Knowing the full complement ofgenet

Knowing the full complement of
genetic changes that take place during resistance evolution
in natural and clinical environments, and addressing their
individual roles in that process, is essential to understanding
the evolution of a strain to antibiotic resistance. However,
genome sequencing of resistant clinical isolates by
itself will not provide the insight we need into the significance
of individual genotypes, and the steps involved in
reaching the resistant state. What is essential is to complement
clinical sequencing studies with experimental evolution
made under a variety of controlled conditions. In that
way, genome-sequencing data can be used to map evolutionary
trajectories, and the phenotypic significance of
individual mutations can be experimentally measured.
This type of experiment will allow reconstruction of evolutionary
histories, and deepen our understanding of the
selective forces leading to the resistant mutant phenotype.
We are already making such experiments, with various
selection pressures, including subMIC and changing antibiotic
concentrations, and where the genomes of the
resulting mutants are completely sequenced. We find that
many genetic alterations occur when bacteria are selected
at low antibiotic concentrations, and importantly, many of
these changes are not predicted from our current knowledge
of antibiotic resistance determinants. Of course some
of these experimental trajectories may represent evolutionary
dead-ends, but until we make the experiments
and compare the outcomes with clinically derived genomes
we will not even be close to fully understanding the paths
of resistance evolution

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

รู้ความเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมที่เกิดขึ้นในระหว่างวิวัฒนาการความต้านทานในสภาพแวดล้อมทางธรรมชาติ และทางคลินิก และแก้ปัญหาของพวกเขาในแต่ละบทบาทเป็นสิ่งสำคัญเพื่อความเข้าใจวิวัฒนาการของการต้านทานยาปฏิชีวนะต้องใช้ อย่างไรก็ตามแยกกลุ่มลำดับของทนทางคลินิกโดยตัวเองจะมีความเข้าใจที่เราจำเป็นต้องเป็นความสำคัญการศึกษาจีโนไทป์แต่ละ และขั้นตอนต่าง ๆ เกี่ยวข้องในถึงรัฐทน สิ่งสำคัญคือการ เติมเต็มศึกษาลำดับทางคลินิกกับวิวัฒนาการที่ทดลองทำภายใต้ความหลากหลายของเงื่อนไขควบคุม ในที่วิธีการ ลำดับกลุ่มข้อมูลสามารถใช้แผนผังวิวัฒนาการtrajectories และความสำคัญของไทป์กลายพันธุ์แต่ละตัวสามารถจะวัด experimentallyการทดสอบชนิดนี้จะช่วยให้ฟื้นฟูของวิวัฒนาการประวัติ และเราเข้าใจอย่างลึกซึ้งกองใช้กับ phenotype การกลายพันธุ์ที่ทนเราได้ทำการทดลองดังกล่าว มีต่าง ๆความดันเลือก subMIC และการเปลี่ยนแปลงยาปฏิชีวนะความเข้มข้น และที่ genomes ของสายพันธุ์ที่ได้จะสมบูรณ์มีการเรียงลำดับ เราพบว่าเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมหลายเกิดขึ้นเมื่อมีเลือกแบคทีเรียที่ความเข้มข้นยาปฏิชีวนะที่ต่ำ และที่สำคัญ มากมายเปลี่ยนแปลงเหล่านี้จะไม่ทำนายจากความรู้ปัจจุบันของเราของความต้านทานยาปฏิชีวนะดีเทอร์มิแนนต์ แน่นอนบางอย่างของ trajectories ทดลองเหล่านี้อาจแสดงถึงวิวัฒนาการdead-ends แต่จน กว่าเราทำการทดลองและเปรียบเทียบผลกับทางคลินิกได้รับ genomesเราไม่แม้แต่จะใกล้เต็มเข้าใจเส้นทางของวิวัฒนาการความต้านทาน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

รู้เต็มรูปแบบของการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมที่เกิดขึ้นในช่วงวิวัฒนาการต้านทานในสภาพแวดล้อมทางธรรมชาติและทางคลินิกและที่อยู่ของพวกเขามีบทบาทสำคัญในแต่ละกระบวนการที่เป็นสิ่งจำเป็นในการทำความเข้าใจวิวัฒนาการของสายพันธุ์ที่จะต้านทานยาปฏิชีวนะที่ อย่างไรก็ตามลำดับจีโนมของเชื้อทางคลินิกทนโดยตัวเองจะไม่ให้ข้อมูลเชิงลึกที่เราต้องการเข้าไปในความสำคัญของยีนของแต่ละบุคคลและขั้นตอนในการเข้าถึงรัฐทน อะไรคือสิ่งที่สำคัญคือการเติมเต็มการศึกษาทางคลินิกที่มีลำดับวิวัฒนาการการทดลองภายใต้ความหลากหลายของเงื่อนไขการควบคุม ในการที่ทางข้อมูลจีโนมลำดับสามารถใช้ในการ map วิวัฒนาการไบร์ทและความสำคัญฟีโนไทป์ของการกลายพันธุ์ของแต่ละบุคคลสามารถวัดได้ทดลอง. ชนิดของการทดลองนี้จะช่วยให้การฟื้นฟูของวิวัฒนาการประวัติศาสตร์และลึกมากขึ้นความเข้าใจของเราของกองกำลังเลือกที่นำไปสู่​​ ฟีโนไทป์กลายพันธุ์ที่ทน. แล้วเราจะทำให้การทดลองดังกล่าวมีต่างๆแรงกดดันเลือกรวมทั้ง subMIC ยาปฏิชีวนะและการเปลี่ยนแปลงความเข้มข้นและสถานที่ที่จีโนมของมนุษย์กลายพันธุ์ที่เกิดขึ้นจะมีลำดับขั้นตอนอย่างสมบูรณ์ เราพบว่าการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมจำนวนมากเกิดขึ้นเมื่อได้รับการคัดเลือกแบคทีเรียที่ระดับความเข้มข้นของยาปฏิชีวนะที่ต่ำและที่สำคัญมากของการเปลี่ยนแปลงเหล่านี้ไม่ได้รับการคาดการณ์จากความรู้ของเราในปัจจุบันของปัจจัยต้านทานยาปฏิชีวนะ แน่นอนบางส่วนของไบร์ทการทดลองเหล่านี้อาจเป็นตัวแทนของวิวัฒนาการตายปลายแต่จนกว่าเราจะทำให้การทดลองและเปรียบเทียบผลกับจีโนมมาทางคลินิกที่เราจะไม่ได้จะใกล้เคียงกับการทำความเข้าใจอย่างเต็มที่เส้นทางวิวัฒนาการต้านทาน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

รู้เต็มเติมเต็มการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมที่เกิดขึ้นในช่วงวิวัฒนาการของความต้านทานในสภาพแวดล้อมธรรมชาติและทางคลินิก และที่อยู่ของพวกเขาบทบาทของแต่ละบุคคลในกระบวนการนั้น เป็นสิ่งจำเป็น เพื่อความเข้าใจวิวัฒนาการของสายพันธุ์ที่ต้านทานยาปฏิชีวนะ . อย่างไรก็ตามลำดับของจีโนมสายพันธุ์ต้านทานทางคลินิกโดยตัวเองจะไม่ให้ข้อมูลเชิงลึกที่เราต้องการลงในความสำคัญของพันธุ์ของแต่ละบุคคลและขั้นตอนที่เกี่ยวข้องในถึงสภาพต้านทาน สิ่งที่ขาดไม่ได้คือกว่าการศึกษาทางคลินิกการทดลองกับวิวัฒนาการภายใต้ความหลากหลายของเงื่อนไขที่ควบคุมได้ ในที่วิธี , ข้อมูลลำดับจีโนมสามารถใช้แผนที่วิวัฒนาการวิถีกระสุน และลักษณะปรากฏความสำคัญของการกลายพันธุ์ของบุคคล สามารถวัดนี้การทดลองประเภทนี้จะช่วยให้สร้างวิวัฒนาการประวัติและลึกมากขึ้นความเข้าใจของเราของกำลังเลือกที่นำไปสู่การกลายพันธุ์ ป้องกันแล้วเราจะทำการทดลองดังกล่าว ต่าง ๆสำหรับการเลือกและการเปลี่ยนแปลง รวมทั้ง submic ยาปฏิชีวนะความเข้มข้นและที่จีโนมของมนุษย์กลายพันธุ์ที่เกิดทั้งหมดนี้ เราพบว่าการดัดแปลงทางพันธุกรรมมากมายเกิดขึ้นเมื่อแบคทีเรีย เลือกที่ความเข้มข้นต่ำที่ยาปฏิชีวนะและหลายการเปลี่ยนแปลงเหล่านี้จะไม่คาดการณ์จากความรู้ของเราของปัจจัยต้านทานยาปฏิชีวนะ แน่นอนบางคนเหล่านี้อาจเป็นตัวแทนของวิวัฒนาการของวิถีปลายตาย แต่ถ้าเราไม่ทำให้การทดลองและเปรียบเทียบผลทางคลินิกและจีโนมเราจะไม่ได้ใกล้ชิดกับความเข้าใจอย่างถ่องแท้ในเส้นทางวิวัฒนาการของความต้านทาน