2.2. Parametric model fit
Each of these 900 time series was fit with the logistic model, which
is the special case when θ equals 1 in Eq. (1). Only the 50 first steps of
the time series were used for calibration, and the 50 remaining steps
were used to assess the quality of the forecasts. Following Hartig and
Dormann (2013), the time series were split into 10 subsets of 5 time
steps each, and the X(t) values at the beginning of each subset were
considered unknown. The rationale of this splitting procedure is to
focus on short subset of the time-series so as to decrease the impact of
the sensitivity to initial conditions which is specific to chaotic
dynamics. The length of the splitting procedure was guided by
Hartig and Dormann (2013) who have already shown that it was
efficient for this parametric model. For other case studies, alternative
splitting length might be more efficient. They could be compared by
trial and error. Three MCMC chains were used with dispersed initial r
values, 500,000 adaptation steps, 500,000 burn-in iterations and
1,000,000 posterior samples, of which 10,000 (1 every 100 steps)
were retained to perform model checks and compute predictions.
Prior distributions were uniforms on [2; 4.5], [0.01; 10] and [0.1; 40]
respectively for r, K and the observation precision equal to 1=σ2
obs. This
last prior distribution was changed to uniform on [10; 600] for cases of
low and middle observation noise (σobs equal to 0.05 or 0.1 in the
simulations). Convergence of the chains was checked with the multivariate
potential scale reduction factor, that was required to be smaller
than 1.2. Bayesian analysis was performed with R version 3.0.1 and
JAGS 3.4 (Plummer, 2003). R and JAGS scripts are provided in
Appendix
2.2 รูปแบบ Parametric
พอดีกับแต่ละช่วงเวลาเหล่านี้ได้900
พอดีกับรูปแบบโลจิสติกซึ่งเป็นกรณีพิเศษเมื่อθเท่ากับ1 ในสมการ (1) เพียง 50
ขั้นตอนแรกของซีรีส์ครั้งที่ถูกนำมาใช้สำหรับการสอบเทียบและ50
ขั้นตอนที่เหลือถูกนำมาใช้ในการประเมินคุณภาพของการคาดการณ์ที่ ติดตาม Hartig และ
Dormann (2013) ชุดเวลาที่ถูกแบ่งออกเป็น 10 ส่วนย่อยของเวลา 5
ขั้นตอนแต่ละและ X (t)
ค่าที่จุดเริ่มต้นของการย่อยแต่ละถือว่าไม่รู้จัก เหตุผลของขั้นตอนการแยกนี้คือการมุ่งเน้นไปที่เซตสั้น ๆ ของอนุกรมเวลาเพื่อที่จะลดผลกระทบของความไวต่อเงื่อนไขเริ่มต้นที่เป็นเฉพาะกับความวุ่นวายการเปลี่ยนแปลง ความยาวของขั้นตอนการแยกถูกแนะนำโดยHartig และ Dormann (2013) ที่ได้แสดงให้เห็นแล้วว่ามันเป็นที่มีประสิทธิภาพสำหรับรูปแบบตัวแปรนี้ สำหรับกรณีศึกษาอื่น ๆ ทางเลือกระยะเวลาในการแยกอาจจะมีประสิทธิภาพมากขึ้น พวกเขาสามารถนำมาเปรียบเทียบโดยการลองผิดลองถูก สามโซ่ MCMC ถูกนำมาใช้กับอาเริ่มต้นกระจายค่า500,000 ขั้นตอนการปรับตัว 500,000 เผาไหม้ในการทำซ้ำและ1,000,000 ตัวอย่างหลังที่ 10000 (1 ทุก ๆ 100 ขั้น) ได้รับการเก็บรักษาไว้เพื่อดำเนินการตรวจสอบรูปแบบและคำนวณการคาดการณ์. แจกแจงก่อนที่เป็นเครื่องแบบบน [ 2; 4.5], [0.01; 10] และ [0.1; 40] ตามลำดับ R, K และความแม่นยำการสังเกตเท่ากับ 1 = σ2 obs นี้กระจายก่อนที่ผ่านมาได้เปลี่ยนไปเป็นเครื่องแบบ [10; 600] สำหรับกรณีของเสียงสังเกตต่ำและปานกลาง(σobsเท่ากับ 0.05 หรือ 0.1 ในการจำลอง) การบรรจบกันของเครือข่ายได้รับการตรวจสอบกับหลายตัวแปรปัจจัยการลดขนาดที่มีศักยภาพที่ถูกต้องจะมีขนาดเล็กกว่า1.2 การวิเคราะห์แบบเบย์ได้ดำเนินการกับรุ่น R 3.0.1 และJags 3.4 (พลัมเม, 2003) R และสคริปต์ Jags มีไว้ในภาคผนวก
การแปล กรุณารอสักครู่..