The purpose of this study was to ev

The purpose of this study was to evaluate the clinical usefulness of the multiplex RT-PCR assay for the rapid and accurate detection and identification of Trichophyton spp. including T. rubrum or T. mentagrophytes, and Microsporum spp. based on ITS-ribosomal gene region and to compare multiplex RT-PCR assay results with conventional and molecular results such as PCR-REBA. PCR-REBA is a highly sensitive and specific probe-based method where multiple oligonucleotide probes are immobilized on nitrocellulose strips, are hybridized with biotin-labelled PCR products, and derive rapid results within
24 h (Ajbani et al. 2011). In this study, we found that positivity for multiplex RT-PCR assay was significantly research also showed that M. canis was positive in only 3/258 (1
2%) samples and other Trichophyton spp. except T. rubrum or T. mentagrophytes were not detected. Therefore,more tests with larger numbers of samples are necessary.The distribution of dermatophytes in a given geographical area depends on climate, environmental or socio-economic factors, immigration and tourism, and the distribution also tends to change over time. Among the total 258 samples, the most frequently identified dermatophyte species were T. rubrum (n = 199, 77
1%) and T. mentagrophytes (n = 28, 10
9%). These results are similar to previous studies where the most common dermatophytes identified include T. rubrum, M. canis,
and Trichophyton interdigitale in Europe, T. rubrum and T. interdigitale in Asia and Australia, M. audouinii and Trichophyton violaceum in Africa, and T. rubrum, T. tonsurans and T. interdigitale in the Americas (Ameen 2010). Additionally, 51 (43
2%) samples identified as T. rubrum or T. mentagrophytes among 118 clinical isolates were confirmed in the diagnosis of tinea unguium,followed by tinea pedis (n = 13, 11%), tinea cruris (n = 7, 5
9%) and tinea corporis (n = 6, 5
1%).The results of present study show that the multiplex RT-PCR assay is a rapid method with a turnaround time that usually takes no more than 3 h (~5 h for PCRREBA), which included 1 h for DNA preparation and
1
5 h for target DNA amplification. It allowed for the rapid identification of Trichophyton spp. including T. rubrum or T. mentagrophytes and Microsporum spp. without a post-PCR process. Furthermore, it was very specific and sensitive because the results were highly correlated with standard fungal identification by PCR-REBA and ITS sequence analysis.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

วัตถุประสงค์ของการศึกษานี้เป็นการประเมินประโยชน์ทางคลินิกของทดสอบ RT-PCR มัลติเพล็กซ์สำหรับการตรวจสอบอย่างรวดเร็ว และถูกต้องและรหัสของ T. rubrum หรือ T. mentagrophytes ออกซิเจน Trichophyton, Microsporum ออกซิเจนตามภูมิภาคยีนของ ribosomal และ multiplex RT-PCR assay เปรียบเทียบผลลัพธ์กับผลทั่วไป และระดับโมเลกุลเช่น PCR REBA PCR REBA จะมีความไวสูง และเฉพาะสอบสวนตามวิธีการที่หลาย oligonucleotide ตรึงบนแผ่นไนโตรเซลลูโลส ไฮบริดกับไบโอตินฉลากผลิตภัณฑ์ PCR และได้รับผลลัพธ์อย่างรวดเร็วภายใน24 ชั่วโมง (Ajbani et al. 2011) ในการศึกษานี้ เราพบว่า บวกสำหรับ multiplex RT-PCR assay มาก วิจัยยัง แสดงให้เห็นว่า กลุ่มดาวสุนัขเมตรบวกในเฉพาะ 3/258 ตัวอย่าง (1 2%) และออกซิเจน Trichophyton อื่น ๆ ยกเว้น T. rubrum หรือ T. mentagrophytes ไม่พบ ดังนั้น การทดสอบเพิ่มเติม ด้วยตัวเลขขนาดใหญ่ของกลุ่มตัวอย่างจำเป็นต้อง การกระจายของ dermatophytes ในพื้นที่ทางภูมิศาสตร์ที่กำหนดขึ้นอยู่กับสภาพภูมิอากาศ ปัจจัยสิ่งแวดล้อม หรือเศรษฐกิจ ตรวจคนเข้าเมือง และการท่องเที่ยว และการกระจายยังมีแนวโน้มที่ เปลี่ยนแปลงตลอดเวลา จากตัวอย่าง 258 รวม พันธุ์ dermatophyte ระบุบ่อยถูก T. rubrum (n = 199, 77 1%) และ T. mentagrophytes (n = 28, 10 9%) ผลลัพธ์เหล่านี้จะคล้ายกับการศึกษาก่อนหน้านี้ที่ dermatophytes ทั่วไปที่พบได้แก่ T. rubrum กลุ่มดาวสุนัข M.และ interdigitale Trichophyton ในยุโรป T. rubrum และ T. interdigitale ในเอเชียและออสเตรเลีย M. audouinii และ violaceum Trichophyton ในแอฟริกา และ T. rubrum, T. tonsurans และ T. interdigitale ในอเมริกา (อะมีน 2010) นอกจากนี้ 51 (43 2%) ตัวอย่างระบุว่าเป็น T. rubrum หรือ T. mentagrophytes ระหว่าง 118 แยกทางคลินิกได้รับการยืนยันในการวินิจฉัยของ tinea unguium ตาม ด้วย tinea pedis (n = 13, 11%), tinea cruris (n = 7, 5 9%) และ tinea corporis (n = 6, 5 1%) ผลการศึกษาแสดงว่า การ RT-PCR assay มัลติเพล็กซ์เป็นวิธีการอย่างรวดเร็ว ด้วยเวลาตอบสนองที่มักจะใช้เวลาไม่เกิน 3 ชม. (~ 5 h สำหรับ PCRREBA), ซึ่งรวม 1 ชม.สำหรับการเตรียมดีเอ็นเอ และ1 5 ชั่วโมงสำหรับเป้าหมายขยายดีเอ็นเอ อนุญาตสำหรับรหัสอย่างรวดเร็วของออกซิเจน Trichophyton T. rubrum หรือ T. mentagrophytes และ Microsporum ออกซิเจน โดยไม่มีกระบวนการ PCR โพสต์ นอกจากนี้ ได้เฉพาะเจาะจง และมีความสำคัญมาก เพราะผลมีสูงความสัมพันธ์กับการระบุเชื้อรามาตรฐาน PCR REBA และการวิเคราะห์ลำดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

วัตถุประสงค์ของการศึกษาครั้งนี้มีการประเมินประโยชน์ทางคลินิกของ multiplex RT-PCR ทดสอบสำหรับการตรวจสอบอย่างรวดเร็วและถูกต้องและบัตรประจำตัวของ Trichophyton เอสพีพี รวมทั้ง rubrum T. mentagrophytes หรือตันและ Microsporum เอสพีพี อยู่บนพื้นฐานของมันโซมอลภูมิภาคของยีนและเพื่อเปรียบเทียบผลการทดสอบ multiplex RT-PCR ที่มีผลธรรมดาและโมเลกุลเช่น PCR-Reba PCR-Reba เป็นวิธีการสอบสวนตามความไวสูงและเฉพาะเจาะจงที่ฟิวส์ oligonucleotide หลายตรึงบนแถบ nitrocellulose มีไฮบริดที่มีไบโอตินที่ติดฉลากผลิตภัณฑ์ PCR และได้ผลลัพธ์อย่างรวดเร็วภายใน
24 ชั่วโมง (Ajbani et al. 2011) ในการศึกษานี้เราพบว่า positivity สำหรับ multiplex RT-PCR ทดสอบอย่างมีนัยสำคัญการวิจัยยังแสดงให้เห็นว่าเอ็ม Canis เป็นบวกเพียง 3/258 ตัวอย่าง (1? 2%) และ Trichophyton spp อื่น ๆ ยกเว้น T. rubrum หรือ mentagrophytes ตันไม่พบ ดังนั้นการทดสอบมากขึ้นด้วยตัวเลขขนาดใหญ่ของกลุ่มตัวอย่างมีการกระจายของ necessary.The dermatophytes ในพื้นที่ทางภูมิศาสตร์ที่ได้รับขึ้นอยู่กับสภาพอากาศหรือปัจจัยแวดล้อมทางเศรษฐกิจและสังคมตรวจคนเข้าเมืองและการท่องเที่ยวและการจัดจำหน่ายยังมีแนวโน้มที่จะเปลี่ยนแปลงตลอดเวลา ในบรรดาทั้งหมด 258 ตัวอย่างส่วนใหญ่ที่พบได้บ่อยชนิด dermatophyte เป็น T. rubrum (n = 199, 77? 1%) และ T. mentagrophytes (n = 28 10 9%) ผลลัพธ์เหล่านี้มีความคล้ายคลึงกับการศึกษาก่อนหน้าที่ dermatophytes ที่พบมากที่สุด ได้แก่ การระบุ T. rubrum, M. canis,
และ Trichophyton interdigitale ในยุโรป rubrum ตันและตัน interdigitale ในเอเชียและออสเตรเลีย, M. audouinii และ Trichophyton violaceum ในแอฟริกาและ T. rubrum ตัน tonsurans ตันและ interdigitale ในอเมริกา (Ameen 2010) นอกจากนี้ 51 (43? 2%) ระบุว่าเป็นตัวอย่าง T. rubrum หรือ T. mentagrophytes ในหมู่ไอโซเลทคลินิก 118 ได้รับการยืนยันในการวินิจฉัยเกลื้อน unguium ตามด้วยเกลื้อน pedis (n = 13, 11%) เกลื้อน cruris (n = 7, 5? 9%) และเกลื้อน corporis (n = 6, 5? 1%). ผลการศึกษานี้แสดงว่า multiplex RT-PCR ทดสอบเป็นวิธีการอย่างรวดเร็วด้วยเวลาตอบสนองที่มักจะใช้เวลาไม่เกิน 3 ชั่วโมง (~ 5 H สำหรับ PCRREBA) ซึ่งรวมถึง 1 ชั่วโมงสำหรับการเตรียมดีเอ็นเอและ
1? 5 ชั่วโมงสำหรับการขยายดีเอ็นเอเป้าหมาย มันได้รับอนุญาตสำหรับการระบุอย่างรวดเร็วของ Trichophyton เอสพีพี รวมทั้ง rubrum T. mentagrophytes หรือตันและ Microsporum เอสพีพี โดยไม่ต้องโพสต์-PCR กระบวนการ นอกจากนี้มันเป็นอย่างที่เฉพาะเจาะจงและมีความสำคัญเพราะผลลัพธ์ที่มีความสัมพันธ์อย่างมากกับบัตรประจำตัวของเชื้อรามาตรฐานโดย PCR-Reba และการวิเคราะห์ลำดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวิจัยครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อประเมินประโยชน์ทางคลินิกของวิธี multiplex RT-PCR สำหรับอย่างรวดเร็ว และถูกต้อง การตรวจหาและจำแนกเชื้อรา Trichophyton spp . ได้แก่ ต. rubrum หรือ mentagrophytes และ spp . โดยขึ้นอยู่กับภูมิภาคของยีนไรโบโซมอลและเปรียบเทียบผลการทดสอบกับผลปกติและโมเลกุล multiplex RT-PCR เช่น pcr-reba . pcr-reba คือความไวสูงเฉพาะโดยวิธีการสอบสวนที่ฟิวส์ ซึ่งหลายที่ที่ถูกตรึงบนแผ่นไนโตรเซลลูโลส เป็นโพรไบโอตินที่มีผลิตภัณฑ์ PCR และได้รับผลลัพธ์อย่างรวดเร็ว ภายใน24 ชั่วโมง ( ajbani et al . 2011 ) ในการศึกษานี้ พบว่า ทั้งสำหรับ multiplex RT-PCR ) อย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ การวิจัยยังพบว่า เอ็ม คานิส เป็นบวกเพียง 3 / 258 ( 12% ) และตัวอย่างอื่นๆ ยกเว้น ต. rubrum Trichophyton spp . หรือ mentagrophytes ไม่พบ ดังนั้นการทดสอบเพิ่มเติม ด้วยตัวเลขขนาดใหญ่ของคนเป็นสิ่งที่จำเป็น การกระจายของ dermatophytes ในพื้นที่ทางภูมิศาสตร์ที่ได้รับขึ้นอยู่กับสภาพภูมิอากาศ ปัจจัยด้านสิ่งแวดล้อมหรือสังคม และตรวจคนเข้าเมือง การท่องเที่ยว และการกระจายที่ยังมีแนวโน้มที่จะเปลี่ยนแปลงตลอดเวลา ในหมู่ทั้งหมด 258 คนส่วนใหญ่มักระบุชนิดเดอร์มาโตไฟต์ ต. rubrum ( N = 6 , 771 ล้านบาท และ ต. mentagrophytes ( n = 28 , 109 ล้านบาท ผลลัพธ์เหล่านี้จะคล้ายคลึงกับการศึกษาก่อนหน้านี้ที่พบมากที่สุด ได้แก่ ต. rubrum dermatophytes ระบุอยู่ เอ็ม ,ในยุโรปและ interdigitale Trichophyton , ต. rubrum และ ต. interdigitale ในเอเชีย และ ออสเตรเลีย และ ม. audouinii Trichophyton violaceum ในแอฟริกา และ ต. rubrum ต. tonsurans และ ต. interdigitale ในทวีปอเมริกา ( Ameen 2010 ) นอกจากนี้ , 51 ( 432 ) ตัวอย่างที่ระบุว่าเป็น ต. rubrum หรือ mentagrophytes 118 ไอโซเลทยืนยันในทางคลินิกในการวินิจฉัยของ unguium เกลื้อน pedis เกลื้อนตาม ( n = 13 , 11 % ) , สังคัง ( n = 7 , 59 เปอร์เซ็นต์ ) และเกลื้อน corporis ( N = 6 , 51% ) ผลการศึกษา พบว่า มัลติเพล็กซ์ ( ปัจจุบันนี้เป็นวิธีที่รวดเร็วด้วยเวลาตอบสนองที่มักจะใช้เวลาไม่เกิน 3 H ( ~ 5 H สำหรับ pcrreba ) ซึ่งรวม 1 ชั่วโมงในการเตรียมดีเอ็นเอ15 ชั่วโมงเพิ่มจำนวนดีเอ็นเอเป้าหมาย มันได้รับอนุญาตสำหรับการอย่างรวดเร็วของ Trichophyton spp . ได้แก่ ต. rubrum หรือ mentagrophytes และ spp . โดยโพสต์โดยกระบวนการ นอกจากนี้ยังมากที่เฉพาะเจาะจงและมีความละเอียดอ่อนเพราะผลสูงมีความสัมพันธ์กับการจำแนกเชื้อรามาตรฐาน โดย pcr-reba และลำดับการวิเคราะห์