Rapid publication-ready MS-Word tables for
one-way ANOVA
Abstract
Background: Statistical tables are an important component of data analysis and reports in biological sciences.
However, the traditional manual processes for computation and presentation of statistically significant results using
a letter-based algorithm are tedious and prone to errors.
Results: Based on the R language, we present two web-based software for individual and summary data, freely
available online, at http://shiny.stat.tamu.edu:3838/hassaad/Table_report1/ and http://shiny.stat.tamu.edu:3838/
hassaad/SumAOV1/, respectively. The software are capable of rapidly generating publication-ready tables containing
one-way analysis of variance (ANOVA) results. No download is required. Additionally, the software can perform
multiple comparisons of means using the Duncan, Student-Newman-Keuls, Tukey Kramer, and Fisher’s least
significant difference (LSD) tests. If the LSD test is selected, multiple methods (e.g., Bonferroni and Holm) are
available for adjusting p-values. Using the software, the procedures of ANOVA can be completed within seconds
using a web-browser, preferably Mozilla Firefox or Google Chrome, and a few mouse clicks. Furthermore, the
software can handle one-way ANOVA for summary data (i.e. sample size, mean, and SD or SEM per treatment
group) with post-hoc multiple comparisons among treatment means. To our awareness, none of the currently
available commercial (e.g., SPSS and SAS) or open-source software (e.g., R and Python) can perform such a rapid
task without advanced knowledge of the corresponding programming language.
Conclusions: Our new and user-friendly software to perform statistical analysis and generate publication-ready
MS-Word tables for one-way ANOVA are expected to facilitate research in agriculture, biomedicine, and other fields
of life sciences.
Keywords: Statistical analysis; Multiple comparisons; Online software; Computation; Biology; R; Shiny
Introduction
Statistical tables are ubiquitous in agricultural, biological,
and biomedical studies (Steel et al. 1997). An example is
shown in Table 1, reporting the effects of oral administration
of interferon tau (IFNT) on concentrations of
amino acids, glucose, lipids, and hormones in the plasma
of Zucker diabetic fatty (ZDF) rats (Tekwe et al. 2013).
Here, we focus on generating tables from one-way analysis
of variance (ANOVA) models where measurements are
summarized as mean ± SEM for each treatment group.
Typically, post-hoc test results are also included in these
tables using a letter-based algorithm (Piepho 2004) to
indicate which treatment groups are significantly different.
With this algorithm, means for treatments are assigned
letters (e.g., a, b, and c) to highlight significant differences.
Those means that are not significantly different are
assigned a common letter. In other words, two treatments
without a common letter are statistically significant at the
chosen level of significance (e.g., P ≤ 0.05 or ≤ 0.01). The
Tukey-Kramer (TK), Student-Newman-Keuls (SNK),
Fisher’s least significant difference (LSD), Duncan (DC),
and Bonferroni (BF) tests are among the most popular
multiple comparison procedures used in life science
research (Steel et al. 1997), including amino acid
biochemistry, nutrition, pharmacology, and physiology
(Wang et al. 2014a,b; Wu and Meininger 1997; Wu
1997).
อย่างรวดเร็วพร้อมพิมพ์ MS Word ตารางการวิเคราะห์ความแปรปรวนแบบทางเดียวบทคัดย่อพื้นหลัง: ตารางสถิติเป็นส่วนประกอบสำคัญของการวิเคราะห์ข้อมูลและรายงานทางด้านวิทยาศาสตร์ชีวภาพอย่างไรก็ตาม คู่มือดั้งเดิมกระบวนการคำนวณและงานนำเสนอของผลลัพธ์อย่างมีนัยสำคัญทางสถิติที่ใช้อัลกอริทึมที่ใช้ตัวอักษรมีแนวโน้มที่จะผิด และน่าเบื่อผลลัพธ์: ตามภาษา R เรานำสองเว็บซอฟต์แวร์สำหรับแต่ละรายการ และสรุปข้อมูล อิสระมีออนไลน์ ที่ http://shiny.stat.tamu.edu:3838/hassaad/Table_report1/http://shiny.stat.tamu.edu:3838 และ /hassaad/SumAOV1 /, ตามลำดับ ซอฟต์แวร์จะสามารถสร้างตารางพร้อมงานพิมพ์ที่ประกอบด้วยอย่างรวดเร็วผลต่างของการวิเคราะห์แบบทางเดียว (การวิเคราะห์ความแปรปรวน) ดาวน์โหลดไม่จำเป็นต้อง นอกจากนี้ ซอฟต์แวร์สามารถเปรียบเทียบหลายวิธีใช้ดันแคน นักเรียนนิวแมน-Keuls, Tukey Kramer และ Fisher ของน้อยที่สุดทดสอบความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญ (LSD) ถ้าเลือกทดสอบ LSD มีหลายวิธี (เช่น Bonferroni และ Holm)ใช้สำหรับปรับค่า p ใช้ซอฟต์แวร์ ขั้นตอนของการวิเคราะห์ความแปรปรวนสามารถเสร็จภายในวินาทีใช้เว็บเบราว์เซอร์ ควร Mozilla Firefox หรือ Google Chrome และคลิกเมาส์ไม่กี่ นอกจากนี้ การซอฟต์แวร์สามารถรองรับการวิเคราะห์ความแปรปรวนแบบทางเดียวสำหรับข้อมูลสรุป (เช่นขนาดตัวอย่าง ค่า เฉลี่ย และ SD หรือ SEM ต่อการรักษากลุ่ม) กับแบบเฉพาะกิจลงหลายเปรียบเทียบระหว่างวิธีการรักษา การรับรู้ของเรา ไม่มีอยู่ว่างค้า (เช่น โปรแกรมและ SAS) หรือซอฟต์แวร์ซอร์ส (เช่น R และงู) สามารถทำได้รวดเร็วเช่นงานไม่ มีความรู้ขั้นสูงของภาษาการเขียนโปรแกรมที่เกี่ยวข้องบทสรุป: ของเราใหม่ และใช้งานง่ายซอฟต์แวร์เพื่อทำการวิเคราะห์ทางสถิติ และสร้างพร้อมพิมพ์MS-Word ตารางการวิเคราะห์ความแปรปรวนแบบทางเดียวคาดว่าจะช่วยงานวิจัยเกษตร biomedicine และฟิลด์อื่น ๆของวิทยาศาสตร์สุขภาพคำสำคัญ: การวิเคราะห์ทางสถิติ เปรียบเทียบหลาย ซอฟต์แวร์ออนไลน์ คำนวณ ชีววิทยา R เงางามแนะนำตารางสถิติอยู่ในเกษตร ชีวภาพและการศึกษาทางชีวการแพทย์ (เหล็ก et al. 1997) ตัวอย่างเช่นแสดงในตารางที่ 1 รายงานผลของการดูแลช่องปากของเต่าอินเตอร์เฟียรอน (IFNT) ในความเข้มข้นของกรดอะมิโน กลูโคส โครงการ และฮอร์โมนในพลาสมาของ Zucker ไขมันโรคเบาหวาน (ZDF) หนู (Tekwe et al. 2013)ที่นี่ เรามุ่งเน้นการสร้างตารางจากการวิเคราะห์แบบทางเดียวรุ่นต่าง (การวิเคราะห์ความแปรปรวน) อยู่ที่วัดสรุปเป็นหมายถึง ± SEM สำหรับแต่ละกลุ่มบำบัดโดยทั่วไป ผลการทดสอบลงแบบเฉพาะกิจอยู่เหล่านี้ตารางที่ใช้ตัวอักษรตามอัลกอริทึม (Piepho 2004)ระบุว่า กลุ่มใดรักษาจะแตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญกับอัลกอริทึมนี้ มีกำหนดวิธีการสำหรับการรักษาตัวอักษร (เช่น a, b และ c) เพื่อเน้นความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญนั้นหมายความว่าไม่แตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญกำหนดตัวอักษรทั่วไป ในคำอื่น ๆ สองรักษาโดยทั่วไปจดหมายมีอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติที่จะเลือกระดับของความสำคัญ (เช่น P ≤ 0.05 หรือ≤ 0.01) ที่Tukey-Kramer (TK), นักศึกษานิวแมน-Keuls (เอสเอ็นเค),ของ Fisher น้อยร (LSD), ดันแคน (DC),และทดสอบ Bonferroni (เอฟ) เป็นนิยมมากที่สุดขั้นตอนการเปรียบเทียบหลายที่ใช้ในวิทยาศาสตร์วิจัย (เหล็ก et al. 1997), รวมทั้งกรดอะมิโนชีวเคมี โภชนาการ เภสัชวิทยา สรีรวิทยา และ(วัง al. et 2014a, b วูและซอลซ์เบิร์ค 1997 วูปี 1997)
การแปล กรุณารอสักครู่..
