2.4. Persistence of R. solanacearum in substrate and host tissue
Forty-gram samples of disinfected substrate (mixture of peat
moss and sand as used in the previous assay with tomato plants)
were placed into two sterile glass petri plates, and a 10 ml aliquot of
R. solanacearum inoculum (106 cfu ml1; produced as described
above) was added to each sample and mixed into the medium with
a sterilized spatula. The final water content was around 60% of the
water-holding capacity of the medium. A sample of 1 g was
immediately removed and serially diluted in 9 ml of physiological
water (8.5 g NaCl L1), and 100 mlwas spread onto the surface of the
selective medium (Triphenyl Tetrazolium Chloride, TTC) and the
non-selective medium (Yeast Dextrose Agar, YDA). Five dilutions
and two replications were used for each dilution and growing
medium. Two glass petri plates were sealed with parafilm to
prevent moisture loss and were incubated in the dark at 25 C and
45 C, respectively, for six weeks. At periodic intervals of seven
days, 1 g sample was removed, serially diluted and plated as
described above. All plates were inverted and incubated at 28 C for
one week and colony forming units (cfu) of bacteria and separately
of R. solanaceraum were recorded.
Pure isolates of all R. solanaceraum colonies were analyzed using
the DAS-ELISA technique, as described above. When the result was
positive, intracellular spaces of tobacco plant leaves were infiltrated
with aqueous suspensions of bacteria (108 cfu ml1) to test their
pathogenicity after the thermal treatments.
To determine the persistence of the pathogen in soil in association
with the host tissue (artificially infected tomato plants), three
pieces of infected stem were placed into sterilized tubes containing
6 g of the disinfected growing medium. Twelve tubes with soil were
prepared, sealed with parafilm to avoid water loss, and placed in
two incubators at 25 C and 45 C, respectively. On a weekly basis
over a 6-week period, the plant debriswas removed from two tubes
of soil incubated at each temperature. The plant pieces from each
tube were washed with sterilized water, and were homogenized
with sterilized water in a mortar. To determine the presence of
pathogenic bacteria, part of this bacterial solution was directly
infiltrated into intracellular spaces of tobacco leaves (about 200 ml
in each leaf) to measure phytopathogenicity. The other part of the
suspension was stored at 6 C.
For bacterial suspensions showing negative results in tobacco,
the remaining suspension was serially diluted and plated as
described above to ensure that no R. solanacearum colonies were
obtained.
To determine the persistence of R. solanacearum in association
with the host tissue, one piece of infected stem was put into each
sterilized Eppendorf tube to be processed as described above.
A total of 12 pieces of infected stems were used in the experiment.
The different pure cultures obtained from the above experiments
were identified through sequencing the 16S rDNA gene. DNA
was extracted using the EaZy Nucleic Acid Isolation kit (E.Z.N.A.
Omega Bio-Tek Inc., USA). Oligonucleotides pA-pH (Edwards et al.,
1989) were used in the PCR and for sequencing. The thermal
profile consisted of 36 cycles including denaturation at 94 C for
1 min, primer annealing at 55 C for 2 min and an extension at 72 C
for 6 min. Amplification products were purified using the High Pure
PCR Product Purification kit (Roche). Sequencing was done at the
Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas de la Universidad
Politécnica de Valencia in Spain (ABI-337 Perkin Elmer)
using the Big Dye Terminator Cycle Sequencing kit (version 2.0)
(PE Biosystem) and the program CHROMAS (version 1.45).
 
2.4 การคงอยู่ของ R. solanacearum ในเนื้อเยื่อพื้นผิวและโฮสต์ตัวอย่างพื้นผิวฆ่าเชื้อ (ส่วนผสมของพรุ 40 กรัมมอสส์และทรายที่ใช้ในการทดสอบก่อนหน้านี้กับพืชมะเขือเทศ)ถูกวางไปสองแก้วใส่ petri แผ่น และส่วนลงตัว 10 ml ของR. solanacearum inoculum (106 cfu ml 1 ผลิตดังที่เหนือ) ถูกเพิ่มเข้าไปแต่ละชิ้นงานตัวอย่าง และแบบผสมเป็นกลางด้วยพาย sterilized เนื้อหาสุดท้ายน้ำมีประมาณ 60% ของการความจุน้ำถือกลาง ตัวอย่าง 1 กรัมมีเอาออกไปทันที และแตกออกใน serially 9 ml ของสรีรวิทยาน้ำ (8.5 g NaCl L 1), และ mlwas 100 ที่กระจายบนพื้นผิวของการงานปานกลาง (Triphenyl Tetrazolium คลอไรด์ ทีทีซีจำกัด) และกลางไม่เลือก (Agar ขึ้นเชื้อยีสต์ YDA) ห้า dilutionsและระยะที่สองใช้สำหรับแต่ละการเจือจาง และเติบโตสื่อ สองแก้ว petri แผ่นถูกปิดผนึก ด้วย parafilm เพื่อป้องกันการสูญเสียความชื้น และมี incubated ในมืดที่ 25 C และ45 C ตามลำดับ ในสัปดาห์ที่หก ในช่วงเจ็ดเป็นครั้งคราววัน 1 g อย่างถูกเอาออก serially ผสม และชุบเป็นอธิบายไว้ข้างต้น กลับ และ incubated ที่ C 28 สำหรับแผ่นทั้งหมดสัปดาห์ที่หนึ่งและเป็นหน่วย (cfu) ของแบคทีเรีย และแยกโคโลนีของอาร์ solanaceraum ได้บันทึกไว้แยกบริสุทธิ์ของอาณานิคม solanaceraum อาร์ทั้งหมดถูกวิเคราะห์โดยใช้ดัส ELISA เทคนิค ตามที่อธิบายไว้ข้างต้น เมื่อได้ผลบวก intracellular ช่องว่างของใบยาสูบพืชที่ถูกแทรกซึมwith aqueous suspensions of bacteria (108 cfu ml1) to test theirpathogenicity after the thermal treatments.To determine the persistence of the pathogen in soil in associationwith the host tissue (artificially infected tomato plants), threepieces of infected stem were placed into sterilized tubes containing6 g of the disinfected growing medium. Twelve tubes with soil wereprepared, sealed with parafilm to avoid water loss, and placed intwo incubators at 25 C and 45 C, respectively. On a weekly basisover a 6-week period, the plant debriswas removed from two tubesof soil incubated at each temperature. The plant pieces from eachtube were washed with sterilized water, and were homogenizedwith sterilized water in a mortar. To determine the presence ofpathogenic bacteria, part of this bacterial solution was directlyinfiltrated into intracellular spaces of tobacco leaves (about 200 mlin each leaf) to measure phytopathogenicity. The other part of thesuspension was stored at 6 C.For bacterial suspensions showing negative results in tobacco,the remaining suspension was serially diluted and plated asdescribed above to ensure that no R. solanacearum colonies wereobtained.To determine the persistence of R. solanacearum in associationwith the host tissue, one piece of infected stem was put into eachsterilized Eppendorf tube to be processed as described above.A total of 12 pieces of infected stems were used in the experiment.วัฒนธรรมบริสุทธิ์ต่าง ๆ ที่ได้จากการทดลองข้างต้นถูกกำหนด โดยลำดับเบสในยีน rDNA 16S ดีเอ็นเอถูกสกัดโดยใช้ชุดแยกกรดนิวคลีอิกซี่ (E.Z.N.A.โอเมก้าไบ-Tek อิงค์ สหรัฐอเมริกา) Oligonucleotides pA-pH (เอ็ดเวิร์ด et al.,1989) ใช้ ในการ PCR และจัดลำดับ ความร้อนโพรไฟล์ประกอบด้วยรอบ 36 รวม denaturation ที่ C 94 สำหรับ1 นาที พื้นการอบเหนียว 55 C สำหรับ 2 นาทีและส่วนขยายที่ 72 Cสำหรับขั้นต่ำ 6 ขยาย ผลิตภัณฑ์ที่บริสุทธิ์ใช้สูงเพียวชุดฟอกผลิตภัณฑ์ PCR (Roche) ลำดับที่ทำการBiología เดอ Instituto โมเลกุล y Celular เด Plantas เดอลา UniversidadPolitécnica de Valencia ในสเปน (337 ลักชัวรี่เพอร์เอลเมอ)ใช้ชุดใหญ่ย้อมเทอร์มิเนเตอร์วงจรลำดับเบส (รุ่น 2.0)(PE Biosystem) และโปรแกรม CHROMAS (รุ่นดาวน์โหลด 1.45)
การแปล กรุณารอสักครู่..
