ResultsSequence analysis of 15 MaER

Results
Sequence analysis of 15 MaERF genes

This study isolated 15 novel ERF full-length cDNAs from banana fruit, designated MaERF1 to MaERF15. The sizes of the deduced amino acid sequences differed substantially (e.g. MaERF3 codes 432 amino acids, while MaERF11 codes 183 amino acids) (Supplementary Fig. S1). The sequence similarities of the MaERFs varied from 18.0% (MaERF3 and MaERF6) to 76.7% (MaERF12 and MaERF13) (Supplementary Table S8). Alignments of the full-length deduced proteins of MaERFs and AtERFs showed conserved motifs, including a DNA-binding domain designated the ERF domain (ranging from 58 to 59 amino acids, Supplementary Figs. S1A, B and S2), which is a defining character of the ERF transcriptional factor gene family (Fujimoto et al., 2000; Nakano et al., 2006; Yin et al., 2010). In addition, MaERF10–MaERF15 also exhibited a repressor domain, the ERF-associated amphiphilic repression domain (EAR) located at the 3’-end of the sequence (Supplementary Fig. S1A, C).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ผลลัพธ์การวิเคราะห์ลำดับยีน MaERF 15นี้ศึกษาแยก 15 นวนิยาย ERF cDNAs ปราศจากจากกล้วยผลไม้ กำหนด MaERF1 เพื่อ MaERF15 ขนาดลำดับกรดอะมิโน deduced แตกต่างมาก (เช่น MaERF3 รหัสกรดอะมิโน 432 ในขณะที่ MaERF11 รหัสกรดอะมิโน 183) (ฟิกเสริม S1) ความเหมือนของลำดับของ MaERFs แตกต่างกันจาก 18.0% (MaERF3 และ MaERF6) 76.7% (MaERF12 และ MaERF13) (เสริมตาราง S8) จัดแนวของการปราศจาก deduced โปรตีนของ MaERFs และ AtERFs แสดงให้เห็นว่าความนำ รวมถึงโดเมนดีเอ็นเอรวมกำหนดโดเมน ERF (ตั้งแต่ 58 59 กรดอะมิโน มะเดื่อเสริม S1A, B และ S2), ซึ่งเป็นการกำหนดอักขระของครอบครัวปัจจัย transcriptional ยีน ERF (ฟุจิโมะโตะและ al., 2000 นากาโนะและ al., 2006 ยิน et al., 2010) นอกจากนี้ MaERF10 – MaERF15 ยังจัดแสดงโดเมน repressor สัมพันธ์ ERF amphiphilic ปราบปรามโดเมน (หู) ตั้งอยู่ที่ 3 ตามลำดับ (ฟิกเสริม S1A, C)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ผลการ
วิเคราะห์ลำดับที่ 15 ยีน MaERF การศึกษาครั้งนี้แยก 15 นวนิยาย ERF cDNAs เต็มความยาวจากผลไม้กล้วยกำหนด MaERF1 เพื่อ MaERF15 ขนาดของกรดอะมิโนอนุมานลำดับแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญ (เช่นรหัส MaERF3 432 กรดอะมิโนในขณะที่รหัส MaERF11 183 กรดอะมิโน) (เสริมรูป. S1) ความคล้ายคลึงกันลำดับของ MaERFs ต่าง ๆ จาก 18.0% (MaERF3 และ MaERF6) ไป 76.7% (MaERF12 และ MaERF13) (ตารางเสริม S8) การจัดแนวของความยาวเต็มรูปแบบอนุมานโปรตีนของ MaERFs และ AtERFs แสดงให้เห็นลวดลายป่าสงวนรวมทั้งโดเมนดีเอ็นเอผูกพันที่กำหนดโดเมน ERF (ตั้งแต่ 58-59 กรดอะมิโนเสริมมะเดื่อ. S1A, B และ S2) ซึ่งเป็นตัวกำหนด ของครอบครัวยีนปัจจัยการถอดรหัส ERF (Fujimoto et al, 2000;. Nakano et al, 2006;.. หยินและคณะ, 2010) นอกจากนี้ MaERF10-MaERF15 ยังแสดงโดเมนอดกลั้นโดเมนปราบปราม amphiphilic ERF ที่เกี่ยวข้อง (EAR) ตั้งอยู่ที่ปลาย 3'ของลำดับ (รูปที่เสริม. S1A, C)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวิเคราะห์ลำดับของยีน

15 maerf
การศึกษาแยก 15 นวนิยาย ERF เต็มตัว cdnas จากกล้วยผลไม้ เขต maerf1 เพื่อ maerf15 . ขนาดของกรดอะมิโนแตกต่างกันอย่างมาก ( เช่น maerf3 รหัส 432 กรดอะมิโน ในขณะที่ maerf11 รหัส 183 กรดอะมิโน ) ( เพิ่มเติมรูปที่ S1 ) ความคล้ายคลึงกันของลำดับ maerfs หลากหลายจาก 18.0 % ( maerf3 และ maerf6 ) 767% ( maerf12 และ maerf13 ) ( ตารางที่ s8 เสริม ) การอนุมานแบบเต็มตัวของโปรตีนของ maerfs aterfs อนุรักษ์และมีลวดลาย รวมถึงดีเอ็นเอมัดโดเมนกำหนด ERF โดเมน ( ตั้งแต่ 58 กับ 59 กรดอะมิโนเสริมลูกมะเดื่อ . s1a B และ S2 ) ซึ่งเป็นการกำหนดลักษณะของยีนในครอบครัว ( ปัจจัย ERF particle ฟูจิโมโตะ et al . , 2000 ; นากาโนะ et al . , 2006 ;หยิน et al . , 2010 ) นอกจากนี้ maerf10 – maerf15 จัดแสดงยังเป็นผู้ควบคุมโดเมน , โดเมนการ ERF เกี่ยวข้อง amphiphilic ( หู ) ตั้งอยู่ที่ 3 ' - ปลายลำดับ ( เพิ่มเติมรูปที่ s1a , C )