ResultsAn automated genotyping proc

Results
An automated genotyping procedure [21,22] was used to screen
8,309 subtype C pol gene sequences from the UK for isolates
genetically linked to the subtype C epidemic in South America
(data not shown). Screening identified a minority of sequences
(n= 54, ,1%) potentially linked to the South American subtype C
epidemic. These 54 sequences were aligned with a set of 1,289
globally sampled reference sequences, plus 84 additional sequences
from the UK. A maximum likelihood (ML) phylogeny constructed
using this alignment confirmed the relationship between the 54
UK sequences and South American isolates, disclosing a wellsupported
monophyletic group comprised exclusively of subtype C
pol genes sampled in East Africa, Brazil and the UK (Figure S1,
Figure S2). Notably, sequences from the UK were intermingled
with sequences from Brazil within this clade. Previously, no isolate
obtained outside South America has been reported to group
within the monophyletic lineage defined by South American
subtype C isolates.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ผลลัพธ์ใช้กระบวนการอัตโนมัติ genotyping [21,22] หน้าจอ8,309 ลำดับยีน pol ชนิดย่อย C จาก UK สำหรับแยกแปลงพันธุกรรมกับโรคระบาดชนิดย่อย C ในอเมริกาใต้(ข้อมูลไม่แสดง) ตรวจระบุชาวลำดับ(n = 54 1%) อาจเชื่อมโยงกับชนิดย่อยอเมริกันใต้ Cโรคระบาด ลำดับที่ 54 เหล่านี้ได้สอดคล้องกับชุดของ 1,289ตัวอย่างลำดับการอ้างอิง บวกลำดับ 84 เพิ่มเติมทั่วโลกจากสหราชอาณาจักร Phylogeny โอกาสสูงสุด (ML) ที่สร้างขึ้นตำแหน่งนี้ใช้ยืนยันความสัมพันธ์ระหว่างการ 54ลำดับประเทศอังกฤษและอเมริกาใต้แยก wellsupported เปิดเผยกลุ่ม monophyletic ที่ประกอบด้วยเฉพาะชนิดย่อย Cตัวอย่างในแอฟริกาตะวันออก บราซิลและอังกฤษ (รูป S1 ยีน polรูป S2) ยวด ลำดับจากสหราชอาณาจักรได้ intermingledมีลำดับจากบราซิลใน clade นี้ ก่อนหน้านี้ ไม่แยกอเมริกาใต้ภายนอกได้รับรายงานการจัดกลุ่มในคนเชื้อสาย monophyletic ที่กำหนด โดยสหรัฐอเมริกาใต้ชนิดย่อย C แยก

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ผลขั้นตอนการ genotyping อัตโนมัติ [21,22] ถูกใช้ในการคัดกรอง 8,309 ชนิดย่อยลำดับยีน C ออฟไลน์ออฟไลน์จากสหราชอาณาจักรสำหรับสายพันธุ์ที่เชื่อมโยงทางพันธุกรรมกับการระบาดของโรคชนิดย่อยC ในอเมริกาใต้(ไม่ได้แสดงข้อมูล) การตรวจคัดกรองระบุเป็นชนกลุ่มน้อยของลำดับ(n = 54, 1%) การเชื่อมโยงที่อาจเกิดขึ้นกับชนิดย่อยอเมริกาใต้ C การแพร่ระบาด เหล่านี้ 54 ลำดับถูกจัดชิดกับชุดของ 1,289 ตัวอย่างทั่วโลกลำดับการอ้างอิงบวก 84 ลำดับเพิ่มเติมจากสหราชอาณาจักร ความน่าจะเป็นสูงสุด (ML) เชื้อชาติสร้างโดยใช้การจัดตำแหน่งนี้ได้รับการยืนยันความสัมพันธ์ระหว่าง54 สหราชอาณาจักรลำดับและแยกอเมริกาใต้เปิดเผย wellsupported กลุ่มไฟย์เลติประกอบด้วยเฉพาะของชนิดย่อย C ยีนออฟไลน์ออฟไลน์ตัวอย่างในแอฟริกาตะวันออก, ประเทศบราซิลและสหราชอาณาจักร (รูปที่ S1, รูป S2) ยวดลำดับจากสหราชอาณาจักรได้รับการผสมกับลำดับจากบราซิลภายใน clade นี้ ก่อนหน้านี้ไม่มีแยกได้นอกทวีปอเมริกาใต้ได้รับการรายงานไปยังกลุ่มที่อยู่ในสายเลือดไฟย์เลติกำหนดโดยอเมริกาใต้ย่อยสายพันธุ์C

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ผลโดยอัตโนมัติกระบวนการส่งเสริม 21,22
[ ]
ใช้หน้าจอในกลุ่ม C โดยลำดับยีนจากประเทศอังกฤษ เพื่อแยกยีนที่เชื่อมโยงกับชนิดย่อย C
ระบาดในอเมริกาใต้
( ข้อมูลไม่แสดง ) การระบุว่าเป็นส่วนน้อยของลำดับ
( n = 0 , 1% ) ที่อาจเชื่อมโยงกับอเมริกาใต้ชนิดย่อย C
ระบาด เหล่านี้ 54 ดังนี้ ชิดกับชุดของ 945
ทั่วโลกในลำดับอ้างอิงบวก 84 เพิ่มเติมดังนี้
จาก UK มีความเป็นไปได้สูงสุด ( ml ) ใช้ระบบเชื้อชาติสร้าง
แนวนี้ยืนยันความสัมพันธ์ระหว่างอังกฤษและอเมริกันใต้ลำดับ 54

monophyletic ได้รับการสนับสนุนโดยเป็นเชื้อกลุ่มเฉพาะของกลุ่ม C
พล ยีนเป็นตัวอย่างในแอฟริกา บราซิล และ อังกฤษ ( รูป S2 S1
รูป ) โดยเฉพาะลำดับจาก UK ถูกผสม
กับลำดับจากบราซิลภายในถัดจากนี้ ก่อนหน้านี้ ไม่แยก
ได้รับนอกอเมริกาใต้ มีรายงานว่า กลุ่ม
ภายใน monophyletic วงศ์ตระกูลที่กำหนดโดยอเมริกาใต้
ชนิดย่อย C ของเชื้อ