Species identificationA combination

Species identification
A combination of morphological and molecular analysis was used for the identification of Trichoderma isolates. For morphological identification, strains were grown on 2% malt extract agar and on PDA under ambient laboratory conditions of light and temperature (about 21°C). Microscopic observations and measurements were made from preparations mounted in lactic acid. Individual isolates were identified at species level using standard mycological key (Gams and Bissett, 1998), species descriptions (Bissett, 1992; Samuels et al., 1999; Kraus et al., 2004), and TrichOKEY 2.0, an online method (http://www.isth.info/tools/molkey/index.php) for the quick and reliable molecular identification of Hypocrea and Trichoderma at the genus, clade, and species levels based on ITS1 and 2 sequences (Druzhinina et al., 2005). TrichOKEY identifies most species unequivocally, although some species have identical or very similar ITS1 and ITS2 sequences and are therefore indistinguishable by this method (Druzhinina et al., 2005, 2006). An accurate identification of species in the Rufa Clade is sometimes problematic as the species of this clade are currently under revision, and both T. viride and T. koningii are being divided into several new species (Druzhinina et al., 2005). In such cases the preferred means of identification is to supplement the barcode method (TrichOKEY) with the sequence analysis of other loci by TrichoBLAST (Jaklitsch et al., 2006; Kubicek et al., 2008).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

รหัสชนิดชุดวิเคราะห์สัณฐาน และโมเลกุลถูกใช้สำหรับการระบุแยก Trichoderma สำหรับรหัสสัณฐาน สายพันธุ์เติบโต 2% มอลต์สกัด agar และพีดีเอภายใต้สภาพแวดล้อมห้องปฏิบัติการของแสงและอุณหภูมิ (ประมาณ 21° C) สังเกตด้วยกล้องจุลทรรศน์และการวัดเกิดจากการเตรียมติดตั้งในกรด แยกแต่ละระบุระดับสายพันธุ์แบบมาตรฐาน mycological (Gams และ Bissett, 1998), ชนิดคำอธิบาย (Bissett, 1992 Samuels et al., 1999 Kraus et al., 2004), และ TrichOKEY 2.0 วิธีการออนไลน์ (ส่วน http://www.isth.info/tools/molkey/index.php) อย่างรวดเร็ว และเชื่อถือได้โมเลกุลรหัส Hypocrea และ Trichoderma ในระดับสกุล clade และพันธุ์ ITS1 และลำดับที่ 2 (Druzhinina et al., 2005) TrichOKEY ระบุสปีชีส์ส่วนใหญ่ unequivocally แม้ ว่าบางชนิดมีเหมือน หรือคล้าย ITS1 และ ITS2 ลำดับดังจำแนกไม่ได้ โดยวิธีนี้ (Druzhinina et al., 2005, 2006) รหัสถูกต้องพันธุ์ Rufa Clade เป็นบางครั้งมีปัญหาเป็นพันธุ์ clade นี้อยู่ภายใต้การปรับปรุง และตำบล viride และตำบล koningii ถูกแบ่งออกเป็นหลายสายพันธุ์ใหม่ (Druzhinina et al., 2005) ในกรณีดังกล่าว หมายถึงต้องการระบุเป็นเสริมวิธีบาร์โค้ด (TrichOKEY) ด้วยการวิเคราะห์ลำดับ loci อื่น ๆ โดย TrichoBLAST (Jaklitsch และ al., 2006 Kubicek et al., 2008)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การระบุสายพันธุ์การรวมกันของการวิเคราะห์ลักษณะทางสัณฐานวิทยาและโมเลกุลถูกนำมาใช้เพื่อระบุตัวตนของเชื้อ Trichoderma
สำหรับการระบุลักษณะทางสัณฐานวิทยาสายพันธุ์ที่ปลูกในวันที่ 2% มอลต์สกัดจากวุ้นบน PDA และภายใต้สภาพแวดล้อมในห้องปฏิบัติการของแสงและอุณหภูมิ (ประมาณ 21 ° C) สังเกตกล้องจุลทรรศน์และการวัดที่ถูกสร้างขึ้นจากการเตรียมการติดตั้งในกรดแลคติก สายพันธุ์ส่วนบุคคลที่ถูกระบุในสายพันธุ์ระดับใช้คีย์เห็ดรามาตรฐาน (Gams และบิซเซท, 1998) รายละเอียดสายพันธุ์ (บิซเซท 1992; แอล et al, 1999;. Kraus et al, 2004.) และ TrichOKEY 2.0 วิธีการออนไลน์ (http :. //www.isth.info/tools/molkey/index.php) สำหรับการระบุโมเลกุลที่รวดเร็วและเชื่อถือได้ของ Hypocrea และเชื้อรา Trichoderma ที่สกุล clade และระดับขึ้นอยู่กับสายพันธุ์ ITS1 และลำดับ 2 (Druzhinina et al, 2005 ) TrichOKEY ระบุสายพันธุ์มากที่สุดอย่างแจ่มแจ้งถึงแม้ว่าบางชนิดมีที่เหมือนกันหรือคล้ายกันมาก ITS1 และลำดับ ITS2 และดังนั้นจึงจะแยกไม่ออกด้วยวิธีนี้ (Druzhinina et al., 2005, 2006) บัตรประจำตัวที่ถูกต้องของสายพันธุ์ในรูฟา Clade บางครั้งเป็นปัญหาเป็นสายพันธุ์ของ clade นี้ขณะนี้อยู่ระหว่างการแก้ไขและทั้งสอง T. viride ตันและ koningii จะถูกแบ่งออกเป็นหลายสายพันธุ์ใหม่ (Druzhinina et al., 2005) ในกรณีดังกล่าวหมายถึงการที่ต้องการของประชาชนคือการเสริมวิธีบาร์โค้ด (TrichOKEY) กับการวิเคราะห์ลำดับของตำแหน่งอื่น ๆ โดย TrichoBLAST (Jaklitsch et al, 2006;. Kubicek et al, 2008).

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ชนิดรหัส
รวมกันของการวิเคราะห์ก้านและโมเลกุลถูกใช้เพื่อกำหนดปริมาณของเชื้อ สำหรับการกำหนดลักษณะสายพันธุ์มีการเติบโต 2% malt extract agar และพีดีเอภายใต้บรรยากาศสภาพห้องปฏิบัติการของแสงและอุณหภูมิ ( ประมาณ 21 ° C ) สังเกตด้วยกล้องจุลทรรศน์และการวัดได้จากการเตรียมติดตั้งในกรดแต่ละสายพันธุ์เป็นสายพันธุ์ที่ระบุในระดับมาตรฐาน ( Gams เห็ดราและใช้คีย์บิสสิต , 1998 ) , ชนิดคำอธิบาย ( บิสสิต , 1992 ; ซามูเอล et al . , 1999 ; เคราส์ et al . , 2004 ) และ trichokey 2.0 วิธีการออนไลน์ ( http://www.isth.info/tools/molkey/index.php ) สำหรับรวดเร็วและเชื่อถือได้และการ hypocrea โมเลกุลของเชื้อที่ สกุล clade , ,และระดับชนิด ขึ้นอยู่กับ its1 2 ลำดับ ( druzhinina et al . , 2005 ) trichokey ระบุสายพันธุ์ชัดเจนที่สุด แม้ว่าบางชนิดที่เหมือนกันหรือคล้ายคลึงกันมาก และ its2 its1 ลำดับและจึงแยกโดยวิธีนี้ ( druzhinina et al . , 2005 , 2006 )ถูกต้องจำแนกชนิดใน clade rufa ปัญหาบางครั้งเป็นชนิดของ clade นี้ ขณะนี้อยู่ระหว่างการแก้ไข , และ T . viride และ T . koningii ถูกแบ่งออกเป็นหลายชนิด ใหม่ ( druzhinina et al . , 2005 )ในบางกรณีวิธีที่ต้องการของประชาชนคือการเสริมบาร์โค้ดวิธี ( trichokey ) กับลำดับการวิเคราะห์สถานะอื่น ๆ โดย trichoblast ( jaklitsch et al . , 2006 ; kubicek et al . , 2008 )