ 5) การกำหนดค่าอดกลั้นเว็บไซต์ที่มีผลผูกพันที่สอดคล้องกับแผนที่นี้มีโอกาสสูงที่สุดของการทำงานในการทดลองการตั้งค่า แกน x แสดงให้เห็นถึงการเปลี่ยนแปลงเท่าในการผลิตโปรตีนแกน y ได้เพิ่มขึ้นจุดแข็งที่มีผลผูกพันสำหรับ repressors ของแต่ละบุคคลโดยลำดับความสำคัญของแต่ละแถว แผนที่สีแสดงให้เห็นว่าการเพิ่มขึ้นของจุดแข็งอดกลั้นผูกพันสามารถชดเชยด้วยอัตราการผลิตที่เพิ่มขึ้นของทั้งยีนเป้าหมายหรือลดการผลิตของตัวเองอดกลั้น ผลกระทบในทางปฏิบัติสำหรับการสร้างรุ่นที่ดีที่สุดของการฆ่าสวิทช์มีดังนี้สอง tetr อดกลั้นผูกพันเว็บไซต์บนโปรโมเตอร์ Laci สอง Laci และเป็นหนึ่งในCIλอดกลั้นเว็บไซต์ผูกพันโปรโมเตอร์ tetr สอง tetr และเป็นหนึ่งในCIλอดกลั้นผูกพันเว็บไซต์ โปรโมเตอร์สารพิษ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ในทั้งหมดแปด ( A , B , . . . , h ) ค่าที่แตกต่างกันของผู้ควบคุมผูกพันเว็บไซต์ทดสอบ ( รูปที่ 4 ) สอง : F และ H พบว่ามีการผลิตระบบทนทานต่อการแปรเปลี่ยนฆ่าจุดแข็งและการผลิตรวมอัตรา ผลของการให้คะแนนที่ดีที่สุดค่า H ได้รับการขยาย ( รูปที่ 5 ) ส่วนผู้ควบคุมมัดเว็บไซต์ค่าสอดคล้องกับแผนที่นี้ได้มีโอกาสมากที่สุดของการทำงานในการตั้งค่าโปรแกรม แกน x แสดงพับเปลี่ยนในการผลิตโปรตีน , แกน Y ได้เพิ่มขึ้นรวมจุดแข็งของ repressors บุคคลโดยลำดับความสำคัญในแต่ละแถว แผนที่สีพบว่าเพิ่มขึ้นในผู้ควบคุมผูกจุดแข็งสามารถชดเชยโดยการเพิ่มอัตราการผลิตของทั้งสองยีน หรือเป้าหมายการผลิตที่ลดลงของผู้ควบคุมนั้นเอง ความหมายในทางปฏิบัติสำหรับการสร้างการปรับรุ่นของสวิตช์ฆ่า ดังนี้ สองสี่ผู้ควบคุมผูกพันเว็บไซต์ใน laci โปรโมเตอร์ สอง laci และ CI λผู้ควบคุมมัดเว็บไซต์บนสี่สองสี่ และโปรโมเตอร์ของλผู้ควบคุมผูกพันเว็บไซต์เกี่ยวกับสารพิษ โปรโมเตอร์