Proposed models of action for the c

Proposed models of action for the candidate genes identified. A) The putative pathways for Lactones and Esters biosynthesis. The δ- and γ-lactones and esters produced (numbered according to Additional file 1: Figure S1) have different alkyl groups at R6, R5, and R10, respectively. C6 and C9 are indicated below the aldehydes and alcohols, which means that the compounds can have six or nine carbons. Please note that different enzymes use free fatty acid or are activated with different groups (CoA, Acyl carrier protein or lipidic group), but must be activated with a CoA group to enter β-oxidation. B) Ethanol and Ethyl acetate production. The Acetyl-CoA produced can also be added to the pool that is used to synthesize the numbered esters (according to Additional file 1: Figure S1). C) The route for Benzenacetaldehyde biosynthesis in melon (and proposed for peach) and tomato, left and right, respectively. For the three routes (A, B, and C), the enzymes codified by the candidate genes proposed are indicated in red. D) The ID of the candidate gene that is proposed for each enzyme. Enzyme abbreviations: FAD, Fatty acid desaturase; FAE, Fatty acid Epoxydase; CYP, Cytochrome P450; PXG, Peroxygenase; FAH, Fatty acid Hydroxylase; LOX, Lipoxygenase; HPL, hydroperoxide lyase; ADH, alcohol dehydrogenase; AAT, Alcohol Acyl Transferase; PDC, Pyr decarboxylase; ALDH, Aldehyde dehydrogenase; ArAT, Aromatic aminoacid Aminotransferase; ArAD, Aromatic amino acid decarboxylase. Compound abbreviations: 2-P-Glycerate, 2-Phospho Glycerate; PEP, Phosphoenol Pyr; Pyr, Pyruvate; AA, Acetaldehyde; Phe, Phenylalanine; Glu, Glutamate.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

รูปแบบที่เสนอการดำเนินการสำหรับยีนผู้สมัครระบุ A)มนต์ putative สำหรับสังเคราะห์ Lactones และ Esters Δ - และγ-lactones และ esters ผลิต (หมายเลขตามแฟ้มเพิ่มเติม 1: รูป S1) มี alkyl ต่าง ๆ กลุ่ม ที่ R6, R5, R10 ตามลำดับ C6 และ C9 ระบุด้านล่าง aldehydes และ alcohols ซึ่งหมายความ ว่า สารประกอบได้ carbons หก หรือเก้า โปรดสังเกตว่า เอนไซม์ต่าง ๆ ใช้กรดไขมันอิสระ หรือจะทำงานกับกลุ่มอื่น (CoA โปรตีน Acyl ผู้ขนส่งหรือกลุ่ม lipidic), แต่ต้องใช้กลุ่ม CoA เพื่อป้อนβ-ออกซิเดชัน B) ผลิตเอทานอลและเอทิล acetate Acetyl-CoA ที่ผลิตเพิ่มสระว่ายน้ำที่ใช้ในการสังเคราะห์ esters ลำดับเลข (เพิ่มเติมตามไฟล์ที่ 1: รูป S1) ได้ C เส้นทาง)สำหรับการสังเคราะห์ Benzenacetaldehyde ในแตง (และเป็นที่นำเสนอสำหรับพีช) และมะเขือเทศ ซ้าย และ ขวา ตามลำดับ ใน 3 เส้นทาง (A, B และ C), เอนไซม์ ประมวลกฎหมายสูง โดยยีนผู้เสนอจะแสดงเป็นสีแดง D) รหัสของยีนผู้สมัครที่จะนำเสนอในแต่ละเอนไซม์ คำย่อของเอนไซม์: แฟชั่น กรดไขมัน desaturase FAE กรดไขมัน Epoxydase CYP, Cytochrome P450 PXG, Peroxygenase ฟ้า กรดไขมัน Hydroxylase LOX, Lipoxygenase HPL, hydroperoxide lyase อัซ แอลกอฮอล์ dehydrogenase AAT แอลกอฮอล์ Acyl Transferase PDC, Pyr decarboxylase ALDH แอลดีไฮด์ dehydrogenase ArAT หอม aminoacid Aminotransferase ArAD กรดอะมิโนหอม decarboxylase ผสมคำย่อ: Glycerate-2-P, 2 Phospho Glycerate PEP, Phosphoenol Pyr Pyr, Pyruvate AA, Acetaldehyde เพ Phenylalanine Glu, Glutamate

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

รูปแบบของการดำเนินการที่เสนอสำหรับยีนระบุ ก) ทางเดินสมมุติสำหรับ lactones และ Esters สังเคราะห์ δ-และγ lactones และเอสเทอผลิต (เลขตามแฟ้มเพิ่มเติม 1: รูปที่ S1) มีกลุ่มอัลคิลที่แตกต่างกัน R6, R5 และ R10 ตามลำดับ C6 และ C9 มีการระบุไว้ด้านล่างลดีไฮด์และแอลกอฮอล์ซึ่งหมายความว่าสารประกอบที่สามารถมีหกหรือเก้าก๊อบปี้ โปรดทราบว่าเอนไซม์ที่แตกต่างกันใช้กรดไขมันอิสระหรือจะเปิดใช้งานกับกลุ่มที่แตกต่างกัน (CoA โปรตีน Acyl ผู้ให้บริการหรือกลุ่ม lipidic) แต่ต้องเปิดใช้งานกับกลุ่ม CoA ที่จะเข้าสู่การเกิดออกซิเดชันβ- B) เอทานอลและการผลิตเอทิลอะซิเตท Acetyl-CoA ผลิตนอกจากนี้ยังสามารถเพิ่มเข้าไปในสระว่ายน้ำที่ใช้ในการสังเคราะห์เอสเทอหมายเลข (ตามแฟ้มเพิ่มเติม 1: รูปที่ S1) C) เส้นทางสำหรับการสังเคราะห์ Benzenacetaldehyde ในแตงโม (และเสนอพีช) และมะเขือเทศซ้ายและขวาตามลำดับ สำหรับงวดสามเส้นทาง (A, B และ C) เอนไซม์ที่ประมวลผลโดยยีนที่นำเสนอจะมีการแสดงในชุดสีแดง D) ID ยีนผู้สมัครที่ได้รับการเสนอให้แต่ละเอนไซม์ เอนไซม์ตัวย่อ: FAD ไขมัน desaturase กรด; FAE กรดไขมัน Epoxydase; CYP, Cytochrome P450; PXG, Peroxygenase; ฟ้ากรดไขมัน Hydroxylase; แซลมอนรมควัน, lipoxygenase; HPL, ไฮโดรไอเลส; ADH, dehydrogenase แอลกอฮอล์ AAT, เครื่องดื่มแอลกอฮอล์ Acyl Transferase; PDC, Pyr decarboxylase; ALDH, dehydrogenase ลดีไฮด์; Arat, หอม aminoacid aminotransferase; Arad, กรดอะมิโนอะโรเมติก decarboxylase สารประกอบตัวย่อ: 2-P-glycerate 2 phospho glycerate; PEP, Phosphoenol Pyr; Pyr, ไพรู; AA, Acetaldehyde; เพ Phenylalanine; Glu, กลูตาเมต

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การนำเสนอรูปแบบของการดำเนินการสำหรับผู้สมัครที่ระบุ ) ซึ่งสำหรับวิถีชีวสังเคราะห์แลคโตนส . การδ - และ - สγแลคโตนที่ผลิต ( เลขตามแฟ้มเพิ่มเติม 1 : รูป S1 ) มีกลุ่มอัลคิล แตกต่างกันที่ R6 , r5 และ R10 ตามลำดับ และ C6 C9 จะแสดงด้านล่างของอัลดีไฮด์และแอลกอฮอล์ซึ่งหมายความว่าสารประกอบที่สามารถหกหรือเก้าด้วย . โปรดทราบว่าเอนไซม์ที่แตกต่างกันใช้กรดไขมันอิสระหรือจะใช้งานกับกลุ่มที่แตกต่างกัน ( COA , พาหะโปรตีนหรือ lipidic กลุ่ม ) แต่ต้องสามารถใช้งานกับอุปกรณ์เพื่อระบุกลุ่มบีตา - ออกซิเดชัน ข ) เอทานอล และการผลิตเอทิลอะซีเตท .ส่วนอาเซ COA ผลิตยังสามารถเพิ่มพูล ที่ใช้เพื่อสังเคราะห์เอสเทอร์ ( นับตามแฟ้มเพิ่มเติม 1 : รูป S1 ) c ) เส้นทาง benzenacetaldehyde ชีวสังเคราะห์ในเมล ( และเสนอให้พีช ) และมะเขือเทศ ซ้าย และขวา ตามลำดับ สำหรับ 3 เส้นทาง ( A , B , C ) , เอนไซม์ codified โดยผู้สมัครที่เสนอจะแสดงในสีแดงD ) หมายเลขของผู้สมัครที่เสนอแต่ละยีนของเอนไซม์ เอนไซม์ย่อ : แฟชั่น , fatty acid desaturase ; เฟ กรดไขมัน epoxydase ; และไซโตโครมพี pxg peroxygenase , ; , ; ฟ้า กรดไขมันปลาแซลมอนรมควัน hydroxylase ; ภาค ; hydroperoxide , HPL , lyase ; ยาถ่าย ; AAT , ADH , แอลกอฮอล์ , ทรานสเฟอเรส ; PDC pyr , ใช้ ; aldh อัลดีไฮด์ ดีไฮโดรจีเนส ; แอท ,อะมิโนแอซิด aminotransferase ; ราดหอมอะมิโนแอซิดดีคาร์บอกซิเลส . คำย่อผสม : 2-p-glycerate 2-phospho , glycerate ; ความ phosphoenol , pyr ; pyr , ไพรูเวท ; AA อะเซทัลดีไฮด์ ; เพ ฟีนิลอะลานีน ; GLU ผงชูรส .