TGGE analysis of PCRamplified16S rD

TGGE analysis of PCRamplified
16S rDNA fragments
has been applied to compare bacterial populations
inhabiting the rhizosphere and phyllosphere of
transgenic potato plants expressing T4lysozyme
and
nontransgenic
potato plants (Figure 3; Heuer&Smalla,
1997). TGGE patterns of rDNA fragments from
the rhizosphere were complex, but identical between
transgenic and nontransgenic
plants. In contrast, profiles
obtained from the phyllosphere samples were less
complex, but showed much more variation between
plants.
Heuer et al. (1997) used DGGE and TGGE to
study the genetic diversity of actinomycetes in different
soils, and to monitor shifts in their abundances
in the potato rhizosphere. In this study, the
authors used two amplification strategies, i.e., a direct
amplification of the actinomycetes 16S rDNA using
groupspecific
primers, and an indirect amplification
approach, whereby actinomycetes specific DNA fragments
were generated with a forward groupspecific

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวิเคราะห์ของ TGGE PCRamplified
16S rDNA
ชิ้นส่วนได้ถูกนำมาใช้เพื่อเปรียบเทียบประชากรแบคทีเรียพำนักอยู่บริเวณรากและ
phyllosphere
ของพืชดัดแปรพันธุกรรมมันฝรั่งแสดงT4lysozyme
และ
nontransgenic
พืชมันฝรั่ง (รูปที่ 3; & Smalla Heuer,
1997) รูปแบบของชิ้นส่วน TGGE rDNA
จากบริเวณรากเป็นที่ซับซ้อนแต่ที่เหมือนกันระหว่างยีนและ nontransgenic พืช ในทางตรงกันข้ามรูปแบบที่ได้รับจากกลุ่มตัวอย่าง phyllosphere น้อยซับซ้อนแต่แสดงให้เห็นความแตกต่างมากขึ้นระหว่างพืช. Heuer, et al (1997) ที่ใช้ DGGE TGGE และการศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของactinomycetes ที่แตกต่างกันในดินและในการตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงในปริมาณของพวกเขาในบริเวณรากมันฝรั่ง ในการศึกษานี้ผู้เขียนใช้สองกลยุทธ์การขยายคือตรงขยายของactinomycetes 16S rDNA ใช้groupspecific ไพรเมอร์และขยายทางอ้อมวิธีโดย actinomycetes ดีเอ็นเอที่เฉพาะเจาะจงถูกสร้างขึ้นด้วยgroupspecific ไปข้างหน้า

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวิเคราะห์ 16S rDNA ของเศษ tgge pcramplified

ได้ถูกนำมาใช้เพื่อเปรียบเทียบประชากรแบคทีเรียที่อาศัยอยู่บริเวณราก และใบของ

ต้นมันฝรั่งพืชแสดง t4lysozyme

พืชมันฝรั่งและ nontransgenic
( รูปที่ 3 smalla
& Heuer , 1997 ) tgge รูปแบบของชิ้นส่วน rDNA จาก
รากมีความซับซ้อน แต่ที่เหมือนกันระหว่างยีน nontransgenic

และพืช ในทางตรงกันข้ามข้อมูลที่ได้จากตัวอย่างใบ

ที่ซับซ้อนน้อยลง แต่พบมากขึ้นการเปลี่ยนแปลงระหว่างพืช
.
Heuer et al . ( 1997 ) ที่ใช้ในการทดลอง และ tgge

ศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อแอคติโนมัยสีทในดินแตกต่างกัน
, และตรวจสอบการเปลี่ยน abundances
ในมันฝรั่งราก . ในการศึกษานี้ ผู้เขียนใช้สองกลยุทธ์ (
,
) ตรงการเพิ่มปริมาณของเชื้อแอคติโนมัยสีท 16S rDNA โดยใช้ไพรเมอร์ groupspecific


วิธี Amplification และทางอ้อม โดยเฉพาะชิ้นส่วนดีเอ็นเอด้วยกัน
ถูกสร้างขึ้นด้วย groupspecific ไปข้างหน้า