The SnpFilt pipeline removed all fa

The SnpFilt pipeline removed all false SNP in all test NGS datasets consisting of paired-end Illumina reads.We also showed that for reliable and complete SNP calls, at least 40-fold coverage is required. Analysis of
bacterial isolates associated with epidemiologically confirmed outbreaks using the SnpFilt pipeline produced results consistent with previously published findings

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ไปป์ไลน์ SnpFilt เอา SNP เท็จทั้งหมดในการทดสอบทั้งหมดที่อ่าน NGS datasets ประกอบด้วย Illumina ปลายคู่ เรายังพบว่าสำหรับสาย SNP ที่สมบูรณ์ และเชื่อถือได้ จำเป็นต้องมีความครอบคลุมน้อย 40-fold วิเคราะห์แบคทีเรียที่แยกได้เกี่ยวข้องกับยืนยัน epidemiologically ระบาดโดยใช้ไปป์ไลน์ SnpFilt ผลิตผลลัพธ์ที่สอดคล้องกับผลการวิจัยเผยแพร่ก่อนหน้านี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ท่อ SnpFilt ลบออก SNP เท็จในทุก NGS ทดสอบชุดข้อมูลที่ประกอบด้วยจับคู่สิ้น Illumina reads.We ยังพบว่าสำหรับการโทร SNP น่าเชื่อถือและมีความสมบูรณ์ครอบคลุมอย่างน้อย 40 เท่าเป็นสิ่งจำเป็น การวิเคราะห์
แบคทีเรียที่เกี่ยวข้องกับการแพร่ระบาดของโรคร่วมรับการยืนยันโดยใช้ท่อ SnpFilt ที่ผลิตผลลัพธ์ที่สอดคล้องกับผลการวิจัยเผยแพร่ก่อนหน้านี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การ snpfilt ท่อออกทั้งหมดเท็จ SNP ในเทคทดสอบข้อมูลประกอบด้วยคู่จบ Illumina อ่าน นอกจากนี้เรายังพบว่าสำหรับความน่าเชื่อถือและสมบูรณ์ HR โทรมา อย่างน้อย 40 เท่าความคุ้มครองจะต้อง การวิเคราะห์ของแบคทีเรียสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องกับ epidemiologically ยืนยันการใช้ snpfilt ท่อสร้างผลลัพธ์ที่สอดคล้องกับผลการวิจัยที่ตีพิมพ์ก่อนหน้านี้