Sulfur dioxide is extensively used

Sulfur dioxide is extensively used during industrial fermentations and contributes to determine the harsh
conditions of winemaking together with low pH, high sugar content and increasing ethanol concentration.
Therefore the presence of sulfite has to be considered in yeast gene expression studies to properly understand
yeast behavior in technological environments such aswinemaking. A reliable expression pattern can be obtained
only using an appropriate reference gene set that is constitutively expressed regardless of perturbations linked to
the experimental conditions.
In this work we tested 15 candidate reference genes suitable for analysis of gene expression during must
fermentation in the presence of sulfite. New reference genes were selected from a genome-wide expression
experiment, obtained by RNA sequencing of four Saccharomyces cerevisiae wine strains grown in enological
conditions. Their performance was compared to that of the most common genes used in previous studies. The
most popular software based on different statistical approaches (geNorm, NormFinder and BestKeeper) were
chosen to evaluate expression stability of the candidate reference genes. Validation was obtained using other
wine strains by comparing normalized gene expression data with transcriptome quantification both in the
presence and absence of sulfite.
Among 15 reference genes tested ALG9, FBA1, UBC6 and PFK1 appeared to be themost reliablewhile ENO1, PMA1,
DED1 and FAS2were theworst. The most popular reference gene ACT1, widely used for S. cerevisiae gene expression
studies, showed a stability level markedly lower than those of our selected reference genes. Finally, as the
expression of the new reference gene set remained constant over the entire fermentation process, irrespective
of the perturbation due to sulfite addition, our results can be considered alsowhen no sulfite is added to themust

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ซัลเฟอร์ไดออกไซด์ใช้อย่างกว้างขวางในระหว่างการหมักแหนมอุตสาหกรรม และมีการกำหนดรุนแรงเงื่อนไขของ winemaking กับ pH ต่ำ น้ำตาลสูงเนื้อหา และความเข้มข้นของเอทานอลที่เพิ่มขึ้นดังนั้นจึง ของซัลไฟต์ที่มีจะเป็นยีสต์ยีนนิพจน์ศึกษาทำความเข้าใจอย่างถูกต้องyeast aswinemaking เช่นลักษณะการทำงานในสภาพแวดล้อมเทคโนโลยี รูปแบบนิพจน์ที่เชื่อถือได้ใช้ชุดยีนการอ้างอิงที่เหมาะสมที่ constitutively แสดงว่า perturbations เชื่อมโยงกับสภาพการทดลองในงานนี้ เราได้ทดสอบ 15 ผู้อ้างอิงต้องเหมาะสมสำหรับการวิเคราะห์ยีนระหว่างยีนหมักในต่อหน้าของซัลไฟต์ เลือกยีนอ้างอิงใหม่จากนิพจน์ทั้งจีโนมการทดลอง รับตามลำดับในอาร์เอ็นเอของสายพันธุ์ไวน์ cerevisiae Saccharomyces สี่ที่เติบโตขึ้นใน enologicalเงื่อนไขการ ประสิทธิภาพของพวกเขาถูกเปรียบเทียบกับยีนทั่วไปที่ใช้ในการศึกษาก่อนหน้านี้ ที่มีซอฟต์แวร์ที่นิยมมากที่สุดตามวิธีทางสถิติต่าง ๆ (geNorm, NormFinder และ BestKeeper)เลือกที่จะประเมินนิพจน์เสถียรภาพของยีนอ้างอิงของผู้สมัคร ตรวจสอบได้รับใช้อื่น ๆไวน์สายพันธุ์ โดยการเปรียบเทียบตามปกติข้อมูลนิพจน์ยีน transcriptome นับทั้งในการสถานะและการขาดงานของซัลไฟต์ในการอ้างอิงที่ 15 ยีนทดสอบ ALG9, FBA1, UBC6 และ PFK1 ปรากฏ ว่า themost reliablewhile ENO1, PMA1Theworst DED1 และ FAS2were ACT1 ยีนอ้างอิงนิยมใช้กันแพร่หลายใน S. cerevisiae ยีนการศึกษา ระดับความมั่นคงแสดงให้เห็นอย่างเด่นชัดต่ำกว่าของยีนของเราอ้างอิงที่เลือก ในที่สุด เป็นการของชุดยีนอ้างอิงใหม่ยังคงคงที่ผ่านการหมักทั้งหมด บกของ perturbation จากนี้ซัลไฟต์ ผลของเราถือได้ว่าซัลไฟต์ไม่เพิ่ม themust alsowhen

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ก๊าซซัลเฟอร์ไดออกไซด์ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในระหว่างการหมักแหนมอุตสาหกรรมและก่อให้เกิดการตรวจสอบที่รุนแรงเงื่อนไขของการผลิตไวน์ร่วมกับพีเอชต่ำปริมาณน้ำตาลสูงและความเข้มข้นของเอทานอลที่เพิ่มขึ้น. ดังนั้นการปรากฏตัวของซัลไฟต์จะต้องมีการพิจารณาในการศึกษาการแสดงออกของยีนยีสต์ที่จะต้องเข้าใจพฤติกรรมของยีสต์ในสภาพแวดล้อมทางเทคโนโลยีเช่น aswinemaking รูปแบบการแสดงออกที่น่าเชื่อถือสามารถรับได้เพียงแค่ใช้ชุดยีนอ้างอิงที่เหมาะสมที่จะแสดง constitutively โดยไม่คำนึงถึงเยี่ยงอย่างที่เชื่อมโยงกับเงื่อนไขการทดลอง. ในงานนี้เราทดสอบ 15 ยีนอ้างอิงผู้สมัครที่เหมาะสมสำหรับการวิเคราะห์การแสดงออกของยีนในช่วงที่ต้องหมักในการปรากฏตัวของซัลไฟต์. ยีนอ้างอิงใหม่ได้รับการคัดเลือกจากการแสดงออกของจีโนมทั้งการทดลองที่ได้จากการจัดลำดับของอาร์เอ็นเอสี่ Saccharomyces cerevisiae สายพันธุ์ไวน์ที่ปลูกใน enological เงื่อนไข ผลการดำเนินงานของพวกเขาได้รับเมื่อเทียบกับของยีนที่พบมากที่สุดที่ใช้ในการศึกษาก่อนหน้านี้ ซอฟต์แวร์ที่นิยมมากที่สุดขึ้นอยู่กับวิธีการที่แตกต่างกันทางสถิติ (geNorm, NormFinder และ BestKeeper) ได้รับเลือกให้เป็นผู้ประเมินเสถียรภาพการแสดงออกของยีนอ้างอิงผู้สมัคร การตรวจสอบที่ได้รับใช้อื่น ๆสายพันธุ์ไวน์โดยการเปรียบเทียบข้อมูลการแสดงออกของยีนปกติที่มีปริมาณยีนทั้งในการแสดงตนและการขาดงานของซัลไฟต์. ในบรรดา 15 ยีนอ้างอิงทดสอบ ALG9, FBA1, UBC6 และ PFK1 ดูเหมือนจะเป็น themost reliablewhile ENO1, PMA1, DED1 และ FAS2were theworst . การอ้างอิงที่นิยมมากที่สุดของยีน Act1 ใช้กันอย่างแพร่หลายสำหรับการแสดงออกของยีนเอส cerevisiae การศึกษาแสดงให้เห็นว่าระดับความมั่นคงอย่างเห็นได้ชัดต่ำกว่าของยีนอ้างอิงเลือกของเรา ในที่สุดขณะที่การแสดงออกของยีนชุดอ้างอิงใหม่คงที่ที่ผ่านกระบวนการหมักทั้งหมดโดยไม่คำนึงถึงของการก่อกวนเนื่องจากซัลไฟต์นอกจากนี้ผลของเราสามารถได้รับการพิจารณาalsowhen ซัลไฟต์ไม่มีจะถูกเพิ่ม themust

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ซัลเฟอร์ไดออกไซด์ถูกใช้อย่างกว้างขวางในอุตสาหกรรม fermentations และจัดสรรเพื่อตรวจสอบเงื่อนไขที่แข็งกร้าว
ของ winemaking ร่วมกับ Ph ต่ำ ปริมาณน้ำตาลสูงและเพิ่มความเข้มข้นของเอทานอล ดังนั้นการปรากฏตัวของซัลไฟต์
ต้องถือเป็นการแสดงออกของยีนในยีสต์ศึกษาให้ถูกต้องเข้าใจพฤติกรรมยีสต์เทคโนโลยีสภาพแวดล้อมเช่น aswinemaking .รูปแบบการแสดงออกที่น่าเชื่อถือได้
เท่านั้นที่ใช้เหมาะสมอ้างอิงชุดยีนที่ constitutively แสดงออกโดยไม่ได้เชื่อมโยงกับเงื่อนไขการทดลอง
.
ในงานนี้เราทดสอบ 15 ผู้สมัครอ้างอิงยีนเหมาะสำหรับการวิเคราะห์การแสดงออกของยีนในช่วงต้อง
หมักในการแสดงตนของซัลไฟต์ .ยีนอ้างอิงใหม่ได้รับเลือกจาก genome-wide การแสดงออก
ทดลองได้โดยการจัดลำดับของ Saccharomyces cerevisiae สายพันธุ์ที่ปลูกไวน์สี่ในเงื่อนไข enological
RNA การแสดงของพวกเขาเมื่อเทียบกับที่ของยีนที่พบมากที่สุดที่ใช้ในการศึกษาก่อนหน้านี้ .
ที่เป็นที่นิยมมากที่สุดซอฟต์แวร์ขึ้นอยู่กับวิธีการทางสถิติที่แตกต่างกัน ( genorm normfinder , และ bestkeeper )
เลือกเพื่อประเมินความมั่นคงของการแสดงออกของผู้สมัครอ้างอิงยีน การตรวจสอบได้รับการใช้สายพันธุ์ไวน์อื่น
โดยเปรียบเทียบกับมาตรฐานข้อมูลการแสดงออกของยีนทราน ริปโตมปริมาณทั้งในการแสดงและการขาดงานของซัลไฟต์
.
ของยีน alg9 fba1 15 อ้างอิงการทดสอบ , และ , ubc6 pfk1 ปรากฏจะมาก reliablewhile eno1 pma1
, , และ ded1 fas2were theworst .ที่นิยมมากที่สุดของ act1 อ้างอิงที่ใช้กันอย่างแพร่หลายใน S . cerevisiae การแสดงออก
การศึกษายีนมีเสถียรภาพระดับอย่างเด่นชัดกว่าบรรดาของเราเลือกอ้างอิงยีน ในที่สุด
การแสดงออกของยีนชุดใหม่อ้างอิงคงที่ ผ่านกระบวนการหมักทั้งหมด โดยไม่คำนึงถึง
ของความยุ่งเหยิงเนื่องจากนอกจากซัลไฟต์ ,ผลที่เราสามารถพิจารณา alsowhen ไม่เพิ่ม themust ซัลไฟต์