ArticleIsolation and molecular char

Article
Isolation and molecular characterization of Salmonella enterica serovar Enteritidis from poultry house and clinical samples during 2010.
ABSTRACT A total of 60 Salmonella enterica serovar (ser.) Enteritidis isolates, 28 from poultry houses and 32 from clinical samples, were isolated during 2010. These isolates were subjected to testing and analyzed for antibiotic resistance, virulence genes, plasmids and plasmid replicon types. To assess genetic diversity, pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) fingerprinting, using the XbaI restriction enzyme, Multiple-Locus Variable-Number Tandem Repeat Analysis (MLVA) and plasmid profiles were performed. All isolates from poultry, and 10 out of 32 clinical isolates were sensitive to ampicillin, chloramphenicol, gentamicin, kanamycin, nalidixic acid, sulfisoxazole, streptomycin, and tetracycline. Twenty-one of thirty-two clinical isolates were resistant to ampicillin and tetracycline, and one isolate was resistant to nalidixic acid. PFGE typing of sixty ser. Enteritidis isolates by XbaI resulted in 10-12 bands and grouped into six clusters each with similarity from 95% to 81%. The MLVA analysis of sixty isolates gave 18 allele profiles with the majority of isolates displayed in three groups, and two clinical isolates found to be new in the PulseNet national MLVA database. All isolates were positive for 12 or more of the 17 virulence genes mostly found in S. enterica (spvB, spiA, pagC, msgA, invA, sipB, prgH, spaN, orgA, tolC, iroN, sitC, IpfC, sifA, sopB, and pefA) and negative for one gene (cdtB). All isolates carried a typical 58 kb plasmid, type Inc/FIIA. Three poultry isolates and one clinical isolate carried small plasmids with 3.8, 6, 7.6 and 11.5 kb. Ten of the clinical isolates carried plasmids, with sizes 36 and 38 kb, types IncL/M and IncN, and one isolate carried an 81 kb plasmid, type IncI. Southern hybridization of a plasmid with an Inc/FIIA gene probe hybridized one large 58 kb plasmid in all isolates. Several large and small plasmids from poultry isolates were not typed by our PCR-based method. These results confirmed that PFGE fingerprinting has limited discriminatory power for ser. Enteritidis in both poultry and clinical sources. However, the plasmid and MLVA allele profiles were a useful and important epidemiology tool to discriminate outbreak strains of ser. Enteritidis from poultry and clinical samples.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

บทความ
แยกและจำแนกโมเลกุลของซัล enterica serovar Enteritidis จากบ้านสัตว์ปีกและตัวอย่างทางคลินิกระหว่าง 2010.
นามธรรมแยก Enteritidis จำนวน 60 สาย enterica serovar (ser.) บ้าน 28 จากสัตว์ปีก และในระหว่างปี 2553 ถูกแยก 32 จากตัวอย่างทางคลินิก การ แยกเหล่านี้อยู่ภายใต้การทดสอบ และวิเคราะห์ความต้านทานยาปฏิชีวนะ ยีน virulence, plasmids และชนิด replicon plasmid การประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรม ฟิลด์สูงเจ electrophoresis (PFGE) ลายพิมพ์ การใช้เอนไซม์จำกัด XbaI มีทำโพรไฟล์หลายโลกัสโพลหมายเลขตัวแปรตัวตามกันไปซ้ำวิเคราะห์ (MLVA) และ plasmid ทั้งหมดที่แยกได้จากสัตว์ปีก และ 10 จาก 32 ทางคลินิกแยกสำคัญแอมพิซิลลิน chloramphenicol, gentamicin กานามัยซิน กรดนาลิดิซิก sulfisoxazole, streptomycin กเตตราไซคลีน Twenty-one ของสามสิบสองทางคลินิกแยกได้ทนต่อแอมพิซิลลินและเตตราไซคลีน และแยกหนึ่งไม่ทนต่อกรดนาลิดิซิก PFGE พิมพ์ของหก ser. Enteritidis แยกโดย XbaI ในวง 10-12 และจัดกลุ่มเป็น 6 กลุ่ม มีความคล้ายคลึงกันจาก 95% เป็น 81% การวิเคราะห์ MLVA หกแยกให้โพรไฟล์ allele 18 กับส่วนใหญ่แสดงในกลุ่มสามแยก และสองทางคลินิกแยกพบใหม่ในฐานข้อมูล PulseNet แห่งชาติ MLVA แยกได้ทั้งหมดมีค่าบวกน้อย 12 ยีน virulence 17 กร้า S. enterica (spvB, spiA, pagC, msgA, invA, sipB, prgH ระยะ orgA, tolC เหล็ก sitC, IpfC, sifA, sopB และ pefA) และค่าลบสำหรับหนึ่งยีน (cdtB) แยกทั้งหมดดำเนิน plasmid ทั่วไป 58 kb พิมพ์ Inc/FIIA สัตว์ปีกที่สามแยกได้และแยกทางคลินิกหนึ่งดำเนิน plasmids ขนาดเล็ก 3.8, 6, 7.6 และ 11.5 kb สิบของการแยกทางคลินิกดำเนิน plasmids มีขนาด 36 และ 38 kb ชนิดของ ร้าน/M และ IncN และแยกหนึ่งดำเนิน plasmid เป็น 81 kb พิมพ์ IncI ภาคใต้ hybridization ของ plasmid พร้อมโพรบมียีน Inc/FIIA เป็น plasmid kb ขนาดใหญ่ 58 หนึ่งในทั้งหมดแยก หลาย และ plasmids จากแยกสัตว์ปีกไม่พิมพ์ โดยวิธีของเราผล ผลลัพธ์เหล่านี้ยืนยันว่า ลายพิมพ์ PFGE ได้จำกัดพลังงานโจ่งแจ้งสำหรับ ser. Enteritidis ในสัตว์ปีกและแหล่งข้อมูลทางคลินิก อย่างไรก็ตาม plasmid และโพรไฟล์ allele MLVA มีเครื่องมือมีประโยชน์ และสำคัญระบาดถือพรรคถือพวกสายพันธุ์ระบาดของ ser. Enteritidis จากสัตว์ปีกและตัวอย่างที่ทางคลินิก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การแยกบทความ และลักษณะทางโมเลกุลของเชื้อซัลโมเนลลา
enterica ซีโรวาร์ enteritidis จากโรงเรือนและตัวอย่างทางคลินิกระหว่าง 2010 .
นามธรรมทั้งหมด 60 Salmonella enterica ซีโรวาร์ ( เซอร์ ) enteritidis เชื้อจากสัตว์ปีก หลัง 28 และ 32 จากตัวอย่างทางคลินิก ที่แยกได้ในช่วงปี 2553 จำนวนที่ถูกภายใต้การทดสอบและวิเคราะห์ยาปฏิชีวนะต่อต้านภัยสังคมยีน , พลาสมิดและประเภท replicon พลาสมิด การประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรม , พัลฟิลด์ gel electrophoresis ( PFGE ) fingerprinting ใช้ xbai เอนไซม์หลายตัวแปรการวิเคราะห์ความเชื่อหมายเลขตีคู่ซ้ำ mlva ) และโปรไฟล์ ในการวิจัย ทั้งหมดที่แยกได้จากสัตว์ปีก และ 10 จาก 32 ไอโซเลตเป็นคลินิกที่มี ampicillin ยา chloramphenicol , , ,น , นาลิดิซิก กรดซัลฟิซ ซาโซลจัง , , และเตตราซัยคลิน . ยี่สิบหนึ่งใน 32 ไอโซเลทและทนต่อ ampicillin ยา tetracycline , และหนึ่งแยกเป็นป้องกันสะพานกรุงธน . PFGE พิมพ์หกสิบกว่าท่าน enteritidis ไอโซเลท โดย xbai ส่งผลให้เกิด 10-12 วงและจัดกลุ่มเป็น 6 กลุ่ม แต่ละคนมีความเหมือนจาก 95% ถึง 81 เปอร์เซ็นต์การ mlva การวิเคราะห์ 60 ไอโซเลทให้ 18 โปรไฟล์ในส่วนใหญ่ของสายพันธุ์ที่แสดงใน 3 กลุ่มและ 2 ไอโซเลทพบเป็นคลินิกใหม่ใน pulsenet แห่งชาติ mlva ฐานข้อมูล ทุกสายพันธุ์เป็นบวก 12 หรือมากกว่าของ 17 โรคยีนส่วนใหญ่พบใน S . enterica ( spvb spia pagc msga , , , , sipb inva , , prgh ช่วง หรือ tolc , เหล็ก , ipfc SITC sopb ซีฟ่า , , , ,และ pefa ) และเชิงลบสำหรับยีน ( cdtb ) ทุกไอโซเลทนำทั่วไป 58 KB พลาสมิดชนิด INC / fiia . สามสัตว์ปีกไอโซเลทและหนึ่งคลินิกแยกถือ ) ขนาดเล็กที่มี 3.8 , 6 , 7.6 และ 11.5 กิโลไบต์ สิบของคลินิกแยกอุ้ม ) มีขนาด 36 และ 38 กิโล ชนิดรวม / m และ incn และแยกดำเนินการเป็น 81 KB พลาสมิดชนิด inci .( ภาคใต้ของพลาสมิดที่มียีนดีเอ็นเอโพรบงค์ / fiia ขนาดใหญ่ 58 KB พลาสมิดในเชื้อ หลายขนาดใหญ่และขนาดเล็กจากสัตว์ปีกสายพันธุ์เป็นพลาสมิดไม่พิมพ์โดยวิธี PCR ที่ใช้ของเรา ผลลัพธ์เหล่านี้ยืนยันว่าลายนิ้วมือได้จำกัดอำนาจจำแนก PFGE สำหรับท่าน enteritidis ทั้งในสัตว์ปีกและแหล่งข้อมูลทางคลินิก อย่างไรก็ตามส่วนพลาสมิด mlva โปรไฟล์และกลุ่มเป็นประโยชน์และที่สำคัญเครื่องมือในการจำแนกสายพันธุ์ระบาดระบาดวิทยาของอัศวิน enteritidis จากสัตว์ปีก และตัวอย่างทางคลินิก