It was of interest to perform a phy

It was of interest to perform a phylogenetic analysis of
the AOB based on the ISR sequences, as the 16s
rRNA gene- based phylogeny has previously been
shown to have a very low resolution, owing to highsequence similarity. Phylogenetic trees constructed on
the basis of the ISR sequences (Fig. la) were topologically
quite similar to the trees constructed on the
basis of 16s rDNA sequences (Fig. 1 b). The branching
of the ISR trees was the same regardless of the method
was markedly improved compared with the 16s rRNA
gene-based phylogeny. The clustering of the trees
constructed on the basis of 16s rRNA gene sequences
has been shown to vary slightly when different
algorithms are used for the phylogenetic analysis
(Utiker et al., 1995), probably because of the small
overall sequence differences between the 16s rRNA
gene sequences. The trees in Fig. 1 were both made
using the maximum-likelihood method (Felsenstein,
198 1) and show the same branching patterns for 10 out
of the 12 AOB examined. Nitrosospira spp. F3 and
N11 3T cluster differently in the two phylogenetic trees
shown in Fig. 1. In a bootstrapped parsimony analysis
with 100 replicates, the branching points occur with a
considerably higher frequency for the ISR sequences
than in the corresponding tree based on 16s rRNA
gene sequences (not shown). The only exception is the
node dividing Nitrosospira multiformis spp. Nl1 3T and
F3 from the other Nitrosospiras, which occurs with a
frequency of 0.53. Clear conclusions on the phylogenetic
position of these two AOB cannot therefore be
drawn at present.
used for tree construction. The resolution, however,

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ก็น่าสนใจเพื่อทำการวิเคราะห์ผลของAOB ที่อิงลำดับ ISR เป็นการ 16srRNA ยีน-คะแนน phylogeny ก่อนหน้านี้ได้แสดงที่มีความละเอียดต่ำมาก เนื่องจากความคล้ายคลึงกัน highsequence ต้นทางที่สร้างขึ้นบนพื้นฐานลำดับ ISR (มะเดื่อ la) ถูก topologicallyค่อนข้างคล้ายกับต้นไม้บนพื้นฐานของ 16s rDNA ลำดับ (รูปที่ 1 b) แยกเป็นสาขาการต้นไม้ ISR แก้ไข โดยวิธีการเดียวกันอย่างเด่นชัดปรับปรุงเมื่อเปรียบเทียบกับของ 16s rRNAใช้ยีน phylogeny คลัสเตอร์ของต้นไม้สร้างขึ้นบนพื้นฐานของ 16s rRNA ยีนลำดับได้รับการแสดงที่แตกต่างกันเล็กน้อยเมื่อแตกต่างกันอัลกอริทึมที่ใช้สำหรับการวิเคราะห์ทาง(Utiker et al. 1995), อาจเนื่องจากขนาดเล็กโดยรวม ลำดับความแตกต่างระหว่างการ 16s rRNAลำดับยีน ทั้งสองทำต้นไม้ในรูปที่ 1โดยใช้วิธีการโอกาสสูงสุด (Felsenstein1 198) และแสดงรูปแบบการโยงหัวข้อเดียวกันสำหรับ 10 ออกของ AOB 12 การตรวจสอบ Nitrosospira F3 ออกซิเจน และN11 3T คลัสเตอร์แตกต่างกันในต้นไม้ผลสองแสดงในรูปที่ 1 ในการวิเคราะห์ bootstrapped parsimonyกับ 100 replicates จุดโยงหัวข้อที่เกิดขึ้นกับการความถี่ที่สูงมากสำหรับลำดับ ISRกว่าใน ต้นไม้ที่สอดคล้องกันอิง 16s rRNAลำดับยีนที่ (ไม่แสดง) เป็นเท่าตัวโหน Nitrosospira multiformis ออกซิเจน Nl1 3T หาร และF3 จากอื่น ๆ Nitrosospiras ซึ่งเกิดขึ้นกับการfrequency of 0.53. Clear conclusions on the phylogeneticposition of these two AOB cannot therefore bedrawn at present.used for tree construction. The resolution, however,

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

มันเป็นที่น่าสนใจที่จะดำเนินการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการของ
AOB ตามลำดับ ISR เป็น 16s
rRNA gene- ตามเชื้อชาติได้รับก่อนหน้านี้
แสดงให้เห็นว่ามีความละเอียดต่ำมากเนื่องจาก highsequence คล้ายคลึงกัน ต้นไม้ที่สร้างขึ้นบน
พื้นฐานของลำดับ ISR (รูป. LA) เป็นทอพอโลยี
ค่อนข้างคล้ายกับต้นไม้สร้างบน
พื้นฐานของลำดับ 16s rDNA (รูป. 1 ข) แขนง
ของต้นไม้ ISR ได้เหมือนกันโดยไม่คำนึงถึงวิธีการที่
ได้รับการปรับปรุงให้ดีขึ้นอย่างเห็นได้ชัดเมื่อเทียบกับ 16s rRNA
เชื้อชาติยีน-based จัดกลุ่มของต้นไม้
ที่สร้างขึ้นบนพื้นฐานของ 16S rRNA ลำดับยีน
ได้รับการแสดงจะแตกต่างกันเล็กน้อยเมื่อแตกต่างกัน
อัลกอริทึมที่ใช้สำหรับการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการ
(Utiker et al., 1995) อาจจะเป็นเพราะมีขนาดเล็ก
แตกต่างลำดับโดยรวมระหว่าง 16s rRNA
ลำดับยีน ต้นไม้ในรูป 1 มีทั้งที่ทำ
โดยใช้โอกาสสูงสุดวิธีการ (Felsenstein,
198 1) และแสดงรูปแบบการแตกแขนงเดียวกัน 10 ออก
12 AOB ตรวจสอบ Nitrosospira เอสพีพี F3 และ
N11 3T คลัสเตอร์แตกต่างกันในทั้งสองต้นไม้
ที่แสดงในรูป 1. ในการวิเคราะห์ความตระหนี่ bootstrapped
100 ซ้ำจุดแขนงเกิดขึ้นกับ
ความถี่สูงมากสำหรับลำดับ ISR
กว่าในต้นไม้ที่สอดคล้องกันบนพื้นฐานของ 16S rRNA
ลำดับยีน (ไม่แสดง) ยกเว้นอย่างเดียวคือ
โหนดหาร Nitrosospira multiformis เอสพีพี Nl1 3T และ
F3 จากที่อื่น ๆ Nitrosospiras ซึ่งเกิดขึ้นกับ
ความถี่ของ 0.53 ข้อสรุปที่ชัดเจนเกี่ยวกับ phylogenetic
ตำแหน่งของทั้งสอง AOB ไม่ได้จึงสามารถ
วาดในปัจจุบัน.
ใช้สำหรับการก่อสร้างต้นไม้ ความละเอียดอย่างไร

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

มันน่าสนใจที่จะดำเนินการวิเคราะห์ชนิดของโดย aob ตามลำดับ ( ISR เป็นrRNA ยีน - ตามระบบเชื้อชาติได้ .แสดงให้เห็นว่ามีความละเอียดต่ำมาก เนื่องจาก highsequence ความเหมือน ซึ่งสร้างขึ้นบนต้นไม้พื้นฐานของ ISR ดังนี้ ( รูป topologically ลา ) คือค่อนข้างคล้ายกับต้นไม้ที่สร้างขึ้นบนพื้นฐานของยีน 16S rDNA ( รูปที่ 1 B ) การแตกแขนงของ ISR ต้นไม้ก็เหมือนกันไม่ว่าวิธีอย่างที่ดีขึ้นเมื่อเทียบกับ 16S rRNAระบบเชื้อชาติจีนจาก กลุ่มของต้นไม้สร้างขึ้นบนพื้นฐานของยีน 16S rRNA ลำดับได้ถูกแสดงจะแตกต่างกันเล็กน้อยเมื่อที่แตกต่างกันขั้นตอนวิธีที่ใช้สำหรับการวิเคราะห์ phylogenetic( utiker et al . , 1995 ) อาจเป็นเพราะของเล็ก ๆความแตกต่างระหว่าง 16S rRNA ลำดับโดยรวมยีน ลำดับ ต้นไม้ในรูปที่ 1 ทั้งคู่ ที่ทําใช้วิธีความน่าจะเป็นสูงสุด ( felsenstein ,198 1 ) และแสดงรูปแบบเดียวกันแยก 10 ออกของ 12 บัณฑิตวิทยาลัยตรวจสอบ ไนโตรโซ ปรา spp . F3 และn11 3T กลุ่มแตกต่างกันในสอง phylogenetic ต้นไม้แสดงในรูปที่ 1 ในการวิเคราะห์ bootstrapped ตระหนี่100 แบบ , แยกจุดเกิดขึ้นด้วยความถี่สูงสำหรับ ISR ลำดับมากกว่าต้นไม้ที่อยู่บนพื้นฐานของ 16S rRNAยีน ลำดับ ( ไม่แสดง ) ยกเว้นอย่างเดียวคือปมแบ่งไนโตรโซ ปรา multiformis spp . nl1 3T และF3 จาก nitrosospiras อื่น ๆซึ่งจะเกิดขึ้นกับความถี่ของ 0.53 . ข้อสรุปที่ชัดเจนในการยืนยันตำแหน่งของทั้งสอง aob ไม่ดังนั้นวาดในปัจจุบันใช้สำหรับสร้างต้นไม้ ความละเอียด , อย่างไรก็ตาม