2.3. Amplification and sequencing o

2.3. Amplification and sequencing of 16S rRNA gene
Amplification of the 16S rDNA (1500 bp) was conducted using
specific primers for the Acetobacter genus, as follows: F: 50-
AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-30 and R: 50-TACCTTGTTAGGACTTCACC-
30. The polymerase chain reaction (PCR) program cycles were
as follows: denaturation at 95 C for 4 min, 32 cycles of 94 C for
1 min, 58 C for 1 min, and 72 C for 95 s, and final extension conducted
for 5 min at 72 C. The PCR products were electrophoresed,
and the 16S rRNA-amplified DNA band was purified using the QIAquick
PCR purification kit (QIAGEN, Hilden, Germany) based on the
instructions on the kit. The purified DNAs were sequenced by
Macrogen, a Korean company. The sequencing results were blasted
with the deposited sequences in the National Center for Biotechnology
Information (NCBI) and GenBank site (http://blast.ncbi.nlm.
nih.gov/Blast.cgi) to identify the isolated bacteria cells.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.3 การขยายและจัดลำดับของยีน 16S rRNAขยายการ 16S rDNA (1500 bp) ได้ดำเนินการโดยใช้ไพรเมอร์เฉพาะสำหรับสกุล Acetobacter เป็นดังนี้: 50 F: -AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-30 และ R: 50-TACCTTGTTAGGACTTCACC -30.พอลิเมอเรสปฏิกิริยาลูกโซ่ (PCR) โปรแกรมวงจรได้ดังนี้: denaturation ที่ C 95 ในนาทีที่ 4 รอบ 32 ของ 94 C สำหรับ1 นาที 58 C ใน 1 นาที และ 72 C 95 s และส่วนขยายสุดท้ายที่ดำเนินการใน 5 นาทีที่ 72 C. ผลิตภัณฑ์ PCR ถูก electrophoresedและ 16S rRNA ขยายดีเอ็นเอวงที่บริสุทธิ์โดยใช้การ QIAquickชุดฟอก PCR (QIAGEN, Hilden เยอรมนี) ตามคำแนะนำเกี่ยวกับชุดสินค้า DNAs บริสุทธิ์ถูกเรียงลำดับตามMacrogen บริษัทเกาหลี ผลการจัดลำดับถูกทำลายกับลำดับที่นำฝากในศูนย์เทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติข้อมูล (NCBI) และไซต์ GenBank (ส่วน http://blast.ncbi.nlmnih.gov/Blast.cgi) to identify the isolated bacteria cells.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.3 การขยายและการเรียงลำดับของยีน 16S rRNA
ขยายของ 16S rDNA (1500 bp)
ได้ดำเนินการโดยใช้ไพรเมอร์ที่เฉพาะเจาะจงสำหรับประเภทAcetobacter ดังนี้ F: 50
AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-30 และ R: 50 TACCTTGTTAGGACTTCACC-
30 ปฏิกิริยาลูกโซ่โพลิเมอร์ (PCR)
รอบโปรแกรมมีดังนี้? denaturation ที่ 95 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 4 นาที 32 รอบจาก 94 องศาเซลเซียสเป็นเวลา
1 นาที 58 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 1 นาทีและ 72 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 95 วินาที, และการขยายสุดท้าย?
ดำเนินการเป็นเวลา5 นาทีที่ 72 องศาเซลเซียส ผลิตภัณฑ์ PCR ถูก electrophoresed,
และ 16S rRNA วงดีเอ็นเอแอมพลิฟายบริสุทธิ์โดยใช้ QIAquick
ชุดฟอก PCR (QIAGEN, ฮิลเดน, เยอรมนี)
บนพื้นฐานของคำแนะนำเกี่ยวกับชุด DNAs บริสุทธิ์มีลำดับขั้นตอนโดย
Macrogen ซึ่งเป็น บริษัท เกาหลี ผลการจัดลำดับถูกทำลายด้วยลำดับที่ฝากไว้ในศูนย์แห่งชาติสำหรับเทคโนโลยีชีวภาพสารสนเทศ(NCBI) และเว็บไซต์ของ GenBank (http:. //blast.ncbi.nlm nih.gov/Blast.cgi) เพื่อระบุเซลล์แบคทีเรียที่แยก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.3 และการหาลำดับเบสของยีน 16S rRNA (
( ของ 16S rDNA ( 1500 BP ) จำนวน
ไพรเมอร์ที่เฉพาะเจาะจงสำหรับ Acetobacter สกุลดังนี้ : F : 50 -
agagtttgatcmtggctcag-30 และ R : 50-taccttgttaggacttcacc -
30 ปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอร์เรส ( พีซีอาร์ ) รอบโครงการ อยู่
ดังนี้ ( 95  C เป็นเวลา 4 นาที 32 รอบ 94  C
1 นาที , 58  องศาเซลเซียสนาน 1 นาทีและ 72  C 95 , และส่วนขยายสุดท้าย )
5 นาทีที่ 72  C ที่เพิ่มปริมาณ electrophoresed 16S rRNA
, และขยายแถบดีเอ็นเอบริสุทธิ์ใช้ qiaquick
PCR ฟอก Kit ( QIAGEN Hilden , เยอรมนี ) ขึ้นอยู่กับ
คําแนะนําในชุด และจำเพาะเป็นลำดับด้วย
macrogen , บริษัทเกาหลี การจัดลำดับผลลัพธ์ถูกระเบิด
กับฝาก ลำดับในศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ (
ncbi ) และพบเว็บไซต์ ( http : / / ระเบิด ncbi . nlm .
NIH . gov / ระเบิด CGI ) เพื่อระบุแยกแบคทีเรียเซลล์