Study of community dynamicsOne of t

Study of community dynamics
One of the strongest points of the application of
DGGE/TGGE in microbial ecology is the simultaneous
analysis of multiple samples, which allows monitoring of the
complex dynamics that microbial communities may undergo
by diel and seasonal fluctuations or after environmental
perturbations. Ward and coworkers [Cl”] were among the
first who used IXGE of 16S rDNA fragments to study population
changes in microbial communities. They examined
the seasonal distribution of community members in a hot
spring microbial mat community [ZS], and the recolonization
of bacterial populations after removal of the top 3 mm of the
community [26]. PCR-DGGE of 16S rDKA fragments has
also been used to examine seasonal changes in bacterioplankton
in coastal waters of Antarctica [27], and to study
the composition and dynamics of bacteria1 populations in
the rhizospherc of the plant chrysanthemum [28]. Recently,
van Hannen efcz/. [29] used PCR-DGGE to monitor changes
in the community composition of bacteria1 and eukaryal
microorganisms after viral lysis.
hlicrobiological. molecular and biogcochemical approaches
were combined to investigate the diurnal behavior of sulfatereducing
bacteria in the top layer of a microbial mat
community [30]. Hybridization analysis of 16s rDNA
DGGE patterns showed a filamcntous migrating sulfate
reducer affiliated to Dc.w~fomxzc. which is assumed to be
obligatory anaerobic, within and below the oxic surface layer.
Santcgoeds rtccl. [31’] combined molecular techniques and
microsensors to study the presence and activity of sulfatereducing
bacteria in biofilms from an activated sludge
basin of a wastewater treatment plant. Rlicrosensor measuremcnts
indicated that anaerobic zones dcvelopcd
within one week of biofilm formation, but that sulfate
reduction did not occur until after six weeks.
Hybridization analysis of 16s rD5JA IXGE profiles
showed that D~.w~j2wll,~s and /k.suLfovilviJ/t-io populations
were the main sulfate-reducing bacteria, and that different
populations came up at the onset of the sulfate reduction.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ศึกษาชุมชน dynamicsหนึ่งในจุดแข็งแกร่งของการประยุกต์DGGE/TGGE ในนิเวศวิทยาจุลินทรีย์เป็นการพร้อมวิเคราะห์ตัวอย่างหลาย ซึ่งช่วยให้ตรวจสอบการdynamics ซับซ้อนที่ชุมชนจุลินทรีย์อาจรับโดย diel และเปลี่ยนแปลงตามฤดูกาล หรือหลังสิ่งแวดล้อมperturbations ผู้ป่วยและเพื่อนร่วมงาน [Cl"] ได้ระหว่างการครั้งแรก ที่ใช้ IXGE ของชิ้นส่วน 16S rDNA ศึกษาประชากรหรือไม่การเปลี่ยนแปลงในชุมชนจุลินทรีย์ พวกเขาตรวจสอบการกระจายตามฤดูกาลของสมาชิกในชุมชนในร้อนชุมชนลื่นสปริงจุลินทรีย์ [ZS], และ recolonization ที่ของประชากรแบคทีเรียหลังจากลบ 3 มม.ด้านบนของใบชุมชน [26] มี PCR-DGGE ของชิ้นส่วน 16S rDKAนอกจากนี้ยัง ใช้เพื่อตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงตามฤดูกาลใน bacterioplanktonในน่านน้ำชายฝั่งทวีปแอนตาร์กติกา [27], และศึกษาองค์ประกอบและของ bacteria1 ประชากรในrhizospherc ของเบญจมาศพืช [28] ล่าสุดรถตู้ Hannen efcz / การ [29] ใช้ PCR-DGGE เพื่อตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงในชุมชนที่มีส่วนประกอบของ bacteria1 และ eukaryalจุลินทรีย์หลังจากไวรัส lysishlicrobiological โมเลกุล และวิธี biogcochemicalไม่รวมการตรวจสอบพฤติกรรม diurnal sulfatereducingแบคทีเรียในชั้นบนสุดของแผ่นจุลินทรีย์ชุมชน [30] การวิเคราะห์การ hybridization ของ 16s rDNAรูปแบบ DGGE พบ filamcntous ย้ายซัลเฟตลดที่เกี่ยวข้องกับ Dc.w~fomxzc ซึ่งคาดว่าจะบังคับไม่ใช้ออกซิเจน ภายใน และ ใต้ชั้นผิว oxicSantcgoeds rtccl [31'] รวมเทคนิคโมเลกุล และmicrosensors ไปเรียนการแสดงและกิจกรรมของ sulfatereducingแบคทีเรียใน biofilms จากตะกอนเปิดใช้งานพื้นของโรงงานบำบัดน้ำเสีย Rlicrosensor measuremcntsdcvelopcd ไม่ใช้โซนที่ระบุภายในหนึ่งสัปดาห์ของผู้แต่ง biofilm แต่ที่ซัลเฟตลดได้ไม่เกิดขึ้นจนกว่าหลังจากหกสัปดาห์การวิเคราะห์การ hybridization ของ 16s rD5JA IXGE โพรไฟล์แสดงว่า D ~ .w ~ j2wll, ~ ประชากร s และ /k.suLfovilviJ/t-ioมีซัลเฟตลดแบคทีเรียหลัก และที่แตกต่างกันหรือไม่ประชากรมาอย่างลดซัลเฟต

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การศึกษาการเปลี่ยนแปลงของชุมชนหนึ่งในจุดที่แข็งแกร่งของการประยุกต์ใช้
DGGE / TGGE
ในระบบนิเวศของจุลินทรีย์เป็นพร้อมกันวิเคราะห์ตัวอย่างหลายๆ
ซึ่งจะช่วยให้การตรวจสอบของการเปลี่ยนแปลงที่ซับซ้อนที่กลุ่มจุลินทรีย์อาจได้รับโดย
Diel
และความผันผวนตามฤดูกาลหรือหลังด้านสิ่งแวดล้อมเยี่ยงอย่าง วอร์ดและเพื่อนร่วมงาน [Cl "]
เป็นคนกลุ่มแรกที่ใช้IXGE ของ 16S rDNA
ชิ้นส่วนเพื่อการศึกษาของประชากรการเปลี่ยนแปลงในชุมชนของจุลินทรีย์ พวกเขาตรวจสอบการกระจายตามฤดูกาลของสมาชิกในชุมชนในร้อนฤดูใบไม้ผลิชุมชนเสื่อจุลินทรีย์[ZS] และไม่ต่ำาประชากรแบคทีเรียหลังจากลบด้านบน3 มมของชุมชน[26] PCR-DGGE ของชิ้นส่วน 16S rDKA ได้รับการใช้ในการตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงตามฤดูกาลในbacterioplankton ในน่านน้ำชายฝั่งของทวีปแอนตาร์กติกา [27] และเพื่อศึกษาองค์ประกอบและการเปลี่ยนแปลงของประชากรในbacteria1 rhizospherc ของดอกเบญจมาศพืช [28] เมื่อเร็ว ๆ นี้รถตู้Hannen efcz / [29] ใช้ PCR-DGGE เพื่อติดตามการเปลี่ยนแปลงในองค์ประกอบของชุมชนและbacteria1 eukaryal จุลินทรีย์หลังจากการสลายไวรัส. hlicrobiological วิธีโมเลกุลและ biogcochemical ร่วมกันในการตรวจสอบพฤติกรรมของแต่ละวัน sulfatereducing แบคทีเรียในชั้นบนสุดของเสื่อจุลินทรีย์ชุมชน [30] การวิเคราะห์การผสมพันธุ์ของ 16s rDNA รูปแบบ DGGE แสดงให้เห็นว่าการโยกย้ายซัลเฟต filamcntous ลดร่วมกับ Dc.w ~ fomxzc ซึ่งจะถือว่าเป็นแบบไม่ใช้ออกซิเจนบังคับภายในและด้านล่างของชั้นผิวออกซิก. Santcgoeds rtccl [31] เทคนิคโมเลกุลรวมและไมโครเพื่อศึกษาการแสดงตนและการทำงานของsulfatereducing แบคทีเรียในแผ่นชีวะจากตะกอนลุ่มน้ำของระบบบำบัดน้ำเสีย measuremcnts Rlicrosensor ชี้ให้เห็นว่าโซนแบบไม่ใช้ออกซิเจน dcvelopcd ภายในหนึ่งสัปดาห์ของการสร้างไบโอฟิล์ม แต่ซัลเฟตที่ลดลงไม่ได้เกิดขึ้นจนกระทั่งหลังจากหกสัปดาห์. การวิเคราะห์การผสมพันธุ์ของ 16s rD5JA โปรไฟล์ IXGE แสดงให้เห็นว่า D ~ ~ .w j2wll ~ และ /k.suLfovilviJ/ ประชากรเสื้อ io เป็นซัลเฟตลดแบคทีเรียหลักและแตกต่างกันที่ประชากรขึ้นมาที่เริ่มมีอาการของการลดซัลเฟตที่

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การศึกษาพลวัตชุมชน
หนึ่งในจุดที่แข็งแกร่งของการประยุกต์การทดลอง /
tgge ในระบบนิเวศของจุลินทรีย์จะวิเคราะห์พร้อมกัน
ของหลายตัวอย่าง ซึ่งช่วยให้การติดตามการเปลี่ยนแปลงประชากรจุลินทรีย์ที่ซับซ้อน

โดยอาจผ่านดิลและตามฤดูกาลความผันผวนหรือหลังจากได้สิ่งแวดล้อม

วอร์ดและเพื่อนร่วมงาน [ CL ] ในหมู่
ครั้งแรกที่ใช้ ixge ของ 16S rDNA เศษเพื่อศึกษาประชากร
การเปลี่ยนแปลงในชุมชนจุลินทรีย์ พวกเขาตรวจสอบ
การแพร่กระจายตามฤดูกาลของสมาชิกชุมชนในฤดูใบไม้ผลิร้อน
จุลินทรีย์เสื่อชุมชน [ ZS ] และ recolonization
ของประชากรแบคทีเรียหลังจากการกำจัดของด้านบน 3 mm
ชุมชน [ 26 ] ดีเอ็นเอ 9 แถบบ่งชี้ของ 16S rdka เศษได้
ยังถูกใช้เพื่อตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงตามฤดูกาลใน bacterioplankton
ในชายฝั่งของทวีปแอนตาร์กติกา [ 27 ] และเพื่อศึกษาองค์ประกอบของประชากรและการเปลี่ยนแปลง

bacteria1 ใน rhizospherc ของเบญจมาศพืช [ 28 ] เมื่อเร็ว ๆนี้
รถตู้แฮนเนิ่น efcz / [ 29 ] ใช้ดีเอ็นเอ 9 แถบบ่งชี้ในการตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงในองค์ประกอบของชุมชน bacteria1

หลังจากไวรัสและจุลินทรีย์ eukaryal เสื่อม .
hlicrobiological .โมเลกุลและ biogcochemical แนวทาง
ถูกรวมกันเพื่อศึกษาพฤติกรรมในการ sulfatereducing
แบคทีเรียในชั้นบนสุดของชุมชนจุลินทรีย์เสื่อ
[ 30 ] การวิเคราะห์ชนิดของ 16S rDNA
การทดลองรูปแบบแสดง filamcntous โยกย้ายซัลเฟต
ลดในเครือ DC W ~ fomxzc . ซึ่งถือว่าเป็น
บังคับ anaerobic , ภายในและด้านล่างของชั้นพื้นผิวออกซิก .
santcgoeds rtccl .