Amplification with rep-PCR primers

Amplification with rep-PCR primers was performed
twice with each primer set. In total 21 reproducible
bands were scored and used for analysis. Products of
amplification with REP, ERIC and BOX primer sets are
shown in Fig. 4a, b and c, respectively. Individual cluster
analysis of REP, ERIC and BOX data revealed very
similar groupings (data not shown). Since a larger data
set increases the validity of groupings obtained by cluster
or principal coordinate analysis, data from all three repPCR
fingerprinting methods were combined in a single
similarity matrix. Cluster analysis of the combined repPCR
data (Fig. 5) revealed groupings similar, but not
identical, to those obtained from RAPDs. The six blood
disease isolates formed a single homogeneous group
which is closely related to the R. solanacearum clove
isolates R142 and B9043. The close relationship
between R142, B9043 and the clove pathogen P. syzygii
(isolate R001), which was suggested by the RAPD data,
can more clearly be seen from the principal coordinate
analysis of the rep-PCR data shown in Fig. 6. The first
two dimensions of the analysis shown here account for
71% of the total variation. South-east Asian moko and
bugtok isolates again grouped very closely, although the
rep-PCR primers did not appear to be as discriminatory
between these and the Central American SFR strains as
were the RAPD primers.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ทำการขยาย ด้วยไพรเมอร์ตัวแทน PCRครั้งที่สองกับแต่ละชุดรองพื้น ในจำลองรวม 21ประตู และใช้สำหรับวิเคราะห์วง ผลิตภัณฑ์ของขยายด้วย REP เอริค และกล่องเป็นชุดแสดงในรูปที่ 4a, b และ c ตามลำดับ คลัสเตอร์แต่ละการวิเคราะห์ข้อมูลตัวแทน เอริค และกล่องที่เปิดเผยมากจัดกลุ่มคล้าย (ไม่แสดงข้อมูล) ตั้งแต่ข้อมูลขนาดใหญ่ชุดเพิ่มความถูกต้องของการจัดกลุ่มได้ โดยคลัสเตอร์หรือหลักประสานงาน วิเคราะห์ ข้อมูลจากทั้งหมดสาม repPCRวิธีการลายพิมพ์มารวมในครั้งเดียวเมทริกซ์คล้ายคลึงกัน การวิเคราะห์ของ repPCR รวมกลุ่มข้อมูล (รูป 5) เปิดเผยการจัดกลุ่มที่คล้ายกัน แต่ไม่เหมือนกับ จาก RAPDs เลือด 6แยกโรคที่เกิดขึ้นเหมือนกลุ่มเดียวซึ่งจะเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับกานพลู solanacearum อาร์แยก R142 และ B9043 ความสัมพันธ์ใกล้ชิดระหว่าง R142, B9043 และ syzygii เชื้อโรค P. กานพลู(แยก R001), ซึ่งถูกแนะนำ โดยการอาร์เอพีดีสามารถเพิ่มเติมชัดเจนมองเห็นพิกัดหลักการวิเคราะห์ข้อมูล rep PCR ที่แสดงในรูปที่ 6 ครั้งแรกสองมิติของการวิเคราะห์ที่แสดงไว้ที่นี่บัญชีสำหรับ71% ของรูปแบบที่รวม Moko เอเชียตะวันออกเฉียงใต้ และbugtok แยกอีกจัดกลุ่มอย่างใกล้ชิด แม้ว่าการไพรเมอร์ตัวแทน PCR ไม่ปรากฏจะแบ่งแยกเป็นระหว่างเหล่านี้และสายพันธุ์อเมริกากลาง SFR เป็นไพรเมอร์อาร์เอพีดีได้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ขยายด้วยไพรเมอร์ตัวแทน-PCR ได้ดำเนินการ
เป็นครั้งที่สองกับแต่ละชุดไพรเมอร์ ทั้งหมด 21 ทำซ้ำ
วงดนตรีที่ถูกยิงและใช้ในการวิเคราะห์ ผลิตภัณฑ์ของ
ใช้เครื่องขยายเสียงกับ REP เอริคและชุดกล่องไพรเมอร์จะ
แสดงในรูป 4A, B และ C ตามลำดับ คลัสเตอร์บุคคล
วิเคราะห์ REP เอริคและกล่องข้อมูลเปิดเผยมาก
การจัดกลุ่มคล้ายกัน (ไม่ได้แสดงข้อมูล) เนื่องจากข้อมูลที่มีขนาดใหญ่
ชุดเพิ่มความถูกต้องของการจัดกลุ่มที่ได้รับจากกลุ่ม
หรือหลักประสานงานการวิเคราะห์ข้อมูลจากทั้งสาม repPCR
วิธีการพิมพ์ลายนิ้วมือร่วมกันในครั้งเดียว
เมทริกซ์ความคล้ายคลึงกัน การวิเคราะห์กลุ่มของ repPCR รวม
ข้อมูล (รูปที่ 5.) เปิดเผยว่าการจัดกลุ่มที่คล้ายกัน แต่ไม่
เหมือนกันกับผู้ที่ได้รับจาก RAPDs เลือดหก
โรคแยกกลายเป็นกลุ่มที่เป็นเนื้อเดียวกันเดียว
ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับอาร์ solanacearum กานพลู
แยก R142 และ B9043 ความสัมพันธ์ใกล้ชิด
ระหว่าง R142, B9043 และกานพลูเชื้อโรคพี syzygii
(แยก R001) ซึ่งได้รับการแนะนำโดยข้อมูลดีเอ็นเอที่
สามารถได้ชัดเจนมากขึ้นจะเห็นได้จากเงินต้นประสานงาน
การวิเคราะห์ข้อมูลตัวแทน-PCR ที่แสดงในรูป 6. ครั้งแรกที่
สองมิติของการวิเคราะห์แสดงที่นี่บัญชีสำหรับ
71% ของการเปลี่ยนแปลงทั้งหมด ตะวันออกเฉียงใต้และเอเชีย Moko
bugtok แยกจัดกลุ่มอีกครั้งอย่างใกล้ชิดแม้ว่า
ไพรเมอร์ตัวแทน-PCR ไม่ปรากฏว่าจะเป็นการเลือกปฏิบัติ
ระหว่างเหล่านี้และอเมริกากลาง SFR สายพันธุ์เป็น
เป็นไพรเมอร์อาร์เอพี