2.7. Statistical analysisRaw fastq

2.7. Statistical analysis
Raw fastq files were demultiplexed and quality-filtered by using
QIIME (version 1.17) with the following criteria: (1) the 250 bp
reads were truncated at any site to receive an average quality score

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.7. Statistical analysisRaw fastq files were demultiplexed and quality-filtered by usingQIIME (version 1.17) with the following criteria: (1) the 250 bpreads were truncated at any site to receive an average quality score<20 over a 10 bp sliding window, with discarding the truncatedreads that were shorter than 50 bp; (2) as exacting barcodematching and two nucleotide mismatch in primer matching, readsthat containing ambiguous characters were removed; (3) only thesequences that overlap longer than 10 bp were assembled accordingto their overlap sequence, and reads which could not beF ¼ 2△△Ct, △△Ct ¼ (Ct, target gene e Ct, reference gene) e (Ct, targetgene e Ct, reference gene)control [35]. Differences between experimentalgroup and control were analyzed using SPSS (version 18.0) statisticalsoftware (SPSS Inc., Chicago, IL, USA) using post-hoc test,Dunnett's. A p-value of less than 0.05 or 0.01 was statisticallyconsidered significantly.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.7 การวิเคราะห์ทางสถิติไฟล์ fastq ดิบถูก demultiplexed และมีคุณภาพที่ผ่านการกรองโดยใช้ QIIME (เวอร์ชั่น 1.17) หลักเกณฑ์ดังต่อไปนี้ (1) 250 bp อ่านถูกตัดทอนที่เว็บไซต์ใด ๆ ที่จะได้รับคะแนนคุณภาพเฉลี่ย<20 10 bp หน้าต่างบานเลื่อน พร้อมกับทิ้งตัดทอนอ่านที่มีความสั้นกว่า50 bp; (2) เป็นบาร์โค้ดเข้มงวดการจับคู่และทั้งสองไม่ตรงกันเบื่อหน่ายในการจับคู่ไพรเมอร์อ่านที่มีอักขระที่ไม่ชัดเจนถูกถอดออก; (3) เพียงลำดับที่ทับซ้อนนานกว่า10 bp ถูกประกอบตามลำดับการซ้อนทับกันของพวกเขาและอ่านซึ่งไม่สามารถBEF ¼ 2? △△กะรัต, △△กะรัต¼ (Ct ยีนเป้าหมายจกะรัตยีนอ้างอิง) จ ( Ct เป้าหมายยีนจกะรัตยีนอ้างอิง) การควบคุม [35] ความแตกต่างระหว่างการทดลองกลุ่มควบคุมและวิเคราะห์โดยใช้โปรแกรม SPSS (รุ่น 18.0) สถิติซอฟต์แวร์(SPSS อิงค์, Chicago, IL, USA) ใช้การทดสอบการโพสต์เฉพาะกิจDunnett ของ p-value น้อยกว่า 0.05 หรือ 0.01 สถิติที่ได้รับการพิจารณาอย่างมีนัยสำคัญ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.7 . สถิติที่ใช้ในการวิเคราะห์ข้อมูลคือ demultiplexed fastq
ไฟล์ดิบและคุณภาพการกรองโดยใช้
qiime ( เวอร์ชั่น 1.17 ) กับเกณฑ์ต่อไปนี้ : ( 1 ) 250 BP
อ่านถูกตัดทอนในเว็บไซต์ใด ๆที่จะได้รับคะแนน
คุณภาพเฉลี่ย < 20 กว่า 10 คู่ หน้าต่าง บานเลื่อน ด้วยการตัด
อ่านที่สั้นกว่า 50 BP ( 2 )
บาร์โค้ดเข้มงวดการจับคู่เบสและไพรเมอร์ทั้งสองตรงกันตรงกัน อ่านที่ประกอบด้วยอักขระที่ถูกลบออก

; ( 3 ) ลําดับที่ทับซ้อนกันเกิน 10 BP ถูกประกอบตาม
ของเหลื่อมลำดับและอ่านซึ่งไม่สามารถดีกว่านะ¼ 2  △△ CT , △△ CT ¼ ( CT เป้าหมายยีน E CT , ยีน อ้างอิง ) E ( CT เป้าหมาย
ยีน E CT , ยีนอ้างอิง ) ควบคุม [ 35 ] ความแตกต่างระหว่างการทดลอง
และกลุ่ม ควบคุม วิเคราะห์ข้อมูลโดยใช้โปรแกรมสำเร็จรูป SPSS ( เวอร์ชั่น 18.0 ) สถิติซอฟต์แวร์
( SPSS Inc , ชิคาโก , IL , USA ) ใช้ Post Hoc Test ,
Dunnett ' s p น้อยกว่า 0.05 หรือ 0.01
ถือว่ามีนัยสำคัญ