2. Materials and methods
2.1. Study design and population
This descriptive cross-sectional hospital based study was conducted
during the period from December 2010 to May 2013 in
Radiation and Isotopes Centre of Khartoum, Khartoum state,
Sudan. The Radiation and Isotopes Centre of Khartoum is one of
themain oncology centers in Sudan, providing treatment for cancer
patients with radiotherapy, chemotherapy and hormonal therapy
[11]. All cancer patients who attended Radiation and Isotopes
Centre of Khartoum were enrolled in the study. Each patient
with no proven evidence of infection at the time of admission,
but developed signs of infection after at least two days of
hospitalization was included in the study. Patients with proven
evidence of infection at the time of admission to the hospital
were excluded from the study. The study was approved by the
Research Committee of the Faculty of Medical Laboratory
Sciences, University of Khartoum. All patients included in this
study were consented verbally before collection of samples.
2.2. Collection of samples
Clinical samples of urine (n = 325), wound pus (n = 130),
blood (n = 20) and sputum (n = 30) were collected from cancer
patients for the investigations of pathogenic microorganism
following standard laboratory procedures [12]. Hospital
specimens were collected from different moist environments,
including infrastructures (n = 551), furniture (n = 232),
surgical equipments (n = 123), laboratories (n = 68), kitchens
(n = 24) using sterile moist cotton swabs. All the collected
specimens were properly labeled and the data were collected
via a questionnaire form.
2.3. Isolation and identification of bacterial species
For possible isolation of bacterial pathogens, each specimen
(clinical or environmental) were inoculated onto blood agar
(HiMedia, India) and MacConkey agar (HiMedia, India) plates.
Then all cultured plates were incubated aerobically at 37 C for
24 h. Blood samples were inoculated onto brain heart infusion
broth and incubated at 37 C for a period of 7–14 days. Each
bacterial isolate was identified on the bases colonial
morphology, Gram staining and required biochemical tests
following standard laboratory methods
2.4. Antimicrobial susceptibility testing
Antimicrobial susceptibility testing was performed using
Kirby–Bauer disc diffusion technique on Mueller-Hinton agar
medium (HiMedia, India) as recommended by the Clinical and
Laboratory Standards Institute [13]. Isolates were tested for their
susceptibility against different antimicrobial agents, including:
amikacin (30 mg), ampicillin (10 mg), cefotaxime (30 mg),
ceftazidime (30 mg), ceftriaxone (30 mg), ciprofloxacin (5 mg),
gentamicin (10 mg), meropenem (10 mg) (HiMedia, India). The
strain of Escherichia coli ATCC 25922 (E. coli) was used as
control, and was examined each time when susceptibility
testing was carried out. The test result was only validated in
cases where inhibition zone diameters of the control strain
within the performance range in accordance to the Clinical
and Laboratory Standards Institute criteria [13].
2.5. Screening of extended-spectrum b-lactamase
(ESBL) production
Gram-negative isolates recovered from cancer patients and
hospital environments were screened for ESBL production by
the double disc synergy test as described by Jarlier et al. [14].
All the isolates showed the resistance to third generation
cephalosporin were examined for ESBL production. A disc
containing amoxicillin/clavulanic acid (30 mg) was placed in
the centre of the Mueller-Hinton agar plate, and discs containing
ceftriaxone (30 mg), cefotaxime (30 mg) and ceftazidime
(30 mg) were placed 30 mm distance from the disc of
amoxicillin/clavulanic acid. A clear extension of the edge of the
inhibition zone of third generation cephalosporin towards
amoxicillin/clavulanic acid disc is interpreted as positive for
ESBL production. Control strains of Staphylococcus aureus
ATCC 25923 (S. aureus), E. coli and Pseudomonas aeruginosa
ATCC 27853 (P. aeruginosa) were run at the same time on
separate plates using the same turbidity as in the test organism
to evaluate the conditions of the test and the potency of the
discs.
2.6. Statistical analysis
The data obtained was coded and entered into the SPSS,
version 16.0. The Chi-square test was used to test for the significant
differences between the variables. P < 0.05 was
considered as statistically significant.
2. วัสดุและวิธีการ2.1 การออกแบบและประชากรศึกษาได้ดำเนินการศึกษาอธิบายเหลวตามโรงพยาบาลช่วงเดือนธันวาคม 2553 ถึง 2013 พฤษภาคมในรังสีและไอโซโทปศูนย์ของคาร์ทูม รัฐคาร์ทูมประเทศซูดาน รังสีและไอโซโทปศูนย์คาร์ทูมเป็นหนึ่งศูนย์มะเร็งวิทยา themain ในซูดาน ให้บริการรักษาโรคมะเร็งผู้ป่วยที่ มีการฉายแสง เคมีบำบัด และฮอร์โมนบำบัด[11] ผู้ป่วยโรคมะเร็งทั้งหมดที่เข้าร่วมรังสีและไอโซโทปศูนย์กลางของคาร์ทูมถูกลงทะเบียนในการศึกษา ผู้ป่วยแต่ละมีหลักฐานพิสูจน์ไม่ติดเชื้อในเวลาเข้าชมพัฒนาแต่อาการติดเชื้อหลังจากที่สองวันโรงพยาบาลถูกรวมในการศึกษา ผู้ป่วยที่มีพิสูจน์หลักฐานการติดเชื้อในเวลาเข้าโรงพยาบาลถูกแยกออกจากการศึกษา อนุมัติการศึกษาตามคณะกรรมการวิจัยของคณะแพทย์ศาสตร์ มหาวิทยาลัยคาร์ทูม ผู้ป่วยทั้งหมดที่รวมอยู่ในนี้ศึกษาได้ยินยอมวาจาก่อนเก็บตัวอย่าง2.2 การเก็บตัวอย่างตัวอย่างคลินิกของปัสสาวะ (n = 325), แผลหนองใน (n = 130),เลือด (n = 20) และ sputum (n = 30) ได้รวบรวมจากโรคมะเร็งผู้ป่วยสำหรับการตรวจสอบจุลินทรีย์ pathogenicตามขั้นตอนมาตรฐานห้องปฏิบัติการ [12] โรงพยาบาลไว้เป็นตัวอย่างได้ถูกรวบรวมจากสภาพแวดล้อมชุ่มชื่นต่าง ๆรวมทั้งโครงสร้างพื้นฐาน (n = 551), เฟอร์นิเจอร์ (n = 232),อุปกรณ์ผ่าตัด (n = 123), ห้องปฏิบัติการ (n = 68), ครัว(n = 24) ใช้ swabs ผ้ากอซชุ่มชื่น ทั้งหมดที่รวบรวมไว้เป็นตัวอย่างได้อย่างถูกต้องชื่อ และข้อมูลถูกเก็บรวบรวมผ่านแบบสอบถาม2.3 การแยกและระบุชนิดแบคทีเรียสำหรับโรคแบคทีเรีย แต่ละตัวอย่างสามารถแยก(คลินิก หรือสิ่งแวดล้อม) ได้ inoculated ลงเลือด agar(HiMedia อินเดีย) และแผ่น MacConkey agar (HiMedia อินเดีย)แล้ว แผ่นทั้งหมดอ่างมี incubated aerobically ที่ 37 C สำหรับตัวอย่างเลือด 24 h. ถูก inoculated ไปยังสมองหัวใจคอนกรีตซุป และ incubated ที่ 37 C เป็นระยะเวลา 7-14 วัน แต่ละแยกเชื้อแบคทีเรียที่ระบุบนโคโลเนียลฐานสัณฐานวิทยา การย้อมสีกรัม และการทดสอบชีวเคมีต้องวิธีปฏิบัติการมาตรฐานต่อไปนี้2.4 การภูมิไวรับยับยั้งจุลินทรีย์ทดสอบภูมิไวรับยับยั้งจุลินทรีย์ทดสอบทำโดยใช้เทคนิคแพร่ดิสก์เคอร์บี้ – Bauer บน Mueller Hinton agarปานกลาง (HiMedia อินเดีย) แนะนำ โดย Clinical และห้องปฏิบัติการมาตรฐาน สถาบัน [13] แยกทดสอบสำหรับการภูมิไวรับต่อแทนจุลินทรีย์ต่าง ๆ รวมทั้ง:amikacin (30 mg), แอมพิซิลลิน (10 มิลลิกรัม), เซฟโฟแทกซิม (30 mg),เซฟตาซิดิม (30 mg), เซฟไตรอะโซน (30 mg), ciprofloxacin (5 มิลลิกรัม),gentamicin (10 มิลลิกรัม), meropenem (10 มิลลิกรัม) (HiMedia อินเดีย) ที่ต้องใช้ของ Escherichia coli ATCC 25922 (E. coli) ถูกใช้เป็นควบคุม และถูกตรวจสอบแต่ละครั้งเมื่อภูมิไวรับทดสอบได้ดำเนิน ผลการทดสอบถูกตรวจสอบเฉพาะในกรณีที่สายพันธุ์ยับยั้งโซนปัจจุบันของตัวควบคุมภายในช่วงประสิทธิภาพในการ Clinicalและเกณฑ์มาตรฐานของห้องปฏิบัติการ สถาบัน [13]2.5. การคัดกรองของสเปกตรัมขยาย b-lactamaseผลิต (ESBL)แยกแบคทีเรียแกรมลบการกู้คืนจากผู้ป่วยโรคมะเร็ง และสภาพแวดล้อมของโรงพยาบาลถูกฉาย ESBL ผลิตโดยsynergy ดิสก์คู่ทดสอบตามที่อธิบายไว้โดย Jarlier et al. [14]ทั้งหมดแยกได้พบว่าความต้านทานการรุ่นสามcephalosporin ถูกตรวจสอบสำหรับการผลิต ESBL แผ่นดิสก์ประกอบด้วยกรด amoxicillin/clavulanic (30 มิลลิกรัม) ถูกวางไว้ในศูนย์กลางของจาน Mueller Hinton agar และดิสก์ที่ประกอบด้วยเซฟไตรอะโซน (30 mg), เซฟโฟแทกซิม (30 มิลลิกรัม) และเซฟตาซิดิม(30 มิลลิกรัม) ถูกวางระยะห่าง 30 มม.จากดิสก์ของamoxicillin/clavulanic กรด ส่วนขยายที่ชัดเจนของขอบของการโซนยับยั้งของ cephalosporin รุ่นที่ 3 ต่อamoxicillin/clavulanic กรดดิสก์จะถูกแปลงเป็นค่าบวกสำหรับการผลิต ESBL สายพันธุ์ควบคุมของ Staphylococcus หมอเทศข้างลายATCC 25923 (S. หมอเทศข้างลาย), E. coli และ Pseudomonas aeruginosaATCC 27853 (P. aeruginosa) ถูกเรียกใช้ในเวลาเดียวกันในแยกแผ่นใช้ความขุ่นเหมือนในการทดสอบสิ่งมีชีวิตการประเมินเงื่อนไขของการทดสอบและจำนวนดิสก์2.6. สถิติวิเคราะห์ข้อมูลที่ได้รับรหัส และป้อนลงในโปรแกรมรุ่น 16.0 ใช้การทดสอบ Chi-square ในการทดสอบสำคัญความแตกต่างระหว่างตัวแปร P เป็น < 0.05ถือเป็นอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ
การแปล กรุณารอสักครู่..

2. วัสดุและวิธีการ
2.1 การออกแบบการศึกษาและจำนวนประชากรนี้โรงพยาบาลตัดขวางการศึกษาตามที่อธิบายได้ดำเนินการในช่วงระยะเวลาตั้งแต่ธันวาคม2010 ถึงเดือนพฤษภาคม 2013 ในการฉายรังสีและไอโซโทปศูนย์คาร์ทูมรัฐคาร์ทูมประเทศซูดาน รังสีและไอโซโทปศูนย์คาร์ทูมเป็นหนึ่งในศูนย์เนื้องอก themain ในซูดานให้การรักษาโรคมะเร็งผู้ป่วยที่มีการรักษาด้วยรังสีเคมีบำบัดและการรักษาด้วยฮอร์โมน[11] ผู้ป่วยโรคมะเร็งทุกคนที่เข้าร่วมการฉายรังสีและไอโซโทปศูนย์คาร์ทูมได้รับการคัดเลือกในการศึกษา ผู้ป่วยแต่ละรายที่มีการพิสูจน์แล้วว่าไม่มีหลักฐานของการติดเชื้อในช่วงเวลาของการรับสมัคร, แต่การพัฒนาสัญญาณของการติดเชื้อหลังอย่างน้อยสองวันของการรักษาในโรงพยาบาลถูกรวมอยู่ในการศึกษา ผู้ป่วยที่มีการพิสูจน์หลักฐานของการติดเชื้อในเวลาที่เข้ารับการรักษาในโรงพยาบาลที่ได้รับการยกเว้นจากการศึกษา การศึกษาได้รับการอนุมัติจากคณะกรรมการวิจัยของคณะห้องปฏิบัติการทางการแพทย์วิทยาศาสตร์มหาวิทยาลัยคาร์ทูม ผู้ป่วยทุกรายรวมอยู่ในนี้การศึกษาได้รับการยินยอมด้วยวาจาก่อนที่จะเก็บตัวอย่าง. 2.2 การเก็บตัวอย่างตัวอย่างทางคลินิกของปัสสาวะ (n = 325) หนองแผล (n = 130) เลือด (n = 20) และเสมหะ (n = 30) ที่ถูกเก็บรวบรวมจากโรคมะเร็งผู้ป่วยสำหรับการตรวจสอบของจุลินทรีย์ที่ทำให้เกิดโรคต่อไปนี้ขั้นตอนการตรวจทางห้องปฏิบัติการมาตรฐาน[ 12] โรงพยาบาลตัวอย่างที่ถูกเก็บมาจากสภาพแวดล้อมที่ชื้นที่แตกต่างกันรวมทั้งโครงสร้างพื้นฐาน(n = 551) เฟอร์นิเจอร์ (n = 232) อุปกรณ์ผ่าตัด (n = 123), ห้องปฏิบัติการ (n = 68) ห้องครัว(n = 24) โดยใช้สำลีก้อนชื้นผ่านการฆ่าเชื้อ . ทั้งหมดที่เก็บรวบรวมตัวอย่างที่ถูกระบุอย่างถูกต้องและข้อมูลที่ถูกเก็บรวบรวมและส่งแบบฟอร์มแบบสอบถาม. 2.3 การแยกและจำแนกสายพันธุ์แบคทีเรียสำหรับการแยกเป็นไปได้ของแบคทีเรียแต่ละชิ้นงาน(ทางคลินิกหรือสิ่งแวดล้อม) ถูกเชื้อลงบนอาหารเลี้ยงเชื้อในเลือด(HIMEDIA, อินเดีย) และวุ้น MacConkey (HIMEDIA, อินเดีย) แผ่น. แล้วจานเพาะเลี้ยงทั้งหมดถูกบ่ม aerobically ที่ 37? C เป็นเวลา24 ชั่วโมง ตัวอย่างเลือดถูกเชื้อเข้าสู่สมองหัวใจแช่น้ำซุปและบ่มที่อุณหภูมิ 37 องศาเซลเซียสเป็นระยะเวลา 7-14 วัน แต่ละแยกเชื้อแบคทีเรียที่ถูกระบุบนฐานอาณานิคมสัณฐานวิทยาการย้อมสีแกรมและการทดสอบทางชีวเคมีที่จำเป็นต่อไปนี้วิธีการตรวจทางห้องปฏิบัติการมาตรฐาน2.4 การทดสอบความไวต่อยาต้านจุลชีพในการทดสอบความไวต่อยาต้านจุลชีพได้รับการดำเนินการโดยใช้Kirby-Bauer เทคนิคการแพร่กระจายบนแผ่นดิสก์ Mueller-Hinton agar ปานกลาง (HIMEDIA, อินเดีย) ตามคำแนะนำของทางคลินิกและการตรวจทางห้องปฏิบัติการสถาบันมาตรฐาน[13] ที่แยกได้มีการทดสอบของพวกเขาอ่อนแอต่อยาต้านจุลชีพที่แตกต่างกันรวมไปถึง: amikacin (30 mg), จิบูตี (10 มก.) cefotaxime (30 มก.) ceftazidime (30 มก.) เดือดดาล (30 มก.) ciprofloxacin (5 มก.) gentamicin (10 มก.) meropenem (10 มิลลิกรัม) (HIMEDIA, อินเดีย) สายพันธุ์ของเชื้อ Escherichia coli ATCC 25922 (เชื้อ E. coli) ถูกใช้เป็นการควบคุมและการถูกตรวจสอบในแต่ละครั้งเมื่อความไวต่อการทดสอบได้รับการดำเนินการ ผลการทดสอบถูกตรวจสอบเฉพาะในกรณีที่มีเส้นผ่าศูนย์กลางบริเวณยับยั้งความเครียดควบคุมอยู่ในช่วงการปฏิบัติงานตามคลินิกหลักเกณฑ์และห้องปฏิบัติการสถาบันมาตรฐาน[13]. 2.5 การคัดกรองของสเปกตรัมขยาย B-lactamase (ESBL) การผลิตไอโซเลทแกรมลบหายไปจากผู้ป่วยโรคมะเร็งและสภาพแวดล้อมในโรงพยาบาลที่ได้รับการคัดเลือกในการผลิตESBL โดยการทดสอบการทำงานร่วมกันสองแผ่นตามที่อธิบายJarlier et al, [14]. ไอโซเลททั้งหมดแสดงให้เห็นความต้านทานต่อรุ่นที่สามcephalosporin มีการตรวจสอบสำหรับการผลิต ESBL แผ่นดิสก์ที่มี amoxicillin / กรด clavulanic (30 มก.) อยู่ในศูนย์กลางของMueller-Hinton จานอาหารเลี้ยงเชื้อและแผ่นที่มีเดือดดาล(30 มก.) cefotaxime (30 มก.) และซิดีม(30 มก.) ถูกวางไว้ 30 มิลลิเมตรระยะทางจาก แผ่นดิสก์ของamoxicillin / กรด clavulanic ขยายที่ชัดเจนของขอบของเขตการยับยั้งการ cephalosporin รุ่นที่สามต่อ amoxicillin / แผ่นกรด clavulanic ถูกตีความว่าเป็นในเชิงบวกสำหรับการผลิตESBL สายพันธุ์ของเชื้อ Staphylococcus ควบคุม aureus ATCC 25923 (เชื้อ S. aureus), เชื้อ E. coli และเชื้อ Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853 (พี aeruginosa) ได้รับการทำงานในเวลาเดียวกันบนแผ่นแยกจากกันโดยใช้ความขุ่นเช่นเดียวกับในชีวิตการทดสอบเพื่อประเมินสภาพของการทดสอบและความแข็งแรงของแผ่น. 2.6 การวิเคราะห์ทางสถิติข้อมูลที่ได้เป็นรหัสและป้อนเข้าสู่โปรแกรม SPSS, รุ่น 16.0 การทดสอบไคสแควร์ถูกใช้ในการทดสอบอย่างมีนัยสำคัญแตกต่างระหว่างตัวแปร P <0.05 ได้รับการพิจารณาเป็นนัยสำคัญทางสถิติ
การแปล กรุณารอสักครู่..

2 . วัสดุและวิธีการ
2.1 . การศึกษาการออกแบบและประชากร
โรงพยาบาลภาคตัดขวางครั้งนี้ โดยศึกษา
ในช่วงธันวาคม 2553 ถึงพฤษภาคม 2556
รังสีและไอโซโทปในศูนย์ของ Khartoum , ซูดานรัฐ
ซูดาน รังสีและไอโซโทปในคาร์ทูม เป็นหนึ่งในศูนย์บริการและศูนย์มะเร็ง
ในซูดาน การให้การรักษามะเร็ง
ผู้ป่วยรังสีรักษาการทำคีโมและการรักษาด้วยยาฮอร์โมน
[ 11 ] ทั้งหมดผู้ป่วยมะเร็งที่ได้รับรังสีและไอโซโทป
ศูนย์คาร์ทูมลงทะเบียนเรียนในการศึกษา ผู้ป่วยไม่มีการพิสูจน์หลักฐานของการติดเชื้อ
เวลาที่เข้าเรียน แต่พัฒนาสัญญาณของการติดเชื้อหลังอย่างน้อย 2 วัน
ต้องถูกรวมอยู่ในการศึกษา ผู้ป่วยที่มีการพิสูจน์
หลักฐานของการติดเชื้อในเวลาที่เข้าพักที่โรงพยาบาล
ถูกคัดออกจากการศึกษา การศึกษาได้รับการอนุมัติโดยคณะกรรมการของคณะวิจัย
วิทยาศาสตร์ห้องปฏิบัติการทางการแพทย์ มหาวิทยาลัยแห่งคาร์ทูม ผู้ป่วยทั้งหมดรวมอยู่ในการศึกษา
ถูกยินยอมวาจาก่อนการเก็บตัวอย่าง .
2.2 . การเก็บตัวอย่าง
ตัวอย่างทางคลินิกของปัสสาวะ ( n = 325 ) , แผลหนอง ( n = 130 )
เลือด ( n = 20 ) และเสมหะ ( n = 30 ) โดยใช้ข้อมูลจากผู้ป่วยมะเร็ง
สำหรับการสืบสวนของ เชื้อโรค จุลินทรีย์
ต่อไปนี้ขั้นตอนปฏิบัติการมาตรฐาน [ 12 ] ตัวอย่างโรงพยาบาล
เก็บจากสภาพแวดล้อมที่ชุ่มชื้นแตกต่างกัน
รวมทั้งโครงสร้างพื้นฐาน ( n = 246 ) เฟอร์นิเจอร์ ( n = 232 ) ,
อุปกรณ์ผ่าตัด ( n = 123 ) ห้องปฏิบัติการ ( n = 68 ) , ครัว
( n = 24 ) โดยใช้ผ้าฝ้าย swabs หมันเปียก . รวบรวมทั้งหมด
จำนวนข้อความถูกต้อง และเก็บรวบรวมข้อมูลผ่านแบบสอบถาม
.
2.3 การแยกและจำแนกชนิดของแบคทีเรียที่แยกได้จาก
( ตัวอย่างแบคทีเรียก่อโรคในแต่ละคลินิก หรือสิ่งแวดล้อม ) ปลูกเชื้อลงบนเลือดวุ้น
( himedia อินเดีย ) และ Lynx ( himedia อินเดีย
) จานแล้วแผ่นการเพาะบ่มที่ 37 ( aerobically C
24 ชั่วโมง ตัวอย่างเลือดถูกเชื้อเข้าสู่สมองหัวใจฉีด
broth บ่มที่ 37 C เป็นระยะเวลา 7 – 14 วัน แต่ละ
แบคทีเรียแยกถูกระบุบนฐานอาณานิคม
สัณฐานวิทยาและชีวเคมีทดสอบการย้อมสีกรัมใช้วิธีการทางห้องปฏิบัติการ
ตามมาตรฐาน 2.4 . ยาต้านจุลชีพกลุ่มการทดสอบ
การทดสอบโดยใช้การใช้ยาต้านจุลชีพ
Kirby –บาวเออร์แผ่นกระจายเทคนิค มูลเลอร์ ฮินตัน วุ้น
ขนาดกลาง ( himedia อินเดีย ) ตามที่แนะนำ โดยทางคลินิกและห้องปฏิบัติการ
มาตรฐานสถาบัน [ 13 ] ทดสอบความไวของเชื้อต่อยาต้านจุลชีพ
ตัวแทนที่แตกต่างกันรวมถึง :
อะมิกาซิน ( 30 มิลลิกรัม ) , แอมพิซิลลิน ( 10 mg ) , ตลาด ( 30 มิลลิกรัม )
ดีม ( 30 มิลลิกรัม )เคร็ก กอร์ดอน ( 30 มิลลิกรัม ) , ซิโปรฟลอกซาซิน ( 5 มิลลิกรัม )
เจนตาไมซิน ( 10 mg ) , ยา ( 10 mg ) ( himedia , อินเดีย )
ของเชื้อ Escherichia coli ( E . coli ATCC 25922 ) ใช้
การควบคุมและการตรวจสอบในแต่ละครั้งเมื่อทดสอบความไว
ได้ดําเนินการ ผลการทดสอบเป็นเพียงตรวจสอบใน
กรณีที่บริเวณยับยั้งเส้นผ่าศูนย์กลางของการควบคุมความเครียด
การแปล กรุณารอสักครู่..
