4. Study of arbitrarily amplified (

4. Study of arbitrarily amplified (RAPD and ISSR) and gene targeted (SCoT and CBDP) markers for genetic
diversity and population structure in Kalmegh [Andrographis paniculata (Burm. f.) Nees]
By Tiwari, Gunjan; Singh, Rakesh; Singh, Nivedita; Choudhury, Debjani Roy; Paliwal, Ritu; Kumar, Ashok; Gupta,
Veena
From Industrial Crops and Products (2016), 86, 1-11. Language: English, Database: CAPLUS,
DOI:10.1016/j.indcrop.2016.03.031
Andrographis paniculata is a medicinal herb also known as 'King of Bitter'. This herb was studied using arbitrary
amplified (RAPD and ISSR) and gene targeted (SCoT and CBDP) mol. markers. Thirty-nine accessions were collected
from five agro-ecol. regions of India. Eighteen RAPD and five ISSR primers generated a total of 124 and 32 amplicons
with an av. of 6.89 and 6.4 amplicons per primer resp. Similarly, 22 SCoT and 19CBDP primers were used to
characterize A. paniculata accessions. A total of 132 and 97 amplicons were generated, with an av. of 6.0 and 5.11
amplicons per primer, resp. Polymorphic information content (PIC) for RAPD and ISSR primers ranged from 0.32 to 0.45
and 0.25-0.42, with resolving power (Rp) ranging from 2.13 to 10.03 and 2.46-3.96, resp. PIC values ranged from 0.09
to 0.48 and 0.30-0.46, with an av. value of 0.34 and 0.41 per primer for SCoT and CBDP markers, resp. The resolving
power for SCoT and CBDP primers ranged from 2.36 to 10.54 and 1.39-13.15 per primer, resp. Unweighted pair group
method with arithmetic mean (UPGMA) based clustering grouped 39 accessions into three broad clusters based on all
four marker systems studied, did not correlate with their agro-ecol. regions. Population structure based anal. divided 39
accessions into seven populations, six populations and four populations using RAPD, ISSR and SCoT markers resp.
Whereas only three populations were obsd. using CBDP primers which corresponded to the grouping obsd. with the
UPGMA. Anal. of mol. variance (AMOVA) based anal. showed that the max. variation (10%) among agro-ecol. regions
was obsd. using CBDP primers; whereas, min. variation (2%) was obsd. using SCoT markers. Taken together, our data
suggest CBDP markers are better markers for genetic diversity study in A. paniculata.
~0 Citings

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

4. ศึกษาการขยายโดยพลการ (RAPD และ ISSR) และยีนเครื่องหมาย (แฟชั่นและ CBDP) สำหรับการกำหนดเป้าหมายทางพันธุกรรมโครงสร้างประชากรและความหลากหลายใน Kalmegh [ฟ้าทะลายโจร (Burm. f) Nees]โดย Tiwari, Gunjan สิงห์ Rakesh สิงห์ Nivedita Choudhury, Debjani Roy Paliwal แคม Kumar อโศก คุปตะVeenaจากอุตสาหกรรมพืชและผลิตภัณฑ์ (2016), 86, 1-11 ภาษา: ภาษาอังกฤษ ฐานข้อมูล: CAPLUSDOI:10.1016/j.indcrop.2016.03.031ฟ้าทะลายโจรเป็นสมุนไพรที่รู้จักกัน 'คิงของขม' สมุนไพรนี้เป็นศึกษาการใช้โดยอำเภอใจขยาย (RAPD และ ISSR) และยีนเป้าหมายเครื่องหมาย mol. (แฟชั่นและ CBDP) สามสิบเก้า accessions ถูกเก็บรวบรวมจากพื้นที่การเกษตร ecol. ห้าของอินเดีย สิบแปด RAPD และไพรเมอร์ ISSR ห้าสร้างจำนวน 124 และ 32 ampliconsด้วยการในิอเวของ amplicons 6.89 และ 6.4 ต่อรองพื้นชอบ ในทำนองเดียวกัน ไพรเมอร์แฟชั่นและ 19CBDP 22 เคยใช้ลักษณะทะลายโจร A. accessions ทั้งหมด 132 และ 97 amplicons สร้างขึ้น มีการในิอเว 6.0 และ 5.11amplicons ต่อรองพื้น ความรับผิดชอบเนื้อหาข้อมูล Polymorphic (PIC) สำหรับไพรเมอร์ ISSR และ RAPD ที่โจมตีระยะไกลจาก 0.32 0.45และ 0.25 0.42 ด้วยการแก้ไขพลังงาน (Rp) ตั้งแต่ 2.13 10.03 และ 2.46-3.96 ชอบ PIC ค่าตั้งแต่ 0.090.48 และ 0.30-0.46 กับค่าในิอเว 0.34 และ 0.41 รองพื้นสำหรับเครื่องหมายแฟชั่นและ CBDP ความรับผิดชอบ ในการแก้ไขพลังงานสำหรับไพรเมอร์ที่โจมตีระยะไกลจาก 2.36 10.54 และ 1.39-13.15 ต่อรองพื้น ชอบคู่ Unweighted กลุ่มแฟชั่นและ CBDPวิธี ด้วยคณิต (UPGMA) จากคลัสเตอร์จัดกลุ่ม 39 accessions ในคลัสเตอร์สามสิ่งอิงทั้งหมดศึกษา ระบบเครื่องหมายสี่ได้ไม่ correlate กับภูมิภาคเกษตร ecol. ของตน โครงสร้างประชากรตามทวาร 39 ถูกแบ่งaccessions ในเจ็ดประชากร ประชากรหก และสี่ประชากรใช้ชอบเครื่องหมาย RAPD, ISSR และแฟชั่นในขณะที่ประชากรเพียงสามถูก obsd ใช้ไพรเมอร์ CBDP ซึ่งความผูกพันในการ obsd การจัดกลุ่ม ด้วยการUPGMA ทางทวารหนัก ของ mol. แปรปรวน (AMOVA) ทางทวารหนัก พบว่าสูงสุด (10%) การเปลี่ยนแปลงระหว่างภูมิภาคเกษตร ecol.แก้ไข obsd ใช้ไพรเมอร์ CBDP ขณะ รูปขั้นต่ำ (2%) เป็น obsd. ใช้เครื่องหมายของแฟชั่น นำมารวมกัน ข้อมูลของเราแนะนำ CBDP เครื่องหมายมีเครื่องหมายที่ดีสำหรับการศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมในทะลายโจรอ.~ 0 Citings

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

4. การศึกษาการขยายพล (อาร์เอพีและ ISSR) และยีนที่กำหนดเป้าหมาย (ชาวสกอตและ CBDP) เครื่องหมายทางพันธุกรรม
ความหลากหลายและโครงสร้างประชากรใน Kalmegh [ฟ้าทะลายโจรโจร (Burm f..)]
โดยทิวา Gunjan; ซิงห์ Rakesh; ซิงห์ Nivedita; Choudhury, Debjani รอย; paliwal, Ritu; มาร์ Ashok; แคนด์
Veena
จากพืชอุตสาหกรรมและผลิตภัณฑ์ (2016), 86, 1-11 ภาษา: English, ฐานข้อมูล CAPLUS,
ดอย: 10.1016 / j.indcrop.2016.03.031
ฟ้าทะลายโจรเป็นสมุนไพรที่รู้จักกันว่า "พระมหากษัตริย์ของขม ' สมุนไพรนี้ได้ศึกษาการใช้โดยพลการ
ขยาย (RAPD และ ISSR) และยีนที่กำหนดเป้าหมาย (ชาวสกอตและ CBDP) mol เครื่องหมาย สามสิบเก้าสายที่ถูกเก็บรวบรวม
จากห้าเกษตร Ecol ภูมิภาคของประเทศอินเดีย สิบแปด RAPD และห้าไพรเมอร์ ISSR สร้างทั้งหมด 124 และ 32 amplicons
กับ AV 6.89 และ 6.4 ต่อ amplicons ไพรเมอร์รับผิดชอบ ในทำนองเดียวกัน 22 ชาวสกอตและ 19CBDP ไพรเมอร์ที่ใช้ในการ
อธิบายลักษณะสายฟ้าทะลายโจร รวมเป็น 132 และ 97 amplicons ถูกสร้างขึ้นโดยมี AV 6.0 และ 5.11
amplicons ต่อไพรเมอร์รับผิดชอบ ข้อมูลเนื้อหา polymorphic (PIC) สำหรับ RAPD และ ISSR ไพรเมอร์อยู่ในช่วง 0.32-0.45
และ 0.25-0.42 กับการแก้ปัญหาพลังงาน (Rp) ตั้งแต่ 2.13-10.03 และ 2.46-3.96, รับผิดชอบ ค่า PIC ตั้งแต่ 0.09 จาก
ที่จะ 0.48 และ 0.30-0.46 กับ AV ค่าเท่ากับ 0.34 และ 0.41 ต่อไพรเมอร์สำหรับชาวสกอตและ CBDP เครื่องหมายรับผิดชอบ การแก้ไขข้อ
พลังงานสำหรับชาวสกอตและ CBDP ไพรเมอร์ตั้งแต่ 2.36-10.54 และ 1.39-13.15 ต่อไพรเมอร์รับผิดชอบ กลุ่มคู่ชั่ง
วิธีที่มีค่ามัชฌิมเลขคณิต (UPGMA) การจัดกลุ่มตามการจัดกลุ่ม 39 สายออกเป็นสามกลุ่มที่กว้างขึ้นอยู่กับทุก
สี่ระบบเครื่องหมายศึกษาไม่มีความสัมพันธ์กับเกษตร Ecol ของพวกเขา ภูมิภาค ทางทวารหนักตามโครงสร้างประชากร แบ่ง 39
สายเป็นเจ็ดประชากรประชากรหกและสี่ของประชากรโดยใช้ดีเอ็นเอ, ISSR และชาวสกอตเครื่องหมายรับผิดชอบ.
ขณะที่มีเพียงสามประชากรเป็น obsd โดยใช้ไพรเมอร์ CBDP ซึ่งตรงกับการจัดกลุ่ม obsd กับ
UPGMA ทางทวารหนัก ของโมล ความแปรปรวน (AMOVA) ตามทางทวารหนัก แสดงให้เห็นว่าสูงสุด การเปลี่ยนแปลง (10%) ในหมู่เกษตร Ecol ภูมิภาค
ถูก obsd โดยใช้ไพรเมอร์ CBDP; ขณะที่นาที การเปลี่ยนแปลง (2%) ถูก obsd ใช้เครื่องหมายชาวสกอต นำมารวมกันข้อมูลของเรา
ขอแนะนำให้เครื่องหมาย CBDP เครื่องหมายที่ดีกว่าสำหรับการศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมในฟ้าทะลายโจร.
~ 0 Citings