Microarray analysis of gene express

Microarray analysis of gene expression patterns in immature ear, seedling, and embryo tissues from the
maize inbred lines B73 and Mo17 identified numerous genes with variable expression. Some genes had
detectable expression in only one of the two inbreds; most of these genes were detected in the genomic
DNA of both inbreds, indicating that the expression differences are likely caused by differential regulation
rather than by differences in gene content. Gene expression was also monitored in the reciprocal F1
hybrids B73 3 Mo17 and Mo17 3 B73. The reciprocal F1 hybrid lines did not display parental effects on
gene expression levels. Approximately 80% of the differentially expressed genes displayed additive expression
patterns in the hybrids relative to the inbred parents. The
20% of genes that display nonadditive
expression patterns tend to be expressed at levels within the parental range, with minimal evidence
for novel expression levels greater than the high parent or less than the low parent. Analysis of allelespecific
expression patterns in the hybrid suggested that intraspecific variation in gene expression levels is
largely attributable to cis-regulatory variation in maize. Collectively, our data suggest that allelic cisregulatory
variation between B73 and Mo17 dictates maintenance of inbred allelic expression levels in the
F1 hybrid, resulting in additive expression patterns.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

วิเคราะห์รูปแบบนิพจน์ของยีนในเนื้อเยื่อหู แหล่ง และตัวอ่อนจาก immature Microarrayบรรทัด inbred ข้าวโพด B73 และ Mo17 ระบุยีนจำนวนมาก ด้วยนิพจน์ตัวแปร ยีนบางอย่างได้นิพจน์สามารถตรวจสอบได้ในหนึ่ง inbreds สอง ยีนเหล่านี้ส่วนใหญ่พบในที่ genomicดีเอ็นเอของทั้งสอง inbreds แสดงว่า ความแตกต่างของนิพจน์มักเกิดจากข้อบังคับที่แตกต่างแทนความแตกต่างในเนื้อหาของยีน ยีนยังตรวจสอบใน F1 ซึ่งกันและกันลูกผสม B73 3 Mo17 และ Mo17 3 B73 ใบผสม F1 กันและไม่แสดงผลโดยผู้ปกครองบนระดับยีนนิพจน์ ประมาณ 80% ของยีน differentially แสดงแสดงนิพจน์สามารถรูปแบบในลูกผสมสัมพันธ์ผู้ปกครอง inbred 20% ของยีนที่แสดง nonadditiveรูปแบบนิพจน์มักจะแสดงในระดับภายในช่วงผู้ปกครอง มีหลักฐานเพียงเล็กน้อยสำหรับนิพจน์นวนิยายระดับหลักสูงมากกว่า หรือน้อยกว่าหลักต่ำ วิเคราะห์ของ allelespecificร่ายในการผสมแนะนำการเปลี่ยนแปลงในระดับยีนนิพจน์ intraspecific ว่าการเปลี่ยนแปลงใหญ่รวมระเบียบ cis ในข้าวโพด โดยรวม ข้อมูลแนะนำที่ cisregulatory allelicความผันแปรระหว่าง B73 และ Mo17 บอกบำรุงรักษาระดับ inbred allelic นิพจน์ในการผสม F1 ในรูปแบบนิพจน์สามารถ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวิเคราะห์ Microarray
ของรูปแบบการแสดงออกของยีนในหูอ่อนของต้นกล้าและเนื้อเยื่อตัวอ่อนจากสายพันธุ์ข้าวโพดB73 และ Mo17 ระบุยีนจำนวนมากที่มีการแสดงออกของตัวแปร
ยีนบางคนมีการแสดงออกที่ตรวจพบในเวลาเพียงหนึ่งในสองสายพันธุ์; ส่วนใหญ่ของยีนเหล่านี้ถูกตรวจพบในจีโนมดีเอ็นเอของสายพันธุ์ทั้งแสดงให้เห็นว่าการแสดงออกที่แตกต่างกันจะเกิดจากกฎระเบียบที่แตกต่างกันมากกว่าโดยความแตกต่างในเนื้อหาของยีน การแสดงออกของยีนได้รับการตรวจสอบยังอยู่ใน F1 ซึ่งกันและกันลูกผสม3 Mo17 B73 และ B73 Mo17 3 สายไฮบริด F1 ซึ่งกันและกันไม่ได้แสดงผลกระทบของผู้ปกครองในระดับการแสดงออกของยีน ประมาณ 80% ของยีนที่แสดงออกแตกต่างกันแสดงสารเติมแต่งที่แสดงออกในรูปแบบลูกผสมเทียบกับพ่อแม่พันธุ์ หรือไม่ 20% ของยีนที่แสดง nonadditive รูปแบบการแสดงออกมีแนวโน้มที่จะแสดงในระดับที่อยู่ในช่วงของผู้ปกครองที่มีหลักฐานน้อยที่สุดสำหรับระดับการแสดงออกนวนิยายมากกว่าผู้ปกครองที่สูงหรือต่ำกว่าผู้ปกครองในระดับต่ำ การวิเคราะห์ allelespecific รูปแบบการแสดงออกในไฮบริดชี้ให้เห็นว่าการเปลี่ยนแปลงสำนวนในระดับการแสดงออกของยีนเป็นส่วนใหญ่ส่วนที่เป็นรูปแบบที่ถูกต้องกำกับดูแลในข้าวโพด เรียกรวมกันว่าข้อมูลของเราแสดงให้เห็นว่า cisregulatory allelic แตกต่างระหว่าง B73 และ Mo17 สั่งการบำรุงรักษาระดับการแสดงออก allelic กำเนิดในF1 ไฮบริดส่งผลให้สารเติมแต่งรูปแบบการแสดงออก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนแบบ microarray ในเด็กหู , ต้นกล้า , และเนื้อเยื่อคัพภะข้าวโพดสายพันธุ์แท้จาก
เส้น b73 mo17 ระบุยีนที่มีการแสดงออกและหลายตัวแปร ยีนบางตัวมี
พบการแสดงออกในเพียงหนึ่งในสองสายพันธุ์ ส่วนใหญ่ของยีนเหล่านี้ถูกพบในดีเอ็นเอของทั้งสองสายพันธุ์
,แสดงสีหน้าแตกต่างกันอาจเกิดจากความแตกต่างระเบียบ
มากกว่าความแตกต่างในยีน เนื้อหา การแสดงออกของยีนยังตรวจสอบในลูกผสม F1
ซึ่งกันและกันและ b73 3 mo17 mo17 3 b73 . แบบ reciprocal F1 ลูกผสมสายไม่แสดงผลโดยผู้ปกครอง
ระดับการแสดงออกของยีนประมาณ 80% ของแสดงออกแตกต่างกันยีนแสดงการบวกการแสดงออกในรูปแบบไฮบริด
ญาติพ่อแม่สายพันธุ์แท้ . การ
20% ของยีนที่แสดง nonadditive
การแสดงออกรูปแบบมีแนวโน้มที่จะแสดงในระดับภายในช่วงของผู้ปกครอง กับ
หลักฐานน้อยที่สุดสำหรับนวนิยายระดับการแสดงออกมากกว่าหรือน้อยกว่าพ่อแม่ผู้ปกครองสูงต่ำ การวิเคราะห์ allelespecific
การแสดงออกในรูปแบบไฮบริด ชี้ให้เห็นว่า การเปลี่ยนแปลงในระดับยีน คือ เซ็นต์จากการเปลี่ยนแปลงกฎระเบียบ
ส่วนใหญ่ CIS ในข้าวโพด รวม , ข้อมูลบ่งชี้ว่า cisregulatory
ความผันแปรระหว่าง b73 ยาฆ่าแมลงและยาฆ่าแมลง mo17 สั่งการรักษาสายพันธุ์ระดับการแสดงออกใน
F1 ลูกผสมส่งผลให้เพิ่มการแสดงออกรูปแบบ