Proteomic analysis of proteins in r

Proteomic analysis of proteins in rice seedling
To determine a protein’s underlying difference between resistant and susceptible cultivars, all proteins were extracted from a 2-week rice seedling of both resistant and susceptible cultivars and then subjected to two-dimensional electrophoresis (2-DE). Highly reproducible protein spots across an 18 cm strip of PI 3-11 NL and molecular weight range 245-11 kDa were detected on CBB staining, shown in Fig.1. Nineteen different protein spots were observed between resistant and susceptible cultivars. These differentially regulated protein spots were successfully identified using LC-MS/MS analysis, followed by a Mascot database search of Oryza sativa in the NCBI database (Table 1). Among the 19 proteins, only two proteins were detected in the resistant cultivar (spots 18, 19), which were identified as proteins related to carbohydrate metabolism. Four proteins (spots 1, 2, 3 and 4) were up-regulated in the resistant cultivar involved in the stress response, antioxidant and protein synthesis. Thirteen spots (spots 5-17) showed high expression

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Proteomic การวิเคราะห์โปรตีนในต้นกล้าข้าวเพื่อตรวจสอบความแตกต่างพื้นฐานของโปรตีนระหว่างพันธุ์ทน และไวต่อ โปรตีนทั้งหมดถูกสกัดจากต้นกล้าข้าว 2 สัปดาห์เป็นของพันธุ์ทั้งทน และไวต่อ และจากนั้น ขึ้นอยู่กับอิสองมิติ (2-DE) จำลองสูงโปรตีนจุดข้าม 18 ซม.มีแถบของพี่ 3-11 NL และน้ำหนักโมเลกุลช่วงตรวจพบบน CBB ย้อมสี แสดงใน Fig.1 kDa 245-11 จุดแตกต่างกันโปรตีนทส่วนถูกตั้งข้อสังเกตระหว่างสายพันธุ์ที่ทน และไวต่อ งูเหล่านี้ควบคุมโปรตีนจุดสำเร็จระบุใช้ LC MS/MS วิเคราะห์ ตาม ด้วยการค้นหาฐานข้อมูลสัญลักษณ์ของ Oryza sativa ในฐานข้อมูล NCBI (ตารางที่ 1) ในหมู่โปรตีน 19 เพียงสองโปรตีนพบในพันธุ์ทน (จุด 18, 19), ซึ่งถูกระบุเป็นโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญคาร์โบไฮเดรต โปรตีน 4 (จุด 1, 2, 3 และ 4) มีควบคุมขึ้นในพันธุ์ทนที่เกี่ยวข้องกับความเครียดการตอบสนอง สารต้านอนุมูลอิสระ และโปรตีนสังเคราะห์ สิบสามจุด (จุดที่ 5-17) แสดงให้เห็นว่าการแสดงออกสูง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวิเคราะห์โปรตีนของโปรตีนในต้นกล้าข้าว
เพื่อตรวจสอบความแตกต่างพื้นฐานของโปรตีนระหว่างพันธุ์ต้านทานและอ่อนไหวโปรตีนทั้งหมดถูกสกัดจากต้นกล้าข้าว 2 สัปดาห์ของทั้งสองสายพันธุ์ที่ทนและอ่อนไหวและเป็นไปแล้วสองมิติ electrophoresis (2-de) จุดโปรตีนสูงสามารถทำซ้ำได้ทั่วแถบ 18 ซม of Pi 3-11 NL และช่วงที่มีน้ำหนักโมเลกุล 245-11 กิโลดาลตันถูกตรวจพบใน CBB การย้อมสีที่แสดงในรูปที่ 1 เก้าจุดโปรตีนที่แตกต่างกันถูกตั้งข้อสังเกตระหว่างพันธุ์ต้านทานและอ่อนไหว เหล่านี้จุดควบคุมโปรตีนที่แตกต่างกันมีการระบุประสบความสำเร็จโดยใช้การวิเคราะห์ LC-MS / MS ตามด้วยการค้นหาฐานข้อมูลมิ่งขวัญของ Oryza sativa ในฐานข้อมูล NCBI (ตารางที่ 1) ในบรรดา 19 โปรตีนเพียงสองโปรตีนถูกตรวจพบในพันธุ์ทน (จุดที่ 18, 19) ซึ่งถูกระบุว่าเป็นโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญคาร์โบไฮเดรต สี่โปรตีน (จุดที่ 1, 2, 3 และ 4) มีขึ้นควบคุมในพันธุ์ต้านทานส่วนร่วมในการตอบสนองต่อความเครียด, สารต้านอนุมูลอิสระและการสังเคราะห์โปรตีน สิบสามจุด (จุด 5-17) แสดงให้เห็นว่าการแสดงออกสูง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวิเคราะห์โปรตีนของโปรตีนในเมล็ดข้าวเพื่อกำหนดเป็นโปรตีนพื้นฐานความแตกต่างระหว่างพันธุ์ต้านทานไว , โปรตีนสกัดจากต้นอ่อนของข้าวทั้ง 2 พันธุ์ต้านทานและอ่อนแอ และภายใต้สองมิติ electrophoresis ( แผ่น ) จุดโปรตีนสูง 18 ซม. ) ในแถบของปี่ 3-11 NL น้ำหนักโมเลกุลและถูกตรวจพบในช่วง 245-11 kDa cbb staining แสดงใน” . สิบเก้าจุดโปรตีนต่าง ๆที่พบระหว่างต้านทานและอ่อนแอ 2 พันธุ์ เหล่านี้สามารถระบุจุดควบคุมมีโปรตีนต่างกันโดยใช้การวิเคราะห์อินซูลินรักษาโรคตามสำหรับฐานข้อมูลการค้นหาของข้าวใน ncbi ฐานข้อมูล ( ตารางที่ 1 ) ระหว่าง 19 โปรตีนเพียงสองโปรตีนที่พบในพันธุ์ต้านทาน ( จุด 18 , 19 ) ซึ่งถูกระบุว่าเป็นโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญคาร์โบไฮเดรต สี่โปรตีน ( จุด 1 , 2 , 3 และ 4 ) ในพันธุ์ที่เกี่ยวข้องในสามารถทนความเครียดการตอบสนอง , สารต้านอนุมูลอิสระและโปรตีนสังเคราะห์ 13 จุด ( จุด 5-17 ) มีการแสดงออกสูง