KMI is a distributed, in-memory has

KMI is a distributed, in-memory hashing library for matching k-mers and short snippets of DNA sequences. The original KMI code was originally implemented using asynchronous MPI communication. In Figure 12 we show how the performance of the original implementation compares to that of the re-implementation of KMI on top of our communication library. We used two systems in the performance evaluation: 32 BG/Q nodes and 32 P7-IH nodes. The results show that the KMI implementation using our model is 9X and 10X faster than the MPI implementation on P7-IH and BG/Q, respectively.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

KMI กระจาย หน่วยแปลงแป้นพิมพ์ไลบรารีสำหรับประชาคมโลก k และข้อมูลโค้ดสั้นของลำดับดีเอ็นเอได้ รหัส KMI เดิมได้เดิมดำเนินการใช้การสื่อสารแบบอะซิงโครนัสของ MPI เราแสดงในรูปที่ 12 วิธีการเปรียบเทียบประสิทธิภาพของการดำเนินการเดิมที่ใช้งานใหม่ของ KMI บนไลบรารีการสื่อสารของเรา เราใช้สองระบบในการประเมินประสิทธิภาพการทำงาน: 32 BG/Q โหนดและโหน P7 IH 32 ผลลัพธ์แสดงการใช้รูปแบบของเราใช้งาน KMI ว่า 9 เท่าและ 10 เท่าเร็วกว่าการใช้งาน MPI P7 IH และ BG/Q ตามลำดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

KMI เป็นกระจายในหน่วยความจำ hashing ห้องสมุดสำหรับการจับคู่ K-mers และตัวอย่างสั้น ๆ ของลำดับดีเอ็นเอ รหัส KMI ต้นฉบับเดิมดำเนินการโดยใช้การสื่อสาร MPI ตรงกัน ในรูปที่ 12 ที่เราแสดงให้เห็นว่าประสิทธิภาพของการดำเนินงานเดิมเปรียบเทียบกับที่ของงานอีกครั้งของ KMI ด้านบนของห้องสมุดการสื่อสารของเรา เราใช้ทั้งสองระบบในการประเมินผลการปฏิบัติงาน: 32 โหนด BG / q และ 32 โหนด P7-IH ผลการศึกษาพบว่าการดำเนินการ KMI โดยใช้รูปแบบของเราคือ 9X 10x และเร็วกว่าการดำเนินงาน MPI ใน P7-IH และ BG / q ตามลำดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

kmi เป็นแบบกระจาย ในความทรงจำ hashing ห้องสมุดสำหรับการจับคู่ k-mers และตัวอย่างสั้นๆ ของดีเอ็นเอลำดับดีเอ็นเอ รหัส kmi ต้นฉบับเดิมใช้สำหรับใช้สื่อสารไม่ตรงกัน ในรูปที่ 12 เราแสดงให้เห็นว่าประสิทธิภาพของการปฏิบัติเดิมเปรียบเทียบกับที่ของกำลังการ kmi บนห้องสมุดการสื่อสารของเรา เราใช้สองระบบในการประเมินผลการปฏิบัติงาน : 32 / 32 p7-ih BG Q โหนดและโหนด ผลที่ได้แสดงให้เห็นว่าการใช้แบบจำลองและ kmi เป็น 9x 10x เร็วกว่าดัชนีผลผลิตอุตสาหกรรมและการ p7-ih BG / Q ตามลำดับ