Mutational pressure and translation

Mutational pressure and translational selection are the main factors for accounting for codon usage variation (Jenkins and Holmes, 2003). Mutational bias was used as a determinant for codon usage variation of different genes; correlation analysis was used to correlate both the axes (Table 3). Correlation analysis showed that COA was negatively correlated with the GC3 value with axis 1 (r = −0.196, P b 0.024) and positively with axis 2 (r = 0.223, P b 0.010), the GC value was found correlated negatively with axis 1 (r = −0.379, P b 0.001) and positively with axis 2 (r = 0.180, P b 0.039). Nc was found to be negatively correlated with both axis 1 (r = −0.176, P b 0.044) and axis 2 (r = −0.464, P b 0.001). Interestingly, GC3, GC and Nc are found correlated with axis 1 and axis 2 of COA, indicating that codon usage bias in RABV ‘G’ gene is not compositional constraint. The patterns of base composition were most likely natural selection and not mutational bias.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ความดัน mutational และเลือกไทหมิงเป็นปัจจัยหลักสำหรับการลงบัญชีสำหรับการเปลี่ยนแปลงการใช้งานรหัสพันธุกรรม (เจนกินส์และโฮล์มส์ 2003) ใช้อคติ mutational เป็นปัจจัยที่สำหรับรูปแบบการใช้งานรหัสพันธุกรรมของยีนแตกต่างกัน ใช้การวิเคราะห์ความสัมพันธ์การเชื่อมโยงทั้งสองแกน (ตาราง 3) การวิเคราะห์ความสัมพันธ์พบว่า COA ถูกความสัมพันธ์ในเชิงลบกับค่า GC3 กับแกน 1 (r = −0.196, P b 0.024) และบวก กับแกน 2 (r = 0.223, P b 0.010), ค่า GC พบความสัมพันธ์ในเชิงลบกับแกน 1 (r = −0.379, P b 0.001) และบวก กับแกน 2 (r = 0.180, P b 0.039) พบว่า Nc เป็นความสัมพันธ์ในเชิงลบกับทั้งแกน 1 (r = −0.176, P b 0.044) และแกนที่ 2 (r = −0.464, P b 0.001) น่าสนใจ GC3, GC และ Nc ได้พบความสัมพันธ์กับแกน 1 และแกนที่ 2 ของ COA ระบุว่า อคติการใช้รหัสพันธุกรรมในยีน RABV 'G' ไม่ใช่ข้อจำกัด compositional รูปแบบขององค์ประกอบพื้นฐานคัดเลือกโดยธรรมชาติมากที่สุดและ mutational ไม่อคติ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ความดันและการเลือก mutational แปลเป็​​นปัจจัยหลักสำหรับการบันทึกบัญชีสำหรับรูปแบบการใช้งาน codon (เจนกินส์และโฮล์มส์, 2003) อคติ mutational ถูกใช้เป็นปัจจัยสำหรับรูปแบบการใช้งาน codon ของยีนที่แตกต่างกัน; การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ได้ถูกใช้ในความสัมพันธ์ทั้งสองแกน (ตารางที่ 3) การวิเคราะห์ความสัมพันธ์พบว่า COA มีความสัมพันธ์เชิงลบกับค่า GC3 กับแกน 1 (r = -0.196, p B 0.024) และบวกกับแกน 2 (r = 0.223, p B 0.010) ค่า GC พบความสัมพันธ์เชิงลบกับแกน 1 (r = -0.379, p B 0.001) และบวกกับแกน 2 (r = 0.180, p B 0.039) Nc ถูกพบว่ามีความสัมพันธ์เชิงลบกับทั้งแกน 1 (r = -0.176, p B 0.044) และแกน 2 (r = -0.464, p B 0.001) ที่น่าสนใจ GC3, GC และ Nc จะพบว่ามีความสัมพันธ์กับแกนที่ 1 และที่ 2 ของแกน COA แสดงให้เห็นว่าการใช้อคติใน codon ยีน RABV 'G' ไม่ จำกัด compositional รูปแบบขององค์ประกอบฐานมีแนวโน้มมากที่สุดการคัดเลือกโดยธรรมชาติและมีอคติไม่ mutational

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ความดันซึ่งเปลี่ยนแปลงและคัดเลือกแปลเป็นปัจจัยหลักสำหรับบัญชีสำหรับการเปลี่ยนแปลงการใช้งาน codon ( เจนกินส์และโฮล์มส์ , 2003 ) ซึ่งเปลี่ยนแปลงอคติที่ถูกใช้เป็นปัจจัยด้านการเปลี่ยนแปลงของยีนรหัสพันธุกรรมแตกต่างกัน การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ใช้ความสัมพันธ์ทั้งแกน ( ตารางที่ 3 ) การวิเคราะห์ความสัมพันธ์พบว่ามีความสัมพันธ์เชิงลบกับค่าสินค้า gc3 กับแกน 1 ( r = − 0.196 P B 0.024 ) และบวกกับแกน 2 ( r = 0.223 , P B 0.010 ) , ค่า GC มีความสัมพันธ์ทางลบกับแกน 1 ( r = − 0.379 P B 0.001 ) และบวกกับแกน 2 ( r = 0.108 P B 0.039 ) NC คือ พบว่ามีความสัมพันธ์กับทั้งแกน 1 ( r = − 0.236 , p B 0.044 ) และแกน 2 ( r = − 0.464 , P B 0.001 ) น่าสนใจ gc3 , GC และ NC ที่พบมีความสัมพันธ์กับแกน 1 และ 2 ของแกนเซอร์ ระบุว่าการใช้งาน codon อคติใน rabv " g " ยีนไม่ใช่ส่วนประกอบจำกัด รูปแบบขององค์ประกอบฐานมีแนวโน้มมากที่สุด ธรรมชาติ การเลือก และไม่ได้เกี่ยวกับการเปลี่ยนแปลงคติ